نام پژوهشگر: مسعود شعبانزاده

مطالعه ارتباط کمی ساختار - فعالیت و نحوه اتصال در بازدارنده های آنزیم تیروزیناز
پایان نامه دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده علوم پایه 1390
  افسانه رضایی   داوود عاجلو

ارتباط کمی ساختار- فعالیت (qsar) و نحوه اتصال برخی از بازدارنده های جدید آنزیم تیروزیناز قارچ با استفاده از روشهای qsar وdocking مورد بررسی قرار گرفت. ساختار مولکولهای مورد نظر با روشهای +mm وam1 در فازهای گاز و محلول با استفاده از نرم افزار hyperchem رسم و بهینه سازی شد. حدود1500 توصیف کننده توسط نرم افزار dragon محاسبه و خروجی های آن وارد spss شد و ارتباط بین پارامتر زیستیlog ic50 و این توصیف کننده ها به کمک روش رگرسیون خطی چندگانه (mlr)، آنالیز مولفه اصلی (pca) و رگرسیون مولفه اصلی (pcr) به دست آمد. نتایج نشان داد ارتباط خوبی بین مقادیر تجربی log ic50 و مقادیر پیش بینی شده وجود دارد. همچنین نتایج نشان داد که با کاهش بار، مساحت سطح قطبی و درجه تا شدگی و افزایش انرژی آبپوشی، log ic50 افزایش می یابد. از سوی دیگر، نتایج محاسبات در فاز گاز و محلول نشان داد که ضریب همبستگی فاز محلول بیشتر است. هم چنین دسته بندی ترکیبات با استفاده از pca انجام شد و 6 دسته مختلف به دست آمد. ساختار سوم آنزیم تیروزیناز توسط روش هومولوژی مدلینگ با استفاده از نرم افزار modeller و دینامیک مولکولی gromacs به دست آمد. سپس انرژی اتصال و جایگاه اتصال لیگاند ها به آنزیم توسط نرم افزار auto dock انجام شد. اتصال در کل آنزیم و جایگاه فعال صورت پذیرفت. در کل ارتباط مستقیمی بین log ic50 و انرژی اتصال به دست آمد، که نتایج اتصال به جایگاه فعال بهتر از کل پروتئین بود. فعالیت ترکیبات دارای log ic50 کمتر، انرژی اتصال منفی تر و پیوند هیدروژنی بیشتر بودند. هم چنین در ترکیبات با فعالیت بیشتر، قسمت های آبگریز ترکیب با قسمت های آبگریز و قسمت های آبدوست ترکیب با قسمت های آبدوست پروتئین بر هم کنش داشتند. در حالیکه این مشاهدات برای ترکیبات کم فعال کمتر مشاهده شد.

سنتز و شناسایی مشتقات جدید 2- پیرازولین و بررسی خاصیت ضدمیکروبی آنها
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا 1379
  مسعود شعبانزاده   داوود آذریفر

هدف این پایان نامه تهیه و شناسائی مشتقات جدید 2- پیرازولین است که هتروسیکلهای پنج عضوی غیر آروماتیک با دو اتم نیتروژن همجوار هستند. این ترکیبات می توانند خاصیت میکروب کشی داشته باشند. اولین مرحله در فرآیند تهیه مشتقات پیرازولینی، تهیه چالکونها بااستفاده از تراکم آلدئید و کتون می باشد. سپس توسط هیدرازین و بعضی مشتقات آن واکنش حلقه زایی را در محیط اسیدی بر روی چالکون انجام می دهیم که نهایتا منجر به تشکیل حلقه 2 - پیرازولین می شود. مجموعه واکنشهای شرکت کننده را می توان به صورت زیر نشان داد:طیفهای ‏‎nmr, ir‎‏ و جرمی و آنالیز عنصری به شناسایی این ترکیبات کمک نموده اند. در نهایت خاصیت ضدمیکروبی ترکیبات تهیه شده مورد بررسی قرار می گیرد و بدین منظور تاثیر بیولوژیکی مواد تهیه شده را بر روی دو باکتری معرف، اشریشیا کولی و استافیلوکوک آئرئوس مورد بررسی و مشاهده قرار می دهیم.