پرورش ماهی و میگو به طور مصنوعی به خصوص در کشورهایی که توانایی گسترش منابع دریایی خود را ندارند ویا اینکه برای آنها پرهزینه است، راه مناسبی برای تأمین بخشی از نیازهای غذایی و پروتئینی محسوب می شود. این پژوهش با هدف بررسی آثار رفاهی حذف یارانه انرژی در میان خانوارهای بهره بردار شیلاتی در استان فارس و بوشهر انجام شد. برای این منظور از داده های مقطعی بهره برداران شیلات استان فارس و بوشهر در سال 1389 استفاده و تابع هزینه، تابع تقاضای نهاده ها و تابع تولید این محصولات برآورد گردید. نتایج نشان داد که در سطح استان فارس و بوشهر حذف یارانه سوخت، منجر به کاهش تقاضای سوخت و کاهش تولید می گردد.که این کاهش تولید منجر به کاهش درآمد و درنتیجه کاهش سودآوری در دو استان به ترتیب به اندازه ی حدود 16/0 و 08/0 درصد می شود. همچنین یافته ها نشان داد غذا مهمترین نهاده در تولید است به گونه ای که انتظار می رود به ازاء 10 درصد افزایش در مقدار مصرف غذا، در دو استان به ترتیب تولید 8/4 و 3درصد افزایش یابد. از سوی دیگر مقدار قدرمطلق کشش تقاضای سوخت کوچکتر از یک بدست آمد که نشان دهنده ی کشش ناپذیر بودن تقاضای این نهاده است همچنین حساسیت تقاضا نسبت به تغییر قیمت در مورد نهاده ی غذا پایین بدست آمد. بر اساس نتایج به دست آمده پیشنهاد می شود با توجه به اهمیت غذا در تولید روی افزایش بهره وری این نهاده تمرکز بیشتری صورت گیرد.