چکیده ارزیابی ایمنی محصولات تراریخته قبل از اینکه وارد زنجیره غذایی انسان شود، لازم است. fao/who راهکارهایی تحت قوانین و مقررات مختلف برای ارزیابی پتانسیل ایجاد بیماری های آلرژی توسط پروتئین های القاء شده به داخل محصولات تراریخته که از طریق مهندسی ژنتیکی ایجاد شده اند، ارائه دادند. بر طبق قوانین ارزیابی آلرژی زایی غذاهای مشتق شده از بیوتکنولوژی یک پروتئین زمانی آلرژی زا است که در قطعات 6 الی 8 اسید آمینه یکسان بهم پیوسته مشابه آلرژن ها و در پنجره های 80 اسید آمینه بیش از 35% با آلرژن ها تشابه داشته باشد و روش سوم شباهت همردیفی کامل توالی است. در این مطالعه با استفاده از سه روش ذکر شده بالا و 4 بانک اطلاعاتی allergenonline، allermatch، adfs و sdap برای پروتئین های glucanase، cry3،cry1ab ، cry1ac، chitinaseو pr1 که به طور وسیعی در محصولات تراریخته استفاده شده است، بهره گرفته شد. هضم آنزیمی در شرایط in silico با استفاده از peptidecutter و peptidemass روی پروتئین های که آلرژی زایی را نشان می دادند، انجام گرفت. نتایج داده ها نشان داد که پروتئین های cry3،cry1ab و cry1ac با آلرژن ها شباهت ندارند اما پروتئین های chitinase، glucanase و pr1 در همه بانک ها با آلرژن ها شباهت نشان دادند. بررسی پتانسیل اپی توپی با نرم افزار پیشگویی پتانسیل اپی توپی در مورد پروتئین pr1 و گلوکاناز هیچ نوع پتانسیل اتصال به ige نشان نداد اما در مورد پروتئین کتیناز در ناحیه sqwgwc پتانسیل اتصال به ige را نشان داد. کلمات کلیدی: آلرژن، ایمنی، اپی توپ، بیوانفورماتیک، پایگاه داده