به دلیل اهمیت کارهای پزشکی وکاربرد تکنولوژی هسته ای در تشخیص ودرمان بیماریها، در اینجا به این موضوع پرداخته شده است. سرطان، بیماری شایعی است که امروزه به عنوان یکی از معضلات جامعه ی بشری شناخته می شود؛ بنابراین تشخیص و درمان آن، خدمت بزرگی به بشریت است. در این یادداشت، توزیع دوز حاصل از پرتوهای پروتون و کربن، اعم از عمقی و سطحی با استفاده از نرم افزار fluka مورد بررسی قرار گرفته است. یکی از اهداف این پروژه، تعیین قابلیتهای نرم افزار است. fluka یکی از کدهای محاسباتی است که در مهندسی و فیزیک هسته ای و فیزیک ذرات بنیادی، کاربرد دارد و قادر است از انرژیkev تا چندین هزار tev را شبیه سازی کند. لازم به ذکر است که این نرم افزار در انرژیهای بالا نتایج بهتری تولید می کند. در این رساله، مشاهده می شود که نتایج حاصل از شبیه سازی برای پروتون با انرژی کمتر از200mev در مقایسه با نرم افزارهای دیگر، انطباق دقیقی ندارد، اما برای کربن 135-300mev، مطلوب است.