ژن های drb1 و dqa2 از جمله ژن های مهمی هستند که در ناحیه کلاس دوم از مجتمع اصلی پذیرش بافتی (mhc)قرار گرفته و نقش مهمی در ایجاد مقاومت و بروز پاسخ ایمنی نسبت به بیماری ها ایفا می کنند. ژنوتیپ های متفاوتی برای این ژن ها در دام ها شناسایی شده که هر ژنوتیپ می تواند با مقاومت یا حساسیت نسبت به بیماری های عفونی و همچنین با تولید در دام ها در ارتباط باشد. این مطالعه به منظور بررسی چند شکلی ژن هایdrb1 وdqa2 و ارتباط آن ها با برخی صفات تولیدی و پارامتر های ایمنی شناختی در گوسفندان نژادهای مهربان و لری بختیاری انجام گردید. برای این منظور از تعداد 155 راس میش نژاد مهربان و 167 راس میش نژاد لری بختیاری خونگیری به عمل آمد.dna ژنومی از نمونه های خون با استفاده از کیت شرکت سینا ژن استخراج گردید .کمیت و کیفیت dna استخراج شده به ترتیب با استفاده از روش اسپکتروفتومتر و ژل آگارز مورد ارزیابی قرار گرفت. به منظور تکثیر قطعه 285 جفت بازی از اگزون دوم ژن drb1 و قطعه 242 جفت بازی از اگزون دوم ژن dqa2از واکنش زنجیره ای پلی مراز ( pcr) بهره گرفته شد. چند شکلی نمونه هایpcr ، با روش های چند شکلی فضایی تک رشته ای (sscp) و توالی یابی dna مورد بررسی قرار گرفت. در تجزیه sscp تعداد یازده الگوی مختلف از ژنdrb1 و نه الگوی مختلف از ژن dqa2 بدست آمد. فراوانی الگو ها و توالی های مختلف در جمعیت های مورد بررسی با کمک رویه freqاز نرم افزار sas آزمون x2 دو سویه مورد بررسی قرار گرفت. ارتباط الگو های مختلف با برخی صفات تولیدی و پارامترهای ایمنی شناختی با کمک تجزیه مدل های خطی تعمیم یافته و مقایسه میانگین ها با روش آزمون چند دامنه دانکن بررسی گردید. ارتباط ژن drb1 با پارامترهای خونی مورد بررسی شامل کل پروتئین های خون، آلفا1، آلفا2، بتا و گاما گلوبولین ها بسیار معنی دار (0001/0 p <) بود. همچنین این ژن ارتباط معنی داری (05/0 p <) با وزن از شیرگیری و وزن نه ماهگی و ارتباط متمایل به معنی داری (1/0p <) با وزن یک سالگی داشت. ژن dqa2 ارتباط متمایل به معنی داری با وزن از شیر گیری داشت (1/0p <). نتایج بدست آمده از این پژوهش نشان داد که اگزون دوم ژن drb1 و اگزون دوم ژن dqa2 را می توان برای انتخاب به کمک نشانگرها مورد توجه قرار داد.