این پژوهش به منظور بررسی دو آلل bf2*13 و bf2*21 ژن bf2 از کلاس i کمپلکس اصلی سازگاری بافتی در دو جمعیت منطقه سیستان (دو توده نژادی خزک و دشتیاری) و سویه تجاری راس 308 صورت گرفت. کمپلکس اصلی سازگاری بافتی مجموعه ای ژنی می باشد که نقش تنظیمی را در سیستم ایمنی ایفا می کند. آزمایشات بسیاری ارتباط این مجموعه ژنی را با مقاومت و حساسیت در مقابل انواع بیماری ها و همچنین صفات تولیدی نشان داده است. ژن bf2 یکی از این جایگاه های مرتبط می باشد. در این تحقیق ابتدا از تعداد 60 قطعه مرغ نژاد راس 308 و همچنین تعداد 72 قطعه مرغ بومی (37خزک و35 دشتیاری) به صورت تصادفی خونگیری شد. سپس dna نمونه های خون با استفاده از کیت استاندارد استخراج گردید و برای تعیین کمیت و کیفیت آن از ژل آگارز یک درصد استفاده گردید. در مرحله بعد پرایمرهای مناسب برای دو آلل bf2*13 و bf2*21طراحی شد و سپس این آلل ها با واکنش pcr، تکثیر و محصول pcr به ترتیب به طول bp 197 و bp 52 توسط الکتروفورز با ژل آگارز 2/1 % و 5/1 % مشاهده شد. فراوانی نمونه های دارای آلل bf2*13 در نژاد تجاری راس 308، 45% و در دو توده نژادی خزک و دشتیاری به ترتیب 6/75% و 8/22% به دست آمد. همچنین فراوانی نمونه های دارای آلل bf2*21 در نژاد تجاری راس 308، 35% و در دو توده نژادی خزک و دشتیاری به ترتیب 9/45 و 2/34% مشاهده شد. با توجه به نتایج تحقیقات انجام گرفته می توان گفت توده نژادی دشتیاری از این نظر که فراوانی نمونه های دارای آلل bf2*13 که رابطه مستقیم با حساسیت به بیماری آنفولانزای مرغی دارد در آن بسیار پایین است در مقابل این بیماری کمتر حساس می باشد. از طرف دیگر، در توده نژادی خزک به رغم بالا بودن فراوانی نمونه های دارای آلل bf2*13، فراوانی نمونه های دارای آلل bf2*21 که رابطه مستقیم با مقاومت به بیماری های مارک، آنفولانزای مرغی، بورس عفونی و برخی صفات تولیدی دارد نیز در حد نسبتاً خوبی است. بنابراین اصلاحگران می توانند فراوانی این آلل ها را در برنامه های اصلاح نژادی مورد استفاده قرار دهند.