مسائل مربوط به فرسایش خاک از جمله کاهش حاصلخیزی خاک در محل و آلودگی ناشی از رسوب در خروجی حوضه، مسائل مربوط به تکتونیک تشدید پدیده های مورفوژنیک و مسائل مورفودینامیکی نظیر وقوع لغزش ها، جریانات واریز ه ای در ارتباط متقابل با ویژگی های فیزیوگرافی حوضه، اقلیم، زمین شناسی و بهره برداری نامناسب از زمین توسط انسان عواقب خطرناکی را برای ساکنین حوضه مورد مطالعه در پی داشته است. لذا شناخت این مسائل جهت برخورد اصولی و مدیریتی با عوارض ناشی از این فعالیت ها و در نهایت پیشگیری از خسارات جانی و مالی و غیره ضروری است. هدف از این پژوهش تحلیل مسائل مربوط به ناپایداری دامنه ها، تکتونیک و فرسایش می باشد که جهت دستیابی به این امر از روش های مختلف کمی(شاخص تراکم زهکشی، نسبت انشعاب، زمان تمرکز و شاخص های تکتونیکی)، انواع نقشه ها و مدل epm استفاده شده است. تحلیل نتایج حاصله نشان می دهد که محدوده مورد مطالعه از لحاظ زمین ساخت فعال است. شاخص های bs، sl، af، smf، t، vf، s، hc، hi گویای فعالیت های تکتونیکی شدید در منطقه می باشد. زمین ساخت فعال در تشدید سیستم های شکل زایی و مورفودینامیک حوضه تأثیر بسزایی داشته است. بر اساس بررسی های به عمل آمده از نقشه های تهیه شده و مشاهدات میدانی و تهیه عکس در خصوص ناپایداری ها انواع مختلفی از این اشکال واریزه ها، زمین لغزش، فرسایش خندقی، شیاری،کنار رودخانه ای، انسانی و غیره در ناپایداری حوضه مورد مطالعه موثر بود ه اند. همچنین نتیجه مربوط به شاخص نوسان رطوبت خاک(ws) بیانگر استعداد بالای حوضه به فرسایش خندقی است. نتایج ارزیابی فرسایش حوضه بیانگر آنست که بارش های رگباری و تند، لیتولوژی سست و تغییرات کاربری اراضی در تشدید فرسایش و اتلاف خاکهای حوضه موثرند. مقدارکل رسوب در حوضه آبخیز مشکین چای 10123764 مترمکعب در سال برآورد شده است. از نظر وضعیت رسوبزایی حوضه وضعیت نامتعادلی دارد که در آن عوامل متعدد تولید کننده رسوب با تأثیرات متفاوت، محدوده مورد مطالعه را تحت تأثیر قرار می دهند.