با وجود فعّالیت های مثبت کمیسیون حقوق بشر سازمان ملل متّحد، انتقادات بسیاری بر عملکرد آن وارد بود که اعتبار کمیسیون را خدشه دار کرده بود تا اینکه در پرتو فرآیند اصلاح ساختار سازمان ملل متّحد، پس از تصویب قطعنامه ایجاد شورای حقوق بشر در مجمع عمومی سازمان ملل متّحد، کمیسیون حقوق بشر، شصت و دوّمین و آخرین جلسه اش را در مارس 2006 برگزار کرد و خاتمه کار خود را اعلام نمود. شورای حقوق بشر به عنوان رکن فرعی مجمع عمومی سازمان ملل متّحد انجام وظیفه کرده و 46 عضو دارد. پس از گذشت حدود پنج سال از فعالیت شورای حقوق بشر، انتقاداتی بر عملکرد آن وارد آمده است و در مقابل، مدافعان ایجاد این نهاد را گامی به جلو ارزیابی کرده اند. در هر حال شورای حقوق بشر می تواند در افزایش کارایی نظارتی سازمان ملل متّحد نقش موثری داشته باشد ولی با توجّه به حاکمیت دولت – محور نمی توان تأسیس آن را پاسخی آرمان گرایانه برای جلوگیری از نقض حقوق بشر در جهان دانست.