در این پژوهش ساختار مولکولی و پیوند هیدروژنی درون مولکولی ترکیب 2-تیوفرمیل-3-آمینو آکریل آلدهید (tfa) و 42 صورت بندی مختلف این ترکیب در سطوح محاسباتی hf، b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** به منظور تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف بهینه شده است. انرژی پیوند هیدروژنی برای سیستم های دارای این پیوند با استفاده از روش اسپینوزا بدست آمده است. طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف 2-تیوفرمیل-3-آمینو آکریل آلدهید به وسیله نظریه اتم ها در مولکول (aim) و نظریه اوربیتال طبیعی (nbo) تجزیه و تحلیل شد. برای تکمیل محاسبات در این قسمت محاسبات ساختاری برای ترکیب مورد مطالعه و صورت بندی های آن در فاز محلول انجام و تاثیر حلال بر روی پایداری صورت بندی های مختلف مشخص شد. همچنین اثرات استخلاف در موقعیت r1 و r2 ترکیب tfa بررسی و اثر این استخلاف ها بر روی ساختار و قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی مطالعه شده است. در ادامه برای واکنش های انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت های گذار بهینه گردید. سپس انرژی فعالسازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت های گذار محاسبه شد و در انتها بهترین تابع پتانسیل حاکم بر فرایندهای انتقال پروتون پیشنهاد شد، و سپس برازش گردیده و پارامترهای وابسته به آن استخراج گردید.