از هر یک از زیر جمعیت های کرمانشاه و اصفهان به صورت تصادفی 20 نمونه خون تهیه و با روش نمکی dna ژنومی آنها استخراج گردید. تعداد آلل در هر جایگاه 2 یا 3 بود.متوسط هتروزیگوسیتی جمعیت کرمانشاه بیشتر از جمعیت اصفهان بود(57/0 در مقابل 42/0). بیشترین مقدار محتوای اطلاعات چند شکل (pic) (4971 /0) مربوط به جایگاه hms03 در جمعیت کرمانشاه و کمترین مقدار آن (2471 /0) نیز به جایگاه ژنی hms07 در جمعیت کرمانشاه مربوط گردید. بیشترین و کمترین شاخص شانون نیز به ترتیب در جایگاه ژنیhms03 و hms07در جمعیت کرمانشاه برآورد شد. فاصله ژنتیکی بین جمعیت اسب کرد کرمانشاه و اصفهان بر اساس رابطه nei، اندک بود که این موضوع احتمالاَ نشان دهنده منشاء ژنتیکی یکسان دو جمعیت می باشد.