نام پژوهشگر: محمدرضا رمضانی

مطالعه تاثیر سوربیتول روی دینامیک آنزیم لیزوزیم سفیده تخم مرغ بوسیله تکنیک nmr تعویض هیدروژن-دوتریوم
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه 1388
  محمدرضا رمضانی   حسین نادری منش

چکیده مطالعه تاثیر سوربیتول روی دینامیک آنزیم لیزوزیم سفیده تخم مرغ بوسیله تکنیک nmr تعویض هیدروژن دوتریوم مطالعات دینامیک مولکولی پروتئین ها روش پایه ای برای فهم مکانیسم عملکرد پروتئین ها بر اساس حرکات درونی آن ها می باشد.حرکات درونی پروتئین ها درفرایند تاخوردگی ومطالعه مکانیسم عمل آنزیم نقش مهمی ایفا میکند.شناخت این حرکات ما را در درک صحیح این فرایندها یاری می رساند. در این تحقیق تاثیر سوربیتول روی دینامیک آنزیم لیزوزیم مورد بررسی قرار گرفت.از روش رزونانس مغناطیسی هسته تکنیک تعویض هیدروژن-دوتریوم برای بررسی این اثر استفاده شد.طیف گیری در دو مرحله انجام شد.در یک مرحله آنزیم در سوربیتول25 /. مولار ودوتریوم ودر مرحله دیگر فقط در دوتریوم حل شد.طیف گیری در ph=3.5 ،دمای 35درجه ودر بازه زمانی 1-48ساعت صورت گرفت.سرعت تعویض هیدروژن-دوتریوم برای هیدروژن های آمیدی اسید آمینه های مختلف با هم متفاوت است و شدت پیک این هیدروژن ها با گذشت زمان کاهش می یابد.در نتیجه می توان سرعت تعویض را در اثر این کاهش شدت پیک محاسبه کرد.مهمترین عوامل موثر در سرعت تعویض هیدروژن-دوتریوم شرکت پروتون های آمید در باند هیدروژنی و میزان پوشیدگی هیدروژن آمیدی است.در این مطالعه نشان داده شد که حضور سوربیتول سبب کاهش سرعت تعویض شده وبا افزایش میزان پوشیدگی پروتون های آمید مانع تعویض آن ها می شود وبه نظر می رسد از این طریق سبب کاهش دینامیک آنزیم میگردد. کلمات کلیدی: رزونانس مغناطیسی هسته، تکنیک تعویض هیدروژن-دوتریوم،اسمولیت(سوربیتول)،لیزوزیم سفیده تخم مرغ

طراحی زیستحسگر اپیوئیدی برپایه تثبیت سلول روی بستر الکترود اصلاح شده با نانوذرات
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم زیستی 1393
  محمدرضا رمضانی   حسین نادری منش

امروزه شیوع و گسترش وابستگی به انواع مواد مخدر به چالش و نگرانی عمومی در جهان تبدیل شده بوجود (opioids) است. از سال 1930 تا کنون روشهای تشخیصی گوناگونی برای شناسایی مواد مخدر مورد بررسی قرار hek آمده است.دراین پژوهش اثر آگونیست اسپیرادولین بر روی حیات رده سلول 293 گرفت. هدف از این بررسی (به عنوان یک آزمون پایلوت) ارائه روش ارزان، سریع و با دقت مناسب برای شناسایی مواد مخدر بود . با توجه به پیشرفتهایی که در عرصه زیستحسگرها به وجود آمده، از زیست حسگر سلولی بر پایه روشهای الکتروشیمیایی ولتامتری چرخهای و امپدانس در کنار بررسیهای استفاده شد. در این دو روش الکتروشیمیایی mtt میکروسکوپی و آزمونهای سمیت سنجی همچون تغییرات جریان و مقاومت در برابر انتقال الکترون در سطح الکترود کربن شیشهای اندازهگیری میشود. برای ایجاد بستر مناسب جهت رشد سلول بر روی ظروف مرسوم کشت و سطح الکترود، نانوذرات طلا در پیکره پلیمر کیتوزان هیدروژل قرار داده شد و نانوکامپوزیت حاصل بهصورت جذب فیزیکی قرار گرفت. بر روی الکترود اصلاح شده با ((hek بخش شناساگر زیستی این حسگر (رده کلیه جنین انسان( 293 را بیان میکند که آگونیست (kappa1) بستر نانوکامپوزیت تثبیت شد.این رده سلولی گیرنده کاپا 1 اسپیرادولین بصورت اختصاصی به آن متصل میشود.برای انجام آزمایشهای الکتروشیمیایی از ترکیب 0مولار) فری/فروسیانید استفاده شد. در اثر اتصال اسپیرادولین به گیرنده اپیوئیدی / فعال نمک پتاسیم ( 1 مقاومت در برابر انتقال الکترون و میزان جریان عبوری از سطح الکترود تغییر مییابد که این ویژگی با تحلیل نمودارهای نایکوئیست و نمودارهای جریان در برابر پتانسیل قابل بررسی است. نتایج نشان دادند که تثبیت بستر نانوترکیب و همچنین اتصال سلول به آن منجر به کاهش جریان عبوری از سطح می- گردد. بررسی مسیر کاهش جریان عبوری و افزایش مقاومت نشان داد که این مسیر مشابه منحنی رشد در برابر دارو نشان داد که hek سلول است. پاسخهای ولتامتری چرخهای و ایمپدیمتری سلولهای 293 میزان جریان در حضور دارو افزایش یافته و میزان مقاومت کاهش مییابد که این رابطه در محدوده غلظت پنج تا 20 میکرومولار بصورت خطی بود. با توجه به نتایج میتوان دریافت که این روشها نهتنها از روشهای نوری، ،spr لحاظ غیر تهاجمی بودن بلکه از نظر حساسیت هم باروشهای دیگر مثل فلورسنت و سمیت سنجی قابل مقایسه هستند، با این تفاوت که در روشهای الکتروشیمیایی شرایط مورفولوژیکی و چرخه حیات سلولی تغییر چندانی نمییابند. بنابراین میتوان از روشهایی چون ولتامتری چرخهای و امپدانس در جهت بررسی رفتار سلولها روی سطح و همچنین شناسایی و بررسی اثر داروها و ترکیبات مختلف بر ساز وکار حیاتی آن ها استفاده کرد.