به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا (brassica napus l.) از نشانگر ملکولی ssr استفاده شد.در این مطالعه از یازده جفت آغازگر اختصاصیssr استفاده شد که در مجموع 76 باند واضح تولید نمودند میانگین تعداد باندهای تکثیری به ازای هر جفت آغازگر و ژنوتیپ به ترتیب 9/6 و6/3 بود. از تعداد کل باندها، 46باند چند شکل بودند،که به طور متوسط هر جفت آغازگر2/4 باند چند شکل تولید نمودند. بنابراین درصد باند های چند شکل 5/60% بود.در بین آغازگرها بیشترین تعداد باند تکثیری مربوط به آغازگرهای na10a09و cb10036bبا 10باند و کمترین تعداد مربوط به آغازگر cb10403با 4باند بود. بر اساس تجزیه خوشه ای به روش upgma و ماتریس تشابه دایس ژنوتیپ های کلزا به 3 گروه تقسیم شدند که نمونه ی licord به تنهایی یک گروه را تشکیل داد در حالی که از لحاظ خصوصیات مرفولوژیکی با بیشتر ژنوتیپ ها شباهت بالایی دارد. علت این امر را می توان تفاوت در سطح پلوئیدی این ژنوتیپ، نامگذاری اشتباه و هر عامل دیگری دانست. براساس ماتریس تشابه، بیشترین شباهت (99/0) مربوط به ژنوتیپ های zarfam و gerinimo و کمترین تشابه (72/0)مربوط به ژنوتیپ های ks-11 و licord بود. در این گروه بندی، ژنوتیپ های ایرانی و خارجی در یک گروه قرار گرفتند. این موضوع قرابت و خویشاوندی ژنوتیپ های ایرانی و خارجی را نشان می دهد