نام پژوهشگر: زهرا سجادیان
زهرا سجادیان لیلا حسنی
پپتیدهای ضد باکتریایی رده ای از مولکول هایی هستند که با مورد هدف قرار دادن غشاهای سلولی، موجب مرگ میکروارگانیسم می شوند و برخلاف آنتی بیوتک های مرسوم به ندرت در باکتری ها مقاومت دارویی ایجاد می کنند. این دسته از ضد باکتری های نو ظهور، مدت زیادی است که توجه بسیاری از آزمایشگاه های تحقیقاتی را در سراسر جهان به خود جلب کرده است. در حال حاضر، بیش از پانصد پپتید ضد باکتری با منشأ طبیعی در پایگاه های اطلاعاتی به صورت مستند وجود دارد. برای سهولت از بهره مندی توانایی این پپتیدهای ضد میکروب به عنوان داروهای آنتی بیوتیکی، تحقیقات رو به جلویی با هدف ابهام زدایی از مکانیسم عملکردشان در حال انجام است. در این پروژه نیز با بهره گیری از تکنیک های دینامیک مولکولی و آزمایشگاهی توانسته ایم به افق های روشنی دست یابیم. به این منظور ما میانکنش دو پپتید ضد باکتریایی آیورین $1.2$ و آنالوگ انسانی اش یعنی llaa را با دو لایه ی لیپیدی dppc مورد مطالعه قرار گرفته است. با استفاده از روش های دینامیک مولکولی و روش های آزمایشگاهی از قبیل تعیین mic و همچنین آنالیز داده های بدست آمده از دورنگ نمایی دورانی این دو پپتید در بافر سدیم فسفات، در وزیکول هایی از جنس dppc و در tfe به مقایسه در فعالیت ضد باکتریایی این دو پپتید پرداخته شد. همانطور که انتظار می رفت پپتید آنالوگ نسبت به آیورین mic کمتر و در نتیجه فعالیت ضد باکتریایی قوی تر دارد. آنالیز داده های تئوری نیز بعد شبیه سازی ??? نانو ثانیه ای حکایت از قدرت بیشتر پپتید آنالوگ دارد چراکه این پپتید آشفتگی بیشتری در غشای dppc ایجاد کرده و تعداد بیشتری مولکول های آب وارد غشا شده است. در نهایت اینکه داده های تجربی و تئوری به صورت معناداری موید یکدیگر بوده اند.کلمات کلیدی: پپتیدهای ضد باکتری llaa و آیورین $1.2$، دیپالمیتول فسفاتیدیل کولین (lr{dppc})، تری فلورواتانول (tfe) و دینامیک مولکولی.
زهرا سجادیان محمدرضا صفاریان
در این پژوهش عملکرد نشت بند گازی خشک به وسیله دینامیک سیالات محاسباتی تحت ضخامت های مختلف مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا مدل هندسی مسئله مورد نظر که شامل یک رینگ گردان و یک رینگ ثابت می باشد، تهیه گردید. روی رینگ گردان شیارهایی به منظور فشرده سازی جریان قرار دارد بنابراین ناحیه محاسباتی عبارت است از فیلم گاز بین دو رینگ و فیلم گازی که درون شیارها قرار دارد. سپس ناحیه محاسباتی ایجاد شده به نرم افزار تولید شبکه انتقال یافته است. برای ایجاد شبکه از سلول های با سازمان شش وجهی استفاده شده است. حل جریان شامل دو نوع جریان آرام و آشفته می باشد که برای حالت آشفته از مدل آشفتگی k- ? rng استفاده شده است. نتایج حل به صورت توزیع فشار، نمودار نیروی بازکننده، نمودار میزان نشتی نشت بند و نمودار سفتی فیلم گاز می باشند. برای هرسه مدل هندسی با توجه به نتایج مشخص شد که نشت بند گازی خشک در محدوده جریان آرام کار می کند. در مدل هندسی رینگ گردان با شیار یک جهته تاثیر پارامترهای زاویه انتهای شیار، نرخ عرض شیار به عرض منطقه خشک در جهت محیطی و نرخ طولی منطقه خشک به طول شیار در جهت شعاعی هندسی بررسی گردید. همچنین برای شیار دو جهته دو مدل هندسی بررسی گردید.