چکیده کمپلکس آنزیمی لاکتوز سنتاز از دو پروتئین مختلف تشکیل شده است که عبارتند از آلفالاکتالبومین و بتا گالاکتوزیل ترانسفراز. به این ترتیب کمپلکس مذکور توسط دو ژن مختلف که هرکدام مربوط به یکی از پروتئین های تشکیل دهنده هستند رمزدهی می شود. کمپلکس لاکتوز سنتاز در داخل سلول های اپیتلیال پستان قرار گرفته و عمل سنتز لاکتوز که مهمترین ترکیب تنظیم کننده فشار اسمزی شیر است را انجام می دهد. هدف از این مطالعه شناسایی واریانت های ژنتیکی مختلف کمپلکس آنزیمی لاکتوز سنتاز در گاوهای هولشتاین ایران بوده است نمون از 400 گاو هولشتاین شکم دوم اخذ و نواحی ژنتیکی مربوط به دو ژن آلفالاکتالبومین و بتا گالاکتوزیل ترانسفراز توسط واکنش زنجیره ایی پلیمراز تکثیر شدند. محصول pcr مورد توالی یابی مستقیم قرار گرفت تا موتاسیون های احتمالی شناسایی شوند. به طور کلی 99 واریانت مختلف لاکتوز سنتاز در این مطالعه مورد شناسایی قرار گرفت. نتایج حاصل از تجزیه تحلیل آماری وجود اختلاف معنی دار در حجم شیر و میزان تولید پروتئین و مواد جامد شیر در یک دوره شیرواری بین گاوهایی که واریانت های مختلف کمپلکس مذکور را داشتند اثبات نمود. میانگین و انحراف معیار تولید شیر در گاوهایی که مطلوب ترین واریانت ژنتیکی کمپلکس مذکور را داشتند 1863+ 4561 و در گاوهایی که نامطلوب ترین واریانت را داشتند 1210+ 14278 بوده است. بر اساس اطلاعات حاصل از این مطالعه اهمیت کمپلکس آنزیمی لاکتوز سنتاز و ژن های دخیل در رمزدهی آن در تاثیر بر صفات مختلف شیردهی و قابلیت آن به منظور استفاده در اصلاح نژاد مولکولی مشخص گردید.