نام پژوهشگر: پروانه پاکروان
پروانه پاکروان محمد مهدی خدایی
برهمکنش dna تیموس گاوی با isatin و دو مشتق سنتزی آن , isatin-?-thiosemicarbazone, ibt isonicotinylhydrazone(iinh) isatin-3- در ph فیزیولوژیکی مطالعه شد. برهمکنش ها با طیف سنجیuv-vis،طیف سنجی فوتومتری، آزمایشات رقابتی، دورنگ نمایی دورانی، تکنیک ویسکوزیمتری مطالعه شد. هیچ جابجایی قرمز و نقطه ایزوبستیک در طیف های جذبی مرئیisatin مشاهده نشد. یک واکنش خاموش شدن قوی فلوئوسانس isatin با dna مشاهده شد و ثابتهای پیوندیkfdna-isatin و تعداد جایگاههای پیوندیn در 297 درجه کلوین محاسبه شد که بترتیب 105 × 8/5 و 42/1 بود. پارامترهای ترمودینامیکی، تغییر آنتالپیh?و تغییر آنتروپی?s طبق معادله وانت هوف محاسبه شد که 22/27 کیلوژول/مول و201ژول/مول کلوین بود که نشان می دهد واکنش بطور اصلی آنتروپی جلوبرنده است ویسکوزیته dna و نتایج خاموش شدن یدید پیشنهاد می کند که isatin درون جفت بازهایdna اینترکلیت نمی شود و تک رشته dna (ss-dna) یک اثر خاموش کننده قوی رویisatin در مقایسه با dna دو رشته (ds-dna)دارد. طیف های دو رنگ نمایی دورانیdna نشان دهنده تغییرات عمیق کانفورماسیونی در مارپیچ dna است همه نتایج نشان می دهد که isatin از طریق groove binder با dna برهمکنش می کند. مولکول iinh می تواند در بین جفت بازهایdna اینترکیلیت شود که توسط شواهد زیر ثابت می شود: هیپوکرومیسم در طیف جذبیuv از iinh، تغییرات طیف دورنگ نمایی دورانی القا شده، افزایش شدید در ویسکوزیته dna و افزایش در فلوئورسانس محلول dna-mb در حضور افزایش مقدار iinh که نشان دهنده آن است که iinh قادر به آزاد کردن mb اینترکلیت شده کامل است. علاوه بر آن، آنتالپی و آنتروپی از واکنش بین iinh و ct-dna نشان می دهد که واکنش آنتالپی مطلوب است (h=-30.18kj/mol, ?s=-20.46j/mol k?). که شاهد دیگری که iinh قادر به اینترکلیت در جفت بازهایdnaاست. ibt توسط اینترکلیت شدن در dna پایدار شده است (ثابت پیوندی آن (kibt-dna=1.03×105 است و رنگ نترال رد را از کمپلکس nr-dna در یک واکنش رقابتی با استفاده از طیف سنجی مرئیuv جایگزین می کند. ثابت های پیوندیkf و تعداد جایگاههای پیوندیn=1 ازibt با dna توسط روش خاموش کردن فلوئورسانس در دماهای مختلف بدست آمد. علاوه بر آن آنتالپی و آنتروپی واکنش بین ibt و dna نشان می دهد که واکنش آنتالپی مطلوب آنتروپی نامطلوب است (?h=-49.87kj/mol, ?s=-75.152j/molk) و افزایش ویسکوزیته از محلول dna شاهد دیگری است که نشان می دهد که مولکول ibt قادر به اینترکلیت در جفت بازهایdna است. مقایسه بین شدت ثابت های پیوندی با استفاده از uv نتیجه می دهد که ibt-dna(1.03×105)? (1.0×105)iinh-dna بزرگتر از isatin-dna(7.34×104m-1) است که به نظر منطقی می رسد از آنجایی که iinh, ibt ناحیه مسطح بزرگتر و سیستم الکترونی? گسترده تر از isatin دارد. که باعث می شود که iinh, ibt بطور عمیقتر داخل dna نفوذ کنند و خیلی قویتر با جفت بازهایdna برهمکنش داشته باشند. این داده ها نشان می دهد که داروی اینترکلیت شده اثر مهمتر روی قدرت پیوندیdna دارد. باید توجه شود که احتمال اینترکلیت شدن مشتقات ایندول (isatin) بین جفت بازهایdna کم است بطور اصلی بخاطر نیروهای برهمکنش کم موثر بین هسته ایندول و بازهایdna است. همه ترکیبات از مطالعه حاصله، فعالیت ضعیف تا متوسط مقابل باکتریهای تست شده مشخص نشان دادند. کلمات کلیدی: dna تیموس گاوی، ایزاتین بتا سمی کاربازون، ایزاتین 3- ایزونیکوتینیل هیدرازون، اینترکلیت، اتصال groove، اندازه گیری ضد میکروبی