وجود خشکسالی های متوالی و افزایش برداشت از منابع آب زیرزمینی دشت الشتر از عوامل اصلی افت سطح آب زیرزمینی محسوب می شوند. لذا ضروری است که مدیریت بهره برداری و حفاظت از آبهای زیرزمینی بویژه در شرایط خشکسالی بعنوان یک اصل و پایه در برنامه ریزی های منابع آب مورد توجه قرار گیرد. این امر نیازمند شناخت عملکرد سفره در شرایط طبیعی، در وهله اول و سپس پیش بینی اثرات برداشت و یا تغذیه بویژه در شرایط خشکسالی با استفاده از مدلسازی سیستم آب زیرزمینی می باشد. modflow از سری مدل هایی است که توانایی شبیه سازی جریان آب زیرزمینی دشت الشتر را فراهم کرده و امکان مدیریت آن را برای کارشناس منابع آب مهیا می نماید. برای این منظور کلیه لایه های ورودی مورد نیاز مدل در محیط نرم افزار arcgis ساخته شد و پس از تنظیم و اجرای اولیه مدل، عمل واسنجی در دو حالت پایدار و ناپایدار انجام گردید، سپس جهت اطمینان از نتایج شبیه سازی، آزمون صحت سنجی صورت گرفت. بعد از این مرحله چهار سناریوی اقلیمی از جمله شرایط ترسالی، شرایط نرمال، خشکسالی متوسط، خشکسالی شدید برای مدل تعریف و واکنش مدل نسبت به این سناریوها سنجیده شد. نتایج نشان داد تنها در صورت اعمال سناریوی ترسالی، بیلان آب زیرزمینی مثبت و برای سایر سناریوها، بیلان منفی خواهد شد. برای مدیریت سه گزینه ترسالی، نرمال و خشکسالی متوسط، کاهش 38 درصدی منابع آب زیرزمینی در قالب طراحی سیستم های آبیاری تحت فشار و برای مدیریت خشکسالی شدید استفاده تلفیقی راهکار مذکور با اجرای طرح تغذیه مصنوعی پیشنهاد گردید.