خرما با نام علمی "phoenix dactilyfera" (2n=36) گیاهی است چند ساله و دو پایه، یعنی گلهای نر و ماده روی پایه های جداگانه ای قرار دارند و در طبقه بندی گیاهی از زیر شاخه نهاندانگان و در رده تکه لپه ای ها و راسته اسپات داران (پالمان) و از خانواده پالماسه می باشد. در این خانواده قریب 200 جنس و 4000 گونه وجود دارد که همگی بومی مناطق گرمسیری و نیمه گرمسیری جنوب آسیا و آفریقا بوده همچنین در نواحی گرم قاره های آمریکا ، اروپا و اقیانوسیه پراکنده هستند در ایران 2%از سطح زیر کشت کشور را به خود اختصاص داده است. از دیگر گونه های مهم خرما علاوه بر phoenix dactilyfera می توان به phoenix canariensis ، phoenix sylvesteris و phoenix atlantic chav اشاره نمود. دراین تحقیقات سیزده ریزماهواره ازخرما با روش فیاسکو جداسازی گردید که از دوازده کاوشگر جهت جداسازی استفاده بیشترین تکرار ریزماهواره ها مربوط به نوکلئوتید ag وct بودند. سپس با استفاده ازنرم افزار فایندر ریزماهواره-ها شناسایی شدند. برای هر ریزماهواره یک جفت آغازگر طراحی شد که طراحی طبق قوانین خود و با استفاده ازنرم-افزار الیگو انجام شد. چندشکلی درهر جایگاه ژنی یا لوکوس بر روی44 نمونه بررسی شد که نه تا ازآغازگر ها دارای چند شکلی بودند و سه تای دیگر از آغازگر ها تک شکلی بودند. اندازه مولکولی آللها از 120 تا 220 جفت باز ارزیابی شد.نشانگرهای mph 1 و mph 7 بیشترین مقدارچندشکلی برابر با 69/0 و 59/0 و نشانگر mph 11 کمترین چند شکلی برابر با 10/0 را دارا هستند. به این معنی که این دو نشانگر، بهتر از همه نشانگرهای استفاده شده، توانسته اند فاصله ژنتیکی ارقام را مشخص کنند در حالیکه نشانگر mph 11 با کمترین مقدار شاخص چندشکلی، به خوبی توانایی جداسازی نمونه ها را نداشته است .از آنجایی که هم اکنون کلید شناسایی برای خرما پیدا نشده است، دراین تحقیق پیشنهاد می شود که تکرار توالی ریزماهواره نشانگر خوبی برای ارزیابی مولکولی و مطالعات ژنتیکی و تهیه کلید شناسایی خرما می باشد.

چکیده تایروزینازها (monophenol, o-diphenol:oxygen oxidoreductase, ec 1.14.18.1) از جمله پروتئینهای مس دار نوع 3 هستند که در نخستین مرحله سنتز ملانین دخالت دارند. این آنزیم ها دو واکنش اورتو-هیدروکسیلاسیون مونوفنل ها و اکسیداسیون اورتو-دی فنل ها را با هدف تولید اورتو-کوئینون کاتالیز می کنند. اورتو-کوئینون با ایجاد ترکیبات حدواسط، در تولید رنگدانه های قهوه ای شرکت می کند. این آنزیم در میکروارگانیسم ها، قارچها، گیاهان و جانوران با عملکردهای بیولوژیک متفاوت یافت می شود. در قارچ ها، تایروزیناز عموماً با تشکیل و ثبات اسپورها، مکانیسم های دفاعی و ترشحی، قهوه ای شدن و تولید رنگدانه ها مرتبط است. قارچ neurospora crassa متعلق به رده آسکومیست ها بوده و منبع مناسبی برای استحصال دو آنزیم تایروزیناز و لاکیز می باشد. این آنزیمها به طور طبیعی در مرحله زایشی قارچ تولید می شوند اما در مرحله رویشی نیز با افزودن ترکیبات بازدارنده رشد مانند آنتی بیوتیک ها و آمینواسیدها و یا صرفاً با تنش قحطی در بافر فسفات می توان تولید آنها را القا کرد. در این تحقیق شرایط بهینه برای تکثیر n.crassa ابتدا مورد مطالعه قرار گرفت. سپس تولید تایروزیناز توسط fgsc#321 از طریق اعمال شرایط القای متفاوت نیز بررسی شد. برای تکثیر سویه از محیط پایه ووگل استفاده شد. عوامل موثر بر میزان رشد، با اندازه گیری وزن خشک میسلیوم های قارچ، بررسی شده و مشخص شد که شرایط بهینه برای رشد سویه، دمای °c25، ph 6، 5/2-2 درصد ساکارز، تاریکی، سکون و زمان 5 روز می باشد. تأثیر القاکننده ها بر تولید تایروزیناز با سنجش فعالیت کرزولازی و کتکولازی عصاره حاصل از میسلیوم های قارچ که در محلول sds سونیکه شدند بررسی گردید. نتایج نشان داد که القاکننده ها قادرند فعالیت کرزولازی عصاره را تا 400% افزایش دهند.

اولین مرحله تولید اسید چرب در موجود زنده ، کربوکسیله شدن مولکول استیل کوآنزیم a می باشد که این عمل تحت تاثیراستیل کوآنزیم a کربوکسیلاز صورت می پذیرد . بدین ترتیب که استیل کوآنزیم a کربوکسیلاز یک co2را بر روی استیل کوآنزیم a تثبیت و تولید مالونیل کوآنزیم a می کند که واسطه کلیدی در بیوسنتز اسیدهای چرب و متابولیت های ثانویه گوناگون است. ژن تک کپی پلاستیدی و سیتوسولی استیل کوآنزیم آ کربوکسیلاز، اولین گام کاتالیزی در بیوسنتز اسیدهای چرب، جهت مطالعه ی روابط فیلوژنتیکی، تکاملی و سیستماتیکی خانواده ها توانایی زیادی دارد. بیوانفورماتیک شاخه ای از علم زیست شناسی است که به ذخیره، تجزیه وتحلیل وتفسیراطلاعات آزمایشگاهی می پردازد. درتجزیه های فیلوژنتیکی روابط تکاملی بین مواد ژنتیکی مدنظراست. این روابط تکاملی به وسیله مطالعه جهش های جایگزینی، حذف، ازدیاد وجهش با آرایش مجدد تعیین می شود که درمعرض انتخاب طبیعی قرارمی گیرند. درواقع فیلوژنی به مفهوم روابط تکاملی بین موجودات یا ژن های آن ها می باشدکه درطول زمان با فرآیندهایی از اجداد مشترک خود مشتق شده اند.با توجه به نقش کلیدی acc ها در گیاهان این تحقیق به منظور بررسی روابط تکاملی درacc های 4 خانواده brassicaceae ، poaceae، polygonaceae و fabaceae انجام شد و برای این منظور تعداد 430 توالی از سایت ncbi استخراج شد که در نتیجه توالی های اسخراج شده گیاهان مورد مطالعه بصورت سیستماتیک بررسی شدند.براساس نتایج حاصل شده از روابط تکاملی گیاهان فوق در خصوص ژن مذکور می توان چنین بیان نمودکه احتمالا ژن های تک نسخه و یا کم نسخه دستخوش تکامل گروهی شوند کم می باشد.این ژن را شاید بتوان در گروه ژن هایی که در طی فرایند تکامل دستخوش تغییرات اندکی شده اند، قرار داد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنتیکی در این تحقیق با سایر مطالعات بدست آمده از تحقیقات مورفولوژیکی و مولکولی مطابقت دارد.

جداسازی باکتری های استرپتومایسس از خاک های مناطق مختلف انجام گرفت سپسبا استفاده از ژن 16srdna باکتری های استرپتومایسس شناسایی شدند.سپس قارچ پاتوژن جداسازی گردید و سپس قارچ پاتوژن وباکتری آنتاگونیست دوال کالچر شده وتاثیر بازدارندگی مورد بررسی قرارگرفت.

لکه موجی گوجه فرنگی با عامل آلترناریا مخرب ترین بیماری قارچی گیاه گوجه فرنگی است. تجزیه توالی نواحی ژنی مشابه مناطقits ، mtssu، lsu، tubulin-? و اندو-پلی گالاکتروناز نتوانسته بین آلترناریا هایی با کنیدیوم کوچک تفکیک قائل شود. لذا در طی این تحقیق با تکثیر منطقهigs با استفاده از pcr-rflp به مطالعه تنوع ژنتیکی ناحیه igs درگونه های آلترناریا عوامل بیماری شانکر ساقه و لکه موجی برگ گوجه فرنگی در ایران پرداخته شد. پنج گونه تحت بررسی در این تحقیق شامل a. arborescens، a. dumosa، a. alternata، a. tenuissima و a. infectoria بودند که از برگ ها وساقه های آلوده مناطق گوجه فرنگی کاری استان های اصفهان، همدان، لرستان، خراسان رضوی، خوزستان، فارس، تهران، مرکزی و گلستان خالص سازی و شناسائی شده بودند. طول قطعات حاصل از تکثیر منطقه igs گونه های فوق دارای اندازه های متفاوت بین 2000-3000 جفت باز بودند. بیشترین گونه جدا شده از نمونه ها در بین جدایه ها a. arborescense بود لذا تنوع درون گونه ای آن مورد بررسی قرار گرفت. در بین باندهای تشکیل شده هیچ چندشکلی دیده نشد و اندازه باندهای به دست آمده، بین 2000-3000 جفت باز بود ولی در نمونه های مربوط به جدایه های سایر گونه ها اندازه باندهای به دست آمده، بین 2000-3500 جفت باز مشاهده شد. در مجموع بیشترین شباهت بین دو جدایه a. alternataوa. arborescense با ضریب تشابه 87/0 و کمترین تشابه بین دو جدایه infectoria .a و a. tenuissimaبا ضریب تشابه72/0بود. ارزیابی مقاومت در مرحله گیاهچه به بیماری لکه موجی در شرایط گلخانه ای بر روی 32 نمونه ژنتیکی از کلکسیون گوجه فرنگی بانک ژن گیاهی ملی ایران انجام شد. میزان حساسیت وسطح تحمل موجود ثبت شد که از این میان نمونه های ژنتیکی 3/2، 3/6، 2/33، 3/24 به عنوان مقاوم ترین شناسایی شدند.

چکیده ارزیابی کمی میزان فعّالیت آنزیم های کاتالاز و پراکسیداز تولید شده در برگ گیاه جودر مرحله گیاهچه درشرایط تنش شوری واستفاده ازآن به عنوان یک شاخص کمی برای مکان یابی qtlهای دخیل در تحمل به شوری روش جدیدی است که در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفته است. در این تحقیق ابتداوالدین چهارجمعیت نقشه بابی جو(owb، l94xv، suxv ، suxcc) برای مطالعه توارث پذیری ووجود تنوع لازم برای صفات مورد مطالعه(میزان فعالیت آنزیم کاتالاز و پراکسیداز)درآنها مورد آزمایش قرار گرفتند. با اندازه گیری سطوح کمی پروتئین و میزان فعّالیت آنزیم های کاتالازو پراکسیدازاستخراج شده از محلول عصاره پروتئین برگها، در مرحله گیاهچه، تنوع قابل ملاحظه ای از نظرصفات مورد مطالعه بین والدین جمعیت owb درسطح شوری200میلی مول nacl در هر سه تکرارمشاهده شد. تعداد 94 لاین دابل هاپلوئید مربوط به این جمعیت برای بررسی چگونگی تفرق صفات مورد مطالعه ومکان یابی qtlهای تحمل شوری مورد آزمایش قرار گرفت. در این مطالعه میزان فعّالیت این دوآنزیم به عنوان دو صفت کمی در دوسطح شوری ]صفر(شاهد)و200میلی مول [nacl در افراد جمعیت کمیت سنجی گردید وتجزیه های آماری با نرم افزار اکسل و آنالیزهای مربوط به مکان یابی qtlها بوسیله برنامه های نرم افزار mapqtl5انجام گرفت. نتایج این تحقیق نشان داد که ردیابی qtl ها برای تحمل به شوری بستگی به سطح غلظت نمک وصفت مورد مطالعه دارد، بطوریکه دراین تحقیق برای آنزیم پراکسیداز، علی رغم وجود تفاوتهایی معنی دار در بین والدین و نیز افراد جمعیت توده نقشه یابی، هیچ مکان ژنی مرتبط با این صفت یافت نشد امابرای میزان فعالیت آنزیم کاتالاز تعداد دوqtl باآستانه معنی داری(lod) بالای سه ، یک qtl برروی کروموزوم(3h)3 و یکqtl برروی کروموزوم(4h)4وتعداددوqtl با پروفیل lodاندکی پایین ترازآستانه معنی داری، یکی برروی کروموزوم(1h)5 ودیگری برروی کروموزوم (5h)7 مکان یابی شد. نتایج این بررسی نشان داد که میزان فعالیت آنزیم کاتالاز می تواند به عنوان یک صفت کمی در مکان یابی qtl های دخیل در تحمل به شوری مورد استفاده قرار گیرد. کلمات کلیدی : مکان یابی qtl ها، جو، آنزیم کاتالاز، آنزیم پراکسیداز، مکانیسم های تحمل شوری

هدف این تحقیق، ساخت میکروذرات کاتیونی شده طلا و به کارگیری آنها جهت افزایش انتقال ژن به سلول های گیاهی به روش زیست پرتابی است. سطح میکروذرات طلا با اندازه 1 میکرون در طی 2 مرحله کاتیونی شد. بدین منظور در مرحله اول، با ایجاد گروه های کربوکسیلیک بر روی سطح میکروذرات طلا از طریق تشکیل یک تک لایه ی خود آرا از ملکول 12-مرکاپتودودکانوئیک اسید (mdda) و در مرحله دوم، با ایجاد پیوند کووالانسی بین گروه های آمینی ملکول های پلی اتیلن ایمین (pei) و گروه های کربوکسیل mdda سطح میکروذرات طلا با گروه های آمینی ملکول های pei دارای بار مثبت شد. گروه های آمینی سطح میکروذرات طلا دارای قابلیت جذب الکتروستاتیک مولکول های dna که بار منفی قویی دارند، هستند. با استفاده از آنالیز طیف سنج فوتوالکترون پرتو ایکس ((xps، نشان داده شد میزان نیتروژن اتمی که نشانگر وجود گروه های آمینی بر روی سطح هستند از صفر درصد بر روی سطح اصلاح نشده به حدود 7/8 درصد اتمی بر روی سطح کاتیونی شده می رسد. اثر افزیش غلظت نمک در بافر بر میزان جذب dna بر روی ذرات کاتیونی شده نیز بررسی شد. نتایج نشان داد غلظت نمک باعث افزایش میزان جذب dna توسط میکروذرات کاتیونی شده از 37/0 به mg dna.g-1 au particles 87/0 می شود. در ادامه به منظور ارزیابی عملکرد میکروذرات کاتیونی شده طلا در انتقال ژن به سلولهای گیاهی، از سامانه ژن گزارشگر gus به منظور ارزیابی فعالیت ژن انتقال داده شده در کالوس های توتون تراریخته استفاده شد. شمارش تعداد نقطه های آبی حاصل از فعالیت ژن انتقال داده شده، نشان داد میزان انتقال ژن توسط میکروذرات کاتیونی به طور متوسط دو برابر بیشتر از آن توسط میکروذرات اصلاح نشده است. افزودن نمک با غلظت 5/0 مولار باعت شد انتقال ژن به طور متوسط تا سه برابر دیگر افزایش یابد. استفاده از روش ارائه شده می تواند گام موثری در افزایش کارایی بیان ژن های انتقال یافته و عملکرد گیاهان تراریخت حاصله از طریق زیست پرتابی محسوب گردد.

چکیده نخل خرما (phoenix dactylifera l.) درختی دوپایه، دیپلویید (36=x2=n2( و تک لپه بوده که به منظور افزایش بهره برداری غذایی، اقتصادی و صنعتی و نیز مقابله با تنش های زیستی و غیرزیستی در تولید خرما، در بیوتکنولوژی مدرن مورد توجه قرار گرفته است. در این تحقیق، گیاهچه های خرمای تراریخت شده با سازه ژنی pbi221 (شامل پیش برنده camv 35s، ژن گزارشگر gus و پایان دهنده nos)، برای تأیید تلفیق و نسخه برداری تراژن و تعیین تعداد جایگاه های ژنی، با pcr، rt-pcr و دورگه سازی ساترن ارزیابی شدند. با مقایسه نتایج حاصل از چندین روش استخراج dna ژنومی از بافت برگ، روش تغییریافته سمبروک، نسبت به سایر روش ها نتیجه مناسب تری را دربرداشت. درعین حال، استخراج rna نیز به کمک سه روش رایج مورد مقایسه قرار گرفت. کیفیت و کمیت dna و rna از طریق تعیین میزان جذب در روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز روی ژل آگارز سنجیده شد. از تفکیک محصولات تکثیریافته با آغازگرهای همگانی s18 و اکتین و آغازگرهای اختصاصی ژن gus و توالی های 35s و nos بر روی ژل، قطعات مورد انتظار مشاهده گردیدند. بیان ژن انتقال یافته از طریق آزمون rt-pcr و به کمک آغازگرهای اختصاصی تراژن gusو نیز آغازگرهای ژن کنترل اکتیناثبات شد. پس از انجام آنالیز دورگه سازی به روش ساترن و مقایسه نتایج با داده های حاصل از rt-pcr، نمونه واجد یک نسخه از تراژن در قیاس با لاین دونسخه ای، مطلوب تر و بیان بهتری را نشان داد. ظهور لکه های آبی در آزمون هیستوشیمیایی gus، عملکرد و بیان ژن uida را تایید نمود. بررسی ها، بیانگر مناسب و موثر بودن روش بمباران ذره ای جهت انتقال ژن به گونه نخل خرما بوده و ارزیابی های انجام شده می توانند توسط محققین بعدی در آنالیز گیاهان تراریخت خرما استفاده گردند. کلمات کلیدی: نخل خرما، آنالیز مولکولی، rt-pcr، دورگه سازی ساترن، سنجش gus

این آزمایش با هدف بررسی تنوع ژنتیکی در لاین های موتانت گزینش شده برای مقاومت به ریزش غلاف در کلزا, با استفاده از نشانگرهای ملکولی در پژوهشکده تحقیقات کشاورزی، پزشکی و صنعتی پژوهشگاه علوم و فنون هسته ای در سال 1390 انجام شد. در این تحقیق دو لاین اکاپی و لیکرد و 32 لاین موتانت آن با استفاده از 20 آغازگر تصادفی rapd مورد ارزیابی قرار گرفت که فقط 12 آغازگر (opa-1، opa-2، opa-3، opa-4، opa-5، opa-8، opa-9، opa-10، opa-11، opa-13، opa-20 وopu-1) باندهای قابل قبولی را ایجاد نمودند. dna حاصل از بذور جوانه زده لاینها به روش ctab استخراج گردید و به وسیله آغازگرهای مورد مطالعه pcr گردیدند. محصول pcr در ژل 5/1 درصد آگاروز الکتروفورز شده و امتیازدهی باندهای موجود در هر ژل بر مبنای صفر و یک انجام شد.تجزیه واریانس مولکولی، ضریب تشابه، تجزیه خوشه ای، محتوای اطلاعات چند شکل (pic)، ضریب همبستگی کوفنتیک، تجزیه به مختصات اصلی (pcoa) برای داده های بدست آمده با استفاده از نرم افزارهای ntsys و ginalax محاسبه گردید. بین جمعیت والدینی و موتانت ها در amova، اختلاف معنی داری مشاهده شد. آغازگرopa-1 با 8 نوار و آغازگر opa-3 با 3 نوار، به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد قطعات تکثیرشده را ایجاد نمودند. دامنه محتوای اطلاعات چند شکلی(pic) مشاهده شده در این تحقیق بین 202/0-473/0 بوده که آغازگرopa-9 با pic برابر473/0 بیشترین محتوای اطلاعات چند شکلی را داشته در مقابل، آغازگر opa-10 با pic برابر 202/0کمترین محتوای اطلاعات چند شکلی را داشت. در تجزیه خوشه ای براساس فواصل ادغام و ضریب تشابه ژاکارد، خط برش درنقطه 34/0 در نظر گرفته شد. بر این اساس ژنوتیپ ها در 4 گروه مختلف دسته بندی شدند.گروه اول شامل ژنوتیپ لیکرد به همراه تعداد 24 لاین موتانت حاصل از همین ژنوتیپ بود. رقم اکاپی به تنهایی و مستقل از سایر لاین ها در گروه دوم قرار گرفت. چهار لاین موتانت a3-16، a3-22، a3-17 و a3-10 در گروه سوم و دو لاین موتانت a2-2 و a19-4 در گروه چهارم قرار گرفتند. مقدار ضریب همبستگی کوفنتیک برای دندروگرام حاصل از روش همبستگی کامل با ضریب تشابه ژاکارد، 89/0 بدست آمد که نشان داد که حدود 89% اطلاعات ماتریس تشابه به دندروگرام منتقل شد است.در تجزیه به مختصات اصلی، مولفه اول 57% از تغییرات بین ژنوتیپ ها را بر اساس داده های ملکولی توجیه کرده و پس از آن مولفه های دوم و سوم بترتیب با مقادیر 40/4 و 77/3 درصد بیشترین واریانس را به خود اختصاص داده اند. نتایج نشان داد که آغازگرهای rapd مورد استفاده در این پژوهش در تمایز بین لاینها و تعیین روابط بین آنها به خوبی عمل کردند. بنابراین می توان آغازگر های rapd مورد استفاده در این مطالعه را به عنوان یک ابزار موثر و مفید در مطالعه تنوع ژنتیکی بین این سری از لاین های کلزا معرفی نمود.

بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‏های بومی پیاز ایرانی در مقایسه با انواع خارجی چکیده: برنامه های اصلاحی گیاهان بر اساس تنوع و انتخاب صفات برتر کمی و کیفی صورت می گیرد. لذا، ارزیابی تنوع ژنتیکی، اولین مرحله در برنامه های اصلاحی است. در این راستا، استفاده از روش های جدید مطالعه‏ی تنوع ژنتیکی ضروری به نظر می رسد. در این بررسی تعیین تنوع ژنتیکی سیزده ژنوتیپ پیاز ایرانی در مقایسه با دو ژنوتیپ خارجی با استفاده از نشانگر رپید ( rapd) صورت گرفته است. پس از استخراج dna و بهینه سازی شرایط آزمایش، یازده آغازگر تصادفی استفاده شد که در ژنوتیپ های پیاز چند شکلی نشان داده بودند. محاسبات آماری بر اساس ضریب تشابه جاکارد و گروه بندی به روش upgma با استفاده از نرم افزار ntsys ver. 2.02 انجام شد. در نمودار حاصل در حد تشابه 94 درصد ژنوتیپ ها در پنج گروه جای گرفتند. ضریب کوفنتیک(cophenetic) بین ماتریس تشابه و نمودار حاصل87/0r = به دست آمد. ژنوتیپ های سفید قم و یزد با ضریب تشابه 94 درصد بیشترین تشابه و ژنوتیپ های کاشان و پادوک با ضریب تشابه 30 درصد کم ترین تشابه را نشان دادند. ژنوتیپ های تگزاس‏ارلی‏گرانو و خمین در یک گروه با ضریب تشابه 80 درصد و یلو سوئیت‏ ‏اسپانیش و یاسوج با ضریب تشابه 83 درصد در گروه دیگر قرار گرفتند. لذا، این احتمال وجود دارد که اجداد اولیه‏ی دو ژنوتیپ تگزاس‏ارلی‏گرانو و سوئیت‏یلو‏اسپانیش متعلق به ژنوتیپ‏های مورد آزمون ایرانی باشند. کلید واژه ها: پیاز (allium cepa) ، تنوع ژنتیکی، ژنوتیپ‏های پیاز ایرانی، rapd studies on genetic diversity of iranian onion in comparison to exotic genotypes abstract plant breeding programs are based on variation and selection of high quality and quantity characters. evaluation of genetic materials is the first step in every breeding program. the use of new methods of genetic variation studies are very necessary, in order to select the hybrid parents and determination of genotypes relationship. random amplified polymorphic dna (rapd) molecular marker has been already used to determine genetic diversity. in this study rapd marker was used to verify genetic diversity between 13 iranian onion genotypes in comparison to two american ones. the data were subjected to statistical analysis, using ntsys, ver. 2.02 software based on similarity coefficient matrix with upgma method. the cophenetic coefficient between similarity matrix and the resulted dendrogram was r = 0.87.the result showed that the analyzed genotypes had a genetic similarity rate of 94 percent for sephid ghom and yazd. whereas, azarshahr and behbahan with 32 percent were ranked in an another group respectively as far as similarities are concerned. so, texas early grano and khomain are in the same group with similar coefficient of 80 percent. yellow sweet spanish and yasouj are also in the same group too. in the view, it seems to be that, there are similarities, indicating the ancestors are from the southwest asia, iran. key words: onion ( allium cepa), genetic diversity, iranian genotype onion, rapd

استرپتومایسس ها همواره به عنوان یک منبع اصلی تولید کننده متابولیت های ثانویه متنوع و آنتی بیوتیک ها مورد توجه می باشند. گزارش های زیادی از کنترل بیولوژیکی بیماری های خاکزاد با استفاده از گونه های استرپتومایسس وجود دارد که برخی از گونه های این جنس تحریک کننده رشد گیاه نیز می باشند. فعالیت آنتاگونیستی 5 جدایه از باکتری های استرپتومایسس جدا شده از نمونه های خاک مناطق بومی، بر علیه 2 گونه قارچ بیماری زای گیاهی آلترناریا آلترناتا، عامل بیماری ایجاد لکه، فساد و سوختگی بر روی بیش از 350 گونه گیاهی و آلترناریا سولانی که عامل بلایت زودرس، مشخصاً در سیب زمینی می باشد، برای کنترل بیولوژیک مورد ارزیابی قرار گرفت. برای انجام این آزمایش باکتری های جنس استرپتومایسس که از مناطق مختلف آذربایجان شرقی جداسازی شده و آزمون مولکولی s rdna16 آن ها انجام شده بود، تهیه گردید. پس از جداسازی و شناسایی پاتوژن های قارچی، با استفاده از کورک بوره استریل، مقاطعی 5 میلی متری از باکتری ها و قارچ ها در دو طرف پلیت حاوی محیط کشت مغذی pda قرار داده شدند و به مدت 20 روز در دمای 28 درجه سانتی گراد انکوبه گردیدند. تمامی جدایه های استرپتومایسس توانستند رشد قارچ های بیمارگر را مهار کنند و ایجاد هاله بازدارندگی نمایند. به طور میانگین جدایه 3dh با ایجاد هاله ای به شعاع 0.98 سانتی متر بیش ترین فعالیت ضد آلترنایی را داشت و به ترتیب جدایه های 45dh، 12dh، 1dh و 34dh بعد از آن قرار داشتند. جدایه 12dh رشد آلترناریا آلترناتا و جدایه 3dh رشد آلترناریا سولانی را بیشتر از بقیه مهار کرد. با توجه به نتایج آزمایشگاهی به دست آمده، امکان بررسی خاصیت آنتاگونیستی این جدایه ها در شرایط مزرعه و نیز توانمندی آنها برای تجاری سازی در زمینه تولید سموم بیولوژیک متصور است. واژه های کلیدی: آلترناریا آلترناتا، آلترناریا سولانی، استرپتومایسس، کنترل بیولوژیک، بلایت زودرس

چکیده تمام نما: در حال حاضر یکی از علل اصلی مرگ و میر در جهان بیماری سل می باشد. در حدود یک سوم جمعیت جهان آلوده به عامل این بیماری (mycobacterium tuberculosois ) هستند. تا کنون تلاش های بسیاری در زمینه درمان این بیماری صورت گرفته است، اما هنوز سل به عنوان یک مشکل باقی مانده است. در سالهای اخیر، پپتیدهای ضد میکروبی به عنوان عوامل درمانی امید بخش مورد توجه قرار گرفته اند. این بررسی با هدف شناسایی و معرفی پپتیدهای ضد مایکوباکتریومی از منابع طبیعی از جمله گیاهان و نیز بررسی آنها به منظور شناسایی خصلت های ضد مایکوباکتریومی، جهت طراحی مولکولهای جدید درمانی برای بیماری سل انجام شده است. در این بررسی از روش in silico استفاده شده است. بدین منظور به بررسی توصیف گرهای مولکولی دو گروه پپتیدی: یکی با خاصیت ضد مایکوباکتریومی و دیگری بدون خاصیت ضد مایکوباکتریومی پرداخته شد، سیس نتیجه حاصل تحت آنالیز آماری قرار گرفت. در نتیجه این بررسی، توصیف گرهای مولکولی متفاوت در این دو گروه که به احتمال زیاد همان خصائل ضد مایکوباکتریومی هستند، شناسایی و مشخص شدند. طبق نتایج، بیشترین توصیف گرهای مولکولی متفاوت مربوط به گروه توصیف گرهای سه بعدی بودند، با درصد هایی که در زیر مشاهده می شود: - rdf descriptors (3d) 38.66% - 3d-morse descriptors (3d) 52.5% - randic molecular profiles (3d) 87.80% - geometrical descriptors (3d) 4.28% - whim descriptors (3d) 26.26% - getaway descriptors (3d) 3.04% - 2d-autocorrelations (2d) 1.04% - atom-centred fragments (1d) 0.83%

در مطالعه حاضر، فرآیند تجاری سازی دستاوردهای تحقیقاتی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران از دو دیدگاه "توانمندی سازمانی" و "ورود به فاز توسعه نوآوری(پایلوت)" ارزیابی و ضمن بررسی دلایل موفقیت ها و ناکامی های آن، راهکارهایی برای گذر از موانع موجود ارائه گردید. این مطالعه به روش دلفی(اجماع نظر خبرگان) انجام شد. به این منظور یک پرسشنامه "پیش آزمون " برای توانمندی سازمانی و یک پرسشنامه اصلی شامل دو بخش مجزای "توانمندی سازمانی" و "توسعه نوآوری" طراحی گردید. نتایج پرسشنامه پیش آزمون حاکی از روایی و پایایی مناسب (ضریب آلفای کرونباخ برابر با 0.794) پرسشنامه توانمندی سازمانی بود. ارزیابی کمی فرآیند تجاری سازی بر اساس عامل توانمندی سازمانی و هریک از 10 مولفه آن در قالب یک مدل خطی ثابت منجر به بهترین برآورد نااریب خطی از تاثیر عامل توانمندی سازمانی و مولفه های آن گردید. علیرغم نقش قابل توجه عامل توانمندی سازمانی در تجاری سازی دستاورد ها، تاثیر وضعیت فعلی این عامل در تجاری سازی دستاوردهای پژوهشی پژوهشکده با توجه به دامنه احتمالی آن (198- تا 198+)، کم و منفی (2-) ارزیابی گردید که با بهبود هریک از مولفه های موثر بر توانمندی سازمانی، امکان بهبود بالقوه تاثیرآن (حداکثر تا 198+) بر روند تجاری سازی دستاوردهای پژوهشکده وجود دارد. نتایج تحلیلی پرسشنامه توسعه نوآوری نیز نشان داد که اکثریت پاسخ دهندگان ورود پژوهشکده به فاز توسعه نوآوری را با استفاده از ساختار، امکانات، تجهیزات و نیروی انسانی موجود به صلاح ندانستند و با برون سپاری و داشتن نقش نظارتی پژوهشکده در این خصوص موافق بودند. نتیجه گیری کلی این بود که توجه بیشتر به عامل توانمندی سازمانی و ورود به فاز پایلوت از مسیرهایی غیر از خود پژوهشکده تاثیر معنی داری بر روند و موفقیت تجاری سازی دستاوردهای پژوهشی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران خواهد داشت.

سالانه حدود 10 میلیون نفر در سرتاسر جهان به ویروس هاری مبتلا می شوند. راه درمان بیماری پس از آلودگی به ویروس واکسیناسیون و سرم درمانی است . آنتی بادی های ضد ویروس هاری در 2نوع hrig و erig هستند که به ترتیب از دو منبع انسانی و اسبی گرفته شده اند. اما کمبود آنتی بادی انسانی و احتمال وجود آلودگی های ویروسی نظیر ایدز در این آنتی بادی ها، همچنین وجود پروتئین های ناخواسته موجود در آنتی بادی به دست آمده از سرم اسب، که باعث ایجاد واکنش ایمنی شدید و ناخواسته با بدن فرد دریافت کننده آنتی بادی می شود، به کارگیری این آنتی بادی ها را به منظور درمان بیماری هاری با مشکلات جدی مواجه کرده است. با توجه به کشنده بودن ویروس هاری و همچنین کمبود شدید آنتی بادی ضد ویروس هاری و هزینه بالای تامین آنتی بادی ضد ویروس هاری وارداتی، امکان تولید آنتی بادی مونوکلونال ضد ویروس هاری در داخل کشور در سیستم-های ارزان قیمت، ایمن وکارا مانند گیاه بسیار مورد توجه می باشد. در این تحقیق، بیان موقت ژن کد کننده زنجیره سبک آنتی بادی مونوکلونال ضد ویروس هاری داخل گیاه تنباکو، مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور پس از اپیتمایز کردن و سنتز ژن کدکننده زنجیره سبک آنتی بادی ضد ویروس هاری این ژن در پلاسمید بیانی مخصوص سلول گیاهی pcambia 1304 قرار داده شد. سپس سازه ی نوترکیب به روش ذوب وانجماد به آگرو باکتریوم تومفسینس انتقال داده شد. انتقال ژن زنجیره ی سبک به برگ های جوان گیاه تنباکو ازطریق تکنیک آگرواینفیلتراسیون انجام شد و تولید پروتئین نوترکیب در گیاه پس از استخراج کل پروتئین،3 روز بعد از اگرواینفیلتراسیون، با آزمون دات بلات و gfp مورد تائید قرار گرفت. در این مطالعه ما اثبات کردیم که زنجیره سبک آنتی بادی مونوکلونال ضد ویروس هاری که قابلیت خنثی کردن آنتی ژن های این ویروس را داراست، به روش بیان موقت درگیاه تنباکوازطریق تکنیک اگرواینفیلتراسیون قابل تولید است.

ژنوتیپ های وحشی و دورگه های امیدبخش بادام، منبع غنی از صفات مطلوب می باشند که برای برنامه های به نژادی و اصلاح نباتات مفید هستند. در بادام، خودناسازگاری توسط یک مکان ژنی چندآللی کنترل می شود. در این پژوهش، آلل های خود ناسازگاری، در 184 رقم، ژنوتیپ و دورگه های امیدبخش بادام مطالعه شد.. واکنش های زنجیره ای پلیمراز با استفاده از چهار مجموعه آغازگر شامل دو جفت آغازگر دژنره (paconsif/em-pc1consrd، em-pc2consfd/em-pc3consrd)، یک جفت آغازگر عمومی (as1ii/amyc5r) و یک جفت آغازگر اختصاصی (cebasf/amyc5r) صورت گرفت. آغازگر اختصاصی cebasf/amyc5r، 21 آلل خودسازگاری sf را در نمونه های مورد بررسی تکثیر کرد.اندازه ی کلیه ی آلل های تکثیر شده توسط آغازگرها، با گزارشات قبلی و نمونه های شاهد مقایسه شد. آلل های s1، s7 و s2 بیشترین فراوانی را داشتند. آلل های s14، s15 و s17 در نمونه های بررسی شده، دیده نشدند و s16 و s28 کمترین فراوانی را در بین آلل ها داشتند.. نمونه ها با استفاده از تجزیه و تحلیل ساختاری و از نظر فاصله ی ژنتیکی آلل های خودناسازگاری در 9 گروه قرار گرفتند. ارقام بادام در گروه های سازگار و نیمه سازگار طبقه بندی شده و نمونه های سازگار از نظر ژنوتیپ خودناسازگاری معرفی شدند.

گل محمدی نسترن بومی و معطر در ایران که به عنوان کار اقتصادی در بسیاری از نقاط ایران در حال کشت و کار است.زادگاه و رویشگاه آغازین گل محمدی سرزمین کهن ایران و خاورمیانه می باشد. از اواخر قرن شانزدهم به سایر کشورها برده شده است. امروزه ایران یکی از بزرگترین تولید کنندگان این گل در دنیا می باشد. در این بررسی با استفاده از نشانگر مولکولی rapd که خود نوعی نشانگر مولکولی dna مبتنی بر pcr می باشد، به بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های گل محمدی پرداخته شد.در این تحقیق از برگ گل استفاده شد و پروتکل استخراج dna با روش ctap تغییر یافته صورت گرفت. تعیین کمیت و کیفیت dna با دو روش اسپکترومتری و بردن روی ژل آگاروز انجام شد. جهت واکنش pcr تعداد 12 پرایمر مورد استفاده قرار گرفت که مجموعا 97 باند روی ژل آگاروز تشکیل شد و از این تعداد 9 باند منومورف و 88 باند پلی مورف تشکیل شد، پس از الکتروفورز، رنگ امیزی و انالیز ژل داده ها با دستگاه عکسبرداری ویژه و نرم افزار gene snap و ntsys آماده گردید، دندرو گرام مذکور در سطح تشابه 47? ، ژنوتیپهای مورد بررسی را در 5 کلاس مجزای ژنتیکی قرار داد. کلاس اول شامل 5 ژنوتیپ شهرهای ماهان ، کرمانشاه ، سمنان ، آذربایجان غربی و کوهبنان است. کلاس دوم دارای بیشترین ژنوتیپ شامل شهرهای بزنجان ، کرمان، راین ، فارس ، اصفهان ، گوغر ، گیلان ، افزاد ، کاشان و رابر بود. کلاس سوم شامل 5 ژنوتیپ شهرهای لاله زار ، مانی ، ایلام ، اراک و دهبکری بوده و نهایتا کلاس 4 و 5 هر کدام شامل یک ژنوتیپ شهر قم و خوزستان می باشد. بنابراین وجود تشابه و تفاوت های مشاهده شده در جمعیت های گل محمدی مورد بررسی و همچنین دوری یا نزدیکی برخی ژنوتیپ ها در دندروگرام بیانگر این است که به احتمال قوی جا به جایی ژرم پلاسم این گیاه با ارزش اقتصادی بالا در سطح کشور اتفاق افتاده لذا ژنوتیپ های مورد بررسی در نقاط مختلف می توانند منشاء یکسانی داشته باشند که در مطالعه و بررسی این ژرم پلاسم اهمیت خصوصیات ژنتیکی در کنار خصوصیات گیاهشناسی آن را قوت می بخشد.

چکیده : trichoderma spp. به عنوان یکی از عوامل کنترل بیولوژیکی موثر بر علیه دامنه وسیعی از پاتوژنها مانند macrophomina phaseolina (tassi) goid شناخته می شود که از طریق استراتژی های گوناگونی از جمله تولید آنزیمهای تجزیه کننده دیواره سلولی (کیتیناز و گلوکاناز) فعالیت می کند. یکی از عوامل محدود کننده کاربرد جدایه های تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیکی، پایین بودن میزان تاثیر آن در سطح مزرعه است. بر این اساس، دست ورزی های ژنتیکی با استفاده از ایجاد جهش به دنبال ارتقای پتانسیل آنتاگونیستی این قارچ به منظور بهبود قدرت کنترلی آن هستند. لذا تأثیرات القای جهش با استفاده از اشعه گاما با دز 250 gry بر روی میزان تولید آنزیم های کیتیناز و گلوکاناز در کلنی های حاصل از کنیدیوم های دو گونه trichoderma harzianum (rifai) و trichoderma viride (pers) در پژوهشکده تحقیقات کشاورزی و پزشکی هسته ای کرج در این مطالعه مورد ارزیابی قرار گرفت. از بین ده جدایه جهش یافته منتخب t. harzianum تنها در یکی از آنها میزان تولید آنزیم کیتیناز در مقایسه با شاهد (وحشی) کاهش نشان داد (جهش منفی) و 80% جهش ها تأثیر مثبت داشتند. در گونه t. viride جهش های مثبت بالاتر بوده و 9/90% جهش ها به افزایش تولید آنزیم کیتیناز منجر شدند. در ارزیابی از آنزیم گلوکاناز تنها 60% از جدایه های جهش یافته گونه t. harzianum دارای جهش مثبت بوده و سه جدایه دارای جهش منفی در گونه t. viride مشاهده شد. آزمون های کشت متقابل نشان دادند که هشت جدایه از گونه t. harzianum و ده جدایه از گونه t. viride از نظر آماری توانایی کنترل بیشتری در مقابل m. phaseolina نسبت به جدایه وحشی داشتنه اند. مطالعه پروفایل پروتئینی این جدایه های جهش یافته این تئوری را تقویت نمود که افزایش تولید آنزیمهای تجزیه کننده دیواره سلولی از طریق القای موتاسیون با اشعه گاما می تواند منجر به افزایش پتانسیل آنتاگونیستی در اکثر جدایه ها شود. سایر جدایه های جهش یافته با افزایش قدرت آنتاگونیستی علیه m. phaseolina که میزان بالاتری از تولید آنزیم را نشان نداده اند احتمالاً واجد جهش هایی در سایر مکانیسم های بیوکنترلی می باشند.

آگاهی از سطح تنوع ژنتیکی و برآورد میزان آن در ژرم پلاسم و تعیین روابط ژنتیکی مواد اصلاحی، پایه و اساس بسیاری از برنامه های اصلاح نباتات به شمار می رود. در این مطالعه 50 تود? آفتابگردان آجیلی با استفاده از 10 نشانگر ریزماهواره مورد بررسی قرار گرفت. تعداد آلل در هر مکان ژنی بین 2 تا 3 و میانگین تعداد آلل به ازای هر مکان ژنی 1/2 بود. رنج تعداد آلل موثر از 964/1 در مکان ژنی ors785 تا 497/1در مکان ژنی ors1088 بود. میانگین آلل موثر برابر832/1 بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و مشاهده شده به ترتیب برابر 439/0و 723/0 بدست آمد. بیشترین هتروزیگوسیتی موردانتظار برابر490/0و کمترین میزان آن 285/0 بود که به ترتیب در مکان های ژنیors785 و ors1088 مشاهده شد. بیشترین هتروزیگوسیتی مشاهده شده برابر 895/0 و کمترین آن 428/0 بود که به ترتیب در مکان های ژنی ors785 و ors1088 مشاهده شد. تجزیه کلاستر افراد 50 توده را براساس ضریب فاصله ژنتیکی جاکارد و الگوریتم complete، به 4 گروه تقسیم بندی نمود. بر طبق تجزیه واریانس مولکولی (amova)، میزان تنوع درون توده ها %91 و تنوع بین توده ها %9 می باشد. براساس این تحقیق می توان نتیجه گرفت که درون جمعیت های آفتابگردان آجیلی تنوع ژنتیکی زیادی وجود دارد و تنوع زیاد به علت دگرگشن بودن این گیاه و انتقال دان? گرده قابل توجیه است. براساس نتایج حاصل در برنامه های به نژادی آفتابگردان آجیلی، می توان انتخاب را درون تودهها انجام داد.

خشکی و کم آبی از مهمترین چالش های تولید برنج در مناطق مختلف دنیا و از جمله ایران می باشد. شناخت ساختار و مکانیسم تحمل به تنش خشکی در ایجاد و انتقال تحمل بسیار حایز اهمیت می باشد. در این میان نقش عوامل رونویسی در تغییر تظاهر ژن های مسئول به تحمل بسیار مهم می باشد. از میان این عوامل نقش wrky تاکنون بخوبی شناخته نشده است. بدین جهت این مطالعه با استفاده از داده های حاصل بررسی اثر تیمارهای ملایم و شدید تنش خشکی در چهار رقم تقریباً مشابه (near isogenic lines, nils) که از حیث تحمل به خشکی دارای واکنش متفاوتی بودند به همراه والد حساس ir64 در سه بافت مختلف ریشه، برگ و خوشه در رابطه با تغییر در تظاهر ژن های wrkyدر مرحله ی زایشی انجام شد. نتایج تجزیه و تحلیل ها نشان داد که از میان تعداد 102 ژن متعلق به خانواده wrky در مقابل تیمارهای تنش خشکی، بروز66 درصد آنها در ریشه و 64 درصد در برگ و همچنین 61 درصد در خوشه در رژیم های تنشی اعمال شده تغییر کرد.و 2 لاین متحمل عملکرد بالاتری در همه ی بافتها داشته اند. از میان این دسته از ژنها که تظاهر آنها در نتیجه اعمال تنش خشکی تغییر نمود degs)) differentially expressed genes ، به عنوان نمونه می توان گفت تعداد 3 ژن از جمله wrky34 در ارقام متحمل و در بافت ریشه ، خوشه ، برگ تحت تیمارهای مختلف تنش آب افزایش یافت و ژن های wrky30 و wrky64 میزان تظاهر آنهاافزایش یافت براساس نتایج این آزمایش می توان نقش تعدادی از ژنهای خانواده عوامل رونویسی wrky از جمله wrky34 را در تحمل به خشکی در برنج مهم دانست و از اینرو انجام مطالعه تکمیلی جهت اثبات اثر این ژنها پیشنهاد می شود.

افزایش جمعیت نتیجه ازدواج و کنترل جمعیت نیز مقابله با طبیعت و امر فطری محسوب می شود این مطلب ضرورت تحقیق را در این زمینه روشن می سازد و به همین دلیل ما موضوع کنترل جمعیت از دیدگاه فقه اهل بیت (ع) را برگزیده و در چهار فصل بررسی نموده ایم. فصل نخست: در این فصل کلیات و تعاریف از قبیل معناو مفهوم کنترل جمعیت، تحدید نسل، مسأله عزل و سیاست جمعیتی، تفاوت بین کنترل جمعیت و تنظیم خانواده، تاریخچه کنترل جمعیت، اندیشه های جمعیتی و...بررسی شده است. فصل دوم: ادله موافقین از قبیل کریمه، نسائکم حرث لکم...، جواز عزل در سنت (که در این دلیل روایات عزل را دسته بندی شده) قاعده اصاله الاباحه، عائله سنگین و نفی عسر و حرج، عمل معصوم (ع) و مسأله نیاز به آب و...در این فصل مورد کنکاش قرار گرفته است. فصل سوم: در این فصل دلائل مخالفین از قبیل مناقشه در جواز عزل (در این مناقشه شش اشکال شده)، نفی سبیل کافرین بر مسلمین، منافی بودن کنترل جمعیت با اعتقاد به رازقیت خدا (در این بخش از آیات و روایات فراوان بهره گرفته ایم)، بررسی فرض ضرورت کنترل جمعیت. چگونه کنترل جمعیت موجب خسارت و زیان است، مطلوبیت کثرت جمعیت در نصوص دینی و بالاخره در پایان این فصل با استفاده از تفاسیر قرآن کریم مغایر نبودن کنترل جمعیت با نظام آفرینش خدا مورد بررسی قرار گرفته است. فصل چهارم: در این فصل راههای اختیاری کنترل جمعیت از قبیل عزل، دارو، ابزار، سقط جنین، مورد نقد و نظر قرار گرفت. و به راههای غیر اختیاری کنترل جمعیت نیز اشاره و نظریات مذاهب اربعه اهل سنت درباره سقط جنین بررسی شد. و در پایان این فصل ضررهای ناشی از سیاست کنترل جمعیت اشاره ای شد. و نیز در نهایت با توجه به مقدماتی که گفته آمد نتایجی را با نام "استنتاج و جمع بندی" اخذ، و آن را بر شمردیم.

این پزوهش در بخش کشت بافت و انتقال ژن، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران - کرج در سال 1392 انجام شد. بیماری آتشک که بوسیله باکتری erwinia amylovora ایجاد می شود، هر ساله عملکرد و کیفیت خانواده سیبیان را کاهش می دهد. هدف از این پژوهش جداسازی و بررسی بیان ژنهای دفاعی pr2, pr1 و pr8 با تحریک بیان آنها با ماده bth در مقاومت القایی در درخت به بود. بدین منظور درختچه های دو ساله به رقم اصفهان تحت تیمار با ماده bth قرار گرفت و 5 روز بعد rna از گیاهان تیمار شده و شاهد استخراج و از روی آن cdna ساخته شد. تکثیر ژنهای pr2, pr8 توسط آغازگرهای عمومی برای این ژنها، به وسیله واکنش pcr انجام گرفت. سپس به منظور توالی یابی، باندهای مورد انتظار پس از جداسازی از ژل روی ناقل ptz57r/t الحاق و پلاسمیدهای نوترکیب در باکتری اشرشیاکولای سویه xl1blue همسانه سازی گردیدند. dna پلاسمیدها استخراج شد و جهت توالی یابی مورد استفاده قرار گرفت. مقایسه توالیهای بدست آمده با سایر توالیهای موجود در بانک اطلاعات نشان داد که تشابه بالایی با ژنهای شناخته شده در سیب و گلابی دارند. برای بررسی بیان این ژن ها آغازگرهای اختصاصی طراحی شد. استفاده از این آغازگرها در واکنش زنجیره ای پلیمراز به تکثیر کارآمد قطعاتی با طولهای مورد انتظار منجر شد. سپس میزان بیان آنها از طریق واکنش real time pcr ارزیابی شد. نتایج نشان داد که بیان هر سه ژن مورد بررسی پس از تیمار گیاه با بیون، به میزان بالایی افزایش یافت.

یکی از مهمترین مسائل سلامتی انسان استفاده از مواد غذایی سالم است. برخی از بیمارگرهای گیاهی قارچی می توانند بعد از آلودگی گیاه میزبان، با تولید متابولیت های ثانویه، محصول گیاه میزبان را به زهرابه آلوده کنند. اینگونه زهرابه ها را مایکوتوکسین (mycotoxin) می گویند. یکی از بیمارگرهای گیاهی قارچی مولد زهرابه قارچ جنس فوزاریوم (fusarium sp.) می باشد. در این تحقیق اثر ضد قارچی اسانس های گیاهان آویشن (thymus vulgaris)، شوید (anethum grareolens)، نعناع (mentha sativa) و فلفل (capsicum annum) با غلظت های متفاوت از 50 تا 200 میکرولیتر در 100 میلی لیتر محیط کشت در شرایط آزمایشگاهی بر دو گونه از بیمارگرهای قارچی fusarium prolifratum مولد زهرابه فامونیزین، عامل بی نظمی و مرگ سلول و fusarium graminearum مولد زهرابه دی اکسی نیوالنول، عامل مسمومیتهای کبدی و کلیوی مورد بررسی قرار گرفت. درصد بازدارندگی رشد هیف جدایه ها بعد از هفت روز در دمای ? c25 با اندازه گیری قطر رویش میسیلیوم در مقایسه با شاهد محاسبه گردید. همچنین اثر اسانس های این گیاهان بر کاهش تولید زهرابه های فامونیزین و دی اکسی نیوالنول در محیط جامد با اندازه گیری مقدار تولید آنها با دستگاههای hplc و lc-ms بررسی گردید. نتایج نشان داد که مقدار زهرابه دی اکسی نیوالنول در جدایه f. graminearum 3 ng/mg 58/14 و در جدایه f. graminearum 48 ng/mg 42 /16 بود. اسانس های گیاهان نعناع، آویشن و شوید با غلظت ul/100ml 200 باعث بازدارنگی کامل زهرابه دی اکسی نیوالنول گردید. مقدار زهرابه فامونیزین در جدایه f.proliferatum 8727(3ii) ng/mg 1 /15 و در جدایه 8732(41) f.proliferatum ng/mg 2/11 بود. اسانس های گیاهان نعناع، آویشن و شوید به ترتیب 6/99 ، 4/82 و 8/94 درصد تولید فامونیزین را در جدایه 8727(3ii) کاهش دادند و در جدایه 8732(41) به ترتیب 3/99، 6/81 و 2/99 درصد کاهش تولید زهرابه فامونیزین مشاهده گردید. بازدارندگی کامل رشد میسیلیوم توسط اسانس های گیاهان آویشن با غلظت ?l/100ml 200 و نعناع با غلظت ?l/100ml 125 مشاهده شد. غلظت های مختلف اسانس گیاه فلفل هیچ گونه تاثیر بازدارندگی در رشد میسیلیوم ها را نشان نداد. از نظر آماری در هر دو گونه قارچ در سطح 1درصد تفاوت معنی دار مشاهده گردید. تاثیر اسانس نعناع هم در بازدارندگی رشد میسیلیوم و هم در کاهش تولید زهرابه در هر دو گونه قارچ از دیگر اسانس ها بهتر بود.

چکیده بیماری های باکتریایی گیاهان میوه دار باعث آسیب های زیادی در سرتا سر جهان می شوند. به منظور مدیریت بیماری های گیاهی، مواد شیمیایی مختلفی در تمام دنیا مورد استفاده قرار می گیرند.این مواد در بافت های حیوانی تجمع پیدا کرده و باعث به خطر انداختن سلامت انسانی می شوند. گیاهان به عنوان مخزنی از مواد شیمیایی درمانی موثر می توانند منابع با ارزشی از آفت کش های طبیعی تلقی گردند. گونه های گیاهی سنتی برای مدیریت میکروارگانیسم های پاتوژن گیاهی مهم هستند. جنس capsicum annuum l.متعلق به خانواده سولاناسه میباشد و انواع مختلفی از فلفل را شامل می شود. در مطالعه حاضر فعالیت ضد باکتریایی عصاره های الکلی میوه گونه ای از فلفل و برگ گیاه درمنه در مقابل سویه های ایزوله و استاندارد فیتوپاتوژن گوجه فرنگی با استفاده از روش انتشار دیسک در آگار و چاهک در مقایسه با آنتی بیوتیک منتخب در شرایط آزمایشگاهی بررسی شده است. عصاره ها فعالیت های ضد باکتریایی را در محدوده مهاری رشد 14- 3 میلی متر نشان دادند.محدوده mic بدست آمده از عصاره های این گیاهان بین 512-32 میکروگرم درمیلی لیتر متعاقب روش رقت در آبگوشت نشان داده شد. این مقادیر برای mbc در محدوده غلظتی512?-64 میکروگرم در میلی لیتر بود. غربالگری فیتوشیمیایی فلفل زینتی حضورساپونین،ترکیبات فنلی، تانن، آلکالوئید،فلاونوئید،استروئید و ترپنوئید و در درمنه حضور آنتراکوئینون، فلاونوئید، تانن، ترکیبات فنلی،آلکالوئید و ترپنوئید رادر هر دو حلال نشان داد. توانایی عصاره های میوه این گونه گیاهی جهت مهار رشد باکتری ها نشان دهنده پتانسیل ضد باکتریایی آن می باشد که ممکن است بتوان از آن در کنترل بیولوژیکی دیگر پاتوژن ها استفاده کرد. نتایج بدست آمده، نشان داد که عصاره اتانولی ومتانولی هر دو گیاه افق قابل توجهی در وسعت بخشیدن به فعالیت های داروهای گیاهی ضد میکروبی دارند.

برنج از گیاهان زراعی مهم ایران و در مناطق وسیعی کشت می شود. از این رو می تواند در ژنتیک آن تنوع ایجاد گردد. شناخت تنوع ژنتیک در ژرم پلاسم گیاهی یکی از قدم های اولیه و زیربنائی برای برنامه های به نژادی می باشد. در این تحقیق تنوع ژنتیک تعداد 28 نمونه از توده های برنج هاشمی که از استان های گیلان و مازندران جمع آوری شده بودند با استفاده از نشانگر ریزماهواره، مورد بررسی قرار گرفت. dna، نمونه ها استخراج شده، با استفاده از 9 آغازگر ریزماهواره در واکنش زنجیره ای پلیمراز تقویت گردید. محصول حاصل بر روی ژل پلی اکریلامید 6% به وسیله الکتروفورز تفکیک گردید. در پایان آلل ها به وسیله رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید مشاهده شد. از 9 نشانگر ریزماهواره، 7 نشانگر پلی مورف و دو نشانگر 111rm و 6643rm مونومورف بوده است. در مجموع تعداد 20 آلل توسط 7 نشانگر پلی مورفیسم با میانگین 2.86 آلل در هر مکان ژنی آشکار گردید. ماتریس شباهت داده ها بر اساس ضریب تشابه جاکارد تشکیل شد و دندروگرام با استفاده از روش upgma و نرم افزار ntsys ترسیم گردید. نمونه های مورد مطالعه به چهار گروه تقسیم شدند که میزان شباهت بین نمونه های مورد مطالعه بین 23/0 تا 100 درصد می باشد. مقدار هتروزیگوسیتی و فراوانی آلل ها با نرم افزار popgene-ver1.31 محاسبه شد. محتوی اطلاعات پلی مورفیسم (pic) به کمک نرم افزار microsatellite tools for excel محاسبه شد. ارزش pic بین 0.07 تا 0.58 با میانگین 37/0 در هر مکان ژنی بود. از بین نشانگرهای مورد استفاده، نشانگر 441rm دارای سودمندی بالایی بوده و حداکثر تعداد آلل و میزان pic به ترتیب 4 آلل و 58/0 داشته و در نتیجه تنوع ژنتیکی خوبی را در بین نمونه های مورد مطالعه نشان داده است. بر اساس نتایج به دست آمده در این تحقیق برنج هاشمی دارای تنوع ژنتیکی بوده و نشانگر ریزماهواره می تواند به عنوان ابزار مفیدی در شناسایی تنوع ژنتیکی نژادهای بومی بکار گرفته شود و از این تنوع می توان در برنامه های به نژادی بهره برداری نمود. همچنین این تحقیق بر استفاده از تعداد نشانگرهای بیشتر برای تشخیص هر چه موثرتر نژادهای بومی به کار رفته تحقیق فوق تأکید دارد.

در این تحقیق اثر باکتری ها در پاکسازی نفت خامِ شناور بر روی آب دریا مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور از نفت خام استخراج شده از سکوی نفتی میدان مشترک فروزان در خلیج فارس به عنوان نمونه استفاده گردید و ابتدا تاثیر مستقیم مخلوط باکتری ها و سپس تاثیر بیوسورفکتانت تولیدی از آنها مطالعه شد. در واقع، در روش اول، از تلقیح زیستی (افزایش توان زیستی) و تحریک زیستی برای افزایش پاکسازی نفت خام از روی آب استفاده شد. در تلقیح زیستی، برای افزایش توانایی زیستی میکروارگانیسم های بومی در تجزیه نفت خام، باکتری های دیگر را به محیط اضافه می کنند. در این مطالعه از باکتری های نفت خوار سودوموناس آئروژینوزا ptcc1074، باسیلوس سوبتیلیس ptcc1023 و اسینتوباکتر کالواستیکوس ptcc1318 برای افزایش توان محیط زیست دریایی استفاده شد. برای بررسی میزان تحریک زیستی باکتری ها و تاثیر بر روی رشد و فعالیت سلولی، فاکتورهای محیطی مانند نوع منبع کربنی، مواد شیمیایی یا مواد مغذی، میزان هوادهی و درجه ی حرارت، نیز مورد بررسی قرار گرفتند. طبق نتایج به دست آمده برای سنجش توان تلقیح باکتری ها، مخلوط سه تایی باکتری ها عملکرد بهتری نسبت به مخلوط دوتایی و باکتری های منفرد داشت و لایه های بیشتری از نفت خام را تجزیه کرد، به طوری که نفت خام تا 86/86% تجزیه شده و محیط آلوده به نمونه نفت خام به رنگ روشن درآمد. در مرحله دوم برای تحریک زیستی محیط موردنظر، شرایط محیطی مورد آزمایش قرار گرفت و فاکتورهای بهینه برای افزایش قابلیت محیط در پاکسازی نفت خام مشخص شد. در این تحقیق نفت خام در غلظت بهینه nacl 7%، 8/6=ph، منبع نیتروژن و فسفر 146/0 و 03/0گرم در 100 میلی لیتر، دور شیکر rpm150 و دمای 37 درجه ی سانتی گراد بهترین تجزیه را داشت. در این شرایط به طور میانگین 65/83% از نفت خام تجزیه گردید. در شرایط محیطی به دست آمده برای پاکسازی نمونه نفتی، کشش بین سطحی نفت/آب از mn/m37 به mn/m8 کاهش پیدا کرد. در این تحقیق همچنین برای پاکسازی بهتر در زمان کمتر از محلول بیوسورفکتانت به دست آمده از مخلوط سه تایی باکتری ها استفاده شد که کارایی بسیار بهتری را نسبت به تاثیر مستقیم مخلوط باکتری ها برروی نفت خام داشت. در این آزمایش محلول بیوسورفکتانت تحت شرایط محیطی بهینه در 60 ساعت، نفت خام تا 47/90% تجزیه گردید. زمان پاکسازی این محلول نسبت به مخلوط باکتری ها به نصف کاهش یافته و میزان تجزیه نیز حدود 82/6% افزایش نشان داد.

گیاهان هاپلوئید و هاپلوئید مضاعف شده دارای اهمیت زیادی در تولید لاین های خالص ژنتیکی می باشند. از میان روش های تولید گیاهان هاپلوئید، کشت میکروسپورهای جدا شده کارآمدترین روش می باشد. هدف از این تحقیق، القای جنین زایی میکروسپور در ارقام مختلف نیشکر (saccharum officinarum) مورد استفاده در کشور می باشد. 6 رقم به شماره های 126، 286، 273، 203، 290 و 83 در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند. پس از ضدعفونی گلچه ها، میکروسپورها با محیط های جداسازی مختلف شامل مانیتول (m0.3) و b-medium جداسازی شدند و القای جنین زایی آنها در محیط کشت at3 و nln-13 با اعمال تنش های مختلف دمایی (درجه حرارت های 4، 30، 33 و 37 درجه سانتیگراد با دوره های زمانی مختلف) و تنش شیمیایی (2,4-d) مورد بررسی قرار گرفت. بهترین تغییرات در ساختار، اندازه و شکل میکروسپورها در ژنوتیپ 83، ضدعفونی با هیپوکلریت سدیم 5/3%، محیط جداسازی مانیتول (m0.3)، محیط کشت nln 13 و تنش دمایی 4 درجه سانتیگراد به مدت 7 روز مشاهده گردید.

پونه آبی با نام علمی (mentha aquatica)نوعی گیاه معطر از خانواده lamiaceaeمی باشد که قسمت های مختلف آن دارای تانن، مواد رزینی، پکتیکی، قند و اسانس است. مقدار اسانس و مواد موثره گیاه بر حسب واریته های مختلف گیاه و شرایط محیطی متفاوت است. بر اساس تحقیقات انجام شده، افزایش در سطح پلوئیدی اغلب منجر به افزایش ماده خشک گیاه و متابولیت های ثانویه می شود، همچنین با توجه به آنکه بیشترین مواد موثره، در برگ ها و ساقه ها وجود دارد به نظر می رسد تغییرات مورفولوژیک خاص در این قسمت ها که گاه با پلی پلوئیدی همراه است، موجب تغییر در میزان مواد موثره گیاه شوند. به همین دلیل در این تحقیق به منظور بررسی پلی پلوئیدی و تغییرات مورفولوژیک وتاثیر آن بر تغییر در میزان ماده موثره پونه آبی، با توجه به اثرگذاری ماده شیمیایی کل شی سین مطالعه ای در دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری و دانشگاه پیام نور مرکز کرج انجام شد. این بررسی بصورت آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی انجام شد که در آن فاکتور اول شامل تیمار کل شی سین در 4 سطح (غلظت های صفر،1/0 ،2/ 0و4/0درصد) و فاکتوردوم شامل تیمارزمان در 4 سطح (در زمان های4،8، 16و 32 ساعت) با تعداد 4 تکرار انجام گرفت. با مطالعه سطوح پلوئیدی توسط فلوسایتومتری ایجاد پلی پلوئیدی در نمونه ها تائید شد و با بررسی میزان اسانس نمونه های تیمار شده به وسیله گازکروماتوگرافی(gc)، اختلاف بین سطوح مختلف القا کننده و همچنین اثر متقابل غلظت و زمان معنی دار تشخیص داده شد و بیشترین تغییر مربوط به سطوح غلظت 2/ 0و4/0درصد کلشی سین در مدت زمان16 ساعت به دست آمد.

اهمیت گیاهان دارویی در جوامع انسانی بر کسی پوشیده نیست، این گیاهان با تاریخ زندگی انسان پیوندی تنگاتنگ داشته و منبع مهمی از دارو های نجات بخش زندگی اغلب مردم دنیا محسوب می شوند. یکی از گام های اولیه جهت اصلاح و گزینش گیاهان، آگاهی از میزان تنوع ژنتیکی در بین جمعیت ها و گونه های موجود می باشد. در این تحقیق 15 جمعیت متعلق به چهار گونه بومادرانachillea spp. جمع آوری شده از مناطق مختلف آذربایجان شرقی از لحاظ تنوع ژنتیکی برخی سیستم های آنزیمی در مرحله گیاهچه ای به روش الکتروفورز در ژل آکریل آمید افقی 7 درصد و پروتئین های ذخیره ای بذور با روش sds-page مورد مطالعه قرار گرفتند. از بین سیستم های آنزیمی، پراکسیداز (pox)، گلوتامات اوگسالواستات ترانس آمیناز (got)، استراز(est)، کاتالاز(cat) ، اسید فسفاتاز(acp) و ریبولوز بیس فسفات کربوکسیلاز (rubisco)، برای دو آنزیم پراکسیداز و got نوارهای چند شکل قابل تفسیر در گونه ها و جمعیت ها به دست آمد. از این چند شکلی در بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت ها و گونه های فوق استفاده شد. برای پروتئین های ذخیره ای، 18 نوار پروتئینی مشاهده شد که چهارتا از آن ها مونومورف و بقیه پلی مورف یا چند شکل بودند. برای آنزیم پراکسیداز، از 13 نوار فقط یک ایزوزیم (11pox) مونومورف و بقیه پلی مورف بودند. برای آنزیم got تمامی ایزوزیم ها برای چهار گونه چند شکلی نشان دادند. کارآیی دو سیستم آنزیمی و روش sds-page در ارائه میزان تنوع موجود بین جمعیت ها و گونه ها متفاوت بود. ایزوزیم های پراکسیداز توانست درصد چند شکلی بالایی حتی در جمعیت های داخل گونه ها نشان دهد ولی ایزوزیم های got در تفکیک بین گونه ها کارآمدتر بود. به طوری که تجزیه کلاستر براساس فقط آنزیم gotچهار گونه را به خوبی از هم تفکیک کرد. محاسبه شاخص های تنوع ژنتیکی شامل تعداد آلل های موثر، تنوع ژنتیکی نی و شاخص شانون برای ایزوزیم های پراکسیداز نشان داد که جمعیت های متعلق به گونهa.filipendula بیشترین تنوع ژنتیکی را دارند. به طوری که 782a.fi با تنوع ژنتیکی نی 0/245±0/24 و شاخص شانون 0/341±0/341، بیشترین تنوع را در بین 15 جمعیت به خود اختصاص داد. همین نتیجه از طریق پروتئین های ذخیره ای نیز تائید شد. به طوری که تنوع ژنتیکی نی و شاخص شانون در گونه a.filipendula به ترتیب 0/228±0/243 و0/324±0/348، بالاترین مقدار را در بین گونه ها داشت. برای ایزوزیمgot بیشترین مقدار شاخص های تنوع در گونه a.tenuifolia به دست آمد. محاسبه فاصله ژنتیکی نی و تجزیه خوشه ای بر پایه upgma با این نتایج مطابقت داشت. این نتایج بیانگر این است که سیستم های آنزیمی پراکسیداز، got و در مرحله بعد الکتروفورز پروتئین های ذخیره ای بذور به خوبی قادرند جمعیت ها و گونه های بومادران را از هم تفکیک نمایند. می توان از این فناوری های زیستی جهت شناسایی و گزینش این گیاه دارویی و احیاناً سایر گیاهان دارویی استفاده نمود.

کاهش پیوسته ی منابع سوخت فسیلی و افزایش پیوسته ی بهای سوخت موجب تلاش های گسترده برای دست یابی به سوخت های جایگزین شده است. اگر بتوان با بهینه سازی هر چه بیشتر فرایندهای تولید، از سوخت های جایگزینی مانند اتانول استفاده کرد می توان امیدوار بود که مشکل انرژی تا اندازه ی زیادی حل شود. برای نیل به این هدف، موثرترین راهکار تجزیه سلولز با استفاده از کمپلکس سلولاز است.سلولز از زنجیره های بلند مولکول های گلوکز تشکیل شده که در فرآیند هیدرولیز، این زنجیره ها گسسته می شوند تا قند را آزاد کنند. سلولازها گستره ی وسیعی از کاربرد را در صنعت(تولید بیواتانول) و کشاورزی(مکمل خوراک دام) دارا می باشند. یکی از بزرگترین مشکلات و موانع استفاده ی تجاری و گسترده از آنزیم سلولاز، بهای آن است.یکی از راهکارهای عمدهبرای کاهش بهای آنزیم، تولید آنزیم های بهینه می باشد.میزان تولید آنزیمهای سلولازی در قارچ تریکودرما ریسئی زیاد بوده و برای اهداف تجاری نیز عمدتاً از آن استفاده شده است. در این پژوهش که با هدف افزایش فعالیت سلولاز در قارچ تریکودرما ریسئی با روش القای موتاسیون شیمیایی(با موتاژن ems)، و فیزیکی(اشعه گاما و فرابنفش) صورت گرفت، ارزیابی کیفی موتانت های حاصل توسط آزمون مندلز، و القای تولید آنزیم به منظور ارزیابی کمی در محیط های کشت اصلاح شده تریکودرما انجام شد. میزان تولید پروتئین و فعالیت ویژه ی آنزیم سلولاز در همه ی موتانت ها اندازه گیری و پروفایل پروتئینی با ژل sds-page بررسی شد. آنالیز نتایج این آزمایشات نشان داد که تیمار های جهش زایی شیمیایی(ems)، فیزیکی(اشعه گاما) و تلفیقی(اشعه گاما و ems) در افزایش تولید آنزیم سلولاز در قارچ تریکودرما موفقیت آمیز بوده و به ترتیب سه جدایه ی tr.c6، tr.m21، وdm7(21) انتخاب شد که میزان پروتئین و فعالیت سلولازی آنها نسبت به جدایه ی والدی افزایش یافته بود.

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های جو دیم، از 14 جفت آغازگر ssr بر روی 20 ژنوتیپ جو استفاده شد. استخراج dna به روشdart با اندکی تغییر انجام شد و dna با کیفیت مناسب به دست آمد. 14 جفت آغازگر در مجموع 424 باند چند شکل تولید نمودند که تقریباً 54/99 درصد از کل 426 عدد باند تولید شده را شامل گردید. در این مطالعه متوسط تعداد باند به ازای هر آغازگر 43/30عدد و برای هر ژنوتیپ 21/3 عدد بود. هم چنین متوسط تعداد باند چند شکل به ازای هر آغازگر 1/72 عدد بود. از کل تعداد باندها، بیشترین تعداد مربوط به آغازگرهای hvm60 و hvm20 با 54 و43 عدد باند و کمترین تعداد مربوط به آغازگرهای bmag0223 و bmac0032 با 20 عدد باند بود. میزان اطلاعات چند شکلی (pic) برای هرآغازگر محاسبه شد. از بین آن ها بیشترین pic مربوط به آغازگرهای hvm60 و hvm20 به ترتیب با مقادیر0/88و 0/73بود و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر bmac0032 با مقدار 0/32 بود. میانگین picبرای کل آغازگرها 6/24به دست آمد. با محاسبه ضریب تشابه جاکارد، ارزش های تشابه بین ژنوتیپ ها دامنه ای از 0/3 تا 0/96 را داشتند. بیشترین تشابه ژنتیکی مربوط به ژنوتیپ های شماره 6 (رقم زراعی) و شماره 5 (لاین امید بخش) با 0/96 بود و کمترین تشابه مربوط به ژنوتیپ های شماره 13 (پوشینه دار) و شماره 10 (پوشینه دار) با 0/3 بود. در این پژوهش دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای به روش upgma و با استفاده از نرم افزار ntsysاستفاده شد. با ترسیم خط برش در فاصله 0/75، ژنوتیپ های مورد مطالعه در 5 گروه اصلی قرار گرفتند. تفکیک بر اساس داده های مولکولیssr تا حدودی توانست ژنوتیپ های دو و شش ردیفه و همچنین ژنوتیپ های دانه پوشیده و بدون پوشینه را از هم تفکیک نماید. نتایج مطالعه ما بر روی جو دیم با آغازگرهای ssr، نشان داد که این آغازگرها در گیاه جو کارایی بالایی دارند و نشانگرهای مورد استفاده توانستند تمامی ژنوتیپ ها را به خوبی از هم جدا و بازشناسی کنند.

پلاستیدها اندامکهای گیاهی همراه با kb 120-150 ژنوم و تعداد 1،000-10،000 نسخه در هر سلول می باشند. کلروپلاست اندامک محوری و شناخته شده در سلول های گیاهی و جلبک های یوکاریوتی است و امکان انجام فتوسنتز را ، فراهم می کند که منبع اولیه غذایی در جهان محسوب می شود، انتقال ژن های خارجی به کلروپلاست گیاهان دارای مزایای زیادی است که می توان به بیان بالا و پایدار پروتئین های خارجی و عدم آلودگی زیست محیطی اشاره کرد، همچنین سکوت ژنی در پلاستیدها گزارش نشده است. کلروپلاست گیاهان یک میزبان مناسب برای بیان ژن های خارجی می باشد. با توجه به طراحی نقاط همولوژی در ناقل اختصاصی گیاه مورد نظر جهت نوترکیبی در ژنوم کلروپلاست، ژنهای خارجی را به ژنوم ها منتقل می کنند. برای بیان بیشتر ژن از قطعات اختصاصی تشدید کننده بیان ژن و جهت بالا بردن میزان نوترکیبی از ژن های reca می توان استفاده کرد، که در طراحی و تهیه ناقل، آنها را مد نظر قرار می دهند. در طراحی وکتور پلاستیدی دو جایگاه دارای همولوژی کامل با کلروپلاست لازم و ضروری است که از 14 جایگاه دوتایی استفاده می نمایند. شیگلا دیسانتری به عنوان علت اصلی اپیدمی اسهال، در صد سال اخیر گزارش شده است. شیگلوز یک بیماری عفونی است که توسط شیگلا ایجاد می شود. بیشتر علائم عفونی شیگلوز شامل اسهال، تب، حالت تهوع، استفراغ، درد شکمی، خون و مخاط یا چرک در مدفوع می باشد. محل اصلی هجوم شیگلاها و ضایعات ایجاد شده در انتهای روده کوچک و سرتاسر کولون است. باکتری پس از رشد، توکسینی تولید می کند که به سلول های اپیتلیال روده حمله و سبب اسهال خونی می شود. که عامل آن آنتروتوکسین شیگلا می باشد. انتروتوکسین شیگلا shigella toxin (st) سالیان زیادی است که شیگا توکسین یا stx بعنوان یکی از عوامل ویرولانس شیگلا دیسانتری در ایجاد اسهال خونی ودسانتری مطرح است. شیگا توکسین ها خانواده ای از سموم دو زیر واحدی ab را تشکیل می دهند . توکسین شیگا stx یک پروتئین هگزامر با وزن مولکولی 70.5 kda کیلودالتون بوده که از یک زیرواحد منومریک سمی و آنزیماتیک به نام stxa و از یک زیرواحد متصل شونده به رسپتور هموپنتامریک به نام stxb تشکیل شده است. قسمت غیر سمی stxb برای ورود و عملکرد قسمت سمی یا stxa ضروری می باشد. ناحیه stxa دارای وزن مولکولی در حدود 32 kda کیلو دالتون بوده که خود از دو قطعه که با پیوند کووالانس به هم متصل شده اند: قطعه اول a1 نام دارد که وزن آن در حدود 28 kda بوده و قطعه دوم بنام a2 دارای وزنی در حدود 4 kda می باشد. ناحیه انتهایی c از قطعه a2 ) c ترمینال a2 ( مسئول برهمکنش زیر واحد stxa با قسمت stxb این توکسین می باشد. قسمت a1 از stxa ناحیه سمی و آنزیماتیک محسوب می شود و سبب مهار سنتز پروتین می گردد. stxb ساختار هموپنتامریک ( 5 زیر واحد ) دارد که از 5 utr منومر کاملا یکسان تشکیل شده است. این ناحیه به کمک قسمت c ترمینال a2 به قسمت stxa با پیوند غیرکووالان متصل می گردد، و باعث ورود این ناحیه به درون سلول می شود. stxb به گیرنده سطح سلولی خود به نام gb3 متصل می گردد که روی اکثر سلولهای بدن بیان می شود. ورود شیگا توکسین به درون سلول میزبان از طریق مکانیسمretrograde system صورت می گیرد. ناحیه a1 از قسمت stxa قسمت سمی محسوب می شود.stxa1 باعث دپورینه شدن آدنوزین در 28s rrna در زیر واحد 60s ریبوزوم می گردد. این تغییر در ریبوزوم باعث می شود که trna نتواند به کمپلکس پروتئین سازی متصل شود و در نتیجه پروتئین سازی در سلول هدف مهار می گردد. با عدم اتصال آن به ریبوزوم یک سری از پروتئین کیناز ها مثل (jun-n terminal kinase) jnk و پروتئین کیناز فعال کننده میتوژن p38 (mapk) فعال می شود که خود منجر به تغییرات در مسیر پیام رسانی در کیناز های تنظیم کننده ای مثل (extracellular signal regulated kinase)erk-1 ,2 می گردد که در نهایت بسته به نوع سلول هدف میتوژن و سایتوکاین های مختلفی تولید می گردد که در فعالیت های مختلفی از سلول تاثیر می گذارد. نکته مهم در فعالیت آنزیماتیک قسمت a1 تجزیه پروتئولیتیکی در باند های دی سولفیدی a1-a2 است که در دستگاه گلژی رخ می دهد. در واقع stxa یک n galactosidase است که با اثر بر 28srrna ریبوزم، سنتز پروتئین را در ریبوزوم مهار می کند. در این مطالعه با بررسی اثرات مهلک سم شیگلا یا شیگا توکسین در ایجاد سندروم اورمیک و اسهال خونی کشنده و شایع بودن آن در اکثر آلودگی ها و با توجه به امکان استفاده از آن در جنگ های بیولوژیک و استفاده های نامتعارف از سوی بشر، طراحی و ساخت وکتور پلاستیدی حاوی ژن stxb همراه با ژن ctbبه منظور تقویت پاسخ ایمنی علیه stxb جهت انتقال به کلروپلاست گیاه کاهو علیه stxb وسم stxa انجام شد.

آنغوزه (ferula assa- foetida l.) گیاهی است بومی و انحصاری استپ‏های ایران و افغانستان متعلق به تیره چتریان (apiaceae)، با خواص دارویی و صنعتی منحصربفرد که آن را از سایر گونه‏های گیاهی متمایز می‏سازد. بذرهای آنغوزه همچون اکثر گیاهان این تیره دارای خواب نسبتا" طولانی بوده و کوتاه کردن دوره خواب و افزایش میزان جوانه‏زنی به روش‏های آزمایشگاهی می‏تواند در تکثیر و احیای این گیاه موثر واقع شود. در پژوهش حاضر با هدف دستیابی به ماده گیاهی کافی برای کشت درون شیشه‏ای و بهینه‏سازی ریزازدیادی گیاه آنغوزه، تأثیر تیمارهای مختلف فیزیکی و شیمیایی شامل سرما، آبشویی، هورمونga3 ، غلظت نمک‏های معدنی محیط کشت وهم‏چنین اثر سال بر شکستن خواب بذر و پرآوری (ریزازدیادی و ریشه‏زایی) این گیاه در شرایط آزمایشی، در قالب طرح کاملا تصادفی مورد بررسی قرار گرفت. در تیمار‏های مربوط به شکست خواب و جوانه‏زنی بذر، 30 لوله آزمایش که هر لوله حاوی یک بذر بود، به عنوان تکرار استفاده شد. آزمون چند دامنه‏ای دانکن نیز به منظور مقایسه میانگین‏ها به‏کار رفت. نتایج نشان داد استفاده از تیمارهای مختلف، تاثیر معنی‏داری بر شکست خواب و افزایش درصد جوانه‏زنی بذر آنغوزه داشت. به گونه‏ای که آبشویی بذر به مدت 6 ساعت با استفاده از سرمادهی مرطوب به مدت 2 هفته در دمای 4 درجه سانتی‏گراد، در محیط کشت ½ ms حاوی 10 میلی‏گرم بر لیترga3، منجر به شکست خواب بذر شده و میانگین جوانه‏زنی را تا 61 درصد در بذور یکساله نسبت به بذور تازه برداشت شده افزایش داد. در آزمایش‏های مربوط به پرآوری آنغوزه نیز، محیطms حاوی یک میلی‏گرم برلیتر هورمون bap در مقایسه با دیگر سیتوکینین‏های بکار رفته (کینتین و 2ip) و هم‏چنین 0/01 میلی‏گرم بر لیتر iba در مقایسه با (naa و پیکلورام)، مناسب‏ترین تیمار به منظور پرآوری گیاهچه‏ها و ایجاد ریشه‏های غده‏ای مناسب برای رشد و تکثیر متوالی گیاه، تشخیص داده شد. در این ترکیب هورمونی، میانگین ارتفاع گیاهچه، 3/96 سانتی‏متر بود که در مقایسه با شاهد (2/28 سانتی‏متر) به میزان 57/6 درصد افزایش نشان داده است. هم‏چنین تعداد ساقه جانبی نیز با میانگین 3 عدد نسبت به شاهد (یک ساقه) به ازای هر ریزنمونه بیشتر بوده است.

با توجه به ویژگی های خاص موجود در محصول بادام از جمله خاصیت انباری بسیار بالا، سهولت نگهداری و حمل و نقل، ضایعات کم و توان بالای صادراتی به صورت مغز خام و یا همراه با پوست، این محصول نسبت به سایر خشکبار ها از ارزش اقتصادی بالاتری برخوردار است .بنابراین یکی از نخستین مراحل در برنامه های اصلاحی بررسی ژرم پلاسم موجود از نظر صفات مختلف مورفو-پومولوژیکی و مولکولی و نهایتاً انتخاب بهترین ارقام و ژنوتیپ های برای بکارگیری در برنامه های اصلاحی و دست یابی به اهداف مورد نظر می باشد. مواد گیاهی این مطالعه شامل 139 ژنوتیپ و رقم بادام بود که از مزرعه کمال آباد کرج جمع آوری گردید .این آزمایش در قالب طرح crd با پنج تکرار برای هر صفت در دو سال 1390 و 1391 انجام شد. ارزیابی های مورفولوژیک شامل صفات کیفی وزن هسته، طول و عرض هسته، وزن مغز، طول و عرض مغز، ضخامت مغز، درصد مغز ودرصد دوقلوئی و صفات کیفی شکل میوه، تاریخ گلدهی، تاریخ رسیدن، عادت باردهی و عادت رشد بود. این صفات بر اساس دستوالعمل ipgri انتخاب گردید. در نهایت میانگین صفات مورفولوژیک در ارقام مختلف برآورد و برای آنالیز های چند متغیره مورد استفاده قرار گرفتند. اندازه گیری صفات کمی و کیفی برای دسته¬بندی ارقام مختلف به روشهای متفاوت و مناسب هر یک انجام شد. در انجام مطالعات ملکولی از برگ های جوان برای استخراج dna استفاده شد. تعیین کمیت و کیفیت dna به دو طریق انجام گرفت از الکتروفورز عمودی ژل پلی آکریل آمید با دستگاه dna analyzer 4300 (li-cor) ، برای جداسازی آلل های ریزماهواره در نمونه ها استفاده شد.نتایج تجزیه واریانس ویژگی¬های مورد مطالعه برای ارقام و ژنوتیپ¬های مورد بررسی نشان داد که برای تمام ویژگی¬های پارامتریک اندازه¬گیری شده، تفاوت معنی¬داری در سطح احتمال یک درصد وجود داشت .بیشترین وزن میوه خشک متعلق به رقم (9/72 گرم) d-88 بود. در حالی که کم ترین وزن میوه خشک در (1/28 گرم) carmelمشاهده شد.با توجه به نتایج مشاهده شده می توان دریافت که جمعیت متشکل از ارقام و ژنوتیپ های مورد بررسی برای انجام مطالعاتی مانند تهیه نقشه های ارتباطی و یا بکارگیری در برنامه های اصلاحی از اهمیت ویژه ای برخوردار است.

با توجه به نیاز گسترده‎ی صنایع غذایی به انواع شیرین کننده‎های حاصل از هیدرولیز نشاسته همچون شربت‎های گلوکز، مالتوز و فروکتوز، استفاده از آنزیم‎های هیدرولیز کننده‎ی نشاسته اهمیت ویژه‎ای پیداکرده است. آنزیم آمیلوپلولاناز (ec 3.2.1.41) یکی از اعضای خانواده‎ی آلفاآمیلازهاست که، قادر به هیدرولیز پیوندهای α-(1→4) و α-(1→6) در نشاسته، پلولان و دکسترین می‎باشد.‎ dna ژنومی از باکتری کوهنلا استخراج شد. طراحی پرایمر از دو توالی از ژن‎های کد کننده‎ی آنزیم آمیلوپلولاناز در این باکتری با نام‎های coh00831 به طول bp 1998 و coh01133 به طول bp 3678 صورت گرفت. ژن coh00831 ابتدا در ناقل کلونینگ pgem-t همسانه‎سازی شد. سپس در ناقل بیانی pet28a کلون، و در میزبان بیانی bl21 (de3) با القاء (m 1/0) iptg در °c 22 به مدت 6 ساعت بیان گردید. ژن coh01133 نیز پس از هضم آنزیمی با آنزیم‎های مهندسی شده در دو سر ژن، در ناقل بیانی pet28a کلون و در میزبان بیانی bl21 (de3) با القاء (m 1/0) iptg در °c 25 به مدت 4 ساعت بیان شد. پس از خالص سازی و سنجش فعالیت آنزیم‎ها، مطالعات بیوانفورماتیکی به منظور بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و شناسایی دمین‎های کاتالیتیکی و غیر کاتالیتیکی توالی‎ها نیز صورت گرفت.

این تحقیق به منظور بررسی پتانسیل تولید میکروتیوبر از گیاهچه¬های ارقام مختلف سیب¬زمینی در شرایط آزمایشگاهی درآزمایشگاه کشت بافت شرکت بهپرور سبلان در سال 1392 اجراء شد. گیاهچه های¬ پنج رقم سیب¬زمینی (آگریا، سانته، مارفونا، ساوالان و کایزر) حاصل از کشت مریستم درشرایط درون شیشه¬ای به روش قلمه¬های تک جوانه تکثیر شدند و از این گیاهچه¬ها برای تولید میکروتیوبر استفاده شد. میکروتیوبرها در شرایط آزمایشگاهی با تناوب نوری 8 ساعت تاریکی و 16 ساعت روشنایی تا تولید اولین میکروتیوبر و سپس در تاریکی کامل و دمای 22-18 درجه سانتی گراد در محیط کشت ms تولید شدند. نتایج تجزیه واریانس حاصل از اندازه¬گیری صفات نشان داد که ارقام سیب¬زمینی از نظر صفات تعداد، وزن و قطر میکروتیوبر در گیاهچه، تعداد برگ در گیاهچه و ارتفاع گیاهچه دارای اختلاف معنی دار بودند. بیشترین قطر میکروتیوبر در گیاهچه مربوط به ارقام مارفونا و کایزر، وزن میکروتیوبر در گیاهچه مربوط به ارقام سانته و مارفونا، تعداد میکروتیوبر در گیاهچه مربوط به ارقام سانته، مارفونا، آگریا و ساوالان، تعداد برگ در گیاهچه مربوط به ارقام سانته، ساوالان، مارفونا و کایزر و ارتفاع گیاهچه مربوط به ارقام کایزر، ساوالان و مارفونا بود. ضرایب همبستگی خطی بین صفات مورد مطالعه نشان داد که وزن میکروتیوبر تولیدی در هر گیاهچه با تعداد میکروتیوبر در هر گیاهچه و تعداد برگ در هر گیاهچه و قطر میکروتیوبر با تعداد برگ در هر گیاهچه رابطه مثبت و معنی¬دار داشتند. براساس نتایج تجزیه خوشه ای گروه دوم با ارقام سانته، ساوالان، کایزر و مارفونا به عنوان ارقام برتر انتخاب شدند.

مصرف آنتی بیوتیک ها بعنوان یک افزودنی و محرک رشد در جهت کاهش عفونت های باکتریایی در جیره طیور سالهاست که با منع شدیدی روبرو گردیده است. اتحادیه اروپا و fao و who هم در رابطه با خطراتی چون افزایش مقاومت باکتریها، استفاده از آنتی بیوتیک ها در جیره طیور بر سلامت مصرف کنندگان هشدار جدی داده¬اند. به همین دلیل برخی اسانس های گیاهی با خاصیت ضد باکتریایی همچون (مورد، درمنه، میخک و گشنیز) به عنوان گزینه های جاگزین آنتی بیوتیک ها در جیره طیور مورد تحقیق و بررسی قرار گرفت. لایه مخاطی روده با ترشح موکوس (موسین) اولین سد دفاعی دستگاه گوارش را تشکیل می¬دهد. در این تحقیق اثر اسانس¬های گیاهی (مورد، درمنه، میخک و گشنیز) بر بیان ژن موسین2 در روده جوجه های گوشتی با استفاده از روشreal time - pcr بررسی شد. بدین منظور آزمایشی با اسانس های مورد، درمنه، گشنیز و میخک انجام شد. تیمارهای آزمایشی در این آزمایش شامل تیمار شاهد، آنتی بیوتیک و سه اسانس درمنه، مورد و گشنیز هر کدام با سه سطح 200،100 و 300 میلی گرم در کیلوگرم جیره و اسانس میخک با سه سطح 100، 300 و 500 میلی گرم در کیلوگرم جیره بودند. برای انجام تحقیق در 42 روزگی 56 نمونه بافت ژژنوم روده جوجه های گوشتی ( از هر تیمار 4 نمونه) تهیه گردید. پس از استخراج rna، سنتز cdna و در نهایت واکنش rt-pcr انجام شد برای مشخص نمودن کمیت نسبی این واکنش ها از روش 2^ (- ??ct) استفاده شد. نتایج نشان داد در جوجه های تغذیه شده با سطوح 500 میلی گرم در کیلوگرم اسانس میخک، 300 میلی گرم در کیلوگرم اسانس مورد و 100 میلی گرم در کیلوگرم اسانس درمنه در بالاترین حد میزان بیان ژن موسین2 مشاهده شد و همچنین درسطح 200 میلی گرم در کیلوگرم اسانس مورد، 100 میلی گرم در کیلوگرم اسانس میخک نیز میزان بیان ژن موسین2 قابل ملاحظه بود. اما در سطح 300 میلی گرم در کیلوگرم اسانس میخک بیان ژن موسین2 تقریباً متوسط و در سطوح300،200،100 میلی گرم در کیلوگرم اسانس گشنیز، بیان ژن موسین کم و تقریباً یکنواخت بود. در سطوح 200 و 300 میلی گرم در کیلوگرم اسانس درمنه بیان ژنی بسیار ناچیز و در حدود بیان ژن در شاهد و آنتی بیوتیک در بافت ژژنوم روده در جوجه های گوشتی داشتند0/05) (p<.

انگور هم به لحاظ سطح زیر کشت و هم ارزش تغذیه¬ای و اقتصادی از مهمترین محصولات باغی در دنیاست. ایران از نظر تولید انگور در رتبه هفتم دنیا جای دارد. انگور به تیره تاکسانان تعلق دارد. دما مهم ترین عامل اکولوژیکی حاکم بر توزیع گونه های گیاهی و پتانسیل عملکرد آنها می باشد. انگور از جمله محصولاتی است که در اثر مواجه شدن با تنش سرمایی میزان محصول آن به شدت کاهش می¬یابد. یکی از روش¬های به¬نژادی ارقام مختلف انگور استفاده از کشت درون-شیشه¬ای و تولید پینه است . از تولید پینه و باززایی آن برای گزینش درون شیشه¬ای جهت افزایش تحمل نسبت به تنش¬های محیطی زنده و غیر زنده (از طریق استفاده از تنوع موجود و یا تنوع سوماکلونی) استفاده می¬شود. به همین منظور با استفاده از دو ریزنمونه¬ی برگ و مریستم میانی از چهار رقم انگور شامل عسکری، سیاه، ریش بابا و گوی آزمایشی به¬صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار و به¬کارگیری تنظیم کننده¬های رشد بنزیل آدنین پورین و نفتالیک استیک اسید هر کدام در پنج سطح (0، 5/0، 1، 5/1 و 2 میلی¬گرم در لیتر) جهت تولید پینه اجرا شد. در این مرحله ویژگی¬های مختلف پینه از قبیل طول، ارتفاع، حجم، وزن تر، وزن خشک و درصد رطوبت نسبی اندازه¬گیری و مورد ارزیابی قرار گرفتند. پس از آن باززایی از پینه¬های حاصل از مریستم میانی انجام شد. در پایان نیز گیاهچه¬های حاصل جهت بررسی میزان تحمل به سرما در معرض چهار سطح دمایی 2، 8، 14 و 25 درجه سانتی¬گراد به مدت یک هفته قرار داده شدند. سپس صفاتی از قبیل میزان نشت الکترولیت، فلورسانس کلروفیل، شاخص کلروفیل، پرولین، قند محلول کل و پروتئین محلول کل اندازه¬گیری شدند. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که اثر ریزنمونه، تنظیم کننده¬های رشد، رقم و برهمکنش آنها برای تمام صفات اندازه¬گیری شده در سطح احتمال یک درصد معنی¬دار بود. مقایسه میانگین¬ها نشان داد که در مجموع رقم ریش¬بابا (در سطح 5/1 میلی¬گرم در لیتر بنزیل آدنین پورین و 2 میلی¬گرم در لیتر نفتالیک استیک اسید) با توجه به صفات اندازه¬گیری شده از طریق مریسم میانی در مقایسه با سایر ارقام در پینه¬زایی بر¬تر بود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس در آزمایش مربوط به بررسی میزان تحمل به سرما نشان داد که اثر دما برای صفات نشت الکترولیت، ضریب spad، fm/fv، fm، پرولین، قند محلول کل و پروتئین محلول برگ در سطح احتمال 5 درصد معنی¬دار بود. در مجموع نتایج نشان داد که رقم انگور سیاه تحمل بیشتری نسبت به سایر ارقام به سرما داشت. همچنین اثر دما برای صفات نشت الکترولیت، فلورسانس کلروفیل، میزان پرولین، قند محلول و پروتئین محلول معنی¬دار شدند که می¬تواند نشان-دهنده ارتباط مستقیم این صفات با میزان تحمل به سرما در ارقام مختلف انگور باشد. در مجموع رقم انگور سیاه با توجه به ویژگی¬های مورد بررسی تحمل به سرمای بیشتری در مقایسه با سایر ارقام نشان داد. در مجموع نتایج حاصل از این آزمایش حاکی از واکنش خوب ژنوتیپ¬های انگور به تولید پینه و ریزازدیادی بود. نظر ¬به اینکه برخی برنامه¬های اصلاحی مثل تحمل به انواع تنشها در شرایط درون شیشه¬ای امکان پذیر است، این نتایج در برنامه¬ریزی اصلاحی کاربرد خواهند داشت.

شوری یکی از جدی ترین تهدیدها برای رشد و تولید محصول در گیاهان است. سیب زمینی یک گیاه زراعی مهم است که حساسیت متوسطی به شوری دارد و عملکرد کمی و کیفی محصول، تحت تأثیر منفی این کنش قرار می گیرد. بدین منظور، در دو رقم آگریا و فونتانه که از ارقام مهم تجاری و صنعتی سیب زمینی هستند، در مرحله کالوس تحت تنش شوری، به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار قرار گرفتند.ابتدا ریزنمونه های برگی دو رقم، در محیط کشت جامد ms به مدت 42 روز قرار گرفته تا کالوس تشکیل و به حجم مناسب برسد. این کالوس ها قبل از واکشت در محیط کشت جدید وزن شدند. در مرحله بعد کالوس های ارقام مورد مطالعه در محیط کشت مایع ms حاوی غلظت های 0، 30، 60، 90 و 120 میلی مولار nacl، به مدت 28 روز قرار گرفته و سپس کالوس ها را وزن کرده تا میزان رشد آن ها بعد از ایجاد تنش مشخص شود. از کالوس هاعصاره گیری کرده و با بافر مخصوص، پروتئین آن استخراج، و در دستگاه الکتروفورز عمودی ژل پلی اکریل آمید (sds - page) قرار گرفت. سپس باندهای پروتئینی با کوماسی بلو r-250 رنگ آمیزی شد. این نمونه ها با نمونه شاهد مقایسه و تغییرات الگوی الکتروفورزی پروتئین های محلول مورد بررسی قرار گرفت. داده های آماری و رسم نمودارها توسط نرم افزارهای excel و spss صورت گرفت و مقایسه میانگین ها با استفاده از آزمون دانکن در سطح احتمال 5 درصد انجام شد. نتایج بررسی شده این تحقیق نشان می دهد که رقم فونتانه کالوس های درشت تر و با وزن بیشتری نسبت به رقم آگریا تشکیل داده اند ولی میزان پروتئین های محلول آن کمتر از رقم آگریا بود. کالوس های رقم آگریا در شوری 30 میلی مولار مقاومت و رشد خوبی از خود نشان داد و رقم فونتانه در شوری 120 میلی مولار، رشد کالوس ها تقریباً متوقف، و پروتئین های محلول آن از بین رفتند، که نشان دهنده حساسیت بسیار بالای این رقم به این مقدار شوری می باشد.

فسفوگلیسرات موتاز (pgm) یک آنزیم ترانسفراز (انتقالی) است که در مرحله هشتم از فرایند گلیکولیز عمل میکند. آنزیم فسفوگلیسرات موتاز (ec 5.4.2.1) (pgm) جابجایی قابل برگشت گروه فسفریل را بین کربنهای 2 و 3 فسفوگلیسرات کاتالیز می کندvoet et al., 2008) ؛ crowhurst et al., 1999). pgm در تمام موجودات زنده یافت میشود و توالی آن در طول تکامل به شدت حفاظت شده است (winn et al., 2012). بهمنظور بررسی روابط فیلوژنتیکی pgm، 196 توالی پروتئینی در گیاهان، جانوران و میکروارگانیسمها و 133 داده نوکلئوتیدی (ژن) در گیاهان، جانوران و میکروارگانیسمهایی که ژن pgm در آنها توالییابی شده است بههمراه دو نمونه اصلی(مدل) از هر سه گروه، درنظر گرفته شدند. در بررسیهایی که توسط نرمافزار megalign و روش clustal w انجام شد، بیشترین تشابه بر اساس تخمین فاصله در میان دادههای پروتئینی گیاهان در میان گونه های مختلف خانواده rosaceae مشاهده شد. بیشترین تشابه مربوط به(prunus dulcis, pdpgm-caa52928) و (malus x domestica, mdpgm-caa06215) که دارای 053/0 فاصله بودند. در میان خانواده های مختلف نیز بیشترین تشابه بر اساس تخمین فاصله مربوط به (ricinus communis, rcpgm-eef42299) از خانواده euphorbiaceae و (populus trichocarpa, ptpgm-xp_002323696) از خانواده salicaceae میباشد که دارای 053/0 فاصله بودند. کمترین تشابه نیز مربوط به (glycine max, gmpgm-xp_003517475) و (micromonas pusilla, mppgm-xp_003060907) میباشد که دارای 476/3 فاصله بودند. در بین گیاهان در سطح ژن نیز بیشترین تشابه بر اساس تخمین فاصله در میان گونههای مختلف خانواده solanaceae مشاهده شد که 088/0 فاصله بودند. کمترین تشابه نیز متعلق به(micromonas pusilla, mppgm-xm_003060861) و (glycine max, gmpgm-nm_001251040) میباشد که 906/2 فاصله بودند. در آنالیزهایی که بهمنظور بررسی خصوصیات ساختاری پروتئین pgm در 5 نمونه اصلی(مدل) انجام شد(آرابیدوپسیس و کرچک، مگس سرکه و انسان، ایکولای) ، وجود هیچ دومین گذرنده از غشاء در آنها تأیید نشد. همچنین هیچکدام از آنها دارای پپتید نشانه نبودند. در هر پنج نمونه مارپیچ آلفا و فنر مارپیچ تصادفی بیشترین اجزاء ساختاری را تشکیل میدهند درحالیکه رشتههای گسترده و پیچ بتا بهصورت متناوب در پروتئین پراکنده شدهاند. همچنین در تعیین دمینهای عملکردی که توسط prodom انجام شد، دمینهای مشترک در 3 نمونه اصلی آرابیدوپسیس، کرچک و باکتری ایکولای و در 2 نمونه اصلی مگس سرکه و انسان مشاهده شد. با توجه به بررسیهای انجام شده، تأیید میشود که pgm یک آنزیم کاتالیزکننده در فرایند گلیکولیز میباشد و تمام گیاهان دارای ژن pgm و سایر موجودات زنده از نظر فیلوژنتیکی در یک منشاء تکاملی مشترک سهیم هستند.

به منظور شناسایی ژنوتیپ های متحمل و حساس برنج به تنش خشکی، آزمایشی با 59 ژنوتیپ برنج در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار در دو محیط بدون تنش ( غرقاب) و تنش خشکی در سال زراعی 1392در شهرستان علی آباد کتول مورد مطالعه قرار گرفت. بیشترین میانگین عملکرد در شرایط نرمال متعلق به ژنوتیپ های caiapo و ir68702–072–1-4-bبه ترتیب 296/7 و 203/7 تن در هکتار بود. در شرایط تنش بیشترین میانگین متعلق به ژنوتیپ های caiapo و pegaso به ترتیب 743/2 و 679/2 تن در هکتار بود. تجزیه کلاستر بر اساس wardروش و برش دندروگرام موجب گروه بندی ارقام در 3 گروه درشرایط نرمال و تنش خشکی گردید. برای بررسی تنوع مولکولی dna ژنومی آنها استخراج و با 36 نشانگر ریزماهواره و 10 نشانگر بین ریزماهواره مورد بررسی قرار گرفتند. از 36 جفت آغازگر ریزماهواره در مجموع 189 آلل با میانگین 25/5 آلل در هر مکان ژنی مشاهده شد. میانگین محتوای اصلاعات چند شکل (pic) 58/0 برآورد شد که نشانگر5647 rm با 81/0 بیشترین و 6022 rmبا 32/0 کمترین (pic) نشان دادند. از 10 جفت نشانگر بین ریزماهواره در مجموع 144 باند با میانگین 4/14 باند به ازای هر جایگاه نشانگری ایجاد نمود و از 144 باند تشکیل شده 17/69 درصد از باند ها چندشکل بودند. آغازگر issr-10 با توالی آغازگری (gt)6cc بیشترین درصد چندشکلی(80 درصد) و آغازگر issr-9 با توالی آغازگری (actg)4 کمترین درصد چندشکلی (55/55) داشتند. بیشترین محتوای اطلاعات چند شکل(pic) را آغازگر issr-7 با 49/0 و آغازگرهایی issr-2، issr-8، issr-9 و issr-10 با 47/0 کمترین مقدار pic را به خود اختصاص دادند. نشانگر issr-10 با 8/34 بیشترین شاخص نشانگری(mi) و نشانگرissr-4 با 23/28 کمترین مقدار شاخص نشانگری را داشتند. براساس تجزیه رگرسیون داده های مولکولی و صفات مورفولوژیکی، برای نشانگر های ریزماهواره در مجموع 90 نشانگر برای شرایط نرمال و 69 نشانگر برای شرایط تنش خشکی برای صفات مرفولوژیکی شناسایی شد. در شرایط نرمال تعداد خوشه و تعداد روز تا گلدهی با 9 نشانگر و در شرایط تنش خشکی وزن خوشه با 9 نشانگر بیشترین نشانگر های مثبت را نشان دادند. برای نشانگر های بین ریزماهواره در مجموع 70 نشانگر برای شرایط نرمال و 72 نشانگر برای شرایط تنش خشکی برای صفات مرفولوژیکی شناسایی شد. در شرایط نرمال عرض برگ پرچم با 9 نشانگر و در شرایط تنش خشکی طول خروج خوشه از غلاف، عرض برگ پرچم، تعداد دانه کل، تعداد دانه پر خوشه و عملکرد در هکتار با 6 نشانگر بیشترین نشانگر های مثبت را نشان دادند. ازنتایج این تحقیق می توان در برنامه های اصلاحی برای ایجاد جمعیتی با هتروزیگوسیتی بالا برای تحمل به تنش خشکی در ژنوتیپ های برنج استفاده شود

با توجه به افزایش رشد جمعیت به بیش از 7 میلیارد و عدم برخورداری یک پنجم آنها از غذای کافی و نیاز به تأمین غذایی،افزایش تولید در واحد سطح میتواند به عنوان یک راهبرد اساسی در حل این مشکل بشمار می آید. در این میان گیاهان زراعی نقش مهمی را در تأمین غذای بشر ایفا میکنند و در بین این گیاهانگندم با دارا بودن مواد غذایی ارزشمندی مانند انواع پروتئین ها، ویتامین ها و موادمعدنی ، حدود 25% کالری غذایی جهان را تأمین می نماید. (salunkhe et al., 1996).بطوری که حدود 6/19% منبع غذایی مردم جهان راتشکیل میدهد. با توجه به محدودیتهای سطح زیر کشت گندم میتوان گفت که افزایش عملکرد میتواند نقط اتکاء راه کارهای عملی برای پاسخگویی به نیاز های کشور باشد. از عواملی که باعث کاهش عملکرد در واحد سطح می گردند،میتوان به تنشهای زیستی مانند آفات و بیماریها اشاره نمود. بیماریfhb(fusarium head blight) که عموما"تحت عنوان، اسکب،wheat scab،head scab،pink scab،white head،head blight نامیده میشود یکی از مهمترین بیماریهای غلات ایران و جهان بوده که علاوه بر خسارت کمی ، خسارات کیفی نیز به بار می آورد که حتی دیده شده در اپیدمی های شدید گاهی تا 50% محصول غیر قابل استفاده می باشد. همچنین این بیماری از بیماریهای مخرب در مناطق گرم و مرطوب کشت گندم در جهان می باشد. علائم بیماری به راحتی قابل تشخیص است و باعث ایجاد خسارات متعددی در گیاه و سلامت انسان و دام می گردد(baiandshanerm, 1994). این بیماری از سالها پیش بطور پراکنده در ایران وجود داشته و یکی از بیماریهای مهم گندم در استانهای مازندران ، گلستان، زنحان، فارس و دشت مغان بشمار میرود ( ملیحی پور و همکاران 1379) در بررسی های انجام شده در شرق مازندران متوسط درصد آلودگی برای ارقام تجارتی فلات ، گلستان و خزر به ترتیب 5/76 ، 61، 8/28 در صد بر آورده شده است ( گلزار و همکاران 1378). همچنین در شرایط اپیدمی تا 70 درصد کاهش عملکرد نیز در شمال کشور گزارش شده است. ( طوطیای، 1377) در این چند سال به علت وجود منابع آلودگی، کشت ارقام حساس به بیماری و مهیا بودن شرایط جوی در مناطق شمالی کشور ، خسارت ناشی از این بیماری بسیار چشمگیر بوده است ( گلزار ، 1368، فروتن و همکاران ، 1372 ، ملیحی پور و همکاران ، 1379) از آنجاییکه مبارزه شیمیایی در ارتباط با این بیماری مناسب نمی باشد انتخاب و استفاده از ارقام متحمل با صفات زراعی بهترین راه مبارزه و کنترل محسوب می شود. با وجود اطلاعات گسترده در مورد این بیماری در ارتباط با تنوع گونه های ایجاد کننده بیماری، تنوع ژنتیکی جدایه های عامل بیماری ، نحوه پراکنش جغرافیایی و ساختار جمعیتی و ساختار جغرافیایی و همچنین تنوع و اختلاف بیماریزایی بین این جدایه ها در ایران اطلاعات زیادی در دست نیست، لیکن این تحقیق در برنامه های اصلاحی جهت تولید ارقام و لاینهای متحمل و مقاوم به بیماری فوزاریوم سنبله گندم و تعیین خسارت و اپیدمیولوژی بیماری بسیار انکار ناپذیر است. تا کنون از روش های ملکولی و فنوتیپی متفاوتی برای مطالعه ساختار جمعیتی و رفتارهای تولید مثلی و پراکنش زیستی – جغرافیایی این قارچ استفاده شده است. نشانگرهای ملکولی از جمله microsatellite،b-tubulin،rapd وissrبرای بررسی تنوع ژنتیکی و مطالعه ساختار جمعیتی و جغرافیایی پاتوژن عامل بیماری بلایت فوزاریومی سنبله گندم استفاده شده است. - در نهایت با توجه به اینکه تا کنون مطالعات همزمانی در زمینه تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی و جغرافیایی این قارچ انجام نشده است نتایج حاصل از این تحقیق در ردیابی جدایه ها در طبیعت و شناسایی گونه های غالب هر منطقه و انتخاب بیماریزاترین جدایه و همچنین کمک به انتخاب ارقام مقاوم و مطالعات اپیدمیولوژیکی بیماری بسیار مفید خواهد بود.

گیاهان موجوداتی بدون تحرک هستند که در معرض شرایط نامساعد محیطی قرار دارند. از اینرو باید از طریق ساز و کاری ویژه به تنظیم روابط خود با محیط بپردازند. در این میان ارتباط بین بخش‎های مختلف گیاه باید به گونه‎ای برقرار شود که با صرف کمترین هزینه، بیشترین سطوح تنظیمی انجام گیرد. رابطه ریشه با اندام‎های هوایی از طریق انتقال مولکول‎های سیگنال در بستر بافت آوندچوبی صورت می‎گیرد. این ارتباط از طریق ترکیبات آلی، غیرآلی، آمینواسیدها، هورمون‎ها و پروتئین‎ها می‎باشد. بررسی‎ها نشان می‎دهد که پروتیین‎های موجود در عصاره آوندچوبی در بین گونه‎های گیاهی به حالت حفاظت شده هستند. این پروتئین‎ها شامل گروه پراکسیدازها، کیتینازها، پروتئازها و پروتئین‎های وابسته به بیماری زایی می‎باشند که به مقدار فراوانی درون عصاره‎ آوندچوبی وجود دارند. هدف از این مطالعه بررسی امکان دخیل بودن این پروتیین‎ها در فرآیند انتقال سیگنال با صرف مقدار انرژی کمتر در ساخت این پروتئین‎ها از ریشه به اندام‎های هوایی می‎باشد. در این بررسی نخست پروتیین‎هایی که از ریشه گیاهان از طریق آوند چوبی به اندام‎های هوایی ارسال می‎گردد از منابع منتشر شده استخراج شد و سپس ویژگی این پروتیین‎ها مانند قابلیت تحرک و خواص فیزیکی و شیمیایی آنها تعیین گردید. انرژی متابولیکی مورد نیاز برای بیوسنتز آن‎ها به همراه انرژی نهفته در پیوندهای پپتیدی محاسبه شد. برای مقایسه سطح انرژی بیوسنتز پروتئین‎های آوند چوبی با پروتئین‎های دیگر بافت‎های گیاهی، به طور تصادفی پروتئین‎های دیگری از ریشه و برگ استخراج گردیده و همین بررسی‎ها بر روی آن‎ها انجام گرفت. نتایج حاصله گویای سطح پایین انرژی پروتئین‎های عصاره آوند چوب نسبت به گروه پروتیین‎های تصادفی بود. بنابراین به نظر می‎رسد پروتینهای آوند چوبی بتوانند به عنوان مولکولهای سیگنال با صرف انرژی کمتر برای بیوسنتز آنها، بین ریشه و اندام های هوایی جابه جا شوند.

چکیده برای هزاران سال، کورکومین در شرق به عنوان یک عامل درمانی برای طیف گسترده ای از بیماری های التهابی، نئوپلاستی و دیگر شرایط استفاده شده است. در سال های اخیر، پتانسیل درمانی بزرگی برای این ترکیب در برابر بیماری های مختلف انسان از جمله سرطان، بیماری های قلبی و عروقی، دیابت، ورم مفاصل، بیماری های عصبی و بیماری hivگزارش شده است. این ترکیب اثرات خود را از طریق کاهش بروز فاکتورهای نسخه برداری التهابی مثل فاکتورهسته ایکاپا-بی(nf-?b) آنزیم هایی مثل سیکلو اکسیژناز2؛ لیپواکسیژناز و سایتوکین هایی مثل فاکتور نکروز توموری ((tnf-? اینترلوکین 1 و اینترلوکین6 انجام میدهد. به دلیل نقش مهم التهاب در اکثر بیماری های مزمن اثر این ماده در بیماری های مزمن مختلف مورد ارزیابی قرار گرفته است. کورکومین به طور کامل جذب نمی شود؛ فراهمی زیستی خوراکی آن حدود 60% است. این اثر احتمالا به دلیل حلالیت ضعیف و انحلال آهسته می باشد. پراکندگی جامد یکی از روش های موفق در بهبود انحلال دارو، و به دست آوردن فراهمی زیستی بهتر می باشد. چنانچه این سیستم در معرض محیط آبکی قرار گیرد، حامل حل شده و دارو برای انحلال و جذب سریع به صورت ذرات بسیار کوچک آزاد می شود. پلیمرهای سنتتیک آبدوست به طور گسترده ای به عنوان ماده حامل برای پراکندگی جامد بررسی شده اند. 30 pvp k- اغلب به عنوان حامل استفاده می شود. این ماده می تواند حلالیت و انحلال بسیاری از داروهایی که به میزان کم در آب حل می شوند را بهبود بخشد. در این تحقیق ما از این پلیمر جهت افزایش انحلال کورکومین استفاده نمودیم و به این امر مهم دست یافتیم که با افزایش میزان نسبت کورکومین به pvp تا 1:6 میزان انحلال پذیری افزایش می یابد البته بهترین نسبت جهت مصارف انسانی نسبت 1:4 پیشنهاد می شود که با میزان مجاز مصرف pvp برای یک فرد بالغ طبق نظر fao برابری می نماید.

امروزه بیماری شاخه و تنه از جمله بیماری اسکا مو(زوال مو، سکته مو)از اهمیت بالایی برخوردار است. بیماری اسکا مو با انتشار جهانی به عنوان یک بیماری مخرب انگور محسوب می شود.قارچ phaeoacremnium یکی از مهمترین عوامل بیماریزای تاکستان های کل جهان مخصوصآ ایران است که با عث ایجاد خساراتی چون تغییر رنگ آوندها و برگها،سرخشکیدگی،کوتولگی، ایجاد لکه در حبه ها و کاهش توده ریشه و در نهایت مرگ گیاه می شود. از بین گونه های قارچ phaeoacroemnium گونه p.aleophilum گونه غالب بیمار اسکا می باشد.از طرفی بسیاری از جدایه های باکتری استرپتومایسس از عوامل طبیعی کنترل کننده ی عوامل بیماریزای قارچی می باشند.فعالیت آنتاگونیستی5 جدایه از باکتریهای استرپتومایسس بر علیه قارچ عامل زوال مو برای کنترل بیولوژیک این بیماری در شرایط آزمایشگاهی و از طریق کشت متقابل مورد ارزیابی قرار گرفت.برای این کار نمونه ای ازقارچ بیمارگر که از باغات آلوده جمع اوری شده با استفاده از کورک بوره استریل در یک طرف پلیت حاوی محیط کشت pda وباکتریهای آنتاگونیست در طرف دیگر پلیت قرار داده شدند و به مدت 20 روز در دمای 28 در جه سانتیگراد انکوبه شدند. پس از 20 روز انکوباسیون تمامی جدایه های استرپتومایسس توانستند رشد میسلیوم قارچی را مهار کنند و در اطرافشان هاله عدم رشد قارچ ایجاد نمایند. این در حالی است که کشت های شاهد قارچ توانستند در طی این مدت تمامی قطر پلیت را پر نمایند.به طور میانگین جدایه dm167با ایجاد هاله ای به شعاع 0.88 بیشترین فعالبت ضد قارچی را داشته و بعد از آن ae30، dm134 ، dm103، ae09 قرار داشتند.

در این مطالعه برای ارزیابی اثرات ضد التهابی گیاه شکر تیغال(echinops cephalotes) بر روی بیومارکرهایی که در جریان بیماریهای اوستئوآرتریت مهم هستند از سلولهای مونوسیت/ ماکروفاژ و سلولهای کندروسیت به عنوان مدلی شبیه به سلولهای مونوسیت / ماکروفاژ و غضروف انسانی مبتلا به اوستئوآرتریت استفاده گردید. بدین منظور این سلول ها به منظور افزایش سطح سایتوکین ها به وسیله لیپو پلی ساکارید (lps) تیمار شدند. ابتدا عصاره گیاه شکر تیغال echinops cephalotes)) از مرکز ذخایر ژنتیکی ایران تهیه شد. برای تهیه سلول های مورد نیاز از 1) بافت غضروفی مفصل متا کارپ اندام حرکتی جلویی گوساله هلشتاین 8 ماهه کاملاً سالم بدون مشاهده هر گونه آثار التهاب ، خونریزی و عفونت ناشی از استئوآرتریت ، نمونه برداری شد . 2) مونوسیت ها بصورت فلاسکی حاوی6 میلیون مونوسیت و 60 میلی لیتر محیط کشت غنی شده سلولی از انیستیتو پاستور تهیه شد. سپس هر یک از انواع سلولهای مورد مطالعه در شرایط مطلوب نگهداری و کشت داده شد. بعد از بررسی محیط کشت دو نوع سلول مورد مطالعه با استفاده از هموسایتومتر سلولها شمارش و قدرت زنده مانی (viability) آنها با روش تریپان بلو ارزیابی شد. پس از تکثیر سلولی میزان lc50 را تعیین نموده و تزریق lps را به میزان µg/ml10 به نمونه های تعیین شده از نظر غلظت های مناسب ( که سلولها در آن لیز نشده باشند) انجام داده و در دمای 37 درجه سانتی گراد در انکوباتور co2 دار با رطوبت 90% به مدت 1 ساعت نگهداری شد. پس از گذشت زمان لازم نمونه ها جهت جداسازی rna طبق دستور العمل کیت آماده می شود.rna جداسازی شده باید به cdna تبدیل شده که با روش rt-pcr انجام می گیرد و پس از آن با روش pcr از cdna بدست آمده مقادیر بیشتری بدست آورده و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی سایتو کینین ها با روش real time – pcr به بررسی میزان بیان ژن آنها پرداخته شد .

هارمین و هارمالین از عمده آلکالوئیدهای بتاکربولینی موجود در دانه گیاه اسپند (peganum harmala l.) هستند، که به¬عنوان ماده¬های مؤثره گیاهی برای مصارف دارویی و پزشکی معرفی شده اند. از نیازهای اساسی توسعه کشت گیاهان دارویی ، شناسایی، ارزیابی و جمع¬آوری توده¬های بومی و نیز معرفی ژرم¬پلاسم¬های سازگار با اقلیم مناطق مختلف می¬باشد. هدف از این پژوهش، بررسی تنوع فیتوشیمیایی 5 توده ژنی منتخب اسپند ایرانی، بر اساس ارزیابی مقایسه¬ای مواد مؤثره هارمین و هارمالین می¬باشد. آنالیز الکتروفورزی پروتئین دانه و آنالیز روغن دانه، به¬ترتیب به¬منظور تعیین پروفایل پروتئینی و پروفایل اسیدهای چرب، جهت تخمین فواصل ژنتیکی توده¬های ژنی صورت گرفته است. الکتروفورز sds-page پروتئین¬های استخراجی دانه توده¬های ژنی اسپند با ژل¬های آکریل آمید 8 و 12 و 16 درصد، چند شکلی را میان توده¬های ژنی نشان نداد. استخراج روغن با استفاده از روش پرس سرد و شناسایی اسید¬های چرب با استفاده از دستگاه کروماتوگرافی گازی (gc) صورت پذیرفت. 6 نوع اسیدچرب شامل پالمیتیک، پالمیتولئیک، استئاریک، اولئیک، لینولئیک، و لینولنیک¬اسید توسط کروماتوگرافی گازی شناسایی گردید. که آنالیز استاتیکی داده¬های درصد اسیدهای چرب نمونه¬ها، جز در لینولئیک اسید، تفاوت معنی¬داری را بین تیمارها نشان نداد. آلکالوئیدهای موجود در گیاه اسپند (p.harmala l.) با روش استخراج اسیدی/ بازی استخراج شدند و با روش طیف سنجی مادون قرمز (ftir) مورد شناسایی، و سپس با روش کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (hplc) مورد ارزیابی مقایسه¬ای قرار گرفتند. برای انجام تحلیل آماری داده¬های حاصل، نمونه¬ها در 3 تکرار و به¬صورت طرح کاملاَ تصادفی ارزیابی شدند. اختلاف معنی¬دار قابل توجهی بین تیمارها از نظر غلظت آلکالوئید¬ها دیده شد. دندروگرام حاصل از آنالیز کلاستر، توده-های ژنی را بر اساس غلظت مواد مؤثره هارمین و هارمالین و سایرصفات گروه¬بندی کرد. این مطالعه می¬تواند به¬عنوان راهکاری در توسعه ژنتیکی و متابولیکی پایدار گونه¬های با ارزش گیاهان دارویی تلقی شود. داده¬های حاصل حاکی از آن است که با توجه به ارزش دارویی آلکالوئیدهای عصاره دانه، اسپند ایرانی پتانسیل بالقوه جهت تولید داروهای خوراکی دارد.با توجه به اهمیت شناخت گیاه قبل از اجرای عملیات به نژادی، داده¬های حاصل می¬توانند به¬عنوان مرجعی در انتخاب روش¬های مناسب اصلاحی، برای افزایش میزان آلکالوئید¬های ضروری در این گیاه به¬کار گرفته شوند.

رابطه فیلوژنی بین 12 گونه وحشی prunus ، یک رقم زراعی بادام و یک رقم هلو، با استفاده از توالی های ناحیه its1-5.8s rdna-its2 ژن ریبوزومی و ناحیه trnl dna کلروپلاستی مورد ارزیابی قرار گرفت. توالی های نوکلئوتیدی حاصل از این بررسی در بانک ژن ncbi به کمک nucleotide blast مورد شناسایی قرار گرفتند. داده ها توسط برنامه clustal x هم ردیف شدند. میزان تناسب هم ردیفی ها با آنالیز فیلوژنیک به کمک روش آنالیز نقشه یابی حداکثر درست نمایی (lma) و با به کارگیری نرم افزار tree-puzzle-5.2براساس آنالیز چهار بخشی انجام گرفت. روش های حداکثر شباهت و نزدیکترین همسایگی به منظور آنالیز ماتریس داده های حاصل، توسط نرم افزار paup*4.0 beta استفاده گردیدند. علاوه بر این، برای بالا بردن دقت یکبار دیگر نیز داده ها با استفاده از نرم افزار mega مورد بررسی قرار گرفتند. فواصل ژنتیکی برای هرجفت از گونه ها مشخص شد و میانگین فاصله ژنتیکی در بین گونه ها تنها کمترین فاصله ژنتیکی را در داخل جنس نشان می دهد.

آنزیم کلسترول اکسیداز باکتریایی( (cox, ec 1.1.3.6یک آنزیم مونومر دو عملکردی وابسته فلاوین آدنین دی نوکلئوتید است که واکنش اکسیداسیون وایزومریزاسیون کلسترول را در حضور اکسیژن مولکولی کاتالیز و تولید 4-کلستن-3- ان و پراکسید هیدروژن می کند و از مهمترین آنزیمهای تجاری دنیاست.کلسترول اکسیداز بعنوان نسل چهارم آفت کش های بیولوژیکی با خاصیت آفت کشی قوی بر روی آفات سرخرطومی و کرم غوزه پنبه جهت تولید گیاه پنبه تراریخت مقاوم به آفات درکشاورزی کاربرد دارد.این آنزیم توسط برخی باکتری های گرم مثبت و منفی تولید می شود.مطالعه حاضر با هدف شناسایی،جداسازی و مقایسه فعالیت های بیوشیمیایی آنزیم کلسترول اکسیداز باکتری های بومی خاک لرستان جهت استفاده بعنوان آفت کش بیولوژیکی پنبه انجام شد. با کشت 130 نمونه در محیط های غربالگری حاوی کلسترول به عنوان تنها منبع کربن و انجام تست های تاییدی رنگ سنجی قرمز و قهوه ای نمودن محیط کشت،جداسازی وتایید فعالیت کلسترول اکسیدازی باکتری ها صورت گرفت.سپس ارزیابی فعالیت آنزیم ها تحت شرایط دماها وph های مختلف بررسی گردید.شناسایی مقدماتی باکتری ها با استفاده آزمایشات بیوشیمیایی و میکروبیولوژی انجام و در آخرجهت تعیین گونه سویه ها و جداسازی ژن کلسترول اکسیداز،قسمتی از توالی ژنوم آنها بوسیله تکنیک pcr تکثیر و بعد توالی یابی شد.در این مطالعه 4 گونه استرپتومایسسa، استرپتومایسسb، رودوکوکوسc و سلیولوسی میکروبیومd با توانایی تولید آنزیم کلسترول اکسیداز از خاک جداسازی گردید که بیشترین فعالیت آنزیمی با مقدار u/ml 2/44در دمای c ° 45 و 7=ph مربوط به سویه استرپتومایسسa بود.همچنین ژن کلسترول اکسیداز باکتری رودوکوکوس c با استفاده از پرایمرهای اختصاصی جداسازی شد.

هدف از این پژوهش بررسی آلرژی¬زایی توالی¬های ورودی به برنج با روش¬های بیوانفورماتیک بود. لزوم استفاده از برنج تراریخته به دلیل محدودیت¬های افزایش سطح زیر¬¬کشت برنج، راه کلیدی پاسخ به تقاضای روز ¬افزون غذا در جهان است. از این¬رو ایمنی مصرف برنج تراریخته یکی از ضروریات مهم به ¬¬شمار می¬رود. یکی از مهم¬ترین موارد ایمنی، اطمینان از حساسیت¬زا نبودن (غیر آلرژن بودن) پروتئین¬های جدید در برنج تراریخته است. آنالیز بیوانفورماتیکی جهت ارزیابی حساسیت¬زایی پروتئین¬های جدید در برنج تراریخته برای از بین بردن نگرانی احتمالی در استفاده از این محصول استراتژیک است. برای رسیدن به هدف مذکور در این پژوهش با استفاده از پایگاه¬های اطلاعاتی بیوانفورماتیک، نظیر ncbi و uniprotتعداد 16 توالی ورودی به برنج شناسایی شد، سپس براساس مقررات سازمان¬های بین¬المللیfao/who در سه سطح محاسبه مشابهت توالی کامل، توالی 80 اسید¬آمینه¬ای و توالی 8 اسید¬آمینه¬ای انجام شد و با استفاده از پنج پایگاه داده آلرژن شاملallergen online ، sdap، adfs، allergome و proap این توالی¬ها به جهت مقایسه تشابه توالی¬ها با آلرژن¬های موجود مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. معیار انتخاب پایگاه¬ داده¬ها، به دلیل کامل بودن و به¬ روز بودن و قابلیت¬های تخصصی بیشتر آن¬ها بوده است. طی این پژوهش مشخص شد که پروتئین ap24 در تمام پایگاه¬های داده مشابهت¬های زیادی با آلرژن¬ها دارد و در بررسی اپی¬توپی این پروتئین با نرم¬افزار peptide cutter در برخی نقاط شکستگی حاصل نشد و در بررسی ساختاری با نرم¬افزارهای asa view و discovery studio مشخص شد به دلیل عمقی¬ بودن اسیدهای آمینه شکستگی صورت نگرفت و در سایر توالی¬های پروتئینی یا هیچ مشابهتی وجود نداشت و یا اگر هم وجود داشت توسط هضم آنزیمی به کمک peptide cutterشکسته شدند. نتایج نشان می¬دهد که توالی¬های ورودی به برنج را می¬توان در چهار گروه مختلف طبقه¬بندی کرد؛1) داده¬هایی که به طور حتم آلرژن هستند. 2) داده¬هایی که به طور حتم آلرژن نیستند. 3) داده¬هایی که در یک پایگاه آلرژن محسوب می¬شوند ولی در پایگاه دیگر آلرژن نیستند. 4) داده¬هایی که احتمال آلرژن بودن آن¬ها وجود دارد و نیاز به مطالعه دقیق¬تر و بررسی¬های ساختاری تکمیلی دارند. نتایج کلی نشان می¬دهد علیرغم نسبتا جامع بودن برخی از این پایگاه¬ها، برای حصول نتیجه بهتر در تحقیقات، استفاده از ارزیابی¬های متعدد و الگوریتم¬های متفاوت و تطبیق نتایج حاصل با یکدیگر ضروری است.

در حال حاضر تحلیل های خطر لرزه ای مرسوم با استفاده از رابطه توزیع احتمال نمایی بزرگا ی زمین لرزه که توسط ریشتر(1958) بیان شده، انجام می شود. این تابع، یک تابع نمایی می باشد که مقادیر آن با استفاده از مولفه های لرزه ای محاسبه می گردد. تابع توزیع احتمال فاصله نیز با فرض اینکه احتمال وقوع زلزله در همه جای یک چشمه لرزه ای وجود دارد و مقدار آن یکسان است در نظر گرفته می شود. این دو موضوع تحلیل خطر لرزه ای را به طور چشمگیری آسان می کند. در این پژوهش به معرفی یک تابع توزیع احتمال مشترک فاصله و بزرگا به جای دو تابع مجزای توزیع احتمال بزرگا و توزیع احتمال فاصله اقدام شده است. این تابع به منظور در نظر گرفتن اثر مشترک توزیع احتمال فاصله و بزرگا و همچنین بیان رفتار واقع بینانه تری از لرزه خیزی منطقه بر مبنای رخداد¬هایی که در گذشته اتفاق افتاده است، بیان شده است. به منظور بررسی عملکرد این تابع، به تحلیل خطر موردی منطقه تهران بزرگ اقدام شده است. در این تحلیل یک بار با استفاده از داده های ثبت شده و یک بار با استفاده از داده های شبیه سازی شده بر مبنای الگوریتم مونت کارلو که توسط هان و چوی(2008) بیان شده استفاده گردیده است. در ادامه به مقایسه نتایج حاصل از این روش با روش متداول پرداخته شده است. نتایج حاصل از تحلیل خطر متداول نسبت به تحلیل خطر با استفاده از تابع مشترک بزرگا و فاصله دارای نتایج محافظه کارانه تری می باشد. علت این موضوع را می توان در توزیع بزرگا و هم چنین توزیع فاصله برای چشمه های مختلف لرزه ای دانست. در توزیع بزرگا در چشمه های لرزه ای مختلف مشاهده می شود که در بعضی از این ناحیه ها توزیع بزرگا دارای خطر لرزه ای بیشتری نسبت به رابطه ی مرسوم می باشند و در بعضی از ناحیه های لرزه ای، مقدار کمتری است. بنابراین به طور کلی نمی توان گفت که رابطه ی ارائه شده در این پژوهش، همواره دارای نتایج با احتمال خطر لرزه ای کمتری نسبت به حالت متدوال می باشد و احتمال خطر لرزه ای بستگی به پیشینه رفتار لرزه ای ناحیه ی مورد مطالعه دارد.

استئوآرتریت شایع¬ترین اختلال مفصلی در انسان می¬باشد. بطوریکه در سن 75 سالگی 80 درصد از مردم به آن مبتلا هستند. این بیماری بیشتر در افراد مسن دیده می¬شود و با افزایش امید به زندگی در کشورهای در حال توسعه تا سال 2020،71¬ درصد جمعیت این جوامع را افراد بالای 65 سال تشکیل می¬دهند. پس استئوآرتریت تأثیرات منفی بر این جوامع خواهد داشت (لورنس ، 1998). مواد و روش: امروزه استئوآرتریت را تنها یک بیماری دژنراتیو نمی¬دانند بلکه آنرا ناشی از یک پدیده فعال بیومکانیکی، بیوشیمیایی¬ و سلولی تلقی می¬کنند. تولید سیتوکین¬های التهابی مانند نیتریت اکساید، پروستاگلندین ایی- تو، تی ان اف- آلفا و آی ال-¬ وان بتا توسط کندروسیت¬ها وماکروفاژهای سینوویال باعث تحریک شدن کندروسیت¬ها و تولید متالوپروتئینازها مانند کلاژناز و درد شده و موجب تخریب غضروف مفصلی می¬شوند (لورنس، 1998). در این¬ مطالعه¬¬ برای ارزیابی اثرات ضد التهابی گیاه سنجد برروی بیومارکرهایی که درجریان بیماری¬های استئوآرتریت مهم هستند از سلولهای مونوسیت/¬ماکروفاژ و سلولهای کندروسیت به عنوان مدلی شبیه به سلول¬های مبتلا به استئوآرتریت ایجاد شده در موش توسط کلاژن نوع ii (cia ii) استفاده گردید. یافته¬ها: بدین منظور ابتدا عصاره گیاه سنجد (.elaeagnus angustifolia l) از مرکز ذخایر ژنتیک ایران تهیه گردید. موش¬های سالم از مرکز انیستیتو پاستور ایران تهیه و نمونه برداری از بافتهای مورد نظر برای بررسی بیان ژن سایتوکینهای پیش التهابی انجام گردید. سپس سلولهای مورد مطالعه در شرایط مطلوب نگهداری و کشت داده شد. در بررسی محیط کشتها، با استفاده از دستگاه هموسایتومتر سلولها شمارش وتوانایی زنده¬مانی (viability) آنها با روش تریپان¬بلو ارزیابی شد. پس از تکثیر سلولی وتعیین ld50و lc50 ، lps به منظور تیمار تزریق گردید. سپس مراحل جداسازی rna و تولیدcdna توسط rt-pcr دو مرحله¬ای و در نهایتreal-time pcr به منظور بیان ژن¬های پیش التهابی سایتوکین¬ها، انجام شد. اهداف و نتیجه¬گیری: درمان استئوآرتریت عبارتند از کاهش درد و تورم مفصل مبتلا و جلوگیری از پیشرفت تخریب غضروف مفصلی است. امروزه علیرغم استفاده روزافزون از طب آلتر¬ناتیو که گیاهان داروئی یکی از گروههای اصلی آن را تشکیل می¬دهند، اثر بخشی بسیاری از این داروها هنوز ثابت نشده و نیازمند مطالعات علمی کنترل شده در تائید یا رد تائید آنها در درمان می¬باشد.

در این مطالعه برای ارزیابی اثرات ضد التهابی گیاه مریم گلی(salvia officinalis.l) بر روی بیومارکرهایی که در جریان بیماری های اوستئوآرتریت مهم هستند از سلول های مونوسیت/ماکروفاژ و سلول های کندروسیت به عنوان مدلی شبیه به سلول های مبتلا به اوستئوآرتریت استفاده گردید. بدین منظور این سلول ها برای افزایش سطح سایتوکین ها به وسیله لیپو پلی ساکارید (lps) تیمار شدند.

بیماری سلیاک که به آن آنتروپاتی گلوتن نیز گفته می شود در اثر آسیب مخاط روده ی کوچک در طی مصرف گلوتن ایجاد می شود. افراد مبتلا قادر به تحمل پروتئین گلوتن نیستند . گلوتن شامل دو خانواده گلوتنین و گلیادین ها است . گلیادین ها شامل سه نوع آلفا و گاما و امگا هستند .علم بیو تکنولوژی مدرن قادر است مشکلات ناشی از پروتئین های حساسیت زا را حل و به حداقل برساند. از روشهای موثر پیش رو در این خصوص فناوری rnai است که برای خاموش یا کاهش بیان ژن به کار می رود.هدف از این تحقیق انجام گامی ضروری در جهت کاهش پروتئین گلوتن کندم با استفاده از تصویر قطعات ژنی آلفا گلیادین و طراحی ساختارrnai برای کاهش بیان پروتوین گلوتن گندم می باشد.

در پژوهش حاضر، نقش عوامل رونویسی به عنوان تنظیم کننده های الگوی بیان در 45 مرحله مختلف نموی گیاه آرابیدوپسیس به روش فازی مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور با بکارگیری نرم افزار geneexpress1.0 (بر مبنای الگوریتم fcm)، بررسی بیان ژن ها و خوشه بندی در دوفاز انجام شد. در فاز اول ژن های 52 خانواده عوامل رونویسی از نظر میزان بیان (از لحاظ مقدار) بررسی، و به خوشه های مجزا تقسیم بندی شدند. سپس برای هر خوشه نمودار الگوی بیان بدست آمد. بطور خلاصه، الگوی بیان تمامی 1624 ژن عامل رونویسی در مراحل نموی در قالب 10 خوشه دسته بندی شدند. بعلاوه، به جهت شناسایی برهمکنش های موجود در ژن-های هر خوشه از پایگاه اطلاعاتی دانشگاه تورنتو استفاده شد. مطابق با نتایج، ژن های دارای بالاترین میزان برهمکنش به عنوان ژن های موثر در تدوین نقشه نمو آرابیدوپسیس ارائه شدند.از نتایج این پژوهش می توان جهت پیش بینی هایی در خصوص تغییرات ژنی حاصل از جهش یا بیماری و یا دستکاری های ژنتیکی بهره گرفت.

ازبین بردن افلاتوکسین در مغز پسته با استفاده از غلظت های مختلف h2o2 و حرارت های مختلف

مطالعه تجمع غیرطبیعی پروتئین ها در سالهای اخیر مورد توجه محققین در حوزه های مختلف علوم به ویژه پزشکی و بیوتکنولوژی قرار گرفته است . در حوزه پزشکی مطالعات عمدتا در رابطه با بیماری هایی است که ارتباط مستقیمی با اختلالات ساختاری پروتئین ها دارند. تاکنون بیش از 20 نوع بیماری در انسان شناسایی شده است که با تشکیل تجمعات پروتئینی معروف به آمیلوئید همراه است؛ وجه اشتراک این بیماریها تشکیل فیبریل های گسترده با ویژگی های منحصر به فردی است از جمله رنگ پذیری با رنگ های کنگورد و تیوفلاوین ها و تشکیل ساختارهای منظم از صفحات بتا. از بیماری های مهم آمیلوئیدوزیز می توان به بیماری های تحلیل برنده سیستم عصبی مرکزی مانند آلزایمر و پارکینسون و امیلوئیدوزیرهای سیستمیک مانند دیابت نوع 2 اشاره کرد بیوتکنولوژی توانسته از داده های بدست آمده در رشته های مختلف علوم بعنوان الگو بهره برداری نماید، از جمله اخیرا شاهد استفاده از خصوصیت تجمع منظم و خودبه خودی پروتئین ها در نانوتکنولوژی بوده ایم

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.