متأسفانه در سالهای اخیر تقلبات در تولید مواد غذایی، به ویژه در فرآورده های گوشتی افزایش قابل توجهی یافته است. هدف از این تحقیق شناسایی گونه های حیوانی در فرآورده های گوشتی با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز بود. بدین منظور 4 فرآورده ی گوشتی شامل گوشت چرخ کرده، کباب لقمه، همبرگر وکنسرو خورشتی به ترتیب به تعداد 10، 7، 8 و 5 از کارخانجات سراسر کشور جمع آوری شد. استخراج dna از نمونه ها به روش گوانیدین تیوسیانات-سیلیکاژل صورت گرفت. قطعه 144 جفت بازی ژن سیتوکروم b ((cytb، از dna میتوکندری با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و آغازگر اختصاصی اسب سانان تکثیر گردید. نتایج نشان دادند که 57/ 28 درصد از کباب لقمه ها و 60 درصد از کنسروهای خورشتی به بقایای بافتی اسب سانان آلوده بودند. سپس قطعه183 جفت بازی ژن 12s rrna ازdna میتوکندری با استفاده از آغازگراختصاصی طیور (مرغ و بوقلمون) تکثیر گردید. نتایج نشان داد، 66/86 درصد کل نمونه ها به بقایای بافتی طیور آلوده بودند. سپس قطعه 195جفت بازی ژن cytb از dna میتوکندری با استفاده از روشpcr-rflp و آغازگر عمومی cb7u تکثیر گردید. جهت تشخیص افتراقی انواع نشخوارکنندگان (گاو،گوسفند و بز)، محصولات pcr با آنزیم sse9i هضم شدند، ناخالصی در 90 درصد نمونه های گوشت چرخ کرده، 100 درصد نمونه های کباب لقمه و 50 درصد نمونه های همبرگر و 40 درصد از نمونه های کنسرو خورشتی مشاهده گردید. نتایج حاصله نشان دهنده ضرورت گنجاندن آزمون های مبتنی بر pcr در استاندارد ملی ایران برای افزایش کیفیت فرآورده های گوشتی می باشد.