این رساله در شش فصل تدوین شده که در فصل اول به تعریف و تاریخچه سیستم های scada می پردازد. در فصل دوم اجزای سیستم های scada مانند rtu ها، معماری سخت و نرم افزاری این سیستم ها، شبکه های ارتباطی و رابط سیستم و کاربر hmi تشریح شده است. در فصل سوم پروتکل های scada و سازمان های مرتبط توصیف و از میان تعداد زیادی پروتکل موجود به انتخاب پروتکل dnp3 با دلایل مشروحه می پردازیم. در فصل چهارم مکانیزم های امنیت جهت انتقال داده و انواع روش های افزایش امنیت در سیستم های scada را در مقوله امنیت پروتکل بررسی می کنیم. در فصل ششم روش پیشنهادی خود را که شامل اضافه مودن یک لایه امنیتی و اتخاذ سیاست امنیتی در تطبیق پذیری با سیستم های فعلی است را تشریح و با روش های ذکر شده در فصل قبل مقایسه می کنیم.و این مسیر را با جمع بندی و ارائه پیشنهادات در فصل ششم به پایان می رسانیم.