چکیده ژن فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز سیتوزولی (pepck-c) یکی از ژنهای کاندیدای مهم می باشد که آنزیم فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز را رمزگذاری می کند که آنزیمی مهم در چرخه گلیکونئوژنسیز می باشد. در ژنوم موجودات زنده دو شکل متفاوت از این ژن وجود دارد: ژن فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز سیتوزولی (pepck-c ) و ژن نوع میتوکندریایی (pepck-m ). در این تحقیق به طور تصادفی 100 نمونه از دو جمعیت بومی منطقه سیستان و بلوچستان به نامهای خزک و دشتیاری مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور از فولیکول انتهایی پر dna استخراج و با استفاده از pcr و پرایمرهای f1r1 ، f2r2 ، f3r3 و f4r4 قطعه ای به طول bp 3792 از فاصله پروموتر تا اگزون شماره 3 از ژن pepck-c تکثیر و سپس قطعات تکثیر شده با استفاده از آنزیم های bste? و aci? مورد هضم قرار گرفت. محصول هضم روی ژل آگارز 5/1 درصد تعیین ژنوتیپ شد و فراوانی های ژنوتیپی و آللی با استفاده از نرم افزار popgene 3.2 مورد آنالیز قرار گرفت. فراوانی آللی برای نمونه های خزک در جایگاه bste?،a=0/98 و b=0/02 و در جایگاه aci?، 86/0 a=و 14/0 b=و برای نمونه های دشتیاری در جایگاه bste? ، 92/0 a=و 08/0 b=و برای جایگاه aci?، 98/0 a=و 02/0 b=بود. تجزیه هاپلوتایپ برای دو snp نشان داد که چهار هاپلوتایپ d ,c ,b ,a در دو جمعیت مرغ وجود دارد و فراوانی آنها به ترتیب برای مرغان خزک 02/0، 14/0،84/0 و 0 و برای مرغان دشتیاری 0، 02/0، 9/0 و 08/0 بود. از نه ژنوتیپ ممکن تنها چهار ژنوتیپ cc، cd، acو bc در دو نمونه مشاهده گردید که در این میان ژنوتیپ cc فراوانی بیشتری داشت. مطالعه حاضر نشان می دهد که در هر دو نمونه چند شکلی وجود دارد.

از نوآوری های امیرکبیر تأسیس دارالفنون بود. یکی از هفت شعبه مدرسه دارالفنون، رشته پزشکی بود. در این پژوهش نحوه و چگونگی آموزش پزشکی در این مدرسه شرح داده شده است و تغییر و تحوّلاتی که در اثر این فرآیند در پزشکی ایران ظاهر گردید، در هفت مقوله طب تشریح و کالبد شکافی، عمل سنگ مثانه، تعمیم آبله کوبی همگانی، ایجاد بیمارستان های جدید، مجلس حفظ الصحه، لزوم داشتن تصدیق برای پزشکان و تحوّل در داروسازی بررسی و تبیین شده است. همچنین به شرح حال، آثار و تألیفات و نوآوری های معلمان و مدرسانی که در این امر تأثیرگذار بودند، پرداخته شده است. این افراد به دو دسته معلمان خارجی و ایرانی تقسیم بندی شده اند. معلمان خارجی عمدتاً معلّم طب فرنگی مدرسه بودند. شاخص ترین آنها دکتر پولاک ، دکترطولوزان و دکتر شلیمر هستند که با تربیت شاگردان و تألیف آثاری ارزشمند ، به ترویج و رواج طب جدید در ایران کمک کردند. مدرسین ایرانی دو دسته هستند دسته اول طبیبان سنتی هستند که عهده دار تدریس طب ایرانی یا سنتی در مدرسه دارالفنون شدند. دسته دوم هم پزشکان فارغ التحصیل مدرسه دارالفنون بودند که پس از فارغ التحصیل شدن و دسته ای از آنها پس از ادامه تحصیلات تکمیلی، تدریس طب نوین را در مدرسه به عهده گرفتند. شاخص ترین چهره های این دسته دکترعلی اکبرخان نفیسی ناظم الاطبا ، دکتر محمد کرمانشاهی و دکتر خلیل خان ثقفی اعلم الدوله هستند که راه معلمان اروپایی خود را ادامه دادند.

به منظور بررسی تاثیر محدودیت غذایی و سطوح مختلف انرژی و پروتئین جیره بر عملکرد و بیان ژنghrelin در جوجه های گوشتی دو آزمایش انجام شد. در آزمایش اول تاثیر محدودیت غذایی و سطوح مختلف انرژی و پروتئین جیره بر عملکرد، غلظت هورمون رشد و بیان ژن ghrelin در جوجه های گوشتی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 576 قطعه جوجه خروس گوشتی سویه راس در یک آزمایش فاکتوریل 3×2×2 و در قالب طرح کاملا تصادفی با 4 تکرار قرار گرفتند. برنامه غذایی شامل مصرف خوراک به صورت آزاد و محدودیت غذایی روز در میان ، سطوح انرژی (3100 و 2800 کیلوکالری بر کیلوگرم) و سطوح پروتئین (22/3، 19/3 و 16/3 درصد) بود. تیمار محدودیت غذایی در طول روزهای 32-22 روزگی اعمال شد. جیره غذایی بر پایه ذرت-کنجاله سویا بود که از روغن سویا انسانی به عنوان منبع انرژی استفاده شد. وزن بدن و مصرف خوراک به صورت هفتگی اندازه گیری شد. در 21 ، 32 و 49 روزگی یک جوجه از هر تکرار انتخاب و پس از خونگیری کشتار شدند. نمونه های خون برای غلظت هورمون رشد آنالیز شد و نمونه های پیش معده برای بررسی بیان ژن ghrelin جمع آوری شد. محدودیت غذایی، مصرف خوراک و وزن بدن (p<0/001) را در کل دوره کاهش داد. همچنین محدودیت غذایی باعث بهبود ضریب تبدیل خوراک (p<0/01) در کل دوره و کاهش افزایش وزن (p<0/001) در 32-22 روزگی شد. کاهش انرژی جیره، مصرف خوراک، وزن بدن (p<0/001)، ضریب تبدیل خوراک و افزایش وزن را افزایش داد. افزایش سطوح پروتئین جیره با افزایش مصرف خوراک(p<0/001)، وزن بدن (p<0/001) و افزایش وزن همراه بود و همچنین ضریب تبدیل خوراک (p<0/001) را در جوجه های گوشتی بهبود داد. محدودیت غذایی باعث کاهش وزن لاشه (p<0/001) و افزایش درصد ماهیچه ران (p<0/01) در 32 روزگی شد.کاهش انرژی باعث افزایش درصد لاشه (p<0/05) و درصد سینه شد. کاهش پروتئین باعث کاهش درصد لاشه(p<0/01)، درصد سینه(p<0/001)، درصد ران (p<0/05) و افزایش درصد چربی حفره بطنی (p<0/001) در 49 روزگی شد. . کاهش انرژی جیره باعث افزایش غلظت هورمون رشد پلاسما در 21 روزگی (p<0/05) شد. روند تاثیر پروتئین جیره بر غلظت هورمون رشد پلاسما در مراحل مختلف رشدی متفاوت بود. میزان نسبی بیان mrna ghrelin در سلولهای پیش معده جوجه ها با استفاده از سیستم real time pcr و روش نسبت delta ct نمونه به delta ct کنترل تعیین شد. افزایش معنی داری در بیان ژن ghrelin پیش معده (0/1>p) بعد از اعمال محدودیت غذایی در 32 روزگی مشاهده شد. کاهش انرژی جیره باعث کاهش بیان ژن ghrelin در 21 روزگی (p<0/05) شد ولی در 32 و 49 روزگی این روند معکوس بود (0/1>p). کاهش سطح پروتئین جیره باعث کاهش بیان ژن ghrelin شد که این کاهش در 21 روزگی (0/1>p) معنی دار بود ولی در 32 و 49 روزگی معنی دار نشد. در آزمایش دوم تاثیر سطوح متفاوت انرژی و پروتئین جیره بر عملکرد و بیان ژن ghrelin در جوجه های گوشتی بررسی شد. 240 قطعه جوجه خروس گوشتی سویه راس در قالب طرح کاملا تصادفی با 5 تیمار، 4 تکرار و 12 قطعه جوجه در هر پن قرار گرفتند. برنامه غذایی شامل انرژی در سطح ثابت (3100 کیلوکاری بر کیلوگرم) با سطوح مختلف پروتئین جیره در دوره های مختلف رشد داده شد. همچنین پروتئین در سطح ثابت با نسبتهای مختلف انرژی (3100 ، 2900 و 2700 کیلوکالری بر کیلوگرم ) در دوره های مختلف رشد داده شد. جیره غذایی بر پایه ذرت-کنجاله سویا بود که از روغن گیاهی به عنوان منبع انرژی استفاده شد. وزن بدن و مصرف خوراک به صورت هفتگی رکورد شد. در 21 ، 42 و 56 روزگی یک جوجه از هر تکرار انتخاب شد و نمونه های خون جمع آوری شد و سپس کشتار شد. نمونه های خون برای غلظت هورمون رشد آنالیز شد و نمونه های پیش معده برای بررسی بیان ژن ghrelin جمع آوری شد. افزایش میزان انرژی جیره باعث کاهش مصرف خوراک ، وزن بدن و افزایش وزن شد که این کاهش در مراحل اولیه زندگی (21-0 روزگی) معنی دار شد(0/001>p). همچنین افزایش انرژی باعث بهبود ضریب تبدیل خوراک شد. افزایش سطوح پروتئین در جیره با افزایش مصرف خوراک، وزن بدن و افزایش وزن همراه بود و همچنین ضریب تبدیل خوراک را در جوجه های گوشتی بهبود داد. افزایش انرژی باعث افزایش درصد چربی حفره بطنی شد. کاهش درصد پروتئین باعث کاهش درصد لاشه و سینه و افزایش درصد چربی حفره بطنی شد. کاهش انرژی جیره باعث افزایش غلظت هورمون رشد شد ولی از لحاظ آماری معنی دار نبود. غلظت هورمون رشد تحت تاثیر سطوح مختلف پروتئین جیره قرار نگرفت. همچنین بیان ژن ghrelin در این آزمایش تحت تاثیر سطوح مختلف انرژی و پروتئین جیره قرار نگرفت.

از رویدادهای سیاسی و اجتماعی مهم ایران در دوره مشروطه خیزش دهقانان گیلان بر ضد مالکان و مناسبات فئودالی است . در پی وقوع انقلاب مشروطه و انتشار پیام مشروطیت و نفوذ افکار آزادی خواهی از شهرها به روستاهای گیلان ، روستاییان این سامان به بیداری و هشیاری طبقاتی دست یافته و بر ضد مالکان ، مباشران و نظام ظالمانه ارباب – رعیتی به حرکت درآمدند . جنبش دهقانان که در ابتدا با امتناع از پرداخت بهره مالکانه همراه بود ، خیلی زود در سرتاسر گیلان گسترش یافت . در این میان چند نقطه از گیلان از جمله رشت ، تالش و لشت نشاء به کانون های اصلی جنبش دهقانان مبدل شدند . در فرآیند جنبش ، اعتراض دهقانان خصلت انقلابی به خود گرفت و رعایا به طور قهرآمیز با مالکان ، حکومت گیلان و مأموران و سربازان اعزامی از پایتخت وارد کشمکش و ستیز شدند و با بیرون راندن مالکان از املاکشان بر زمین ها و اموال آن ها چنگ انداختند . در پی ریزی و سازماندهی این جنبش تشکیلات اجتماعیون – عامیون گیلان از جمله انجمن های عباسی نقش اصلی را داشتند و برخی از اعضای این انجمن مانند رحیم شیشه بر و سیدجلال شهرآشوب ، رهبری جنبش دهقانان را بر عهده گرفتند . دهقانان در روند جنبش با تشکیل انجمن های محلی بلوکات کوشش نمودند تا قدرت سیاسی را در روستاها به دست گیرند و بدین گونه دست مالکان را از روستاها کوتاه نمایند . جنبش دهقانان بیش و پیش از همه واکنش مالکان را برانگیخت . آنان با تشکیل انجمن مالکین گیلان در صدد مهار و سرکوب جنبش دهقانان برآمدند . در همین راستا دولت و مجلس مشروطه ، انجمن ولایتی و حکمرانان گیلان به پشتیبانی از مالکان برخاستند و برای جلوگیری از تعمیق و گسترش خیزش و مهار آن وارد عمل شدند . با پیش آمدن استبداد صغیر زمین? کامل سرکوب جنبش دهقانی فراهم شد و مالکان و سردار افخم حکمران وقت گیلان با به کار گیری زور و خشونت، موفق به سرکوب خیزش دهقانان که بیش از دو سال به طول انجامیده بود ، شدند . در پژوهش حاضر نگارنده با بهره گیری از منابع و اسناد برجای مانده از دوره قاجار و مشروطه و تحقیقات مورخان و پژوهشگران تاریخ معاصر برای نخستین بار به طور مستقل و مفصل جنبش دهقانان گیلان در عصر مشروطه را مورد بررسی قرار داده و زوایا و ابعاد گوناگون آن را روشن نموده است .

گوسفند به عنوان حیوانی اهلی برای قرن ها نقش مهمی در تامین منابع غذایی مردمان سرزمین فلات ایران بر عهده داشته است و این ناحیه به عنوان منشا این گونه به شمار می رود. در بین نشانگر های ژنتیکی، توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روشها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه hvr1 از ژنوم میتوکندری یکی از نژاد های گوسفند بومی ایران (گوسفند مغانی) می باشد. برای انجام این تحقیق تعداد 10 عدد نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوندجمع آوری شد. پس از استخراج dna از آنها، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک pcr تکثیر شده و بعد از بدست آمدن بهترین جواب در pcr، تعیین توالی شد. پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی hvr1 از ژنوم گوسفند مغانی با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژاد ها از مناطق مختلف جهان، مشخص شد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی a می باشد، از مقایسه توالی ناحیهhvr1 گوسفند مغانی با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی a از ژنوم گوسفندان سایر نژاد، نزدیکی آن با نژاد بلوچی ایران و یک نژاد از ترکیه تعیین شد که به دلیل مکان زیستی این نژاد از نظر جغرافیایی دور از انتطار نبود همچنین تجزیه و تحلیل نمودار فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی a نشان داد حتمالاً قوچ و میش اوریال به عنوان منشا نژاد بلوچی و نزادهای آسیایی مورد مطالعه مطرح است و این نژادها از آن مشتق شده اند. در نهایت توالی به دست آمده از این منطقه برای اولین بار در بانک ژن با کد دسترسی fj531545 ثبت و نام گوسفند مغانی برای اولین بار در بانک جهانی ژن آورده شد و این نژاد به انجمن های بین المللی معرفی شد.

به منظور بررسی تأثیر انواع مختلف کربوهیدرات های غیرالیافی بر پتانسیل تجزیه پذیری، سوخت و ساز نیتروژن در شکمبه، مولفه های خون و تغییرات جمعیت باکتری های سلولتیک گوساله های نر هلشتین 5 آزمایش در شرایط برون تنی و درون تنی انجام شد. آزمایش اول: تأثیر ساکارز، نشاسته و ساکارز + نشاسته بر پتانسیل تخمیرپذیری علف خشک یونجه، تفاله چغندر قند و سلولز خالص با استفاده از تکنیک تولید گاز مورد بررسی قرار گرفت. مواد غذایی مذکور به صورت مکمل نشده (300 میلی گرم) و مکمل شده با ساکارز، نشاسته و مخلوط مساوی آنها (21 میلی گرم) کشت داده شدند. حجم گاز تولید شده در زمان های 2، 4، 6، 8، 12، 24، 48، 72 و 96 ساعت ثبت شد. داده ها در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی آنالیز آماری شدند. نتایج این آزمایش نشان داد که افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی مقدار گاز تولید شده را به طور معنی داری افزایش داد (05/0 >p). در مجموع کمترین گاز تولید شده مربوط به یونجه و بیشترین آن مربوط به سلولز خالص بود. افزودن ساکارز باعث افزایش معنی دار نرخ تولید گاز در علف خشک یونجه شد (05/0 p<). نشاسته باعث کاهش معنی دار نرخ تولید گاز در تفاله چغندر قند شد (05/0 p<). همچنین افزودن ساکارز + نشاسته به سلولز خالص باعث افزایش نرخ تولید گاز شد (05/0 p<). زمانیکه علوفه پایه علف خشک یونجه یا تفاله چغندر قند بود، افزودن ساکارز، نشاسته یا ساکارز + نشاسته به طور معنی داری تولید گاز از بخش قابل تخمیر را افزایش داد (05/0 p<)، و در این ارتباط تأثیر ساکارز قابل توجه تر از نشاسته بود. آزمایش دوم: اثرات مکمل کردن نشاسته یا ساکارز بر کنتیک هضم مرتبه اول ماده خشک و الیاف نامحلول در شوینده خنثی علف خشک یونجه، سبوس گندم و تفاله چغندرقند در شرایط آزمایشگاهی کشت ثابت مورد ارزیابی قرار گرفت. یک گرم از مواد غذایی ذکر شده، به صورت مکمل نشده و مکمل شده (70 میلی گرم به ازای گرم ماده خشک) با ساکارز یا نشاسته یا مخلوط مساوی آنها در زمان های 4، 8، 16، 24، 48 و 96 ساعت کشت داده شد. این آزمایش در قالب طرح کرت های دو بار خرد شده انجام شد. از مدل غیرخطی مرتبه اول برای تخمین پارامترهای کنتیکی هضم ماده خشک و الیاف نامحلول در شوینده خنثی استفاده گردید. در این آزمایش افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی، هضم ماده خشک را در علف خشک یونجه به طور معنی داری کاهش داد (01/0 >p). مقدار هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی تفاله چغندر قند و سبوس گندم، با افزودن نشاسته به طور معنی داری کاهش یافت (01/0 >p). افزودن ساکارز + نشاسته بر هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی هر سه ماده خوراکی مورد استفاده در این آزمایش تأثیر معنی داری داشت (05/0 >p). افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی به تفاله چغندر قند و سبوس گندم (به جز زمانیکه ساکارز به سبوس گندم اضافه شد)، باعث کاهش ثابت نرخ هضم ماده خشک شد. ثابت نرخ هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی در علف خشک یونجه و سبوس گندم در پاسخ به افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی در مقایسه با نمونه های مکمل نشده به طور معنی داری افزایش یافت (05/0 >p). ساکارز باعث افزایش ثابت نرخ هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی در علف خشک یونجه شد. نشاسته ثابت نرخ هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی در علف خشک یونجه و سبوس گندم را افزایش داد. بخش فاقد پتانسیل هضم ماده خشک در علف خشک یونجه و سبوس گندم، با افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی به محیط کشت به طور معنی داری افزایش پیدا کرد (05/0 >p). به طور کلی بخش فاقد پتانسیل هضم الیاف نامحلول در شوینده خنثی در علف خشک یونجه و سبوس گندم، برای تیمارهایی که حاوی کربوهیدرات های غیرالیافی بودند، بیشتر بود. غلظت نیتروژن آمونیاکی محیط کشت در علف خشک یونجه با افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی کاهش یافت (01/0 >p). آزمایش سوم: تأثیر انواع مختلف کربوهیدرات های غیرالیافی (ساکارز یا نشاسته) بر مقدار و کنتیک هضم سلولز خالص، غلظت نیتروژن آمونیاکی و ph تخمیر در شرایط آزمایشگاهی کشت ثابت مورد بررسی قرار گرفت. تیمارهای آزمایشی شامل سلولز مکمل نشده و سلولز به علاوه ساکارز، نشاسته یا مخلوط مساوی ساکارز + نشاسته (467 میلی گرم به ازای گرم سلولز خالص) بودند. تیمارها در زمان های 24، 48 و 96 ساعت کشت داده شدند. از مدل غیرخطی مرتبه اول برای تخمین پارامترهای کنتیکی هضم سلولز استفاده شد. نتایج این آزمایش نشان داد که افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی باعث کاهش معنی دار مقدار هضم سلولز در مقایسه با سلولز مکمل نشده شد (01/0 p<)، و این اثر با شدت بیشتری در مورد نشاسته مشاهده شد. افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی به محیط کشت، باعث کاهش معنی دار نرخ هضم سلولز شد (05/0 p<). زمانیکه کربوهیدرات های غیرالیافی به محیط کشت افزوده شدند، نرخ هضم سلولز به طور معنی داری کاهش یافت (05/0 p<). بخش فاقد پتانسیل هضم سلولز درتیمارهایی که حاوی ساکارز یا ساکارز + نشاسته بودند، بیشتر بود (05/0 p<). ph محیط کشت در مورد سلولز مکمل نشده در مقایسه با تیمارهای مکمل شده با کربوهیدرات های غیرالیافی بالاتر بود (01/0 p<). آزمایش چهارم: تأثیر جیره های حاوی انواع مختلف کربوهیدرات های غیرالیافی بر سوخت و ساز نیتروژن، متابولیت های خونی و برخی آنزیم های کبدی در گوساله های نر هلشتین مورد ارزیابی قرار گرفت. این آزمایش در قالب طرح مربع لاتین 4×4 انجام شد. جیره پایه ای که مورد استفاده قرار گرفت، شامل علف خشک یونجه، دانه جو، کنجاله سویا و تفاله چغندر قند (به ترتیب400، 290، 190 و 50 گرم در کیلوگرم) بود. نشاسته یا ساکارز یا مخلوط 1:1 آنها به مقدار 70 گرم در کیلوگرم ماده خشک به جیره پایه افزوده شد. نتایج این آزمایش نشان داد که جیره های حاوی ساکارز، نشاسته یا ساکارز + نشاسته، غلظت نیتروژن آمونیاکی مایع شکمبه را در مقایسه با جیره شاهد، کاهش دادند (06/0 p=)، اما بر ph شکمبه تأثیری نداشتند. غلظت نیتروژن پپتیدی مایع شکمبه با افزودن کربوهیدات های غیرالیافی به جیره پایه کاهش یافت (09/0 p=). افزودن کربوهیدرات های غیرالیافی غلظت نیتروژن غیرآمینی پلاسمای خون را در مقایسه با جیره شاهد، به طور معنی داری کاهش داد (04/0 p=). تیمارهای آزمایشی تأثیر معنی داری بر غلظت کلسترول، انسولین، تری گلیسیرید، آلبومین، پروتئین کل پلاسما و آنزیم های کبدی خون در قبل و 4 ساعت بعد از خوراک صبحگاهی نداشتند. آزمایش پنجم: تأثیر انواع مختلف کربوهیدرات های غیرالیافی (ساکارز یا نشاسته) بر جمعیت سه گونه اصلی سلولتیک موجود در شکمبه (فیبروباکتر سوکسینوژنز، رومینوکوکوس فلاوفسینز و رومینوکوکوس آلبوس) با استفاده از روش real-time pcr در شرایط درون تنی و برون تنی مورد بررسی قرار گرفت. در بخش درون تنی چهار گوساله نر هلشتاین در قالب طرح مربع لاتین 4×4 مورد استفاده قرار گرفتند. تیمارهای مورد آزمایش همانند آزمایش چهارم بود. در بخش برون تنی سلولز خالص به عنوان سوبسترا مورد استفاده قرار گرفت. تیمارهای آزمایشی شامل سلولز مکمل نشده و سلولز به علاوه ساکارز یا نشاسته یا ساکارز + نشاسته بودند. در شرایط درون تنی، افزودن ساکارز یا نشاسته تأثیر معنی داری بر جمعیت کل باکتری های آزاد در شکمبه نداشتند، اما افزودن ساکارز + نشاسته باعث افزایش معنی دار جمعیت کل باکتری های شکمبه شد (05/0 p<). تحت شرایط آزمایشگاهی کشت ثابت نیز افزودن کربوهیدارت های غیرالیافی به سلولز، مقدار کل باکتری ها را در محیط کشت پس از گذشت 48 ساعت از انکوباسیون افزایش داد (09/0 p=). انواع مختلف کربوهیدرات های غیرالیافی تأثیر معنی داری بر جمعیت فیبروباکترسوکسینوژنز و رومینوکوکوس آلبوس نسبت به جمعیت کل باکتری ها (??ct) در مایع شکمبه در قبل از مصرف خوراک و 4 ساعت پس از مصرف خوراک نداشت. منبع کربوهیدرات های غیرالیافی افزوده شده به جیره پایه تأثیر معنی داری بر جمعیت باکتری رومینوکوکوس فلاوفسینز نسبت به جمعیت کل باکتری ها قبل و 4 ساعت بعد از خوراک صبحگاهی نداشت، اما با افزودن ساکارز و نشاسته به سلولز در شرایط آزمایشگاهی جمعیت این باکتری نسبت به جمعیت کل باکتری ها به طور معنی داری کاهش یافت (01/0 p<).

در این بررسی سعی شده تا با تکیه بر منابع و اسناد موجود پرتوی بر اصلاحات و اقدامات اجتماعی و فرهنگی عباس میرزا افکنده شود. در این پژوهش به روی کار آمدن قاجارها و قدرت گیری آقامحمدخان و سپس به سلطنت رسیدن فتحعلی شاه پرداخته شده. همچنین ضمن پرداختن به چگونگی شکل گیری سلطنت قاجارها و روی کار آمدن فتحعلی شاه، تحولات اجتماعی و فرهنگی دوران عباس میرزا مورد نقد و بررسی قرار گرفته است. ضمنا در این رساله سعی شده تا ریشه این حرکت را که به علت وقوع دو جنگ با روسیه تزاری بوده است، تبیین گردد و نیز به روابط عباس میرزا با فتحعلی شاه و انتصاب او به عنوان ولیعهد و فرمانده کل نیروهای مدافع ایران در برابر روسیه پرداخته شده و این که چگونه او به همراه وزاری کاردان و لایق خود یعنی میرزا عیس و ابوالقاسم قائم مقام فراهانی پی برد که با آن وسایل ساده و ابتدایی ارتش ایران در آن زمان قادر نخواهد بود تا در برابر ارتش مجهز روسیه کاری از پیش ببرد و جلوی تجاوزات آنها را به ایران بگیرد مورد نقد و ارزیابی قرار گرفته، در این پژوهش اعتقاد بر این است که به همین منظور وی برای جلوگیری از تصرف سرزمین های ایران در برابر بیگانگان متوجه شد که راهی ندارد جز اینکه به همان وسایل و ابزار ملل متمدن مجهز شود. در نتیجه وی شروع به یکسری اصلاحات در زمینه های مختلف در ایران نمود. از جمله در زمینه چاپ و چاپخانه، انتشار روزنامه، ترجمه کتاب، اعزام محصل به فرنگ، دعوت از خارجیان برای اسکان در ایران و مهمتر از همه اصلاحات در زمینه نظامی نمود. او در این اصلاحات بیش ترین تمرکز خود را به زمینه نظامی معطوف کرد. هر چند عباس میرزا نتوانست در این خصوص توفیق زیادی حاصل نماید، لیکن اقدامات وی زمینه های رشد و بیداری را در ایران فراهم آورد و نام وی را به عنوان آغازگر و سلسله جنبان جنبش اصلاحات در تاریخ معاصر ایران ثبت کرد.

تولید شیر و چربی گاوهای هلشتاین استان خراسان رضوی با استفاده از مدل دام تک صفته، چند صفته و تکرار پذیری برای سه دوره نخست شیردهی آنالیز شد و مولفه های واریانس ، پارامترها و روند ژنتیکی با استفاده از روش reml برای رکوردهای 305 روز برآورد شد. وراثت پذیری صفات تولید شیر و چربی در دوره اول شیردهی با مدل تک صفته 28/0 و 22/0 و با مدل چند صفته 28/0 و 23/0 بدست امد و در دوره های شیردهی بالاتر کاهش پیدا کرد. همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی بین تولید شیر و چربی 84/0 و 78/0 بود. این همبستگی ها بین دوره های شیردهی با افزایش فاصله بین دوره ها کاهش پیدا کرد. وراثت پذیری و تکرار پذیری با استفاده از مدل تکرارپذیری برای صفت تولید شیر 28/0 و 47/0 بود و برای صفت تولید چربی 17/0 و 36/0 به دست آمد. روند ژنتیکی از طریق ضریب رگرسیون میانگین ارزش ارثی گاوها بر سال تولد برای صفات تولید شیر و چربی بدست آمد. روند ژنتیکی برای تولید شیر 12/8 کیلوگرم در سال بدست آمد. این پارامتر برای چربی نزدیک به صفر بود ولی روند محیطی برای این صفت 96/6 کیلوگرم در سال بود.

چکیده کشف تأثیرگذاری رجال تاریخی و چگونگی نقش آنها در ساختن تاریخ هر دوره یکی از راه های مهم مطالعه در تاریخ است. این تحقیق با پیش فرض شناسایی و معرفی رجل تاریخی که در کتاب احسن التواریخ حسن بیگ روملو از آنها نام برده شده شروع می شود. با این پیش فرض و در چهارچوب انتخاب این رجل با عنوان رجال صفوی که حرف اول نام آنها با یکی از حروف الف تا چ آغاز می شود و همچنین رجال غیرصفوی که در آن دوره می زیسته اند و نقشی در رقم خوردن تاریخ صفوی داشته اند، اثر حاضر نگارش شده است. پس از انتخاب رجل بر اساس معیار ذکر شده، و جستجوی زندگی نامه آنها و کشف تمام مطالبی که درباره آنها در هشت منبع اصلی و انتخابی از دوره صفوی وجود داشت، ذیل عنوان نام هر رجل زندگی نامه او در بطن وقایع تاریخی که در آن حضور داشته آورده شده است. آشنایی با تاریخ صفویه از طریق این زندگی نامه ها ما را با جزئیات مفیدی آشنا می کند که معمولاً در تاریخ نگاری های سیاسی نادیده گرفته می شوند. جزئیاتی مانند، ارزش ها و تفاخرهای اجتماعی، نحوه پوشش، نوع غذاها، معماری، تفریحات، پزشکی، نگرش های فکری رایج حتی مضرات اجتماعی یا احیاناً انحطاط های فکری در بین جامعه مورد مطالعه از طریق شناخت و آگاهی از زندگی افراد آن جامعه و نوع روابط انسان ها با یکدیگر از این دست به شمارند. واژگان کلیدی: رجال سیاسی ـ رجال نظامی- دوره صفویه- احسن التواریخ

چکیده در این تحقیق به منظور شناسایی چند شکلی ژن کراتین، سه جایگاه میکروساتلایتی درون یکی از توالی های این ژن (krt2-13) بر روی کروموزوم 3 انتخاب گردید. و پارامتر های ژنتیکی (هتروزیگوسیتی، شاخص شانون، تعداد آلل موثر، تعداد آلل واقعی و تعادل هاردی واینبرگ) در جمعیت گوسفند بلوچی ایستگاه عباس آباد مشهد مورد بررسی قرار گرفتند. و در پایان ارتباط بین ژنوتیپ ها و صفات تولیدی پشم مورد آزمون قرار گرفت. استخراج dna با استفاده از کیت دیاتوم انجام شد. کمیت و کیفیت dna با دو روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز روی ژل انجام شد، سپس قطعات pcr برای جایگاه های ژنتیکی مورد مطالعه با استفاده از واکنش زنجیره پلی مراز(pcr) تکثیر شدند. پس از الکتروفورز و رنگ آمیزی ژل آکریل آمید، باند ها قابل رویت بودند. تکثیر در هر سه جایگاه مورد مطالعه به خوبی انجام گرفت و هر سه جایگاه از چند شکلی مناسبی برخوردار بودند. تعداد آلل ها در جایگاه های bmc1009 ، krt2-13 و oarvh34 به ترتیب برابر با 4 ، 4 و 5 بودند. تنها در جایگاه oarvh34 تعادل هاردی واینبرگ برقرار بود. جایگاه oarvh34 بیشترین و جایگاه bmc1009 کمترین تعداد آلل موثر را داشتند. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار (nie) بر اساس کل جایگاه ها در این جمعیت 6053/0 برآورد گردید. در مجموع می توان نتیجه گرفت که جمعیت گوسفند بلوچی ایستگاه عباس آباد مشهد با توجه به جایگاه های مورد مطالعه از تنوع ژنتیکی نسبتا بالا برخوردار می باشد.

باکتری مایکوباکتریوم آویوم پاراتوبرکلوزیس به عنوان عامل بیماری یون شناخته می شود و همچنین ممکن است در شیوع بیماری کرون در انسان نقش داشته باشد. خسارات اقتصادی سنگین حاصل از این بیماری، موجب پیشرفت سنجش های سریع، حساس و خاصی برای شناسایی حیوانات آلوده گردیده است، که برای طرح ریزی راهبرد های منطقی در کنترل گسترش پاراتوبرکلوزیس ضروری می باشد. ژنوم این باکتری از حدود 5 میلیون جفت باز در یک کروموزوم حلقوی با بیش از 4500 ژن تشکیل شده است و طول متوسط هر ژن در آن 1015 جفت باز می باشد. ژن های بیماریزای مرتبط با این باکتری شامل hspx، f57 و is900 هستند که ما در این تحقیق از توالی درون جایگیر is900برای شناسایی پاراتوبرکلوزیس استفاده کردیم. هدف از این مطالعه، توسعه ی تکنیک pcr real-time برای تعیین کمیت باکتری پاراتوبرکلوزیس در نمونه های مدفوع گاوی بود. نمونه های مدفوع از 40 گاو موجود در 2 گله ی گاوهای شیری تجاری و در موقعیت های متفاوت ایران جمع آوری شدند. قطعه ی 400 جفت بازی با استفاده از آغازگرهای p90 و p91 مخصوص جایگاه ژنی is900 از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز به منظور تشخیص پاراتوبرکلوزیس در نمونه های مدفوع تکثیر شد. 10 نمونه مدفوع توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز مثبت نشان داده شد. قطعه ی 400 جفت بازی تکثیر شده از جایگاه ژنی is900 در داخل ناقل ptz57r/t همسان سازی شد. پلاسمید نوترکیب، استخراج شد و به عنوان dna استاندارد مورد استفاده قرار گرفت. نتایج با استفاده از منحنی استاندارد حاصل از پلاسمید حاوی is900 (98=% (r2 تعیین کمیت شدند. توانایی کمی سازی در این آزمایش در دامنه ی گسترده ی خطی ( 50 تا 5×105 کپی ) برای ارزیابی تعداد کپی های قطعه ی هدف از پاراتوبرکلوزیس در نمونه های مثبت مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان می-دهد که روش real-time pcr می تواند به عنوان روش جایگزین برای تشخیص سریع تر پاراتوبرکلوزیس معرفی شود. کاربرد سودمند این سنجش، توانایی کمیت سنجی دقیق و سریع تعداد سلول های پاراتوبرکلوزیس در نمونه های ناشناخته می باشد.

تغذیه و امنیت غذایی بی شک یکی از مهمترین موضوع های مورد بحث دنیای امروز و سازمان تجارت جهانی است. با توجه به ارتباط مستقیم بین سلامت خوراک دام با سلامت غذای انسان، ضرورت دارد که تولید خوراک دام به عنوان حلقه ای از زنجیره ی تولید غذای انسان مورد توجه قرار گیرد. در این تحقیق پرایمر با طول bp 91 از منطقه 12s rrna میتوکندریایی طراحی و blast گردید و بررسی صحت آن با استفاده از نرم افزار clc انجام گرفت. قطعه ی 91 جفت بازی تکثیر شده از جایگاه ژنی 12s rrna در داخل ناقل ptz57r/t همسان سازی شد و در ادامه پلاسمید نوترکیب استخراج و به عنوان dna استاندارد مورد استفاده قرار گرفت. جهت کمی سازی نمونه ها بصورت درصد تقلب، ساخت استاندارد تقلب با استفاده از مخلوط پودر ماهی خالص و پودر بافت طیور در مقادیر 1، 10 و 20 درصد انجام گرفت. نتایج با استفاده از منحنی استاندارد حاصل از پلاسمید (99=% (r2 تعیین کمیت شدند. توانایی کمی سازی در این آزمایش در دامنه ی گسترده ی خطی ( 500 تا 105×6 کپی ) برای ارزیابی تعداد کپی های قطعه ی هدف از بافت طیور در نمونه های مثبت مورد ارزیابی قرار گرفت. معادله خطی رگرسیون با استفاده از استاندارد تقلب ترسیم گردید و درصد تقلب نمونه ها مشخص شد. نتایج کمیت سنجی نشان می دهد که روش real-time pcr می تواند به عنوان روشی دقیق و سریع بکار گرفته شود. کلید واژه ها: تشخیص کمی، پودر ماهی، بافت طیور، real-time pcr ، mtdna

منوژنیازیس، یکی از شایع ترین آلودگی های ماهی های پرورشی ایران است، که اکثرا بواسطه گونه ها داکتیلوژیروس و ژیروداکتیلوس ایجاد می شود. بیش از شصت گونه داکتیلوژیروس در ماهیان آب شیرین ایران شناسایی شده است. اما به لحاظ اپیدمیولوژیک و تنوع گونه ای در ایران به خوبی شناخته نشده اند و نیاز به انجام مطالعات بیشتر با استفاده از روش های حساس و مولکولی است. در این مطالعه ابتدا با روش مرفولوژی گونه های داکتیلوژیروس ماهی کپور معمولی و کپور علفخوار تشخیص داده شدند و سپس با استفاده از روش pcr بر روی ژن 28s rrna، ابتدا جنس داکتیلوژیروس تشخیص داده شد سپس محصول pcr تعیین توالی گردید و با استفاده از نرم افزار clc work bench توالی ها انالیز و با رجوع به بانک ژنی گونه ها تشخیص داده شدند. نمونه گیری طی زمستان 89 تا شهریور 90تعداد 100 ماهی کپورپرورشی و کپورعلفخوار در نوبت های متفاوت به آزمایشگاه انگل شناسی دانشکده دامپزشکی منتقل گردید. ابتدا گسترش مرطوب از آبشش تهیه و زیر میکروسکوپ بررسی شد، انگل های جدا شده براساس شکل و نحوه قرار گرفتن قلاب ها، قلابچه ها و طول کرم، براساس کلید تشخیصی تشخیص گونه داده شد. گونه های تشخیص داده شده از لحاظ مرفولوژی عبارتند از داکتیلوژیروس اکستنسوس، داکتیلوژیروس انکوراتوس، داکتیلوژیروس لاملاتوس و یک گونه داکتیلوژیروس ناشناس که از لحاظ مرفولوژی تشخیص گونه داده نشد. نتایج مولکولی نیز گونه های داکتیلوژیروس اکستنسوس و داکتیلوژیروس لاملاتوس به طور قطع تایید گردید و گونه انکوراتوس به دلیلی عدم ژن ثبتی در ncbiنیاز به بررسی بیشتری دارد، گونه ای که از لحاظ مرفولوژی تشخیص داده نشد که از لحاظ نوکلئوتیدی 92 درصد به داکتیلوژیروس کریپتومرس شبیه بود که نیاز به بررسی ها بیشتری دارد. ترسیم درخت فیلوژنی بین گونه ای نیز نشان داد که گونه ای داکتیلوژیروس لاملاتوس و داکتیلوژیروس اکستنسوس جدا شده از ماهیان با سایر گونه های مشابه در دنیا قرابت ژنی نزدیکی دارند، نمونه های که از لحاظ مرفولوژی داکتیلوژیروس انکوراتوس تشخیص داده شدند در یک کلاستر جداگانه قرار گرفتند. دو نمونه دیگر تقریبا با فاصله ژنی نسبی با داکتیلوژیروس کریپتومرس در کلاستر جداگانه قرار دارد که نیاز به بررسی بیشتر دارد. تاکسونمی با استفاده از روش های بیولوژی مولکولی تعداد گونه ها را نسبت به تاکسونمی بر پایه مرفولوژی افزایش خواهد داد . تجزیه و تحلیل فیلوژنی با استفاده از درخت فیلوژنی (nj) در این مطالعه نشان می دهد کاراکترهای مورفولوژیک به همراه شناسایی مولکولی برای تایید تشخیص گونه ها ضروری می باشد.

هدف اصلی این تحقیق بهینه سازی روش real-time pcr نسبی مبتنی بر سایبرگرین جهت اندازه گیری بیان ژن های ifn-? و tgf?1 در خوکچه های هندی واکسینه شده با واکسن تب برفکی تیپ o بود. برای این مطالعه، نمونه های خون از دو گروه خوکچه هندی واکسینه شده و شاهد در سه زمان متفاوت و مشخص گرفته شد. پس از انجام خونگیری، استخراج rna و تبدیل آن به cdna صورت گرفت. به منظور اندازه-گیری میزان بیان ژن‏های ifn-? و tgf?1از روش real-time pcr به صورت نسبی استفاده شد. سپس داده های خام به صورت ct از دستگاه گرفته و برای تعیین بیان ژن ها از فرمول لیواک استفاده شد. بررسی آماری داده ‏ها توسط برنامه excel و آزمون t استیودنت در سطح 5% (p<0.05) انجام شد. نتایج نشان داد بیان ژن های ifn-? و tgf?1 در خونگیری های دوم و سوم نسبت به خونگیری اول، به طور معنی داری (p<0.05) افزایش یافت.

این مطالعه با هدف همسانه سازی و بیان پروتئین های ساختاری p1 و غیر ساختاری 3c ویروس تب برفکی سروتیپ o جدا شده از استان خراسان رضوی در مخمر پیشیا پاستوریس و ارزیابی پاسخ ایمنی آن ها در خوکچه هندی، انجام گرفت. ژن های پروتئین های ساختاری p1 و غیر ساختاری 3c این ویروس تکثیر و تعیین توالی شدند و توالی های به دست آمده با توالی سایر سویه های سروتیپ o و سویه های سروتیپ های این ویروس از نظر فیلوژنتیکی مقایسه شدند. نتایج آنالیز تعیین توالی و فیلوژنتیکی نشان دادند که ژن p1 بیشترین شباهت نوکلئوتیدی و اسید آمنیه ی را با سویه سروتیپ o پاکستان pak/39/2008 به ترتیب (%93 /94) و (37/98%) داشت. ژن 3c بیشترین میزان شباهت توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه ی را با دو سویه سروتیپ a هندوستان aind288/07 و aind 287/96 به ترتیب با 74/93 و 100 درصد داشت. این نتایج نشان می دهند که ویروس شیوع یافته در ایران در سال 1389 ممکن است از کشورهای همسایه شرقی به ایران وارد شده باشد. در این تحقیق ژن p1-2a و 3c با دنباله های چسبان kpniو xbai توسط pcr تکثیر شدند و ژن p1-2a درون ناقل ptz57r/t الحاق و به باکتری dh5? انتقال داده شد. پس از تائید صحت همسانه سازی به روش هضم آنزیمی و pcr، ژن p1-2a و 3c به درون ناقل بیانی ppicz-b مخمر الحاق و به باکتری dh5? جهت تکثیر انتقال داده شدند. ناقل های بیانی ppicz-bp1-2a و ppicz-b3c پس از غربالگری و تائید صحت همسانه سازی به روش هضم آنزیمی و توالی یابی با آنزیم pmei خطی شده و با روش الکتروپوریشن به مخمر پیشیا پاستوریس انتقال داده شدند. مخمر پیشیا پاستوریس نوترکیب در محیط mmh کشت داده و با متانول بیان پروتئین های مورد نظر القاء شد. بیان پروتئین های p1-2a و 3c به روش لکه گذاری، sds-page و وسترن بلات تایید گردید. پروتئین های تولید شده از مخمر استخراج و با کمک ستون کروماتوگرافی میل ترکیبی ni-nta خالص سازی شد ند و به عنوان آنتی ژن تحریک کننده سیستم ایمنی به خوکچه های هندی تزریق شدند. نتایج این پژوهش نشان داد که ژن p1-2a در ناقل ptz57r/t و ناقل بیانی ppicz-b و ژن 3c در ناقل بیانی ppicz-b به درستی همسانه شده اند. ورود ژن های p1-2a و3c به داخل ژنوم مخمر پیشیا پاستوریس با روش نوترکیبی همولوگ با استخراج dna ژنومی مخمر و انجام pcr تائید شد. بیان پروتئین های p1-2a و 3c در مخمر به روش وسترن بلات با مشاهده باند اختصاصی پروتئین هدف کاملا تایید شدند. غلظت پروتئین های نوترکیب p1-2a و 3c با روش برادفورد به ترتیب، 100 و 40 میکروگرم در میلی لیتر اندازه گیری شدند. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که نوع پروتئین نوترکیب در تحریک سیستم ایمنی در برابر ویروس تب برفکی در سطح 05/0 معنی دار بود. ولی اثر افزودن یاور در تحریک سیستم ایمنی معنی دار نبود (p>0.05). بین دو تیمار p1-2a و p1-2a3c همراه با یاور در تحریک سیستم ایمنی تفاوت معنی داری مشاهده نشد. به طور کلی می توان گفت که در این تحقیق ژن های p1-2a و 3c با موفقیت در مخمر پیشیا پاستوریس تکثیر، همسانه و بیان شدند و پروتئین های تولید شده قادر به تحریک سیستم ایمنی و تولید آنتی بادی علیه ویروس تب برفکی سروتیپ o می باشند.

بیماری تب برفکی یکی از بیماری های ویروسی و به شدت مسری در بین حیوانات اهلی بخصوص زوج سمان می باشد که هر ساله خسارات اقتصادی فراوانی به صنعت دامپروری کشور وارد می کند. این بیماری در کشور ایران از طریق واکسیناسیون و قرنطینه حیوانات بیمار کنترل می شود. به منظور کنترل مناسب و موثر شیوع بیماری تب برفکی، تست های تشخیصی مختلفی که قادر به شناسایی حیوانات آلوده از واکسینه شده هستند، توسعه یافته اند. در حال حاضر تشخیص آنتی بادی های پروتئین-های غیرساختاری به ویژه پلی پپتید غیرساختاری 3ab مطمئن ترین روش برای تشخیص حیوانات آلوده از واکسینه می باشد. هدف از انجام این پژوهش تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن کد کننده ناحیه 3ab ویروس بیماری تب برفکی به منظور استفاده از آن برای تولید کیت های تشخیصی در تحقیقات آینده می باشد. در این مطالعه، سروتایپ o ویروس بیماری تب برفکی از موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شعبه شمال شرق تهیه گردید. این ویروس در سال 2010 از نمونه های دام مشکوک به بیماری تب برفکی در استان خراسان رضوی جدا شد و توسط آزمایش های ساندویج الایزای غیرمستقیم و rt-pcr مورد تشخیص قرار گرفت و سروتایپ آن تعیین گردید. rna ویروسی از ویروس تخلیص گردید و واکنشrt-pcr با هدف جداسازی و تکثیر قطعه 672 جفت بازی ناحیه ژنی 3ab انجام پذیرفت. محصول pcr خالص سازی شد و در داخل وکتور ptz57r/t کلون گردید. پلاسمیدهای حاوی قطعه ژنی مورد نظر، تخلیص شدند و با استفاده از روش های کلونی pcr و joined pcr مورد تأیید قرار گرفتند.

فیتات منبع عمده تأمین فسفر در جیره حیوانات مزرعه ای می باشد. این ترکیب دسترسی زیستی به مواد معدنی، پروتئین ها و کربوهیدرات ها را کاهش می دهد. آنزیم فیتاز با تجزیه فیتات، باعث کاهش اثر ضد تغذیه ای آن می شود. میکروارگانیسم ها بهترین منبع تولید تجاری این آنزیم محسوب می شوند. فیتاز تولید شده توسط باسیلوس سابتیلیس برای استفاده در صنعت مناسب می باشد. در این مطالعه به منظور همسانه سازی و بررسی امکان تولید فیتاز نوترکیب، ژن فیتاز با استفاده از آغازگرهای لینکردار طراحی شده از باکتری باسیلوس سابتیلیس ptcc 1156، جداسازی شد. پس از انجام واکنش pcr، ژن فیتاز با روش همسانه سازی ta در وکتور ptz57r/t کلون شد و جهت تأیید صحت، مورد توالی یابی قرار گرفت. نتایج توالی یابی صحت انجام همسانه سازی را نشان داد. توالی به دست آمده پس از ویرایش با شماره دسترسی jn886002 در ncbi ثبت شد. به منظور استخراج ژن فیتاز و همسانه سازی در وکتور بیان pet-32a(+)، پلاسمید نوترکیب و وکتور با آنزیم های برشی (bamhi و hindiii) مورد هضم قرار گرفتند. در نهایت، پس از انجام واکنش اتصال، پلاسمید حاصل به باکتری اشرشیاکلی bl21(de3) منتقل و ساختاری حاصل شد که ممکن است پس از القای بیان با القاگر مناسب قادر به تولید آنزیم فیتاز نوترکیب باشد.

به منظور ارزیابی مکمل سازی منابع روغن گیاهی (روغن کانولا، سویا) و پیه به همراه ضداکسیدان های آلی پودر زردچوبه و تفاله گوجه فرنگی در جوجه های گوشتی تحت تنش گرمایی تعداد 6 آزمایش انجام گرفت. در آزمایشات اول و دوم که در قالب آزمایشات فاکتوریل 3*3 طرح کاملاً تصادفی انجام شد در آزمایش اول، اختلاف معنی داری در وزن بدنی، مصرف خوراک، ضریب تبدیل، راندمان مصرف انرژی، پروتئین، شاخص تولید و پاسخ ایمنی جوجه های تغذیه شده با روغن های کانولا، سویا و پیه و سطوح پودر زردچوبه مشاهده نشد بجز در 28 روزگی که شاخص تولید و وزن بدنی در گروه تغذیه شده با روغن کانولا بالاتر بود. پودر زردچوبه و روغن کانولا، وزن نسبی طحال و بورس را افزایش و چربی بطنی و کبد را کاهش دادند فراسنجه های ظاهری استخوان و درصد کلسیم استخوان در گروه کانولا و زردچوبه بالاتر بود. در آزمایش دوم روغن کانولا و زردچوبه کلسترول خون را کاهش دادند و زردچوبه باعث افزایش hdl شد. فراسنجه های خونی شامل شمارش سلولی و درصد هماتوکریت تحت تأثیر قرار نگرفت اما نسبت هتروفیل به لمفوسیت در جوجه های تحت تنش تغذیه شده با زردچوبه کاهش یافت. نوع روغن تأثیری بر فعالیت آنزیم های alp، ast، alt، ck، ldh و لیپاز نداشت. پودر زردچوبه فعالیت آنزیم های alp، ast، alt، ck، و لیپاز را کاهش داد. روغن کانولا باعث افزایش فعالیت gpx و زردچوبه باعث افزایش فعالیت sod و gpx گردید. پودر زردچوبه شاخص tbars را نیز کاهش داد. آزمایشات سوم و چهارم نیز در قالب طرح کاملاً تصادفی با آزمایشات فاکتوریل 3*3 انجام شد. در آزمایش سوم نوع روغن و سطح تفاله گوجه تأثیری بر عملکرد، شاخص تولید، راندمان مصرف انرژی، پروتئین و پاسخ ایمنی جوجه های تحت تنش گرمایی نگذاشت. روغن کانولا وزن نسبی کبد و چربی بطنی و تفاله گوجه وزن نسبی چربی بطنی را کاهش داد و وزن نسبی طحال و بورس در روغن کانولا و تفاله گوجه افزایش یافت. روغن کانولا و تفاله گوجه باعث بهبود شاخص های ظاهری استخوان شدند در آزمایش چهارم روغن کانولا و تفاله گوجه میزان کلسترول و ldl را کاهش و hdl را افزایش داد. فعالیت آنزیم-هایalp، ast و ldh در جوجه های تغذیه شده با روغن کانولا کاهش یافت. تفاله گوجه نیز فعالیت آنزیم های alp، ast، alt و ck را کاهش داد. فعالیت gpx و شاخص tbars در پیه کمتر بود تفاله گوجه باعث بهبود فعالیت sod، gpx و کاهش tbars گردید تفاله گوجه h:l را کاهش داد. آزمایشات پنجم و ششم نیز در قالب طرح کاملاً تصادفی با آزمایشات فاکتوریل 2*2*3 انجام گرفت. در آزمایش پنجم روغن کانولا وزن بدنی، شاخص تولید و راندمان مصرف انرژی و پروتئین را بهبود بخشید ولی سطح پودر زردچوبه و تفاله گوجه تأثیری بر عملکرد، راندمان مصرف انرژی و پروتئین نداشت. پاسخ ایمنی و وزن نسبی اندام های لمفاوی بورس و طحال در جوجه های تغذیه شده با روغن کانولا، زردچوبه و تفاله گوجه بالاتر بود. روغن کانولا، پودر زردچوبه و تفاله گوجه درصد چربی بطنی را کاهش دادند. روغن کانولا و زردچوبه باعث بهبود فراسنجه های استخوانی شدند ولی تفاله گوجه تأثیری نداشت همچنین روغن کانولا باعث بهبود ارتفاع پرز و عمق کریپت و کاهش عرض پرز شد ولی پودر زردچوبه و تفاله گوجه تأثیر معنی داری نداشتند. عمق کریپت تحت تأثیر اثرات متقابل روغن، گوجه و زردچوبه قرار گرفت. در آزمایش ششم روغن های کانولا و سویا کلسترول و ldl را کاهش و hdl را افزایش دادند. زردچوبه نیز ldl را کاهش و hdl را افزایش و تفاله بر هیچ کدام اثر نگذاشت. نوع روغن، زردچوبه و تفاله تأثیری بر پروتئین تام و گلوکز خون نداشت. روغن کانولا درصد هموگلوبین و هماتوکریت را افزایش داد. روغن کانولا، زردچوبه و تفاله گوجه نسبت h:l را کاهش دادند فعالیت آنزیم های alp، ast و alt در روغن کانولا و تفاله گوجه کاهش یافت ولی از زردچوبه تأثیر نپذیرفتند. روغن کانولا و زردچوبه فعالیت gpx را افزایش و tbars را کاهش دادند. کلید واژه ها: روغن، زردچوبه، تفاله گوجه، عملکرد، ایمنی و فراسنجه های ضداکسیدانی

فیتازها(مایواینزیتول هگزا فسفات فسفوهیدرولاز) آنزیم های هستند که اسید فایتیک را هیدرولیز و فسفر معدنی را برای حیوانات قابل دسترس می کنند.تولید طبیعی و نوترکیب این آنزیم ازجمله مسائل مهم حوزه مهندسی ژنتیک محسوب می گردد. در این پروژه، ژن فیتاز خارج سلولی باکتری باسیلوس سابتیلیسatcc12711(phyc) با استفاده از پرایمرهای لینکردار حاوی سایت های برشی bamhi و hind iii جداسازی شد. به منظور انجام توالی یابی و بررسی خصوصیات، ژن تکثیر شده phyc به ناقل ptz57r/tمنتقل و سپس به باکتری اشرشیاکلیdh5? انتقال داده شد. غربالگری کلونی آبی و سفید با استفاده از iptg و x-galبه منظور انتخاب کلونی های نوترکیب انجام گردید و کلونی های حاوی ژن هدف با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و روش کلونی pcr انتخاب شدند. آنالیز و بررسی همولوژی ژن هدف با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک صورت گرفت. هضم آنزیمی وکتور کلونینگ با استفاده از آنزیم های محدودکننده ذکر شده صورت گرفت. ژن هدف به ناقل بیانی pet32a(+) به منظور بیان ژن وارد شد. ناقل نوترکیب به سویه اشرشیاکلیbl21 (de3) انتقال و حضور ناقل نوترکیب با استفاده از کلونی pcr تایید گردید. سپس سویه بیانی حاوی ژن هدف با استفاده از iptg در غلظت نهایی 1 مولار در حضور cacl2 10 میلی مولار تحریک شد. نتایج استخراج پروتئین در sds-page الکتروفورز شده و اندازه پروتئین فیتاز تولید شدهkd 64 تخمین زده شد. همچنین نتیجه دات بلات صحت تولید پروتئین فیتاز را تایید می نماید. اندازه گیری فعالیت آنزیمی با استفاده از روش استاندارد فسفاتاز نشان داد که آنزیم نوترکیب تولید شده در این تحقیق، در 7ph= بیشترین فعالیت را دارا می باشد. فعالیت آنزیم اندازه گیری شده برابر با u/ml 44/7 بود که وابسته به حضور یون کلسیم می باشد. تحقیقات نشان می دهد که این آنزیم به جهت مقاومت حرارتی و هزینه تولید پایین،قابلیت بالای برای استفاده در صنعت مواد افزودنی و دارویی دارد.

این مطالعه با هدف همسانه سازی و بیان آنتی ژن سطحی ncsrs2 از انگل نئوسپورا کانینوم در دو سامانه بیانی پروکاریوتی و یوکاریوتی انجام گرفت. پس از تکثیر جایگاه ژنی ncsrs2 و تعیین توالی آن با استفاده از روش ta cloning درناقل ptz57r/t، توالی به دست آمده با توالی سایر سویه های نئوسپورا کانینوم از نظر فیلوژنتیکی مقایسه شدند. نتیجه توالی یابی تحت شماره دسترسی jq410454 دربانک جهانی ژن ثبت شد. آنالیز توالی ژن ncsrs2 بین 98 تا 100 درصد همسانی با توالی های ثبت شده نئوسپورا کانینوم نشان داد. جهت همسانه سازی در باکتری، جایگاه ژنی ncsrs2 با آغازگرهای دارای سایت برشی آنزیم های ecori و sali تکثیر شد و به درون ناقل بیانی pet32a (+) الحاق گردید و پلاسمید نوترکیب حاصل (pet32-ncsrs2) ابتدا جهت تکثیر به باکتری اشرشیا کلی سویه dh5? و سپس جهت بیان پروتئین نوترکیب به باکتری اشرشیا کلی سویه bl21(de3) انتقال داده شد. القای بیان با استفاده از iptg انجام شد. برای همسانه سازی در مخمر pichia pastoris، از آغازگرهای دارای سایت برشی آنزیم های kpni و xbai جهت تکثیر جایگاه ژنی ncsrs2 استفاده شد و فرآورده pcr به درون ناقل بیانی ppicz-b الحاق گردید. پلاسمید نوترکیب حاصل (ppiczb-ncsrs2) به باکتری اشرشیا کلی سویه dh5? انتقال داده شد. پس از غربالگری و تائید صحت همسانه سازی، پلاسمید ppiczb-ncsrs2 با آنزیم pmei خطی شد و با روش الکتروپوریشن به مخمر انتقال داده شد. مخمر نوترکیب در محیط mmh کشت داده شد و بیان پروتئین به کمک متانول تحریک شد. وضعیت بیان پروتئین ncsrs2 در هر دو سامانه بیانی به روش های sds-page، دات بلات و وسترن بلات بررسی گردید. پروتئین های تولید شده استخراج و خالص سازی شدند و فعالیت آنها در محیط آزمایشگاه با آزمون الایزای غیرمستقیم بررسی شد. نتایج این پژوهش نشان داد که ژن ncsrs2 در ناقلین pet32a (+) (باکتری) و ppicz-b (مخمر) به درستی همسانه شده است. ورود ژن ncsrs2 به باکتری bl21(de3) به روش-های کلنی pcr و هضم آنزیمی تأیید شد. ورود ژن ncsrs2 به داخل ژنوم مخمر پیشیا پاستوریس با روش نوترکیبی همولوگ با استخراج dna ژنومی مخمر و انجام pcr تائید شد. بیان پروتئین ncsrs2 در باکتری و مخمر به روش وسترن بلات با مشاهده باند اختصاصی پروتئین هدف تأیید شد. با توجه به انجام واکنش بین پروتئین های تولید شده در این سامانه های بیانی و آنتی بادی اختصاصی نئوسپورا کانینوم در محیط آزمایشگاه می توان گفت احتمالاً این پروتئین ها توانایی ایجاد ایمنی حفاظتی علیه انگل نئوسپورا کانینوم را خواهند داشت. به طور کلی می توان گفت که در این تحقیق ژن ncsrs2 با موفقیت در سامانه-های بیانی پروکاریوتی و یوکاریوتی همسانه و بیان شد به نحوی که پروتئین های تولید شده احتمالاً قادر به تحریک سیستم ایمنی علیه انگل نئوسپورا کانینوم و پیشگیری از انتقال آلودگی می باشند.

تشکیلات دیوانسالاری ایران در عهد حاکمیت مغول ها دستخوش دگرگونی های قابل توجهی گردید. تسلط مغول ها و تاسیس سلسله ایلخانی منجر به ورود سنت ها و عناصر دیوانی تازه ای شد که از ختاییان و همچنین یاسای چنگیزخان، اقتباس شده بود. این عوامل جدید به واسطه حاکمیت سیاسی مغول ها،بر تشکیلات دیوانی ایران تاثیر بسزایی گذاشت. هدف اصلی این پژوهش بررسی مبانی شکل گیری و احیاء دیوانسالاری ایرانی و شناخت دگرگونی های ایجاد شده در راس تشکیلات دیوانسالاری ایران در دوره مغول و حکومت ایلخانی است و تلاش می کند تا عناصر جدید را در ترکیب با میراث کهن دیوانسالاری ایرانی مورد بررسی قرار دهد. این تحقیق از طریق بررسی ساختار تشکیلات دیوانی، نحوه انتصاب، میزان اختیارات، حوزه نفوذ و تعامل مقام های بلندپایه دیوانی با ایلخان و امرای برجسته مغول تلاش می کند تا به شناخت تحولات اداری عهد ایلخانان دست یابد. تحولات تشکیلات دیوانی ایران در عهد ایلخانان به ویژه در حوزه اختیارات وزیر که در این دوره عمدتاً صاحب دیوان خوانده می شود، منعکس شده و بخش عظیمی از این پژوهش به بررسی نقش، موقعیت و اختیارات این مقام در دوره ایلخانان اختصاص یافته است. نتایج این پژوهش نشان خواهد داد که الگوهای ختایی و محتوای یاسا و نیز نوع نگاه ایلخانان به موضوع قدرت و حکمرانی، مهمترین عوامل تاثیر گذار در تشکیلات دیوانی ایران در عهد ایلخانان است و چنین به نظر می رسد که با بررسی روند رویدادهای این دوره، میزان و نحوه تاثیر گذاری عوامل اخیر از یک سو و عناصر بومی دیوانسالاری ایرانی دارای یک سیر و روند مشخص و یکسانی نبوده و در مجموع نشان داده خواهد شد که این روند دارای فراز و نشیب های قابل توجهی متاثر از عوامل سیاسی، بحران در روابط ایلخانان با مملوکان و الوس جوچی و سرانجام گرایش مغول ها به فرهنگ و دین ایرانیان بوده است.

هدف از انجام این مطالعه توالی یابی و بررسی سازماندهی ژن هورمون رشد (gh) و ناحیه پروموتور آن و همچنین بررسی تفاوت های تک نوکلئوتیدی (snps) ممکن این ژن در دوگونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران بود. تعداد 10 عدد نمونه خون شتر نر و ماده تک کوهانه از کشتارگاهی در یزد، همچنین تعداد 6 عدد نمونه خون شتر های نر و ماده دو کوهانه از ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان اردبیل واقع در روستای جهاد آباد و همچنین یک عدد نمونه خون شتر دو کوهانه از باغ وحش مشهد تهیه گردید. پس از عمل استخراج dna واکنش pcr برای هریک از نمونه ها توسط پرایمرهای اختصاصی انجام شد و عمل توالی یابی با استفاده از محصولات pcr انجام شد. توالی های مورد توافق برای هریک از شترهای تک کوهانه و دوکوهانه بدست آمد. با استفاده از همین توالی های مورد توافق ترکیب نوکلئوتیدی، بررسی های فییلوژنتیکی و سایر بررسی ها انجام شد. همانند سایر پستانداران، ژن هورمون رشد در شتر دارای 5 اگزون است که توسط 4 اینترون از هم جدا شده اند. بر اساس مقایسه توالی های بدست آمده در مطالعه با توالی ثبت شده در ncbi مشخص شد که توالی ژن هورمون رشد شتر تک کوهانه کاملاً با توالی ثبت شده در ncbi مشابه می باشد. در مرحله بعد بیشترین شباهت را مربوط به lama pacos و lama glama بود که به ترتیب 93/92% و 53/92% بود. همچنین توالی بدست آمده ژن هورمون رشد شتر دوکوهانه بیشترین شباهت را با توالی این ژن در شتر تک کوهانه داشت که 52/99% بود. بعد از آن بعد بیشترین شباهت را مربوط به lama pacos و lama glama بود که به ترتیب 93/92% و 53/92% بود. در ناحیه پروموتور توالی جعبه tata یک جهش را نشان داد و به ctat تبدیل شده بود. مشابه همین حالت در لاما (lama glama) نیز مشاهده شده است. توالی یابی10 نمونه مختلف ژن هورمون رشد از شتر تک کوهانه و 7 نمونه مختلف از شتر دوکوهانه به ما این اجازه را داد که تعدای تفاوت تک نوکلئوتیدی را در این ژن شناسایی کنیم. بررسی ها دو نوع هاپلوتایپ را در شتر های تک کوهانه نشان داد. همچنین مقایسه توالی های مورد توافق شتر تک کوهانه و دو کوهانه 9 اختلاف تک نوکلئوتیدی را بین این دو گونه مشخص کرد.

نهاد ها، سازمان ها و ساختار اداری هر جامعه از جمله آثار حیات اجتماعی و تمدنی آن جامعه محسوب می شوند؛ لذا تغییر و تحول این ساختار ها و سازمان ها از موضوعات اساسی در بررسی سوابق تاریخی و فرهنگی هر جامعه است. در این میان ساختار اداری ایران اگرچه در دوره های تاریخی در ظاهر از ویژگی ها و کارکردهای مشابهی برخوردار بوده است، اما بررسی ها نشان می دهد سازمان های اداری در دوره های گوناگون و حکومت های مختلف تفاوت هایی داشته اند. نظام اداری دوره قاجاریه که بخشی از آن در این پژوهش مورد کنکاش قرارگرفته است نیز از ابتدا تا پایان شاهد تغییرات و دگرگونی های فراوان بوده است. تشکیلات حکومت قاجار بخصوص در زمان ناصرالدین شاه انسجام، سازمان دهی و توسعه فراوان یافت لذا این دوره از نظر تعدد تشکیلات و تغییرات حائز اهمیت زیادی است. بخشی از این تشکیلات معطوف به مناصب و مقامات اداری است. بر این اساس هدف بررسی حاضر شناسایی مقامات و مناصب اداری ایران در دوره پادشاهی ناصرالدین شاه و مظفرالدین شاه قاجار در حوزه های دربار ، دیوان و تشکیلات ایالات و ولایات و به منظور شناخت مهمترین ویژگی های ساختار اداری وعوامل موثر در تغییرات ساختار اداری ایران در این دوره است. همچون گذشته، موروثی بودن برخی مناصب، انحصار برخی مناصب برای شاهزادگان قاجاری و نیز در میان خانواده های معتبر وابسته به دربار قاجار، گسترش پدیده چند منصبی بودن رجال عهد قاجار، و همچنین تغییرات تقریبا مداوم در سطوح بالای تشکیلات اداری به خصوص در وزارتخانه ها،ایجاد مناصب جدید و یا حذف برخی مناصب به دنبال تشکیل وزارتخانه های جدید و تاثیر پذیری از تشکیلات اداری دول اروپایی،کاهش اعتبار و اختیار برخی مناصب از جمله ویژگی های ساختار اداری ایران در حوزه مناصب اداری این دوره است. توسعه روابط خارجی، تاسیس سفارت خانه های متعدد در ایران و متعاقباً تاسیس سفارت خانه های ایران در کشورهای همسایه، حضور مستشاران نظامی دول اروپایی در ایران، مسافرتهای متعدد شاه قاجار و رجال سیاسی ایران به فرنگ و اعزام دانشجویان ایرانی جهت کسب علوم و فنون جدید به اروپا و افزایش اطلاعات صاحب منصبان ایرانی از تشکیلات کشورهای اروپایی، از مهمترین عوامل تاثیرگذار بر ساختار اداری کشور در دوره ناصری و مظفری در حوزه مناصب اداری بوده است.

کشمش میوه خشک شده انگور است که به صورت خام یا به عنوان یکی از اجزای تشکیل دهنده مواد غذایی در محصولاتی نظیر فراورده های نانوایی و نوشیدنی ها استفاده می شود. ایران یکی از صادرکنندگان اصلی کشمش در سال های اخیر محسوب می گردد، ازاین رو اطمینان از کیفیت میکروبی و ایمنی این محصول از اهمیت زیادی برخوردار است. یکی از مهم ترین نگرانی ها در زمینه ایمنی این محصول، حضور قارچ های تولید کننده توکسین می باشد. به منظور جداسازی و شمارش فلور قارچی ارقام عمده کشمش (پلویی، پیکامی و تیفی) در خراسان رضوی از چهار محیط کشت ygc، pda، cz و dg18 استفاده گردید. نتایج آماری نشان داد که آلودگی قارچی نمونه های کشمش تیفی بیش-تر از دیگر نمونه ها بود. همچنین روش خشک کردن تأثیر معنی داری در میزان آلودگی قارچی نداشت. پس از خالص?سازی ایزوله ?های جدا شده، شناسایی اولیه جدایه?های حاصل به روش ماکروسکوپی و میکروسکوپی انجام پذیرفت. بر اساس نتایج به دست آمده جنس? های aspergillus و penicillium به ترتیب فراوان?ترین قارچ?های جدا شده از نمونه?های کشمش بودند. به منظور شناسایی جدایه ها در حد گونه، قطعه bp 600 از ناحیهinternal transcribed spacer 5.8srrna کپک ها به روش واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر شد. براساس نتایج به دست آمده، نمونه های کشمش حاوی گونه های مختلفی از جنس های aspergillus، penicillium، rhizomucor، mucor، alternaria و cladosporium بودند که در این میان aspergillus niger بیشترین درصد فراوانی را به خود اختصاص داد. ارزیابی ایزوله های قارچی جدا شده از نمونه های کشمش با استفاده از روش مولکولی pcr به منظور شناسایی قارچ های مولّد اکراتوکسین و آفلاتوکسین نشان داد که از بین 50 ایزوله قارچی جدا شده از نمونه های کشمش در محیط کشت pda، 6 جدایه تولید کننده اکراتوکسین و 2 جدایه تولید کننده آفلاتوکسین بودند. همچنین 45 نمونه کشمش (پلویی، پیکامی و تیفی) به لحاظ حضور dna قارچ های تولید کننده اکراتوکسین و آفلاتوکسین و نیز بیان این ژن ها (به روش های pcr و reverse transcription-pcr) مورد بررسی قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده تنها نمونه های کشمش تیفی (15 نمونه) آلوده به dna قارچ های مولّد سم اکراتوکسین بودند. این در حالی است که در هیچ یک از نمونه های کشمش، dna قارچ مولّد آفلاتوکسین مشاهده نشد. بررسی بیان ژن مولّد اکراتوکسین با استفاده از روش reverse transcription-pcr در نمونه های کشمش تیفی نشان داد که از مجموع 15 نمونه کشمش تیفی، در 11 نمونه ژن دخیل در مسیر بیوسنتز اکراتوکسین در سطح mrna بیان شد. همچنین مطالعه کمّی بیان ژن های مسیر بیوسنتز اکراتوکسین و آفلاتوکسین قارچی بر پایه روش مولکولی real-time pcr مطلق و اندازه گیری میزان سموم اکراتوکسین و آفلاتوکسین به روش hplc، نشان داد که همبستگی مثبتی بین تعداد کپی cdna حاصل از نسخه برداری از ژن های مسیر بیوسنتز اکراتوکسین (782/0=r2) و آفلاتوکسین (870/0=r2) با غلظت توکسین تولید شده وجود داشت.

شناسایی ژن های میکرو آر ان ای از اهمیت ویژه ای برخوردار است. توسعه روش های محاسباتی و متعاقبا صرفه جویی در هزینه و زمان پژوهش های آزمایشگاهی، تاثیر بسزایی در افزایش سرعت و دقت شناسایی آنها دارد. با توجه به اینکه زمان کمی از شناخت میکرو آر ان ای ها می گذرد، در ابتدا روند پژوهش ها کند بود، اما به مرور با شکل گیری پایگاه های اطلاعاتی بیولوژیکی و درک اهمیت آنها دانشمندان به مطالعات گسترده در این زمینه پرداختند. تاکنون روش های مختلفی با در نظر گرفتن ویژگی های متفاوت از جمله ویژگی های ساختاری، موقعیتی و ترمودینامیکی بر روی گونه های مختلف از جمله انسان، موش و حتی گونه های گیاهی ارائه شده است. با این وجود، مدل های هوشمند برای گونه های نشخوارکنندگان وجود ندارد یا بطور سطحی مطالعه شده اند. در این مطالعه نقش انواع دسته بندی کننده های هوشمند در پیش بینی ژن های میکرو آر ان ای ها برای گاو و گوسفند مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا بر روی سه دسته ویژگی ساختاری، موقعیتی و ترمودینامیکی تمرکز و ویژگی های برتر با استفاده از تحلیل مولفه های اصلی انتخاب گردید. سپس داده ها با استفاده از دسته بندی های گوناگون مورد مطالعه قرار گرفتند. در مجموع ماشین بردار پشتیبان با کرنل rbf و الگوریتم یادگیری smo بهترین دسته بندی کننده برای ژن های میکرو آر ان ای در نشخوارکنندگان معرفی گردید. سپس نرم افزار شناسایی ژن های pre-mirna طراحی و پیاده سازی شد. با استفاده از این نرم افزار در مجموع 18776 pre-mirna شناسایی گردید. در ادامه تحقیق به منظور دست یابی به میکرو آر ان ای های بالغ از آنالیزهای مجازی بهره گرفته شد. در نهایت به ترتیب در گاو و گوسفند 25 و 28 میکرو آر ان ای بالغ گزارش گردید. با توجه به محدودیت مالی پروژه 3 میکرو آر ان ای بالغ جدید در گوسفند بر اساس روش rt-pcr تایید و به منظور بررسی عمومی حضور میکرو آر ان ای ها در گاو و گوسفند از real-time pcr استفاده و حضور دو میکرو آر ان ای مورد تایید قرار گرفت.

یکی از موضوعات اصلی نسخ و کتب خطی زندگی نامه ها است ، که بخشی از این زندگی نامه ها به افراد مذهبی اختصاص دارد که یکی از آن ها حضرت عبدالعظیم (ع) است . کتبی که در شرح زندگی حضرت عبدالعظیم نگاشته شده اند عبارتند از : رساله صاحب بن عباد به نام رساله فی فضل عبدالعظیم ، منتقلهالطالبیه تألیف ابواسماعیل ابراهیم بن عبدالله ، نسب نامه حضرت عبدالعظیم اثر احمد عمله خزانه دار ، امام زادگان شهر ری اثر محمد صادق حسین طباطبایی ، سرگذشت پیامبر (ص) و امامان و امام زادگان از محمد علی بیگ وردی ترکمان و آثاری که از علیقلی میرزا اعتضادالسلطنه باقی مانده است که عبارتند از : شرح حال امام زادگان ری ، جُنگ علیقلی میرزا ، شرح حسب و نسب حضرت عبدالعظیم و گزارش ری و نسخه ای که در این جا به تصحیح آن پرداخته شده شرح حال حضرت عبدالعظیم است . این نسخه در 55 برگ و 110 صفحه تنظیم شده است که قسمت عمده مطالب کتاب در باره زندگی حضرت عبدالعظیم است و دو بخش دیگر آن که حجم کم تری را در بر می گیرد شامل زندگی نامه امام زاده عبدالله و امام زاده حمزه است . این نسخه در سال 1296 ق . کتابت شد . مولف کتاب اعتضادالسلطنه و کاتب آن مسیح کمره است . اعتضاد السلطنه یکی از پسران فتحعلی شاه که اهل علم و ادب بود و آثاری از خود به جا گذاشت . او در طول زندگی خود پست های مهمی داشت که از جمله آن ها وزارت علوم و معارف و ریاست دارالفنون بود . خدماتی نیز توسط او انجام شد که یکی از آن ها تأسیس تلگراف خانه بود . از اعتضادالسلطنه تألیفاتی نیز به جا مانده است . در این کار هدف تصحیح انتقادی نسخه خطی شرح حال حضرت عبدالعظیم است که اهمیت تصحیح نسخه امروز، بر هیچ کس پوشیده نیست . شرط تعالی و ترقی جامعه آگاهی از پیشینه تاریخ و تمدن است که یکی از راه های آن دسترسی عموم به آثار گذشتگان است که از طریق تصحیح نسخ این کار امکان پذیر می شود

چکیده غله، محصول اصلی اقتصاد کشور در عصر ناصری و نان خوراک اصلی مردم بود. از همین روحکومت ناصری و تمام گروه ها و طبقات اجتماعی در سراسر این عصر به طور مستقیم با مسئله ی نان و فراز و نشیب قیمت غله درگیر بودند. قحطی ها موجب رکود داد و ستد و تجارت، کاهش شدید کشت و زرع، بحران مالی دولت ،بحران حمل و نقل،شیوع بیماری های واگیردار،مهاجرت ، مرگ و میر و ناامنی می شدند و بر مناسبات ارضی و مالکیت زمین تأثیر می گذاشتند. بلواهایی که در پی گرانی و قحطی نان رخ می داد شکل روابط حکومت و مردم را دچار تغییر و تحول می کرد و به توسعه ی نفوذ سیاسی برخی از مهم ترین گروه های اجتماعی منجر می شد. سیاست خارجی عصر ناصری نیز متأثر از قحطی ها و بحران های نان بود. بررسی مسئله ای با این گستره تاثیر در حوزه های اقتصادی ، سیاسی و اجتماعی از اهمیت و ضرورت سزاوار توجهی برخوردار است. این پژوهش بر مبنای روش توصیفی-تحلیلی و با بهره گیری از اسناد درجه اول به ویژه مکاتبات دولتی ، مطبوعات همان عصر و خاطرات و سفرنامه های ناظران حوادث به انجام رسیده است. به نظر می رسد لاینحل ماندن مسئله نان تا پایان عصرناصری از سویی توان اقتصادی حکومت را کاهش داد و از طرفی به افزایش قذرت و نفوذ برخی از گروه های اجتماعی منجر شد.این وضعیت در فراهم آمدن زمینه های نهضت مشروطیت در سال های بعد بسیار موثر واقع شد.

آنزیم فیتاز به گروه خاصی از فسفاتازها اختصاص دارد که مسئول اولیه هیدرولیز اسید فیتیک می باشند. این آنزیم کاربردهای زیادی در صنعت برای قابل دسترس کردن، فسفر، مواد معدنی، انرژی و اسیدهای آمینه دارد. اسید فیتیک فرم اصلی اما غیر قابل استفاده فسفر در دستگاه گوارش طیور است که بدون افزودن آنزیم فیتاز در جیره غذایی از دستگاه گوارش دفع خواهد شد. هدف از این پروژه ارائه ساختار جدید فیتاز به منظور افزایش بیان و پایدار سازی گرمایی این آنزیم بر مبنای برنامه های بیوانفورماتیکی می باشد. با تجزیه و تحلیل نواحی بالادست ژن فیتاز گونه های قارچیِ مختلف به یک توالی جدید دست پیدا کردیم که نتایج مبین کارآمدی بیان سیستم ارائه شده در این تحقیق نسبت به مدل های پایه ای ژن فیتاز می باشد. از آنجایی که یک مشکل اصلی استفاده از فیتاز در جیره غذایی طیور عدم پایداری این آنزیم در دماهای بالایی است که طی فرآوری خواراک مورد استفاده قرار می گیرد، لذا دستیابی به فیتازی با مقاومت حرارتی بالا در کاربرد صنعتی تولید این آنزیم بسیار ضروری به نظر می رسد. مدل فیتاز مقاوم به حرارت با جایگزینی چند اسیدآمینه در توالی پروتئینی فیتاز طبیعی ساخته شد. ارزیابی ساختار سه بعدی پروتئین نشان داد پایداری حرارتی بدون اعمال تغییر معنی داری در شکل و ساختار فیتاز ایجاد شده است.

آنزیم اندوگلوکاناز اولین آنزیم از کمپلکس آنزیمی سلولاز است که باندهای داخلی گلیکوزیدی زنجیره‏ی سلولزی را می‏شکند و زنجیره های پلی ساکاریدی مجزای سلولز را به وجود می‏آورد. یکی از بهترین منابع تولید آنزیم اندوگلوکاناز باکتری باسیلوس سابتیلیس می‏باشد که اندوگلوکاناز مقاوم در برابر حرارت تولید می‏کند. در این تحقیق، ژن کد کننده ی آنزیم اندوگلوکاناز خارج سلولی باکتری باسیلوس سابتیلیس بومی جداسازی شده از چشمه‏های آب گرم با استفاده از آغازگرهای دارای جایگاه برشی اختصاصی، حاوی سایتهای برشی xhoi و bamhi جداسازی شده و پس از توالی‏یابی و بررسی خصوصیات، ژن تکثیر شده به ناقل ptz57r/t انتقال داده، سپس وارد باکتری e .coli dh5? شد. غربالگری کلونی‏های حاوی پلاسمید نوترکیب با استفاده از روش انتخابی آبی/سفید و با استفاده از iptg و x-gal صورت گرفت. حضور ژن هدف در ناقل کلونینگ ptz57r/t با استفاده از روش کلونی pcr و هضم آنزیمی تایید شد. سپس ژن اندوگلوکاناز را وارد ناقل بیانی(+)pet-21a کرده و پس از توالی‏یابی و تائید صحت قطعه همسانه‏سازی شده، ناقل بیانی وارد باکتری e. coli bl21(de3) شد. القا بیان به وسیله iptg با غلظت 1 میلی مولار صورت گرفت. صحت بیان پروتئین اندوگلوکاناز با استفاده از روش sds-page تایید شد که باند kd 47 را نشان داد.

چکیده در تاریخ معاصر ایران، مساله «حدود» و «مرز» همواره یکی از مهمترین مسائل در روابط با کشورهای همجوار بوده است. این اهمیت بیشتر از همه مبتنی بر تعیین دقیق مرزها و تفکیک قلمرو دولت، بر اساس وضع موجود در زمان انعقاد صلح نامه ها بوده است. در ایران دوره قاجاریه برای اولین بار سازوکاری برای تعیین مرزها شکل گرفت. چگونگی برخورد با این قضیه و تفهیم سرحد توافق شده به سرحدنشینان از مسائلی بود که سیاست مداران را به خود مشغول می کرد. در این میان تعیین و تحدید حدود ایران و عثمانی که در این دوره برای اولین بار برای تصمیم گیری شد از مباحث مهم در روابط بوده است. در تقسیم سرزمینهای دو کشور، بیش از همه به عوامل انسانی و جغرافیایی توجه می شد، و از این دو عامل، انسان ها در بنیانهای فکری حکومت های مرکزی نقشی ثانویه را داشتند و همیشه در پیمان ها به شکل زننده ای از اماکن جغرافیایی نام برده شده است. چون وضعیت انسانی ماجرا تاکنون به صورت جداگانه ای در جایی بررسی نشده بود، پژوهش حاضر نقش کُردها را در روابط ایران و عثمانی از آغاز حکومت قاجار تا عهدنامه ارزروم دوم 1263-1200ق بررسی نموده است. تحقیق حاضر به صورت کلی به وضعیت کُردها و به صورت جزئی به نقش شخصیت های کُرد تاثیرگذار در روابط ایران و عثمانی، خصوصاً در دوره سلطنت فتحعلی شاه و محمدشاه پرداخته است.

ایمونوگلوبولین زرده تخم مرغ در سالهای اخیر از نظر پزشکی، ژنتیک و علوم دامی کاربرد وسیعی پیدا کرده است. این ایمونوگلوبولین دارای 4 زنجیره پلی پپتیدی حاوی دو زنجیره سبک و دو زنجیره سنگین می¬باشد. شاخه سبک ایمونوگلوبولینy درپرندگان یک ناحیه متغیر و یک ناحیه ثابت و شاخه سنگین آن، یک ناحیه متغیر و 5 ناحیه ثابت را دارا می¬باشد ساختمان ناحیه ثابت مشخصه یک کلاس یا زیر کلاس ایمونوگلوبولین ها و ناحیه متغیر مخصوصا قطعات cdr بیشترین نقش را در باند شدن با آنتی ژن دارند. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی و آنالیز فیلوژنتیکی ژن های کد کننده زنجیره¬های سبک و سنگین ایمونوگلوبولین y مرغ¬های بومی خراسان در سطح mrna می¬باشد بدین منظور 20 نمونه طحال از مرغ¬های غیر خویشاوند بومی خراسان جمع آوری شد. پس از استخراج rna و تولید cdna از طریق رونویسی معکوس، تکثیر قطعات ژنی زنجیره های سنگین و سبک igy توسط آغازگرهای اختصاصی و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز انجام پذیرفت. بعد از توالی یابی، بررسی جهش¬ها برای هر دو زنجیره سبک و سنگین انجام پذیرفت. در زنجیره سبک نواحی cdr3دارای بیشترین تنوع و نواحی c کمترین تنوع را داشتند.و در زنجیره سنگین نیز تعداد 5 هاپلوتیپ برای توالی¬ها مشخص گردید که جمعا 9 جهش در آنها وجود داشتند از این تعداد 5 جهش معنی دار بود. همچنین نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد، که مرغ بومی خراسان از نظر ژن کد کننده شاخه سبک کمترین فاصله ژنتیکی را با مرغ لگهورن سفید و مرغ لگهورن فرانسه و از نظر ژن کد کننده شاخه سنگین دارای کمترین فاصله ژنتیکی با مرغ لگهورن سفید و مرغ بومی آذربایجان را دارد.

هدف از انجام این مطالعه توالی یابی و بررسی قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین و همچنین بررسی تفاوت های تک نوکلئوتیدی (snps) ممکن این توالی ژن در دوگونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران بود. تعداد 10 عدد نمونه خون شتر نر و ماده تک کوهانه از کشتارگاهی در مشهد، همچنین تعداد 5 عدد نمونه خون شتر های نر و ماده دو کوهانه از ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان اردبیل واقع در روستای جهاد آباد تهیه گردید. پس از عمل استخراج dna واکنش pcr برای هریک از نمونه ها توسط پرایمرهای اختصاصی انجام شد و عمل توالی یابی با استفاده از محصولات pcr انجام شد. توالی های مورد توافق برای هریک از شترهای تک کوهانه و دوکوهانه بدست آمد. با استفاده از همین توالی های مورد توافق ترکیب نوکلئوتیدی، بررسی های فیلوژنتیکی و سایر بررسی ها انجام شد. بر اساس مقایسه توالی های بدست آمده در این مطالعه با توالی ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی ncbi مشخص شد که توالی قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین، چهار جهش را نشان می دهد که یکی از آن ها در ناحیه پروتئین بایندینگ قرار گرفته بود و جهشی دیگر در ناحیه 516- به وقوع پیوسته که در پروموتور ژن بتا کازئین گاو هم مشاهده شده بود. در مرحله بعد بیشترین شباهت مربوط به camalaus bactrian بود. همچنین توالی بدست آمده قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین شتر دوکوهانه بیشترین شباهت را با توالی این ژن در شتر تک کوهانه داشت. در ناحیه پروموتور توالی ژن بتا کازئین شتر دو کوهان دو جهش مشاهده شد. توالی یابی10 نمونه مختلف پروموتور ژن بتا کازئین از شتر تک کوهانه و 5 نمونه مختلف از شتر دوکوهانه به ما این اجازه را داد که تعدادی تفاوت تک نوکلئوتیدی را در این ژن شناسایی کنیم. بررسی ها پنج نوع هاپلوتایپ را در شتر های تک کوهانه و سه هاپلوتایپ را در شترهای دو کوهان نشان داد. همچنین مقایسه توالی های مورد توافق شتر تک کوهانه و دو کوهانه 2 اختلاف تک نوکلئوتیدی را بین این دو گونه مشخص کرد.

هدف از انجام این مطالعه شناسایی سویه های مختلف blv در استان خراسان رضوی بود. برای انجام این کار از 111 راس گاو شیری از 9 گاوداری درتعدادی از شهرستان های مختلف استان خونگیری شد. همچنین از 29 راس گاو مبتلا به سرطان غدد لنفاوی در کشتارگاه مشهد نمونه بافت تهیه گردید. علاوه بر این از 1 راس گاو نر مولد نمونه خون و اسپرم گرفته شد. جهت شناسایی عامل بیماری از واکنش زنجیره ای پلیمراز ) pcr ( استفاده که در نتیجه 22 راس از گاوهای خونگیری شده ) 22.1 %( و 22 راس از گاو های کشتار شده ) 91 %( آلوده به ویروس لوکوز بودند. اسپرم و خون گاو نر تست شده نیز آلوده به ویروس لوکوز بود. جهت شناسایی سویه های ویروس از تکنیک چند شکلی طول قطعه محدود ) rflp ( استفاده شد. از 22 نمونه خون آلوده به ویروس لوکوز، 12 نمونه ) 22.2 %( به سویه شماره یک و 11 نمونه ) 32.1 %( به سویه شماره چهار ویروس آلودگی داشتند. همچنین از 22 نمونه بافت آلوده، 22 )% نمونه ) 23 %( آلوده به سویه شماره یک، 2 نمونه ) 22.2 %( آلوده به سویه شماره چهار و 1 نمونه ) 1.3 آلوده به سویه شماره سه بودند. جهت تایید نتایج حاصل از rflp ، از هر سوی? شناسایی شده یک نمونه توالی یابی شد. با استفاده از داده های مربوط به توالی یابی آنالیزهای فیلوژنیکی انجام و درخت فیلوژنیکی رسم گردید. تا به امروز سوی? شماره 1 تنها سوی? شناخته شد? blv در ایران بوده و تاکنون هیچ گزارشی مبنی بر وجود سویه های شماره 1 و 3 ویروس لوکوز گاوی در کشور ارائه نشده است. با توجه به نتایج به دست آمده در این مطالعه مبنی بر اینکه بالاترین نرخ آلودگی به blv و بالاترین نرخ ایجاد سرطان غدد لنفاوی در گاو مربوط به سوی? شماره 1 است، می توان عنوان کرد که این سویه از ویروس لوکوز گاوی می تواند اصلی ترین عامل بروز بیماری لوکوز انزوتیک گاوی در استان خراسان رضوی باشد.

هدف از این مطالعه مهندسی و ساخت یک سری از فیوژن آنتی بادی های کاملاً انسانی بود. مهندسی و تعویض اسید آمینه های هدف ژن وحشی کد کننده توالی hp-rnase (k7a/n71a/n88a/r91d/e111/a) توسط روش site-directed mutagenesis pcr صورت گرفت. ژن های وحشی و مهندسی شده در باکتری اشرشیاکلی سویه ی bl21(d3) بیان گردیدند و خالص سازی با استفاده از سیستم کروماتوگرافی تمایلی علیه his-tag صورت گرفت. غلظت فیوژن پروتئین ها به ترتیب 4 و 3.2 گرم بر لیتر برای hp-rnase وحشی و مهندسی شده بود. اختصاصیت فرآورده های آنزیمی نوترکیب توسط آزمون های sds- page و وسترن بلات تائید شدند. نتایج اندازه گیری فعالیت هیدرولازی hp-rnase در حضور غلظت های مختلفی از ممانعت کننده های ریبونوکلئازی (ri) نشان داد که سویه مهندسی شده توانایی فرار از دست ممانعت کننده های ریبونوکلئازی را کسب نموده و 2.5 برابر بیشتر از سویه وحشی سوبسترای rnaی را هدف قرار می دهد. ازاینرو ما فیوژن پروتئینی را طراحی و بیان نمودیم که حاوی تعداد دو 4d5 scfv آنتی بادی ضد her2، یک ناحیه ثابت igg1 انسانی و تعداد دو hp-rnase مهندسی شده بود (scfv-fc-hpr). همچنین ساختار های متفاوتی از فیوژن آنتی بادی با استفاده از قرار دهی قطعات لینکر های برشی (هوشمند) و پپتید نفوذ پذیر طراحی شده در موقعیت های مختلف در تلاش برای بهبود استقرار hp-rnase در سیتوزول یا هسته و افزایش نرخ فرار آن از کیسه های اندوزومی پس از داخل شدن به واسطه رسپتور های سطح سلول ایجاد گردید. ساختار ژنی در لاین سلولی hek-293t به صورت موقتی بیان گردید. خالص سازی با استفاده از سیستم کروماتوگرافی تمایلی علیه his-tag صورت گرفت و غلظت فیوژن پروتئین ها به ترتیب 2.8، 2.9، 2.4 و 3.9 گرم بر لیتر برای ab. 1، ab. 2، ab. 3 و ab. 4 بود. اتصال فیوژن آنتی بادی ها به قسمت خارج سلولی آنتی ژن her2 به صورت موازی با استفاده از فلوسایتومتری در لاین های سلولی sk-br3 و mda-mb-468 بررسی شد. این نتایج نشان دادند که آنها دارای شدت فلورسانس قابل تشخیص بسیار قوی در لاین سلولی sk-br3 که her2 مثبت و فقدان فلورسانس قابل تشخیص در لاین سلولی mda-mb-468 که her2 منفی بودند. از اینرو افینیتی فیوژن آنتی بادی ها به her2-ecd بر اساس روش بیوسنسوری توسط دستگاه رباتیک octet red 96 اندازه گیری شد و با افینیتی آنتی بادی تراستوزوماب مقایسه گردیدند. نتایج نشان دادند که افینیتی فیوژن آنتی بادی ab. 1، ab. 2، ab. 3 وab. 4 به ترتیب 17، 18، 18.5 و 12 بود. نتایج آزمایشگاهی آزمون dose response cytotoxicity نشان دادند که فیوژن آنتی بادی های شماره 1 و 2 قادرند به طور معنی داری رشد سه لاین سلولی her2 مثبت و همچنین لاین سلولی مقاوم به هرسپتین را در مقایسه با تراستوزوماب مهار نمایند. بعلاوه اینکه آنها هیچ اثر قابل تشخیصی بر روی زنده مانی سه لاین سلول سرطانی her2 منفی از خود نشان ندادند. به طور کلی نتایج ما نشان دادند که اثر متقابل بین hp-rnase و ri را می توان با دستکاری اسید آمینه های درگیر در این برهمکنش مختل نمود. همچنین نتایج پژوهش حاضر نشان دادند که scfv-fc-hpr آنتی بادی های مهندسی شده می توانند امید بخش معرفی یک داروی جدید ضد سرطان کاملاً انسانی برای درمان سرطان پستان محسوب گردند.

تریپتوفان یک اسید آمینه آروماتیک ضروری است که کاربرد گسترده ای در زمینه های مختلف مثل مکمل های غذایی انسان و دام، مواد دارویی مثل داروهای خواب آور،آرام بخش یا محلول رینگر و مواد بهداشتی دارد. باکتری اشرشیاکلی میزبانی با استفاده گسترده که دارای زمینه ی ژنتیکی شفاف و معلوم ، ابزارهای مهندسی متابولیک مناسب و در دسترس و رشد سریع در محیط کشت ارزان است ، توجه زیادی را برای تولید تریپتوفان و دیگر ترکیبات آروماتیک به خود جلب کرده است. دراین پروژه با در نظر گرفتن عناصر تنظیم کننده نسخه برداری در ناحیه ی پروموتوری و نقش احتمالی این عناصر در افزایش بیان ،الگوهای جدیدی از اپرون تریپتوفان اشریشیا کلی با تمرکز بر یکی از مهمترین قسمتهای آن یعنی ناحیه ی پروموتور ارائه شد. بدین منظور از آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای ارزیابی پروموتورهای ارائه شده از لحاظ خصوصیات ساختاری انحنا وانعطاف پذیری وخصوصیات ترمودینامیکی پایداری و انرژی انباشت و همچنین فاکتور ناپایداری ناشی از فشار داپلکس (sidd) استفاده شده و بر پایه ی این خصوصیات 10 هسته ی پروموتوری برتر و 5 ناحیه ی فرادست پروموتور جهت استفاده در پروسه های آزمایشگاهی پیشنهاد گردید.

بیماری تب برفکی اولین بیماری ویروسی شناخته شده در حیوانات است که با گذشت بیش از صد سال از شناخت آن، همچنان یکی از مهمترین خطراتی است که صنعت دامپروری دنیا را تهدید می نماید. یکی از مهمترین روش های شناسایی حیوان واکسینه شده از حیوان مبتلا به تب برفکی استفاده از پروتئین غیرساختاری 3abcبه عنوان آنتی ژن در کیت الایزا می باشد. از اینرو، ژن 3abc ویروس تب برفکی سروتایپ o با استفاده از واکنش زنجیره پلیمراز و پرایمرهای اختصاصی حاوی سایت های برشی bamhi و hindiii جداسازی شد. به منظور بررسی خصوصیات نوکلوتیدی، ژن تکثیر شده به ناقل ptz57r/t انتقال و حضور ژن هدف در ناقل کلونینگ ptz57r/t با استفاده از روش¬های کلونی pcr، هضم آنزیمی و توالی یابی تایید شد. به منظور تولید آنتی ژن نوترکیب، ژن هدف به وکتور بیانی pet21a (+) وارد و سپس به باکتری اشرشیاکلی bl21(de3) به عنوان میزبان بیان منتقل شد. باکتری حاوی وکتور نوترکیب با استفاده از iptg در غلظت نهایی5/1 میلی مولار القا شد. تولید پروتئین نوترکیب با استفاده از الکتروفورز پروتئین و وسترن بلاتینگ تایید شد. وزن مولکولی پروتئین تولید شده در حدود 50 کیلودالتون مشخص شد. نتایج آزمون الایزا نشان داد که آنتی ژن نوترکیب تولید شده به خوبی با آنتی بادی اختصاصی اتصال پیدا می کند و این آنتی ژن، پتانسیل مناسبی جهت استفاده در کیت تشخیصی الایزا برای شناسایی حیوانات اهلی آلوده از حیوانات واکسینه شده دارد.

چکیده میوستاتین کنترل کننده منفی رشد عضله است. جهش¬های طبیعی که در ژن کد کننده آن در طول تکامل نژادها رخ داده است، رابطه معنی¬داری را با حجم و رشد عضله نشان می¬دهند. این جهش¬ها به دو صورت، تخریب ژن میوستاتین و یا کاهش سطح رونوشت آن، موجب ایجاد فنوتیپ "عضله مضاعف" در برخی نژادهای گاو، گوسفند و سگ می¬شوند. این یافته¬ها این فرضیه را تقویت می¬کنند که با استفاده از تکنیک¬های زیست فن¬آوری برای تخریب ژن میوستاتین، می¬توان فنوتیپ عضله مضاعف را دیگر نژادهای حیوانات مزرعه¬ای و از جمله نژادهای بومی کشور ایجاد نمود. اهداف اصلی این مطالعه عبارت بودند از: الف) توسعه روشی برای مهندسی تالن¬ها ب) ساخت یک جفت تالن برای تخریب ژن میوستاتین در گوسفند، گاو و بز و ج) تست فعالیت تالن¬های ساخته شده در سلول¬های بنیادی جنینی موشی. به این منظور روش golden-gate cloning برای ساخت تالن¬ها با اعمال تغییراتی در پروتکل آن بهینه¬سازی شد. همچنین دو ناقل پلاسمیدی جدید حاوی رنگ¬های فلورسنت mcherry و egfp جهت کلون نمودن منطقه کد کننده تالن¬ها ساخته شدند. با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک منطقه¬ای در اگزون دوم ژن میوستاتین برای هدف¬گیری بوسیله تالن¬ها انتخاب گردید. این ناحیه در گوسفند، بز، گاو، خوک و موش کاملاً یکسان بود. سه جفت تالن در پلاسمیدهای متفاوت جهت هدف¬گیری این منطقه خریداری و یا بوسیله روش مذکور ساخته شد. فعالیت تالن¬هایی که برای هدف¬گیری این منطقه طراحی و ساخته شده بودند در سلول¬های بنیادی جنینی موشی مورد بررسی قرار گرفت. کلونی¬های سلولی بوسیله تکنیک high resoloution melting (hrm) جهت تشخیص جهش¬های القا شده بوسیله تالن¬ها در منطقه هدف غربالگری شدند. نتایج نشان دادند که تالن¬های مهندسی شده برای هدف¬گیری اگزون دوم میوستاتین قابلیت القای موتاسیون با کارایی بین 5 الی 35 درصدی را دارا هستند. جهت تایید این نتایج، سه کلونی که بوسیله hrm جهش یافته تشخیص داده شده بودند برای منطقه هدف توالی¬یابی شدند. به این وسیله، سه آلل حاوی جهش که هر کدام به ترتیب حاوی 7، 11 و 22 جفت باز حذف شده در منطقه هدف بودند شناسایی شدند. نتایج این مطالعه قابل تعمیم به دیگر نژادها هم هستند و لذا کارایی بالای تالن¬ها این امکان را فراهم می¬آورد تا محدودیت¬های تکنیکی برای تولید حیوانات تراریخت مزرعه¬ای به نحو بسیار چشمگیری کاهش یابد. کلیدواژه¬ها: میوستاتین، تالن، جهش زایی، هدف¬گیری ژن¬ها.

سرطان پستان شایعترین سرطان در بین زنان ایرانی است. مطالعات مداوم ژنتیکی در خانواده های دچار سرطان پستان با تظاهر زود هنگام، منجر به کشف 2 ژن brca1 و brca2 شده است که استعداد ابتلا به این سرطان را افزایش می دهد. در بین بیماران دچار سرطان پستان، بیش از 5 تا 10 درصد موارد مستقیما با وراثت جهش های این دو ژن مرتبط هستند که منجر به ایجاد اکثر سرطان های پستان ارثی می شوند. تحقیقات گسترده بر روی snpهای مورد مطالعه در جمعیت های مبتلا به سرطان پستان و تخمدان نشان دادند که موتاسیون های 185delag با شماره ثبت ژنی rs77944974 و 5382 insc با شماره ثبت ژنی rs76171189 دارای بیشترین فراوانی در بین جمعیت ها هستند. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی جهش های 185delag و 5382insc ژن brca1 با استفاده از روش arms-pcr در جمعیت بیماران ایرانی مبتلا به سرطان پستان ساکن استان خراسان بزرگ بود. بدین منظور از تعداد 100 نفر بیمار مبتلا به سرطان پستان که در بیمارستانهای قائم و امید بستری شده بودند و نمونه پاتولوژی آنها مثبت بود به میزان 2 میلی لیتر نمونه خون گرفته شد. همچنین برای داشتن گروه شاهد از تعداد 30 فرد سالم که از نظر سنی همسان و نتایج ماموگرافی آنان نیز منفی بود نمونه خون تهیه گردید. استخراج dna از نمونه ها با استفاده کیت دیاتوم مبتنی بر روش گوانیدین تیوسیانات سیلیکاژل انجام شد.جهت تشخیص snpها بر اساس روش arms-pcr طراحی پرایمرهای بیرونی و arms با استفاده از نرم افزار primer premier نسخه 5 انجام شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تکثیر قطعات بیرونی جهش های 185 delag و 5382 insc به ترتیب به طول های 253 و 319 جفت باز بر اساس روش استاندارد صورت گرفت. سپس محصولات هر یک از pcrها به صورت مجزا به عنوان dna هدف برای انجام واکنش arms-pcr با استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای شناسایی و ردیابی جهش های 185 delag و 5382 insc به ترتیب به طول های 219 و 273 جفت باز بر اساس روش استاندارد با موفقیت بهینه و انجام شد. الکتروفورز محصولات pcr بر روی ژل آگارز 8/0 درصد انجام شد. نتایج این مطالعه بیان داشت که 8 نفر از بیماران مبتلا به سرطان پستان جهش مربوط به snp,185delag و 17 مورد از بیماران مبتلا جهش مربوط به snp, 5382 insc را نشان دادند. برای اطمینان از صحت انجام نتایج، توالی یابی نمونه ای مثبت به جهش های مورد بررسی به همراه چند نمونه شاهد انجام شد. نتایج توالی یابی فعالیت درست و دقیق پرایمرهای طراحی شده را تائید نمودند.

تلاش های بیشماری جهت تهیه واکسن موثر علیه بیماری سل گاوی انجام شده است که در این راستا ایمن سازی با پلاسمید نوترکیب حاوی آنتی ژن های هدف، راهکاری امید بخش به شمار می آید. این مطالعه با هدف کلونینگ، تایید بیان و ارزیابی ایمنی زایی پلاسمیدهای یوکاریوتی کد کننده ایمونوژن های هدف در مدل موش balb/c مورد بررسی قرار گرفت. آنتی ژن های 6 esat-و cfp-10 در پلاسمید بیانی یوکاریوتی pcdna3.1(+) کلون شدند. صحت و عملکرد پلاسمیدهای نوترکیب pcdna3.1(+)/esat-6 و pcdna3.1(+)/cfp-10در سطح dna با روش کلونی pcr، نقشه یابی آنزیمی و توالی یابی، در سطح rna باrt-pcr ژن esat-6 و cfp-10 از بافت ماهیچه مورد تزریق و در سطح پروتئین با وسترن بلات تایید شد. سپس موش هایbalb/c به 7 گروه تقسیم شدند و با تیمارهای پلاسمید نوترکیبesat-6 ، cfp-10، ترکیب دو پلاسمید، ppd، pbs، pcdna3.1(+) و گروه بدون تزریق ایمن شدند. بیست روز پس از تزریق، موش ها کشته و طحال و نمونه بافت ماهیچه آنها جدا شد. سپس سوسپانسیون لنفوسیتی تهیه و با ppd گاوی ppdانسانی مواجهه شد و پس از 72 ساعت به منظور سنجش تحریک سلول های لنفوسیت، تست mtt انجام شد. مایع رویی کشت لنفوسیت ها جهت بررسی الگوی ترشحی جمع آوری و با تست الایزا مقادیر ifn-y ، il-10 و il-4 اندازه گیری شد. همچنین سنجش بیان ژن های ifn-y ، il-10 و il-4 به وسیلهreal-time pcr صورت گرفت. آزمایشات الایزا وmtt تایید کرد که پلاسمیدهای نوترکیب کد کنندهesat-6 وcfp-10 توانایی القاء پاسخ ایمنی را در موش ها دارد و می توانند با القاء پاسخ ایمنی کاندید مناسبی برای dna واکسن علیه عفونت سل گاوی باشند.

پژوهش های حاضر با هدف ارزیابی اثرات استفاده از عصاره هسته انگور و ویتامین c به صورت تزریق داخل تخم مرغی و مکمل با جیره غذایی بر عملکرد، پاسخ ایمنی، وضعیت آنتی¬اکسیدانی، مورفولوژی روده و بیان ژن hsp70 در جوجه¬های گوشتی تحت تنش گرمایی انجام شد. در آزمایش اول، آنالیز تقریبی هسته انگور، قدرت آنتی اکسیدانی و ضد میکروبی عصاره هسته انگور به روش آزمایشگاهی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج آزمون frap نشان داد قدرت آنتی اکسیدانی عصاره هسته انگور بیشتر از مقدار مشابه ویتامین c بود. همچنین سطوح مختلف عصاره هسته انگور اثر مهاری بر باکتری اشریشیا کلی داشت. آزمایش دومدر قالب طرح بلوک تصادفی با 7 تیمار، 5 بلوک و 98 عدد تخم مرغ در هر بلوک انجام شد. تیمارهای آزمایشی شامل:شاهد (بدون سوراخ و تزریق)، شاهد (سوراخ شده)،5/0 میلی¬لیتر سرم نمکی،3 میلی¬گرم ویتامین c،3 میلی¬گرم عصاره هسته انگور،5/4 میلی¬گرم عصاره هسته انگور،6 میلی¬گرم عصاره هسته انگور بود. تغذیه داخل تخم مرغی عصاره هسته انگور به مقدار 5/4 میلی گرم سبب افزایش قابلیت جوجه درآوری نسبت به گروه های شاهد شد. تزریق 5/4، 6 میلی گرم عصاره هسته انگور و یا 3 میلی گرم ویتامین c به ازای هر تخم مرغ، غلظت آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز همولیزات جوجه ها را افزایش داد. در آزمایش سوم، جوجه¬های هچ شده در آزمایش دوم در قالب طرح کاملا تصادفی با 5 تکرار و 8 قطعه جوجه در هر تکرار تا سن 22 روزگی پرورش داده شدند. تغذیه داخل تخم مرغی عصاره هسته انگور و ویتامین c به ترتیب در سطح 5/4 و 3 میلی گرم به ازای تخم مرغ سبب افزایش اضافه وزن جوجه ها نسبت به گروه های شاهد در دوره آغازین گردید. تزریق داخل تخم مرغی سطوح مختلف عصاره هسته انگور و ویتامین c جمعیت باکتری اشریشیا کلی در محتویات ایلئوم جوجه ها را در سن 10 روزگی کاهش داد. آزمایش چهارمدر قالب طرح کاملا تصادفی با 5 تیمار و 5 تکرار و در شرایط دمای طبیعی انجام شد. تیمارها شامل: شاهد، ویتامین c در سطح 300 میلی¬گرم در کیلوگرم، عصاره هسته انگور در سطح 150، 300 یا 450 میلی¬گرم در کیلوگرم بود.جوجه های تغذیه شده با جیره های حاوی 150 و 300 میلی گرم عصاره هسته انگور در کیلوگرم جیره، افزایش وزن و شاخص کارایی تولید بیشتری نسبت به گروه شاهد داشتند. تغذیه عصاره هسته انگور سبب کاهش جمعیت باکتری هایکلی فرم محتویات ایلئوم شد. سطوح مختلف عصاره هسته انگور سبب افزایش ضخامت لایه ماهیچه ای، ارتفاع پرز و عمق کریپتژژونوم پرنده ها شد. عصاره هسته انگور سبب کاهش سطح آنزیم آلکالین فسفاتاز سرم جوجه های گوشتی شد. آزمایش پنجم در قالب طرح کاملا تصادفی با 5 تیمار و 5 تکرار و در شرایط تنش گرمایی مزمنانجام شد. تیمارها مشابه آزمایش چهارم بودند. افزایش وزن بدن، ضریب تبدیل خوراک و شاخص کارایی تولید در جوجه های تغذیه شده با 300 میلی گرم عصاره هسته انگور در کیلوگرم جیره به ترتیب بیشتر، کمتر و بیشتر بود. تغذیه جوجه های گوشتی با سطوح 300 و 450 میلی گرم عصاره هسته انگور در کیلوگرم جیره سبب افزایش درصد وزن تیموس، کاهش سطح کلسترول و مالون دی آلدئید سرم، کمترین درصد هتروفیل، کمترین نسبت هتروفیل به لنفوسیت، بیشترین درصد لنفوسیت، کاهش جمعیت باکتری اشریشیا کلی در ایلئوم، کاهش سطح آنزیم آسپارتات آمینوترانسفراز و افزایش پاسخ ثانویه تیتر آنتی بادی علیه گلبول قرمز گوسفندی شد.

هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی بخشی از اگزون و اینترون شماره 7 ژن بتاکازئین شترهای تک کوهان و دو کوهان ایرانی بود.کازئین بخش اصلی پروتئین های شیر می باشد که به صورت چندین شکل مولکولی (?s1, ?s2, ? and ?) با واریانت های آللی متنوع می باشد. بتاکازئین برای ساختار میسل های کازئین مهم می باشد و پلی مورفیک ترین ژن پروتئین موجود در شیر می باشد. برای انجام این تحقیق تعداد 10 نمونه خون شتر تک کوهانه از کشتارگاه مشهد و تعداد 5 نمونه خون شتر دو کوهانه از مرکز اصلاح نژاد شهر مشکین شهر استان اردبیل جمع آوری شد. پس از استخراج dna، تکثیر قطعه 927 جفت بازی از ناحیه ژنی بتاکازئین با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای اختصاصی طراحی شده براساس روش استاندارد انجام گردید. توالی یابی نواحی تکثیر شده به روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و به منظور تعیین فاصله ژنتیکی با توالی های حاصل از مطالعات دیگر، مورد مقایسه قرار گرفتند. دو تفاوت تک نوکلئوتیدی در اگزون شماره هفت و همچنین دو تفاوت تک نوکلئوتیدی در اینترون شماره 7 شترهای ایرانی در مقایسه با توالی قبلی شتر تک کوهان ثبت شده در ncbi مشاهده شد. همچنین نتایج آزمون فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor-joining نشان داد شتر ایرانی بیشترین شباهت را با گونه شتر تک کوهانه ثبت شده در ncbi دارا می باشد.

بیماری تب برفکی (fmd) یکی از بیماری های مهم دامی است که باعث خسارت اقتصادی بالایی به صنایع تولید شیر و گوشت می شود. در حال حاضر از ویروس های ضعیف شده بعنوان واکسن علیه این بیماری استفاده می شود. هزینه بالای تولید و خطر فعال شدن ویروس های ضعیف شده در واکسن های سنتی باعث شده است که در سال های اخیر، تولید واکسن های نوترکیب برای مقابله با این بیماری مورد توجه قرار گیرد. در مطالعه حاضر، از یک رویکرد اپی توپ محور برای تولید واکسن نوترکیب تب برفکی در گیاه توتون استفاده شده است. بدین منظور توالی ژنی کدکننده آمینواسیدهای 129 تا 169 پروتئین vp1 که یکی از پروتئین های پوششی ویروس مولد تب برفکی است با استفاده از ناقل اگروباکتریوم در گیاه توتون بیان شد. لاین های تراریخته بر اساس مقاومت به کانامایسین و آزمون pcr گزینش شده و بیان ترانسژن در آنها در سطح رونویسی و ترجمه مورد بررسی قرار گرفت. هرچند در آزمون های real time pcr و الایزا تمامی لاین های گزینش شده سطحی از بیان ترانسژن را نشان دادند، اما در آزمون وسترن بلات، باند مورد نظر تنها در دو لاین 10 و 42 مشاهده شد. قابلیت ایمنی زایی پروتئین نوترکیب تولید شده در لاین های توتون از طریق تزریق به حیوان آزمایشگاهی (خرگوش) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که واکسن نوترکیب تولیدی می تواند سیستم ایمنی میزبان را تحریک کند که این با مشاهده حضور آنتی بادی های اختصاصی در سرم بدست آمده از حیوانات تیمار شده در آزمون الایزا به اثبات رسید. علاوه بر این، از آن جا که یکی از اهداف مهم پژوهش حاضر افزایش سطح بیان ترانسژن در لاین های تراریخته از طریق راهکارهایی چون افزودن توالی اتصال ریبوزومی، بهینه سازی کدونی و کاربرد سیگنال پپتید بود، میزان بیان ژن در دو لاین 10 و 42 به شکل کمی اندازه گیری شد. نتایج نشان داد که سطح بیان ترانسژن در دو لاین 10 و 42 به ترتیب 65/0 و 72/0 درصد کل پروتئین های محلول گیاه است. در مجموع یافته های این پژوهش نشان داد که با به کارگیری استراتژی های مناسب و هم چنین استفاده از اپی توپ های درست می توان به یک واکسن نوترکیب موثر علیه تب برفکی دست یافت.

منابع پروتئینی در تغذیه انسان نقش مهمی دارند. شیر شتر یکی از منابع پروتئینی غنی به شمار می آید. ? –لاکت آلبومین یکی از پروتئین های مهم آب پنیر شیر شتر می باشد . نواحی کد کننده ، نواحی هستند که در بیان ژن اهمیت ویژه ای دارند . به این دلیل هدف از این تحقیق بررسی ساختار ناحیه تنظیمی ژن ?–لاکت آلبومین به طول حدود 1020 نوکلئوتید می باشد که احتمالاً در 2 گونه شتر تک کوهانه و 2 کوهانه ایران به مقدار زیادی مشابه می باشد. 10 نمونه خون از شتر تک کوهانه و 5 نمونه خون از شتر 2 کوهانه جمع آوری شد. ناحیه مورد نظر با استفاده از آغازگر های اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. پس از تجزیه و تحلیل به دست آمده ، 5 هاپلوتایپ در نژاد های تک کوهانه و 3 هاپلوتایپ در نژاد های 2 کوهانه مشاهده گردید. همچنین 7 ناحیه تنظیمی در نژاد تک کوهانه و 7 ناحیه تنظیمی در نژاد دو کوهانه مشاهده شد.

ریزرِنا ها توالی های کوتاه رِنا با طولی حدود 22 نوکلئوتید می باشند، که با اتصال به نواحی خاصی از رِناپ ، منجر به کاهش بیان آنها در مرحله پس از نسخه برداری می شوند. این عوامل در غالب مسیرهای بیولوژیکی نقش ایفا می کنند و از بزرگترین کلاسهای تعدیل کننده بیان ژن در حیوانات محسوب می شوند. چالش اصلی در مطالعه و کاربرد ریزرِناها، شناسایی ژنهایی است که بوسیله هر ریزرِنا تنظیم می شوند. در این حوزه ابزارهای محاسباتی مهمترین نقش را بر عهده دارند، اما سرعت رشد بالا و افزایش پیچیدگی داده های بیولوژیکی موجب شده است که مشکلات اساسی در زمینه دقت و قدرت تعمیم دهی این روش ها وجود داشته باشد. هدف از انجام این پژوهش ارائه مدلی جامع، دقیق و با قابلیت تعمیم دهی بالا، به منظور پیش بینی جایگاه های هدف کارکردی ریزرِناها بر اساس شواهد دقیق آزمایشگاهی، الگوریتم تکاملی و روش های بهینه سازی و محاسباتی هوشمند بود. بدین منظور داده های تایید شده آزمایشگاهی از منابع مربوطه جمع آوری، پالایش و تصحیح شدند و به کمک روش های مبتنی بر شناسایی بیان اختصاصی ژنها و الگوریتم ژنتیک اقدام به تکمیل سازی آنها شد. در مرحله بعد، ویژگی های مهم جایگاه های هدف طراحی و محاسبه شده و پس از مهندسی ویژگی، خصیصه های کلیدی انتخاب شدند. برای پیاده سازی مدلِ پیش بینی کننده، از انواع روش های یادگیری ماشینی مبتنی بر شبکه های عصبی مصنوعی و ماشین های بردار پشتیبان استفاده شد و ارزیابی مدلها در دو سطح داده های اصلی و داده های مستقل صورت پذیرفت. در نهایت، مدل منتخب در سطح داده های پروتئومیکس نیز ارزیابی و با دیگر روش های موجود مقایسه شد. نتایج نشان داد که روش پوششی rsfs با 48 و روش رتبه بندی sd با 50 خصیصه انتخابی بهترین کارایی را در انتخاب ویژگی ها دارند و ویژگی هایی نظیر حداقل انرژی آزاد کل داپلکس، حفاظت شدگی ژنتیکی و ماهیت نوکلئوتیدی در موقعیت های خاص جایگاه هدف، طول و ترکیب 3’utr، قابلیت دسترسی و مجاورت جایگاه با موتیف های ares، بیش نمایش آماری آن و طول بلندترین ساختار پیوسته مهمترین ویژگی ها در شناسایی جایگاه های هدف کارکردی می باشند. مدل های مبتنی بر ماشین های بردار پشتیبانِ بهینه سازی شده، با هسته تابع شعاعی پایه و الگوریتم یادگیری حداقل مربعات یا برنامه ریزی درجه دو، با دقت 99 درصد بر حسب هر دو معیار صحت و ضریب همبستگی متیو، بهترین عملکرد را در پیش بین جایگاه های هدف داشتند. ارزیابی با داده های مستقل نیز نشان داد که شبکه عصبی تشخیص الگو، دارای 16 نرون در لایه میانی، با دقت 86 و 75 درصد به ترتیب بر اساس معیار صحت و ضریب همبستگی متیو، بالاترین توان را در تعمیم دهی نتایج دارد. به طور کلی بهترین مدل از هر دو جنبه دقت و توان تعمیم دهی، ماشین بردار پشتیبان با هسته چندجمله ای درجه 3 و الگوریتم یادگیری بهینه سازی حداقلی پی در پی بود. ارزیابی این مدل به کمک داده های پروتئومیکس و مقایسه با دیگر روش های موجود نشان داد که مدل پیشنهادی در این مطالعه حداقل 7/0 درصد از لحاظ دقت و 5/11 درصد از لحاظ حساسیت، عملکرد بالاتری نسبت به بهترین روش موجود دارد.

روابط، مناسبت¬ها و معادلات سیاسی و فرهنگی ایران و عثمانی در طول تاریخ حدود چهار قرن همجواری، دستخوش تغییرات و فراز و نشیب¬های مختلف و متفاوتی شده است. شکی نیست که عوامل و دلایل متفاوت و پیچیده¬ای در تحولات روابط این دو حکومت ایفای نقش کرده¬اند و تبیین جامع این روابط، بدون در نظر گرفتن مجموعه عوامل و دلایل، به دلیل تقلیل منابع عدیده تأثیرگذار و تعیین¬کننده، فاصله گرفتن از دقت¬ورزی در پژوهش تاریخی است و چنین تحقیقی از خطا و اشتباه تقلیل¬گرایی برکنار نخواهد بود. این تحقیق با چنین رویکردی و با هدف تبیین گستردگی عوامل موثر در مناسبات ایران و عثمانی و با اذعان به پیچیدگی تبیین این روابط و اقرار به تأثیرگذاری عوامل مختلف و پرهیز از تحلیل تک¬عاملی، نقش عامل انسانی، اجتماعی، جغرافیایی، دینی و تاریخی کردها را به عنوان یکی از عوامل مهم و تأثیرگذار در روابط و مناسبات این دو حکومت تحلیل و تبیین می¬کند و بدین شکل با مد نظر قرار دادنِ سیر و تحولِ یکی از عواملی که در این مناسبات پیچیده، کمتر به شکل مستقل مورد توجه قرار گرفته، تحقیقات کنونی را کامل¬تر می¬کند. رساله¬ی پیش¬رو دربرگیرنده¬ی نقش شخصیّت¬ها، فرمانروایان و گروه¬های کردی مطرح در مناسبات بین دو کشور ایران و عثمانی مقارن حکمرانی ناصرالدین شاه، مظفرالدین شاه، محمدعلی شاه و احمد شاه، به ویژه از عهدنامه¬ی ارزروم دوم 1326ه.ش/ 1847.م تا سقوط سلسله¬ی قاجاریه در سال 1305ه.ش/ 1925.م می¬باشد. نتایج این تحقیق نشان می دهد که کردها در مناسبات ایران و عثمانی علاوه بر ایفای نقش به عنوان عاملی تأثیرگذار در روابط خصمانه و دوستانه و معاهداتی چون ارزروم دوم به عنوان معمولی متأثر نیز از این روابط تأثیر پذیرفته¬اند.

هلیکوباکتر پیلوری شایع ترین پاتوژن گوارشی است که نیمی از مردم دنیا را آلوده ساخته و مهمترین علت بیماری های معده ای-روده ای از جمله گاستریک مزمن، زخم معده و دوازدهه، سرطان معده و لنفوما است. ژن caga (سیتوتوکسین مرتبط با ژن a) یکی مهمترین شاخص های بیماری زای این باکتری است. در این مطالعه به منظور همانه سازی بخش های آنتی ژنیک ژن caga و بررسی تولید igy در زرده تخم مرغ در ابتدا بر اساس برنامه های بیوانفورماتیکی قطعه حاوی اپی توپ های اصلی ژن caga به طول 996 جفت باز شناسائی شد سپس این قطعه به کمک pcr از ژنوم هلیکوباکتر پیلوری موجود در بیوپسی معده 30 بیمار مبتلا به این باکتری جدا شده و با استفاده از هضم آنزیمی به ناقل pet32a و سپس به داخل میزبان های کلون سازی و بیانی وارد شد. نتایج توالی یابی کلونیگ موفق ژن caga را نشان داد و در نهایت ترکیب پروتئینی بدست آمده توسط روش sds-page و دات بلات تائید شد. در مرحله بعد ترکیب پروتئینی بدست آمده به 3 مرغ از نژاد hy-line تزریق شد. تخم مرغ ها به مدت 10 هفته جمع آوری شدند و igy تولید شده در زرده تخم مرغ آنها با استفاده از روش sds-page بررسی و تائید شد.

بعد از قتل نادرشاه افشار هریک از سرداران وی و سرکردگان محلی به فکر تشکیل حکومت افتادند؛ در این دوران زمینه مناسبی برای تشکیل خانات مستقل و نیمه مستقل فراهم شد و در آذربایجان و منطقه قفقاز تعدادی خان نشین و سلطان نشین محلی تأسیس گردید. خان نشین های قراباغ، ایروان و نخجوان از جمله مهم ترین این خان نشین ها بودند که از بدو تأسیس همواره با تهدیدات داخلی و خارجی گوناگونی مواجه بودند؛ این خان نشین ها برای رفع مخاطرات داخلی و خارجی سیاست ها و برنامه های مختلفی را اجرا کردند. در این دوره مهمترین نیروهای موثر در منطقه، دول روسیه و عثمانی بودند و بعد از روی کار آمدن آقامحمدخان، دولت قاجار نیز تلاش کرد در حوادث منطقه قفقاز موثر باشد. هدف این بررسی شناسایی عوامل و علل اتخاذ مواضع و تکاپوهای خان نشین های قراباغ ایروان و نخجوان نسبت به فعالیت های دولت عثمانی، روسیه و ایران با اتکا به اسناد و گزارش‏های تاریخی است. دستاوردهای این بررسی نشان می دهد که عثمانی ها پس از رانده شدن از کریمه و الحاق گرجستان به روسیه طبق پیمان «گیورگیوسک» 1193ه‍.ق./ 1784م. (بین ارایکلی دوم و کاترین) تلاش داشتند به منظور جلوگیری از توسعه طلبی روس ها، با خوانین آذربایجان و داغستان یک اتحاد نظامی علیه روس ها ایجاد کنند. دولت روسیه نیز تلاش می کرد از طریق ملوک خمسه و ارایکلی خان حاکم گرجستان قدم به قدم بر قفقاز مسلط شود. دولت ایران از زمان آقامحمدخان تلاش نمود این خان نشین ها را که از زمان مرگ نادر دوره ای از استقلال را تجربه کرده بودند، زیر سلطه دولت ایران قرار دهد، خوانین نیز در فکر حفظ استقلال داخلی خود به هر قیمت ممکن و خنثی ساختن تهدیدات دشمنان داخلی و خارجی بودند؛ و این امر همواره اصل مهم در موضع-گیری این خانشین ها محسوب می شد. بر این اساس، اصل «تهدید مشترک»، و ایجاد توازن قوا در رقابت منطقه ای موجب نزدیکی این خوانین به امپراتوری عثمانی و روسیه و گاهی ایران بود.

حدود 30 تا 40 درصد از ناباروری ها در جنس نر به دلایل ناشناخته است. مشخص شده است که ژنتیک در اختلال روند اسپرماتوژنز سهم دارد و درمیان عوامل مورد مطالعه، ریزحذف های کروموزوم y یکی از شایع ترین آن هاست. مطالعات بر روی ریزحذف های نواحی azf کروموزوم y نتایج بسیار متفاوتی را نشان داده است. در این مطالعه، به منظور بررسی مقایسه ای نواحی ژنومیazf وsry در کروموزوم y انسان و دام(شامل گاو و گوسفند) و تشخیص ناباروری به کمک sts (sequence-tagged sites) مارکرها از نمونه خون 45 مرد نابارور و 5 راس دام نابارور استفاده شد. پس از استخراج dna، جهت مطالعه وجود ریزحذف های کروموزوم y در نمونه های انسانی و دامی، pcr ابتدا به صورت uniplex برای هر شش جفت پرایمر و سپس به صورت مولتی پلکس بهینه سازی شد. نتایج نشان داد که sts مارکرهای طراحی شده برای کروموزوم y انسان قادر به تکثیر جایگاهی در کروموزوم y دام نبوده و نمی تواند برای تشخیص ناباروری در دام بکار گرفته شود. از میان نمونه های انسانی، میکرودلیشن در سه مورد از افراد مورد مطالعه مشاهده گردید در دو مورد از نمونه های دامی و یک مورد از نمونه های انسانی حذف ژن ddx3y وجود داشت. هیچ کدام از افراد سالم و نمونه های کنترل، حذفی را در نواحی azf نشان ندادند. بطور کلی نتایج این مطالعه نشان داد که بررسی ژن های موثر در ناباروری موجود در ناحیه azf می تواند در تشخیص ناباروری در دام نیز استفاده شود.

تاریخ دوره قاجاریه، یکی از دوره های مهم تاریخ ایران، چه از نظر تحولات سیاسی، اجتماعی و فرهنگی و چه از نظر طول دوره محسوب می شود. در این دوره ما شاهد نگارش بسیاری از آثار تاریخی و تاریخ نگاری هستیم که بخشی از این آثار به چاپ رسیده است. با این حال بخش زیادی از این آثار به صورت نسخ خطی در کتابخانه های داخل و خارج کشور باقی مانده است که ضرورت دارد به منظور شناسایی این دوره تاریخی و پژوهش در ابعاد مختلف آن، تصحیح و مورد نقد و ارزیابی قرار گیرند. یکی از این آثار، تاریخ صاحبقرانی، اثر محمودمیرزا قاجاراست که بخشی از تاریخ ایران در دوره قاجاریه از ابتدای این سلسله تا آغاز سال 1249ق را در دو جلد دربرمی گیرد. وابستگی مولف اثر به خاندان قاجاریه و حضور او در دربار، موجب شده که داده های این اثر از اهمیت زیادی برای تاریخ قاجاریه بخصوص اوایل این دوره برخوردار باشد. هدف این پژوهش بررسی و تصحیح انتقادی نسخه خطی تاریخ صاحبقرانی است. در تصحیح این نسخه خطی، ضمن بازخوانی متن، گزارش های تاریخی داده شده در نسخه، با منابع دیگر و معاصر با رویدادها، بررسی و مطالعه تطبیقی شده است. همچنین ضمن ارائه توضیحات تکمیلی و تعلیقات در تکمیل گزارش های تاریخی، اقدام شده است تا بدین وسیله حتی الامکان اثری کامل و جامع در اختیار پژوهشگران قرار گیرد.

با توجه به نقش و جایگاه باکتری های پروبیوتیک در ایجاد اثرات سلامت بخش و مفید بر بدن و تاکید بر مصرف روزانه این باکتری ها از طریق مواد غذایی، شناسایی و شمارش دقیق این باکتری ها برای تولید فراورده های غذایی پروبیوتیک با کیفیت میکروبی استاندارد از اهمیت زیادی برخوردار است. ماست در سراسر دنیا یکی از مهمترین فراورده های غذایی حامل باکتری های پروبیوتیک به شمار می آید. به منظور ارزیابی باکتری های پروبیوتیک lactobacillus acidophilus در این محصول از واکنش زنجیره ای پلیمراز رقابتی (pcr رقابتی) و real-time pcr که روش های مولکولی مناسب در شمارش باکتری ها محسوب می شوند، استفاده شد.

دردهه اخیر حجم داده های ژنتیکی، رشد بسیار فزاینده ایی داشته است. مطالعات ارتباطی کل ژنومی (gwas) شامل استفاده از چند شکلی های تک نوکلئوتیدی ( snps ) که در سرتاسر ژنوم پراکنده هستند، می باشد تا همبستگی بین تنوع ژنتیکی با تنوع فنوتیپی صفات دارای مکانیسم وراثتی پیچیده بررسی شود. gwas کاربردهای متعددی از جمله شناسایی snp های مرتبط با صفات ، بیماریها، بررسی تنوع ژنتیکی صفات، همچنین بررسی اثرات متقابل ژنها دارد. تلفیق نتایج gwas در انتخاب ژنومی، یکی از کاربردهای دیگر می باشد. هدف از این تحقیق بررسی عوامل موثر روی مطالعات ارتباطی ژنومی در جوامع با ld بالا (گاو) و پایین (انسان) بود. با توجه به ابعاد مختلف سناریوهای این تحقیق ، snp های 200 امین و 600 امین روی کروموزم شماره یک در گاو و snp های 2000 امین و 6000 امین روی کروموزم شماره یک در انسان به عنوان snp های کاندید شبیه سازی شدند. اندازه نمونه، تعداد مارکرهای ژنتیکی، ld ناحیه ژنومی کاندیدا و اندازه اثر snp کاندید در حوزه مطالعات جوامع با ld بالا (گاو) و ld پایین (انسان) ارزیابی شد. ld در جوامع انسانی به مراتب کمتر از گاو می باشد. در این تحقیق مشخص شد، در مطالعات ارتباطی ناحیه ژنومی کاندیدا با ld نسبی بالا، مارکرهای با اندازه اثر 8/1 و 9/1 (نسبت بخت هتروزیگوت و هموزیگوت ، یه ترتیب) حتی با اندازه نمونه زیاد، قابل شناسایی نیست. همچنین مشخص شد در مطالعات نواحی ژنومی کوتاه کاندیدا در حوزه دامی ، احتمال رخداد لایه بندی جمعیتی زیاد است. ld ناحیه کاندیدای ژنومی، روی شناسایی مارکر مرتبط با صفت اثر گذار است، به طوریکه مشخص شد در نواحی ژنومی کاندیدا با ld متوسط، شناسایی snp کاندید با شدت بیشتری امکان پذیر است. در این تحقیق با مطالعه ارتباطی کل ژنومی 50138 snp گاو ، مشخص شد که اگر مارکر مدنظر در ناحیه با ld بالا مستقر باشد، در صورتیکه اندازه اثر آن، 8/1 و 9/1 (نسبت بخت هتروزیگوت و هموزیگوت ، به ترتیب) باشد، شناسایی آن با 2000 نمونه (1000 case و 1000 control ) امکان پذیر نیست. در این تحقیق مشخص شد، با افزایش اندازه موثر snp کاندید، در نواحی با ld نسبی بالا، احتمال تشکیل خوشه ایی از snp ها به عنوان مارکرهای مرتبط با صفت، زیاد می شود. با توجه به ld بالا در مطالعات جوامع دامی، شناسایی مارکر های مرتبط با صفات را نسبت به انسان دشوار تر ساخته است. اگر تعداد snp های مورد ارزیابی در مطالعات ارتباطی نواحی ژنومی برابر باشد، - log p value مارکر (snp) کاندید در جامعه انسانی بیشتر از جامعه دامی است چرا که ld بین مارکرها در جامعه دامی بیشتر است. ولی در مطالعات ارتباطی کل ژنومی، به دلیل تراکم snp های مورد مطالعه در جامعه با ld پایین ، مقادیر – log p value ی snp کاندید کمتر می باشد. در روش کنترل ژنومیک، آماره ? که نشان دهنده میزان اثر لایه بندی جمعیتی است، به نسبت case / control در بین زیرگروه های مختلف جوامع همخون، بستگی دارد بطوری که در این تحقیق مشخص شد، هر چه این نسبت بیشتر از عدد یک منحرف شود، اریبی نتایج مطالعات ارتباطی بیشتر می گردد. در این تحقیق مشخص شد با استفاده از پایگاه داده های ژنومی انسان مثل hap map و نرم افزارهای شبیه ساز همانند qmsim و gwasimulator، امکان شبیه سازی مطالعات ارتباطی ژنومی در جوامع با ld بالا و پایین به راحتی فراهم می گردد.

دو آزمایش به منظور مطالعه تأثیر سطوح مختلف اسانس میخک و پروبیوتیک پروتکسین به صورت تزریق داخل تخم مرغی و همچنین مکمل در جیره غذایی بر عملکرد، خصوصیات لاشه، ترکیبات لیپیدی و شیمیایی سرم خون، صفات بافتی روده، پاسخ ایمنی وبیان ژن های avbd1 و avbd2 جوجه های گوشتی حاصل از این تخم مرغ ها انجام گرفت. در آزمایش اول، به منظور بررسی تأثیر تزریق داخل تخم مرغی اسانس میخک و پروبیوتیک پروتکسین در دوران هچری و تأثیر آن بر عملکرد ، ایمنی و بیان ژن جوجه های گوشتی، آزمایشی در قالب طرح کاملاً تصادفی با 6 تیمار با تعداد 360 عدد تخم مرغ نطفه دار، سویه کاب 500 صورت گرفت. هر تیمار دارای 4 تکرار بود و 12 عدد تخم مرغ در هر تکرار استفاده شد. تیمارها در آزمایش اول شامل: 1- شاهد (بدون تزریق اسانس، آنتی بیوتیک و پروبیوتیک) 2- تزریق آب مقطر3- تزریق اسانس میخک به مقدار ppm50 4- تزریق اسانس میخک به مقدار ppm 100 5- اسانس میخک به مقدار ppm 150 6- تزریق پروبیوتیک پروتکسین به مقدار ppm 100 بود. مواد مورد آزمایش با استفاده از آمپول مجهز به سوزن mm19، در روز 18 انکوباسیون به داخل اتاقک هوایی تخم مرغ ها تزریق شد و سپس 288 جوجهاز جوجه های تفریخ شده انتخاب و تا سن 42 روزگی پرورش یافتند. نتایج این آزمایش نشان داد تزریق پروبیوتیک و ppm 150 اسانس میخک جوجه درآوری را به طور معنی داری افزایش داد. افزایش وزن و ضریب تبدیل جوجه های حاصل از این تیمارها در دوره پایانی(25- 42 روزگی )به طور معنی داری نسبت به سایر تیمارها بهبود یافته بود. مصرف خوراک، خصوصیات لاشه، غلظت تری گلیسیرید، آلانین آمینو ترانسفراز و آسپارتات آمینو ترانسفراز سرم خون تحت تأثیر اسانس میخک و پروبیوتیک قرار نگرفت اما غلظت ldl کاهش و hdl سرم خون در این تیمارها به طور معنی داری افزایش یافت. تزریق پروبیوتیک و ppm 150 اسانس میخک در تخم مرغ ها، صفات بافتی روده جوجه های گوشتی حاصل از این تخم مرغ‏ها را به لحاظ ارتفاع پرز، عمق کریپت و سطح پرز در 42 روزگی بهبود بخشید. نتایج نشان داد که تزریق پروبیوتیک پروتکسین در روز 18 انکوباسیون به داخل کیسه هوایی تخم مرغ، موجب افزایش ایمنی سلولی در 12و24 ساعت پس از تزریق فیتوهما گلوتنین روزگی شد. همچنین موجب افزایش بیان ژن های avbd1 و avbd2 در 42 روزگی شد. در آزمایش دوم، تعداد 240 قطعه جوجه یکروزه سویه کاب 500 به طور طرح کاملاً تصادفی به 5 تیمار و هر تیمار دارای 4 تکرار و 12 قطعه در هر پن تقسیم شدند. 5 تیمار شامل جیره شاهد، جیره های حاوی 150، 300 و 450 ppm اسانس میخک و جیره حاوی پروبیوتیک پروتکسین به مقدار ppm 120 که تا سن 42 روزگی به جیره جوجه ها اضافه شدند. شاخص های اندازه گیری شده شامل عملکرد، خصوصیات لاشه، ترکیبات لیپیدی و شیمیایی خون، صفات بافتی روده ، پاسخ ایمنی و بیان ژن های avbd1 و avbd2 در جوجه های گوشتی بود. مکمل ppm 450 اسانس میخک در جیره، مصرف خوراک، افزایش وزن روزانه و ضریب تبدیل خوراک را به طور معنی داری در دوره پایانی بهبود بخشید و غلظت کلسترول سرم خون را کاهش داد. پروبیوتیک پروتکسین غلظت کلسترول سرم، اسید اوریک پلاسما، ldl و نسبت کلسترول به hdl را در سن 42 روزگی به طور معنی داری کاهش داد . نتایج نشان داد که افزودن پروبیوتیک پروتکسین به جیره ، موجب افزایش ارتفاع ، مساحت پرز و عمق کریپت در 42 روزگی شد. همچنین مکمل سازی باپروبیوتیک پروتکسین موجب افزایش ایمنی همورال در جوجه های گوشتی شد. نتایج حاصل از آزمایشات بیان ژن نشان داد که در42 روزگی افزودن پروبیوتیک پروتکسین و 450 ppm اسانس میخک ، موجب افزایش معنی دار بیان ژن های avbd1 و avbd2 در جوجه های گوشتی شد.

پژوهش حاضر با هدف بررسی نگاره های نسخ? مصور اکبرنام? محفوظ در موز? ویکتوریا و آلبرت لندن صورت گرفته است. نسخ? نام برده یکی از نسخ مصور زمان اکبرشاه (1014-963ق./1605- 1556م.)، سومین پادشاه از سلسل? گورکانیان هند می باشد. پژوهش گر به منظور نیل به هدف در پی پاسخ گویی به این مسائل می باشد که ویژگی عمومی نگاره های نسخ? اکبرنامه چیست و ساختار ترکیب بندی آن ها چگونه است. این پژوهش که با روش توصیفی-تحلیلی و جمع آوری اطلاعات کتابخانه ای صورت گرفته است دارای نتایج کلی بدین شرح می باشد: نقاشی گورکانی تحت تأثیر سه مکتب نقاشی ایرانی، نقاشی اروپایی و نقاشی هندو می باشد که برخی ویژگی های این سه شاخه در نقاشی گورکانی تلفیق شده و به وحدت رسیده اند. نگاره های نسخ? اکبرنامه در فضایی بین دو بعد و سه بعد قرار دارند. نام نگارگران را در اکثر نگاره های این نسخه می توان یافت ولی راجع به زندگی نامه این هنرمندان، اطلاعات چندانی موجود نمی باشد. در هیچ یک از نگاره های نسخ? مورد مطالعه، فضای مسقف مشاهده نمی شود؛ در عین حال در این نگاره ها از ترکیب بندی های متفاوتی استفاده شده است. در برخی نگاره ها ترکیب بندی بسته تر و نما نزدیک تر می باشد؛ در حالی که در گروه دیگری از نگاره ها ترکیب بندی بازتر و نما دورتر می باشد. پژوهش حاضر می تواند برای مراکز پژوهشی هنر اسلامی و هنر شرقی، فرهنگستان هنر، دانشجویان و هنرمندان دارای کاربرد باشد.

سندروم آسیت یک عارضه متابولیکی/ژنتیکی است که در صنعت طیور گوشتی ضرر اقتصادی بسیار زیادی وارد میکند. در این پایان نامه سندروم آسیت علت یابی شد و عامل اصلی آن بررسی گردید. به علاوه بررسی ترنسکریپتوم کل پرندگان سالم با ترنسکریپتوم کل پرندگان آسیتی مورد مقایسه قرار گرفت. در مرحله اول بافت شش به عنوان موثر ترین عامل بروز بیماری شناخته شد. در بررسی ترنسکریپتوم نیز تعداد بالغ بر 100 ژن شناسایی شد که بیان آنها در گروه اسیتی به طور معنی داری متفاوت از گروه سالم بود. در نهایت تعدادی از این ژنها به عنوان ژنهای نشانگر احتمالی آسیت معرفی شدند.

علاقه به تولید آنزیم فیتاز در حقیقت به جهت افزایش دسترسی فسفر و دیگر مواد معدنی در جیره پرندگان و تک معده ای ها و کاهش آلودگی محیطی می باشد. جدایه از قارچ آسپرژیلوس نایجر که بزرگترین هاله را بر روی محیط کشت همراه با سوبسترای اختصاصی داشت، به عنوان سویه اصلی جهت جداسازی ژن فیتاز و کلونینگ آن در حامل ptz57 r/t در نظر گرفته شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 1347 جفت بازی ژن phya انجام و با موفقیت به حامل کلونینگ منتقل شد. بررسی ویژگی های نوکلوتیدی ژن phya جدا شده در این پژوهش نشان داد که قابلیت مناسبی جهت بیان نوترکیب در میزبان بیانی پیشیاپاستوریس دارد.

میکروب های موجود در اکوسیستم میکروبی شکمبه نشخوارکنندگان که کنسرسیوم پیچیده ای از گروه های مختلف میکروبی را تشکیل می دهند، به عنوان دستگاه های متابولیک انجام وظیفه می کنند. این میکروب ها نقش مهمی را در سلامت و عملکرد حیوان ایفا می کنند. کارایی نشخوارکنندگان در استفاده از خوراک های مختلف به علت وجود اکوسیستم به شدت متنوع میکروبی شکمبه می باشد. یکی از مهمترین اختلالات متابولیکی که در نشخوارکنندگان در اثر بر هم خوردن توازن میکروبی و همچنین روابط متقابل میان آنها رخ می دهد اسیدوز شکمبه ای می باشد. این اختلال در اثر تولید بیش از حد اسید لاکتیک در محیط شکمبه پدید می آید و سالانه خسارات فراوانی را بر دامداری های صنعتی سراسر جهان وارد می کند. امروزه علم بیوانفورماتیک جایگاه خاصی را در تمام شاخه های علوم زیستی به خود اختصاص داده و علوم دامی نیز از آن مستثنی نبوده است. در طی سال های اخیر، شبکه متابولیکی شمار زیادی از ارگانیسم های مختلف ساخته شده است، اما مطالعات مرتبط با شبکه های متابولیک میکروب های شکمبه کمتر انجام شده است. شمار ارگانیسم هایی که برای آنها شبکه متابولیکی بازسازی شده است به طور موازی با توالی یابی کامل ژنومی افزایش پیدا کرده است. شبکه های متابولیکی بازسازی شده به یک ابزار ضروری برای مطالعه سیستم بیولوژی متابولیسم تبدیل شده اند. مدل های متابولیکی مبتنی بر ژنوم یک بستر قدرتمندی را برای معنا نمودن اطلاعات ژنومی به بینش عمیق زیستی فراهم می کنند. در پژوهش حاضر به عنوان یکی از اولین مطالعات سیستم بیولوژی شکمبه، مدل های متابولیکی مبتنی بر ژنوم دو گونه باکتریایی استرپتوکوکوس بویس و مگاسفرا السدنی ساخته شدند. در محیط شکمبه یک رابطه متقابل میان این دو باکتری وجود دارد، به طوری که استرپتوکوکوس بویس اسید لاکتیک را تولید می کند و مگاسفرا السدنی آن را مصرف می کند. در گام اول، توالی کامل ژنومی هر دو گونه باکتریایی که از قبل توالی یابی شده بودند و در پایگاه داده img نگهداری می شوند مورد استفاده قرار گرفتند. در این تحقیق، ساخت شبکه متابولیک اولیه از روی اطلاعات انوتیشن ژنومی باکتری ها با استفاده از زبان برنامه نویسی متلب و جعبه ابزار raven صورت گرفت. سپس شبکه های اولیه تصحیح و بهبودبخشی شدند و شکاف های مدل در طی یک فرآیند زمانبر پر گردید. آنالیز موازنه شار بر روی هر یک از مدل ها انجام شد و کیفیت ساخت مدل ها ارزیابی گردید. علاوه بر این از آنالیزهای تغییرپذیری شار، حسایت و توپولوژی برای مطالعه مدل ها با اهداف خاص استفاده شد. نتایج بدست آمده نشان داد که مدل باکتری استرپتوکوکوس بویس (istr472) 694 واکنش، 626 متابولیت و 472 ژن را شامل گردید. همچنین مدل متابولیکی باکتری مگاسفرا السدنی (imeg618) 851 واکنش، 787 متابولیت و 618 ژن را شامل گردید. مدل ها با اطلاعات درون تنی و آزمایشگاهی اعتبارسنجی شدند و توانایی پیش بینی بالقوه آنها برای رفتارهای متابولیکی مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین در این پژوهش روابط متقابل باکتری های تحت مطالعه در تولید و مصرف اسید لاکتیک با استفاده از دو روش مدل سازی اجتماعی (روش آنالیز موازنه شار و optcom) شبیه سازی شدند و مقایسه گردیدند. مقایسه دو روش نشان داد که میان روش ها تفاوت معنی داری وجود ندارد و بهتر است که برای مدل های ساده روابط میکروبی از آنالیز موازنه شار استفاده گردد. در نهایت، کنسرسیوم دو مدل متابولیکی مبتنی بر ژنوم برای پیش بینی مصرف لاکتات تولیدی توسط مگاسفرا السدنی که نقش مهمی را در کنترل اختلال متابولیکی اسیدوز ایفا می کند به کار برده شد. روی هم رفته، مدل های ساخته شده ارگانیسم ها مدل های پیش بینی کننده ای بوده که قادرند بینشی را درباره تولید و مصرف لاکتات میکروبی در شکمبه ایجاد کرده و پیش بینی هایی را نیز از رفتار فیزیولوژیکی ارگانیسم ها ارائه کنند. همچنین از این مدل ها می توان به عنوان ابزاری برای درک بهتر متابولیسم و مهندسی متابولیک باکتری های تحت مطالعه به منظور تولید کمتر لاکتات یا مصرف بیشتر آن در محیط شکمبه بهره برد. در فاز دوم تحقیقاتی، یک سیستم تلفیقی از gis و آنتولوژی برای مدیریت اطلاعات متابولیکی و ژنومی باکتری های مذکور طراحی گردید. سیستم پیشنهادی از توانایی بالایی برای نمایش، مدیریت، استفاده مجدد، به اشتراک گذاری و کوئری نمودن اطلاعات متابولیکی و ژنومی برخوردار است. اطلاعات مدل های ساخته شده در سامانه ابداعی به منظور ارزیابی عملکرد سیستم ثبت گردیدند و عملکرد سیستم با موفقیت آزمون شد. از ویژگی های منحصر به فرد سیستم پیشنهادی می توان به گسترش پذیری آن برای مدیریت اطلاعات متابولیکی و ژنومی سایر میکروب ها نیز اشاره کرد.

طریقت صفوی در سیر بدست گیری قدرت دنیوی سه مرحله از تحول اندیشه ای متمایز را تجربه نمود. شافعیگری – صوفیگری از تأسیس این طریقت تا زمان شیخ جنید مشی غالب بود. این مرحله از طریقت صفوی فاقد برنامه ای جهت رسیدن به قدرت سیاسی بود و همچون بیشتر گرایش های صوفیانه بر زهد و گوشه گیری و کرامات رهبران تأکید داشت. مرحله دوم با کوچ اجباری شیخ جنید به آناتولی و شام آغاز گردید. در این دوره، اندیش? مبارزه طلبانه غالیانه وارد این طریقت گردید و به صورت عملی و نظری طریقت صفوی به دو حوز? غربی و شرقی تقسیم شد. بدین معنی که در حوز? غربی فرزندان ابراهیم شیخ شاه به صورت کامل شافعی گری را کنار گذاشتند. به جای آن اندیشه و باورداشتی وارد طریقت صفوی گردید که به اندیش? «غالیانه» موسوم است. در تقابل این دو برای ریاست فائقه و مسند نشینی طریقت صفوی، حوز? غربی دست بالا را یافت. این امر با حذف شیخ جعفر به عنوان نمایند? حوز? شرقی شروع شد و با تأسیس سلسله صفوی صورت عملی به خود گرفت. تقریبا همه پژوهش ها و تحقیقات جدید دور? نوین اندیشه صفویان را تأئید می نمایند. منتها اختلاف در آغاز، منشاء و چگونگی تحول این دوره جدید است.

از آنجایی که حساسیت به آسیت موروثی بوده، در نتیجه یکی از راه های کنترل این عارضه انتخاب در جهت بهبود کیفیت فراسنجه های خونی است. تخمین پارامترهای ژنتیکی مربوط به فراسنجه های خونی و انتخاب پرندگان بر اساس ساختار ژنتیکی این صفات می تواند در بهبود جوجه های گوشتی موثر باشد. بنابراین هدف این مطالعه تخمین وراثت پذیری و همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی بین پارامتر های خونی و نسبت وزن بطن راست به کل بطن ها (وزن شاخص کارایی قلب) و اندازه گیری وزن بدن در سه سن مختلف (به عنوان شاخص عملکرد) بود. فراسنجه های خونی شامل فشار دی اکسید کربن، فشار اکسیژن خون، اکسیژن اشباع خون، هماتوکریت، بیکربنات و ph خون سیاهرگی که در سن 21 روزگی در 250 جوجه از نژاد آرین اندازه گیری شد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

امروزه نشانگرهای مولکولی نقش عمده و ویژه ای را در صنعت دامپروری بازی می نمایند. در این میان ریزماهواره ها یکی از پرکاربردترین نشانگرهای ژنتیک مولکولی برای شناسایی چند شکلی و تعیین ساختار ژنتیکی در داخل و بین جمعیت ها به حساب می آیند. علاوه بر این، در مطالعات همبستگی بین جایگاه های مختلف ژنی با صفات مهم تولیدی نیز نشانگرهای ریزماهواره ای بسیار مفید می باشند. هدف از این تحقیق آنالیز ژنتیکی چندشکلی جایگاههای qtl موثر بر صفات تولیدی شیر روی کروموزومهای 1، 6، 7 و 20 در گاو هلشتاین با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای بوده است. برای این منظور از 156 راس گاو شیری هلشتاین در مزرعه نمونه آستان قدس رضوی که حداقل دارای یک سال رکورد تولید شیر بوده اند، به صورت تصادفی خون گیری به عمل آمد. پس از استخراج dna به روش نمکی بهینه یافته، تکثیر جایگاه های مورد نظر توسط آغازگرهای اختصاصی و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) صورت گرفت. تکثیر قطعات در نمونه های جمع آوری شده با استفاده از ده نشانگر ریزماهواره ای شامل agla29، ilsts72، bm5004 (کروموزوم 20)، bms1979، ilsts006 (کروموزوم 7)، fbn13، ilsts97، bm143 (کروموزوم 6)، bm1824، bm4307 (کروموزوم 1) انجام شد. محصولات pcr مرتبط به هر نشانگر روی ژل پلی اکریل آمید 8-6 درصد الکتروفورز و سپس ژنوتیپ هر یک از نمونه ها با استفاده از رنگ آمیزی نیترات نقره تعیین گردید. وفور آللی و ژنوتیپی برای هر یک از نشانگرها با شمارش مستقیم آلل ها برآورد و از مدل خطی ساده برای محاسبه اثر آن ها بر صفات تولیدی شیر (میانگین تولید شیر، میانگین تولید چربی، میاگین تولید پروتئین) و نیز میانگین سلول های سوماتیک شیر در شکم زایش های مختلف استفاده شد. تعداد آلل ها در هر یک از نشانگرها به ترتیب 4، 4، 6 (کروموزوم 20)، 4، 4 (کروموزوم 7)، 6، 4، 6 (کروموزوم 6)، 5 و 5 (کروموزوم 1) و با شاخص چند شکلی به ترتیب 651/0، 479/0، 597/0، 535/0، 637/0، 665/0، 635/0، 710/0، 636/0 و 572/0 برای هر یک از نشانگرها برآورد گردید. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده ها وجود اثر qtl در تمامی جایگاهها به جز نشانگر ilsts006 بر صفات تولید شیر در جمعیت مورد مطالعه را نشان داده است. در ضمن، از 10 نشانگر ریزماهواره مورد مطالعه در این تحقیق، 7 نشانگر شامل bm4307، bm1824، bm143، ilsts97، fbn13، agla29 و bm1979 اثر معنی دار بر تعداد سلولهای سوماتیک شیر داشته اند.

بررسی و شناسایی بیماریهای ژنتیکی در جوامع انسانی و دامی از اهمیت ویژه ای برخوردار است و در این راستا استفاده از روش های نوین مولکولی در تشخیص ژن های مغلوب نهفته و اتوزومال در افراد هتروزیگوت ما را در جلوگیری از تشخیص ژن های مغلوب در اجتماع یاری می کند. چندین ژن مغلوب اتوزومال در نژاد های مختلف گاو شناسایی شده اند که باعث مرگ و میر گوساله های تازه متولد شده و یا جنین آنها می گردند. هدف از این تحقیق، بررسی و شناسایی حاملین بیمایهای ژنتیکی نقص در ژن تولید کننده آنزیم یوریدین منوفسفات سنتاز (dumps) و نقص در چسبندگی گلبولهای سفید (blad) در گاوهای بومی نژاد سرابی بود. بدین منظور تعداد 160 راس گاو نر و ماده سرابی واقع در مرکز تحقیقات گاو سرابی (شهرستان سراب، استان آذربایجان شرقی) به میزان 2 سی سی خونگیری صورت گرفت. استخراج dna با روش بوم مبتنی بر گوانیدین تیوسیونات سیلیکاژل انجام شد. در این تحقیق واکنش pcr-rflp برای شناسایی بیماریهای ژنتیکی dumps و blad بهینه شد. قطعات 108 و101 جفت بازی به ترتیب از ژن umps و cd18 با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و جفت پرایمر های اختصاصی طراحی شده برای هر یک از ژن ها تکثیر شدند. پس از انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز عمل هضم آنزیمی (rflp) برای بدست آوردن الگوی هضمی مناسب به منظور تشخیص و شناسایی حاملین انجام شد. محصولات واکنش زنجیره ای پلیمراز به ترتیب برای ژن umps با استفاده از آنزیم ava ? و برای ژن cd18 با استفاده از آنزیمtaq ? هضم گردیدند و برای تایید نتایج حاصله از هضم آنزیمیtaq ? ازآنزیم ???hae استفاده شد. نتایج حاصل از بررسی الگوهای هضمی برای دو بیماری blad و dumps نشان داد که هیچ یک از دام های موجود در ایستگاه تحقیقاتی گاو سرابی حامل ژن های جهش یافته نبودند. این موضوع عدم استفاده از اسپرم های خارجی و اصیل بودن دام های این ایستگاه را تایید می نماید. نتایج حاصل از این تحقیق نشان دادند که لزوم استفاده از تکنیک های مولکولی به منظور شناسایی ناقلین این بیماری ها چه در سطح گله و چه در سطح اسپرم های وارداتی و تولیدی مراکز اصلاحی داخل کشور امری غیر قابل انکار می باشند. همچنین این نتایج نشان دادند که این تکنیک ها می توانند به عنوان ابزاری مفید و قدرتمند به آسانی در مراکز اصلاحی کشور اجرائی شوند و اقتصادی سالم و شکوفا را برای صنعت دامی کشور رقم بزنند.

این آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی در یک دوره 49 روزه با هدف بررسی تاثیر استفاده از پودر عصاره شیرین بیان بر عملکرد و فاکتور¬های خونی جوجه¬های گوشتی انجام شد. به این منظور تعداد 600 قطعه جوجه یکروزه سویه راس 308 با 10 تیمار غذایی تغذیه شدند که هر تیمار دارای 5 تکرار با 12 قطعه جوجه در هر تکرار بود. در این آزمایش 2 نوع جیره غذایی استفاده شد که یکی از آنها بر اساس تامین 100درصد و دیگری 95 درصد احتیاجات اسیدهای آمینه قابل هضم پیشنهادی شرکت راس فرموله شدند. تیمارهای غذایی برای هر یک از دو جیره شامل: یک جیره پایه بعنوان شاهد (بدون افزودنی)، یک جیره غذایی حاوی 2 گرم بر کیلوگرم جیره، پری¬بیوتیک فرمکتو و3 جیره دیگر دارای سه سطح 2، 1 و 5/0 گرم بر کیلوگرم پودر عصاره شیرین¬بیان در جیره آغازین(14-1) بود. در جیره رشد(35-15) سطوح عصاره شیرین¬بیان و فرمکتو به نصف دوره آغازین کاهش یافت و در دوره پایانی(49-35) مکمل شیرین بیان و یا فرمکتو از جیره¬ها حذف شد. در روز 21 یک عدد جوجه از هر تکرار خونگیری و برای اندازه گیری پارامترهای خونی به آزمایشگاه ارسال شد. به منظور بررسی تاثیر تیمار¬های اعمال شده بر ترکیبات لاشه وبرخی اندام¬های گوارشی، کشتار و تفکیک لاشه در دو سن 21 و 49 روزگی انجام شد. نتایج حاصل از این آزمایش نشان داد که اضافه وزن، خوراک مصرفی و ضریب تبدیل غذایی تحت تاثیر تیمار¬های اعمال شده قرار نگرفت. ولی برسی فاکتورهای خونی نشان داد که پرندگانی که از جیره¬های حاوی مقادیر شیرین بیان استفاده کرده بودند در مقایسه با فرمکتو و شاهد کلسترول خون کمتری داشتند. همچنین استفاده از شیرین بیان باعث کاهش چربی حفره بطنی جوجه¬های گوشتی در مقایسه با تیمارهای شاهد و فرمکتو بدون تاثیر منفی بر کاهش وزن بدن شد. استفاده از شیرین بیان در مقایسه با تیمار شاهد و فرمکتو بر روی سایر پارامتر¬های اندازه گیری شده تاثیر معنی داری نداشت.

هدف از انجام این تحقیق، ارزیابی نقش اجزای شیر در بازیافت ویروس‏های روده‏ای و استخراج rna آنها از شیر خام بود. بدین منظور چهار محلول مدل شیر خام از طریق افزودن لاکتوز، پروتئینهای آب پنیر، کازئین و چربی در نسبتهای مختلف ساخته شد. سپس به هر محلول مدل شیر خام از کلی فاژ ms2 در چندین غلظت تلقیح شد. نتایج نشان داد که بیشترین بازدارندگی بر بازیافت کلی فاژ و استخراج rna حاصل از آن متعلق به کازئین و پروتئینهای آب پنیر می‏باشد، در حالیکه موثرترین جزء در تسهیل استخراج rna، چربی شیر خام است. همچنین براساس مدلهای پلی نومیال، ضریب بازیافت کلی فاژ ms2 و بازده استخراج rna آن با میزان ماده خشک محلول‏های مدل شیر خام و غلظت تلقیح ویروس همبستگی نشان داد (به ترتیب 0/67=2r و 0/93=2r). براساس نتایج حاصل می‏توان گفت که با حذف کازئین و پروتئینهای آب پنیر (سانتریفوژ تحت g ×40000 برای مدت یک ساعت) قبل از انجام آزمایش، می‏توان بهترین شرایط را برای بازیافت ویروس‏های روده‏ای و استخراج rna آنها ایجاد نمود. همچنین به دنبال آن به منظور انجام آزمایش‏های ملکولی می‏توان ویروس‏های استخراج شده در بخش محلول را با چربی شیر مجددا مخلوط و هموژن کرد. جهت ارزیابی آلودگی نمونه‏های شیر خام به ویروس‏های روده‏ای، از یک فرایند جدید که بر مبنای جداسازی اجزای شیر خام به همراه استخراج rna ویروسی توسط فنل – تیوسیانات گوآنیدین – کلروفورم استوار است، استفاده شد. مجموعه پرایمرهای nv و ev، براساس روش semi-nested rt-pcr به منظور تعیین میزان آلودگی نمونه‏های شیر خام جمع آوری شده (19=n)، مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج نشان داد که از مجموع 19 نمونه شیر خام، به ترتیب 4 و 6 نمونه حاوی نوروویروس‏های انسانی (ggi و ggii) بودند. این در حالی است که هیچ انتروویروسی در نمونه های شیر خام شناسایی نشد. همچنین قابلیت استفاده از باکتریوفاژهای male-specific rna بعنوان یک جانشین برای شاخص‏های متداول (اشرشیاکلی) در تعیین حضور ویروس‏های روده‎‏ای در شیر خام بررسی گردید. نتایج حاکی از آن بود که هیچگونه همبستگی بین تعداد اشرشیاکلی و حضور نوروویروس‏ها وجود ندارد در حالیکه بین تعداد باکتریوفاژهای male-specific rna و حضور نوروویروس‏ها در شیر خام این همبستگی تایید شد. نوروویروس‏ها در بیشتر نمونه‏های شیر خام با تعداد باکتریوفاژهای بالاتر از شناسایی شدند.

جستجوی ژنولوژیکی، فرایند پیچیده ای می باشد که با استفاده از سوابق تاریخی و گهگاه آنالیز ژنتیکی، به اثبات خویشاوندی افراد می پردازد. از آنجا که ژنوم انسان، دارای بخشی از اطلاعات است که تقریبا بدون تغییر از نیاکان اولیه، نسل به نسل منتقل می شوند، از آنالیز همین بخش از dna به منظور جستجوهای ژنولوژیکی استفاده می شود. single nucleotide polymorphism یا snp ها، فراوانترین شکل از پلی مورفیسم های dna ای هستند که به عنوان نشانگرهای ژنتیکی ساده در بسیاری از هاپلوگروپ ها و تعیین اجداد جمعیت ها مورد استفاده قرار می گیرند. این ویژگی snp ها زمانی که با عدم وقوع نوترکیبی در ناحیه غیرنوترکیب کروموزوم y همراه شود (y-snp)، آن ها را به یک ابزار با ارزش در پیش بینی منشا نژادی و جغرافیایی نمونه های ناشناخته تبدیل می نماید. روش های متعددی برای بررسی snp ها وجود دارد. یکی از کارآمد ترین آن ها که در این پروژه نیز از آن استفاده شده است، روش arms-pcr می باشد. در این روش دو الل متفاوت از یک snp در طول انجام یک واکنش pcr، مورد بررسی قرار می گیرند. همچنین وقوع جهش های نقطه ای و یا جهش های حذف و اضافه کوچک نیز با این روش، قابل شناسایی می باشند. در مطالعه ی حاضر، به منظور بررسی کیفیت این روش در snp-typing، دو هاپلوگروپ c3 و r1a1 انتخاب شدند. بدین ترتیب که برای یافتن این دو هاپلوگروپ، از تعدادی نمونه مرد افغانی، ازبک و تاجیک، به عنوان کنترل مثبت و از نمونه مردان یمنی، به عنوان کنترل منفی، استفاده شد. پس از اطمینان از صحت فرضیه مورد نظر در انتخاب نمونه ها با استفاده از روش توالی یابی، روش arms-pcr بهینه سازی شده و نتایج، توسط الکتروفورز مورد تایید قرار گرفت. در پایان به منظور تایید بیشتر این روش، از تکنیک tetra-primer arms-pcr استفاده شد که صحت نتایج قبلی را کاملا تایید نمود.