باکتری های pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum، pectobacterium atrosepticumو dickeya chrysanthemi عوامل بیماری پوسیدگی نرم و ساق سیاه در بسیاری از محصولات مهم تجاری در طول فصل رشد، حمل و نقل و انبار هستند. این باکتری ها بیمارگر های فرصت طلب هستند که تمایل به ایجاد بیماری در مواقعی که مقاومت گیاه میزبان شکسته شده باشد را دارند. در این تحقیق 109 جدایه از غده و ساقه ی گیاهان سیب زمینی، گوجه فرنگی، هویج و چغندرقند دارای علائم بیماری از مناطق مختلف استان کردستان و آذربایجان غربی جمع آوری گردید. خصوصیات فنوتیپی، بیوشیمیایی و انگشت-نگاری dna در مورد همه ی جدایه ها مورد مطالعه قرار گرفت. مطابق خصوصیات افتراقی فنوتیپی جدایه ها pectobacterium، dickeya و جنس های حدواسط شناسایی شدند. بر اساس آنالیز های نتایج خصوصیات بیوشیمیایی و فنوتیپی جدایه ها به چهار گروه تقسیم شدند. 31 جدایه برای مطالعه تنوع ژنتیکی بر اساس توالی های تکرار شونده در rep-pcr انتخاب شدند. برای انگشت نگاری ژنتیکی از آغازگر های rep، eric و box استفاده شد. الگو های به دست آمده از rep-pcr بر اساس ضریب دایس تجزیه شدند و دندروگرام ها با استفاده از نرم افزار ntsys ver 2/02 و روش upgma رسم شدند. آغازگر های rep، eric و box به ترتیب هفت، شش و پنج گروه را تشخیص دادند. انگشت-نگاری انجام شده توسط rep-pcr توانایی جدا کردن جدایه ها را حتی در سطح زیر گونه دارد. نتایج آزمون های فنوتیپی و ژنتیکی انجام شده، تنوع بالایی را میان جدایه ها نشان داد و میان اثر انگشت ژنتیکی جدایه ها با منطقه نمونه برداری آن ها ارتباط خاصی دیده نشد.