زمینه و هدف: آرتریت روماتوئید یک بیماری التهابی با علت ناشناخته است. اخیراً نقش سوپرآنتی ژنها (sags) در ایجاد بیماری های التهابی مورد توجه قرار گرفته است. زیرا، باعث تحریک تکثیر سلول های t و تولید سایتوکاین های التهابی می شوند. ازآنجا که انتروتوکسین های استافیلوکوکوس آرئوس (s. aureus) به عنوان سوپرآنتی ژن های کلاسیک معرفی شده اند، همچنین، احتمالاً در راه اندازی این بیماری نقش داشته باشند. لذا، هدف این تحقیق بررسی وجود ژن اینتروتوکسینd استافیلوکوکوس آرئوس (s. aureus) در خون و مایع مفصل بیماران مبتلا به آرتریت روماتوئید می باشد. مواد و روش: در این مطالعه نمونه های خون و نیز مایع مفصل 103 بیمار مبتلا به آرتریت روماتوئید مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از ژن رفرانس اینتروتوکسین d سویه ی استاندارد (m28521.1 ) یک جفت پرایمر طراحی شد و از نظر بیوانفرماتیکی مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین، از نمونه های خون و مایع مفصل استخراج dna انجام گرفت. سپس پروتوکل pcr راه اندازی و set up شد. پس از آن نمونه های خون و مایع مفصل مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل به صورت توصیفی آنالیز و تحلیل شدند. نتایج: جفت پرایمر طراحی شده باعث تکثیر توالی با اندازه 294 جفت باز گردید. نتایج pcr حاکی از آن بود که در خون 42 نفر(40/77 %) از بیماران مبتلا به آرتریت روماتوئید ژن اینتروتوکسینd استافیلوکوکوس آرئوس وجود دارد، در حالی که در 60 نفر(58/25 %) نمونه ی مایع مفصل بیماران این ژن شناسایی شد. نتایج تعیین سکانس محصول pcr صحت تشخیص را تأیید نمود. بحث و نتیجه گیری: یافته های این مطالعه نشان داد 30 نفر(29/12 %) درصد از بیماران مبتلا به آرتریت روماتوئید دارای ژن اینتروتوکسین dاستافیلوکوکوس آرئوس در خون و مایع مفصل خود می باشند . همچنین این یافته نشان دهنده نقش دیگر سوپرآنتی ژن ها علاوه بر مسمومیت زایی آن ها می باشد.