نام پژوهشگر: شیوا قربانی

تعیین پراکندگی و فراوانی ویروس های شایع روی کدوئیان در منطقه ارومیه
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه یاسوج - دانشکده کشاورزی 1390
  شیوا قربانی   مینا راستگو

در سراسر دنیا تحقیقات مختلفی در جهت شناسایی نوع بیماری های ویروسی کدوییان انجام شده است. در ایران نیز با توجه به اهمیت کدوییان تحقیقات زیادی روی ویروس های بیمارگر آن ها صورت گرفته است. جهت شناسایی، تعیین پراکنش و فراوانی ویروس ها ی آلوده کننده کدوییان در منطقه ارومیه، 326 نمونه در طول فصل زراعی 1390-1389 از مزارع این منطقه جمع آوری گردید. شناسایی و تعیین پراکنش ویروس ها ی آلوده کننده کدوییان در طی سال زراعی 90-1389 با استفاده از das-elisa و tpia و آنتی بادی های چندهمسانه ای ویروس موزاییک هندوانه، ویروس موزاییک کدو، ویروس موزاییک زرد کدو، ویروس موزاییک خیار، ویروس لکه زرد کدو، ویروس خربزه ارومیه و ویروس لکه حلقوی پاپایا نجام گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که ویروس موزاییک هندوانه تیپ 2 (wmv-2) بالاترین میزان آلودگی نمونه ها را به خود اختصاص داده بود و بعد از آن به ترتیب ویروس لکه حلقوی پاپایا، ویروس موزاییک خیار، ویروس خربزه ارومیه، ویروس موزاییک زرد کدو، ویروس لکه زرد کدو و ویروس موزاییک کدو قرار داشتند. آلودگی های مخلوط نیز در تعدادی از نمونه ها مشاهده شد که بیشترین میزان آن مربوط به آلودگی مخلوط دو ویروس موزاییک هندوانه و خربزه ارومیه بود. بعد از این که در آزمون الایزا مشخص شد که ویروس موزاییک هندوانه ویروس غالب در منطقه ارومیه است، بررسی های بعدی روی این ویروس متمرکز شد. جهت بررسی دامنه میزبانی ویروس موزاییک هندوانه از گیاهان متنوعی متعلق به چهار خانواده استفاده گردید. در این آزمون مشخص شد که ویروس روی cucurbita pepo علایم رگبرگ نواری سبز و موزاییک، روی cucumis melo l.cv.felexusus و chenopodium amaranticolor coste et reyn لکه موضعی نکروز ، روی c. sativus l.cv. peto seed رگبرگ نواری سبز و روی nicotiana tobaccum cv. burly علامت موزاییک را ایجاد کرد. یک قطعه 966 نوکلئوتیدی با آزمون ic-rt-pcr تکثیر و مستقیما برای تعیین ترادف فرستاده شد. تحلیل نتایج ترادف نوکلئوتیدی شامل هم ردیف سازی چندگانه ترادف های نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی و تعیین درصد یکسانی آمینواسیدی پروتئین های ویروس موزاییک هندوانه جدا شده از ارومیه با پروتئین های سایر جدایه های موجود در بانک ژن با نرم افزارmega5.05 انجام گرفت. چندین درخت فیلوژنتیکی از همردیف سازی 774 نوکلئوتید از ژن پروتئین پوششی 49 جدایه wmv با جدایه ارومیه ترسیم شد. در درخت های فیلوژنتیکی ترسیم شده جدایه ارومیه داخل هیچکدام از 6 گروهی که قبلاً توسط محققین دیگر تعیین شده بود قرار نگرفت و یک شاخه کاملاً مجزایی را ایجاد کرد. جدایه ای که در این تحقیق بررسی شد از روی کدوی زمستانی از ارومیه جدا شد. ترادف جدایه ویروسی تعیین شده در این تحقیق با رس شمار در بانک ژن قرار داده شد. از آزمون سرولوژیکی das-elisa برای بررسی میزان حساسیت و تحمل پذیری ارقام محلی و تجاری در منطقه به ویروس موزاییک هندوانه استفاده شد. در این آزمون مشخص شد که ارقام محلی و تجاری کدو و خیار که کشاورزان برای کشت استفاده می کنند نسبت به ویروس حساس تر می باشند ایجاد کرد. از آزمون سرولوژیکی das-elisa برای بررسی میزان حساسیت و تحمل پذیری ارقام محلی و تجاری در منطقه به ویروس موزاییک هندوانه استفاده شد. در این آزمون مشخص شد که ارقام محلی و تجاری کدو و خیار که کشاورزان برای کشت استفاده می کنند نسبت به ویروس حساس تر می باشند