نام پژوهشگر: ارکان کریمی

شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های احتمالی درگیر در مقاومت به سرمازدگی و یخ زدگی در سیب (malus domestica) و انگور (vitis vinifera)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده کشاورزی 1390
  ارکان کریمی   ناصر مهنا

تنش دمای پایین یکی از مهم ترین عوامل محیطی است که عملکرد گیاهان را محدود می نماید. شبکه وسیعی از ژن های مختلف در تنظیم تحمل گیاه به این تنش نقش ایفا می نمایند. در این تحقیق، نخست 921 عدد از ژن های مذکور از تحقیقات و مقالات معتبر علمی استخراج گردید و سپس به منظور شناسایی ژن های مشابه با آنها در ژنوم کامل دو گیاه سیب (malus domestica)و انگور (vitis vinifera)، توالی آمینو اسیدی این ژن ها در گیاه مدل آرابیدوپسیس از سایت ncbi استخراج شد و با استفاده از برنامه blastp با پایگاه های داده apple gene set (amino acid) و grape gene set (amino acid) در سایت iasma مورد مقایسه قرار گرفت. و نتایج کلی به دست آمده در 8 بازه تشابه مختلف، گروه بندی گردید و ژن های دارای همولوگ و فاقد همولوگ بر اساس معیارهای علمی در هر دو گیاه شناسایی شد.