ساختارهایrna بصورت پیکره حلزونی شکل از دنباله هایrna می باشد که به وسیله زنجیره هایی از نوکلئوتیدهای آدنین، گوانین، سیتوزین و اوراسیل توسط قوانین جفت پایه ای واتسن و کریک به صورت (a-u , u-g) و (g-c) پیوند هیدروژنی برقرار می کنند. پیش بینی ساختار rna یکی از مسائل مهم در علم بیوانفورماتیک می باشد، که توجه ویژه ای در سال های اخیر به ان شده است. در این پایان نامه روش های شمارش تعداد ساختارهایrna، هم چنین توزیع توده ها در ساختار های rna مورد بررسی قرار گرفته است. یک ساختار rna را k-نامتقاطع گویند، هرگاه یک مجموعه k تایی از کمان هایی را که دو به دو متقاطع اند را شامل نمی شوند و یال های متقاطع گذرنده دوطرفه بیشتر از 1-k نباشند. و?-کانونی گویند، هر گاه یال های مشمول در یک توده حداقل ?باشند.