نام پژوهشگر: محمد ربانی خوراسگانی

تولید محصولی پروبیوتیک برای پیشگیری و کنترل پوسیدگی دندان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اصفهان 1392
  نیره جبالی   مهرناز کیهانفر

پوسیدگی دندان و بیماری های پریودنتال دو بیماری عفونی شایع در بین بیماریهای دهانی انسان می باشد. پوسیدگی دندان یک بیماری چند عاملی است که عوامل اصلی مسبب این بیماری شامل باکتری های پوسیدگی زا، کربوهیدرات های قابل تخمیر، میزبان و زمان می باشد. اولین نشانه های بالینی پوسیدگی دندان در دهان ضایعات لکه مانند سفیدی است که توسط چشم دیده می شود و در عین حال در این زمان روند فرآیند پوسیدگی برای ماه ها در جریان بوده است. در سالهای اخیر گرایش هایی به سمت درمان ضدمیکروبی برای مبارزه با بیماری ها مرسوم شده است. با توجه به خطر جدی که مقاومت آنتی بیوتیکی در برابر استفاده از آنتی بیوتیک ها بر علیه بیماری های مهم ایجاد می کند استفاده کمتر از آنتی بیوتیک ها و گسترش درمان های جدید که بر پایه آنتی بیوتیک نیست، ضروری می باشد. یکی از این درمان ها استفاده از ریزسازواره ها یی است که به طور کلی پروبیوتیک ها نامیده می شوند. این نوع درمان با عنوان باکتری درمانی نیز شناخته می شود. تأثیر پروبیوتیک ها در بهبود بیماری هایی مانند پوسیدگی دندان، بیماری های پریودنتال، بوی بد دهان و عفونت های قارچی دهان ثابت شده است. هدف از این تحقیق تولید محصولی پروبیوتیک برای کنترل و پیشگیری از پوسیدگی دندان می باشد. برای این منظور در ابتدا چهار سویه لاکتوباسیل(لاکتوباسیلوس کازئی، لاکتوباسیلوس پاراکازئی، لاکتوباسیلوس روتری و لاکتوباسیلوس پلانتاروم) به عنوان پروبیوتیک از نظر ویژگی هایی مانند تأثیر بر قدرت تشکیل بیوفیلم و اثر بر میزان رشد باکتری های بیماریزای اصلی مسبب پوسیدگی دندان (استرپتوکوکوس موتانس و استرپتوکوکوس سوبرینوس) و همچنین میزان اثر تجمعی با این عوامل بیماریزا مورد بررسی قرار گرفت. در این تحقیق همچنین اثر یکسری ترکیبات طبیعی شامل عسل، گلاب، سرکه و کلستروم گاوی نیز بر میزان رشد و تشکیل بیوفیلم توسط عوامل بیماریزا مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که باکتری های پروبیوتیک نسبت به سایر عوامل تأثیر بهتری در مورد عدم تشکیل بیوفیلم و ممانعت از رشد باکتری های بیماریزای مربوط به پوسیدگی دندان نشان دادند. در مرحله بعد لاکتوباسیلوس پلانتاروم به عنوان باکتری پروبیوتیک برای واردکردن به فرمول دهان شویه انتخاب شد. سه فرمولاسیون برای دهان شویه پیشنهاد شد. این سه فرمولاسیون از نظر قدرت تشکیل بیوفیلم و رشد دو سویه استرپتوکوکوس موتانس و استرپتوکوکوس سوبرینوس مورد بررسی قرار گرفت. نتایج تأئید کننده اثر این سه فرمولاسیون در کاهش قدرت تشکیل بیوفیلم و ممانعت از رشد سویه های استرپتوکوک مورد مطالعه بودند.

جستجوی مولکولی و آنالیز قسمتی از سکانس و فیلوژنی ژن rna ریبوزومی تریپانوزوم در شترهای یک کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف آباد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده دامپزشکی 1392
  سمانه مهرابیان   محمدرضا محزونیه

تریپانوزوم ها می توانند گونه های مختلف مهره داران از قبیل حیوانات و انسان ها را آلوده کرده و به کم خونی، کاهش وزن، تب و ضعف منجر شوند. اگر بیماری در دام ها درمان نشود می تواند به مرگ و زیان های جدی اقتصادی منتج شود. مطالعه ی حاضر جهت جستجوی مولکولی و آنالیز قسمتی از سکانس و فیلوژنی ژن rna ریبوزومی تریپانوزوم در شترهای یک کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف آباد انجام شد. تعداد 278 نمونه خون در سه بازه زمانی مختلف از شترهای یک کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف آباد اخذ شد و جهت ردیابی تریپانوزوما به روش pcr مورد آزمون قرار گرفتند. میزان آلودگی به تریپانوزوما در کل 07/1 درصد بود. نمونه های مثبت تنها در فصل های بهار و تابستان یافت شدند (8/3 درصد) و در فصل های پاییز و زمستان هیچ نمونه ی مثبتی به دست نیامد. در این مطالعه 2 نوع واریانت ژنتیکی در rna ریبوزومی در جدایه های تریپانوزوم در شترهای نجف آباد نشان داده شد. نتیجه ی حاضر می تواند بیانگر این مسئله باشد که خوشبختانه میزان آلودگی به تریپانوزوم در منطقه بسیار پایین است. جهت پیشگیری از بیماری پیشنهاد می شود از ورود دام های مشکوک به کشور ممانعت به عمل آید و دام های وارداتی نیز که از نظر ظاهری سالم هستند به وسیله ی تست های مولکولی مورد آزمایش قرار گیرند. اگرچه این تنوع ژنتیکی در rrna تریپانوزوم های در حال گردش در جمعیت شتران نجف آباد می تواند نشان دهنده ی این مسئله باشد که در زمینه ی خصوصیات بیولوژیک (از قبیل حدّت، بیماری زایی و سازگاری میزبانی) با یکدیگر تفاوت هایی داشته باشند، اما مطالعات تکمیلی جهت تأیید این فرضیه مورد نیاز است. این اطلاعات به عنوان داده های اولیه در زمینه ی مطالعه ی تنوع ژنتیکی تریپانوزوم ها می توانند مورد استفاده قرار گیرند.

بررسی تاثیر پروبیوتیک، عسل و سیاهدانه بر کنترل اسهال ناشی از پرتودرمانی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اصفهان - دانشکده ریاضی 1392
  هاجرالسادات منصوری تهرانی   مهناز رعایایی

مقدمه و اهداف: پرتودرمانی در ناحیه لگن برای بیماران سرطانی باعث ظهور اسهال در بیشتر آنان می گردد. از دلایل احتمالی این رخداد به تغییر در فلور باکتریایی روده، افزایش نفوذ پذیری سلولهای مخاطی روده و حرکات روده می توان اشاره کرد. درمان رایج برای اسهال در این بیماران استفاده از داروهای ضداسهال و رعایت رژیم غذایی است. داروهای ضداسهال با مهار حرکات روده، اسهال را کاهش می دهد. اما مصرف این داروها در دوزهای بالا و موثر بیش از دو روز مجاز نیست، و از سوی دیگر مصرف این داروها فلور میکروبی روده را متعادل نمی کند. پروبیوتیک ها از سال های دور همراه با رژیم غذایی در نقاط مختلف جهان مورد استفاده بوده اند و امروزه علاوه بر توصیه مصرف غذاهای حاوی پروبیوتیک ها، اشکال دارویی تولید و استفاده می شود. پروبیوتیک ها ریزسازواره های ساکن روده هستند که اگر به تعداد کافی مصرف شوند، اثرات مفیدی بر سلامتی میزبان دارند. استفاده از پروبیوتیک ها فلور از دست رفته روده را جبران کرده، به عملکرد صحیح روده کمک می کند. عسل ماده مغذی سنتی است که خواص احتمالی بر سلامت دارد از جمله؛ ضد باکتری، آنتی اکسیدان و ضدالتهابی و پره بیوتیک. سیاهدانه در طب سنتی خاور میانه و برخی از کشورهای آسیایی برای ارتقاء سلامتی و درمان بسیاری از بیماری ها از جمله آسم، سردرد، اسهال، عفونت، فشار خون و مشکلات گوارشی استفاده می شود در این پژوهش اثرات پروبیوتیک ها، عسل و سیاهدانه بر اسهال ناشی از پرتودرمانی ارزیابی می شود. مواد و روشها: این کارآزمایی بالینی تصادفی شده بر روی 84 بیمار واجد شرایط انجام شد که در ناحیه لگن پرتودرمانی می شدند. این بیماران به چهار گروه تقسیم شدند: مصرف کنندگان پروبیوتیک، مصرف کنندگان پروبیوتیک و عسل، مصرف کنندگان مخلوط عسل و سیاهدانه و گروه مصرف کننده دارونما. شاخص های اسهال و چند شاخص هماتولوژیک و ایمنولوژیک در این بیماران ارزیابی شد. نتایج: آزمون های آماری ارتباط معنی داری را بین شاخص های اسهال و گروه های درمانی در مقایسه با گروه شاهد نشان دادند. سه گروه درمانی تاثیر معنی داری بر شاخص های هماتولوژیک و ایمنولوژیک نداشتند. بحث: پروبیوتیک ها، عسل و سیاهدانه باعث کاهش در اسهال ناشی ار پرتودرمانی و نیازمندی به مصرف داروهای ضداسهال شده و تاثیر مثبتی بر قوام مدفوع دارند.

بررسی روند ژنتیکی صفات تیپ در گاوهای هلشتاین
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی 1392
  محمد ربانی خوراسگانی   محمدعلی ادریس

این مطالعه با هدف برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تیپ و بررسی روند تغییرات ژنتیکی این صفات انجام شد. به این منطور از 16837 رکورد شرکت شیر و گوشت اصفهان مربوط به سال های 69 تا 89 استفاده شد. پارامترهای ژنتیکی با استفاده از روش حداکثر درست نمایی محدود شده و الگوریتم میانگین اطلاعات(ai-reml) برآورد شد. ارتباط ژنتیکی صفات با استفاده از آنالیز چندمتغیره بدست آمد. روند ژنتیکی صفات از طریق رگرسیون ارزشهای اصلاحی بر سال تولد بدست آمد. نتایج نشان داد صفات تیپ با افزایش عمر حیوان تغییرات نسبتا زیادی کرده است. صفات زاویه دار بودن، استقرار سرپستانک ها و عمق پستان نسبت به بقیه ی صفات ارتباط ژنتیکی قوی تری(به ترتیب 0/68، 0/20 و 0/13-) با تولید شیر داشتند. بیشترین ارتباط ژنتیکی با درصد چربی مربوط به قدرت بدنی(0/34) و نمای عقبی پاهای عقبی(0/31) بود. بیشترین ارتباط ژنتیکی منفی با درصد چربی(0/46-) نیز برای زاویه دار بودن بدست آمد. نمای جانبی پاهای عقبی و شکاف پستان بیشترین ارتباط را با تعداد تلقیح کمتر(به ترتیب 0/16- و0/15-) داشته و نمای عقبی پاهای عقبی، استقرار سرپستانک ها، عرض عقب پستان و ارتفاع عقبی پستان بیشترین ارتباط را با سخت زایی کمتر(به ترتیب 0/71-، 0/64- ، 0/51- و 0/44-) داشتند. ارتفاع پستان و نمای عقبی پاهای عقبی بیشترین همبستگی مثبت را با طول عمر داشتند(بترتیب 0/31 و0/13) و زاویه دار بودن بیشترین همبستگی منفی(0/17-) را با طول عمر به خود اختصاص داد. روند ژنتیکی صفات تیپ نشان داد طول سرپستانک ها در حال کاهش می باشد. ارتباط ژنتیکی این صفت با تولید شیر نشان می دهد که انتخاب برای تولید شیر بیشتر، باعث ایجاد تغییر در طول سرپستانک ها شده است. نمرات عمق پستان نیز افزایش نشاد داد. روند ژنتیکی اکثر صفات در حد مطلوب و رو به بهبود بوده است. در بین صفات تیپ، بعد از طول سرپستانک ها بیشترین تغییرات مربوط به قامت و زاویه ی لگن بود. قامت گاوها در سالهای اخیر افزایش پیدا کرده که احتمالا به خاطر توجه اصلاحگران به این صفت در برنامه های اصلاحی بوده است. زاویه ی لگن بهبود خوبی داشته است ولی ارتفاع پستان به میزان اندکی کاهش یافته است. به طور کلی نتایج نشان داد که پیشرفت ژنتیکی مناسبی در سالهای اخیر اتفاق افتاده است.

بررسی ژن های موثر در مقاومت به فلزات سنگین و نانو اکسیدهای فلزی در سودوموناس های جداسازی شده و کنترل زیستی آنها توسط آنتاگونیست های میکروبی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه اصفهان - دانشکده علوم پایه 1392
  شهلا سلطانی نژاد   گیتی امتیازی

با افزایش سطح فلزات در محیط به علت فعالیت های صنعتی و اعمال کشاورزی مدرن، باکتری ها استراتژی هایی را جهت کاهش غلظت درون سلولی آلوده کننده های سمی به روش های مختلف دارا می باشند. بنابراین محیط های آلوده به فلزات سنگین دارای میکروارگانیسم هایی با قابلیت مقاومت در برابر این فلزات هستند. پژوهش حاضر در ارتباط با بررسی ژن های موثر در مقاومت به فلزات سنگین و نانو اکسیدهای فلزی در سودوموناس های ایزوله شده و کنترل بیولوژیکی آنها بوسیل? آنتاگونیست های میکروبی می باشد. در ابتدا 15 سویه از نمونه های خاک و پساب جداسازی شد. هشت سویه بر اساس مقاومت بالا در برابر یون های مس و روی، نانو اکسید مس و نانو اکسید روی غربال گری گردید. سویه ها بر اساس خصوصیات مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و آنالیز توالی ژن rrna s16 به عنوان سویه های سودوموناس شناسایی شدند. آنالیز ژن rrna s16 نشان داد که %25 سویه ها به سودوموناس پوتیدا، %25 به سودوموناس فلورسنس و %5/12 به سودوموناس آئروژینوزا تعلق دارند. تمام سویه ها به منظور تعیین حضور ژن های مربوط به مقاومت به یون های مس و روی (copa و czcc) مورد بررسی قرار گرفتند. برای این کار ابتدا dna ژنومی استخراج شده و با پرایمرهای اختصاصی طراحی شده برای این ژن ها pcr گردید. در میان سویه های غربال گری شده فقط fluorescens cuo-2 p. و p. putida zn-2 با پرایمرهای استفاده شده در این پژوهش ژن copa و سویه های p. fluorescens strain cuo-1، pseudomonas sp. zno-1، pseudomonas sp. zno-2 و putida zn-2 p. ژن czcc را دارا بودند. جهت تعیین نیمرخ پلاسمیدی باکتری ها، dna پلاسمیدی جداسازی شده و بوسیل? الکتروفورز ژل آگارز مشخص گردید. نتایج نشان داد که %75 سویه های جداسازی شده یک پلاسمید با وزن مولکولی بالا (kb 2/17) را حمل می نمایند، در حالی که سوی? p. putida zn-2 دارای دو پلاسمید می باشد. بیشترین غلظت قابل تحمل هم? سویه ها بر علیه یون های مس و روی، نانو اکسید مس، نانو اکسید روی و برخی از آنتی بیوتیک ها اندازه گیری شد. ارتباط بین مقاومت به فلزات سنگین و نانو اکسیدهای فلزی با مقاومت به آنتی بیوتیک ها با فرض مقاومت به استرس چندگانه در باکتری ها مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز آماری ارتباط مثبتی بین مقاومت به فلزات سنگین، نانو اکسیدهای فلزی و آنتی بیوتیک ها در تمام سویه ها نشان داد. اگزوپلی ساکارید تولید شده توسط سویه های مقاوم به نانواکسیدهای فلزی، استخراج گردیده و اثر محافظتی آنها بر روی سلول ها مورد ارزیابی قرار گرفت. کاهش در میزان اگزوپلی ساکارید بعد از برهم کنش مایع رویی کشت p. fluorescens cuo-1 با نانو ذرات cuo مشاهده گردید. طیف های ft-ir اگزوپلی ساکارید استخراج شده از مایع رویی کشت باکتری و نانو ذرات cuo بر هم کنش داده با اگزوپلی ساکارید، تقریباً مشابه بود. پوشانده شدن نانو ذرات بوسیل? اگزوپلی ساکارید به کمک آنالیز ft-ir و xrd تأیید گردید. بررسی اثر نانو ذرات cuo پوشیده شده با اگزوپلی ساکارید بر روی e. coli ptcc1336 و s. aureus ptcc1113 سمیّت کمتری در مقایسه با نانو ذرات cuo نشان داد. نتایج پیشنهاد می کند که پوشانده شدن نانو ذرات بوسیل? اگزوپلی ساکارید تولید شده بوسیل? باکتری ها می تواند یک مکانیسم احتمالی مقاومت در برابر این ذرات باشد. به منظور بررسی فعالیت آنتاگونیستی لاکتوباسیل ها علیه سودوموناس آئروژینوزا از 4 گون? لاکتوباسیلوس کازئی، لاکتوباسیلوس پلانتاروم، لاکتوباسیلوس بولگاریکوس و لاکتوباسیلوس برویس استفاده گردید. برای این کار کشت عاری از سلول لاکتوباسیل ها در محیط mrs فراهم گردیده و فعالیت ضدمیکروبی آنها بر روی سودوموناس آئروژینوزا به روش انتشار در آگار به کمک چاهک بررسی شد. پس از این که مشخص شد کدام لاکتوباسیلوس بیشترین اثر ممانعت کنندگی را دارد، قسمت های مختلف کشت آن مثل کشت کامل باکتری دارای cfu/ml 106، شیراب? اسیدی، شیراب? خنثی شده و سلول های شسته شد? لاکتوباسیلوس که در بافر نمکی با غلظت cfu/ml 106 سوسپانسیون گردیدند، فراهم شده و فعالیت ضد میکروبی آنها مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین تأثیر این بخش ها بر روی تولید بیوفیلم توسط سودوموناس آئروژینوزا نیز آزمایش گردید. نتایج نشان داد که هیچ گونه سلول زند? سودوموناس آئروژینوزا بعد از کشت در برابر نمون? شیراب? اسیدی و کشت کامل لاکتوباسیلوس برویس مشاهده نشد. در مقایسه با سودوموناس آئروژینوزای رشد کرده در محیط lb، نمون? کشت کامل و شیراب? اسیدی لاکتوباسیلوس برویس اثر ممانعت کنندگی معنی داری بر روی تولید بیوفیلم داشتند. با توجه به نتایج این پژوهش می توان بیان نمود که خاک های آلوده به فلزات سنگین منابع بالقوه ای برای جداسازی سویه های مقاوم به فلزات سنگین و نانواکسیدهای فلزی می باشند و درک اساس ژنتیکی مقاومت به فلزات سنگین در باکتری ها می تواند به استفاد? بهتر از این مکانیسم های طبیعی جهت بهبود محیط زیست هم? موجودات زنده منجر شود.