یکی از مسائل اجتناب ناپذیر دولتها از جمله دولتهای دینی، شیوه برخورد دولتها با مخالفان سیاسی می باشد. سوال اصلی پژوهش در پی بررسی شیوه برخورد امام علی (ع) و امام خمینی(ره) با مخالفان سیاسی است. اهمیت موضوع از این جهت است که هر نظام سیاسی و گروهی سعی می کند، دیدگاهها و اعمال خود را با گزینش بعضی از قسمتهای زندگی سیاسی امام علی و امام خمینی توجیه کند.