پایان نامه حاضر در پنج فصل تنظیم شده است که هر فصل خود شامل چند اصل، و هر اصل شامل چند ماده و بند است . سعی شده است تا جایی که امکان داشته باشد این اصلها و ماده ها براساس ابواب فقهی تنظیم گردد. و هر جا که امکان آن وجود نداشت ، براساسس منشور سازمان ملل متحد در مورد حقوق بشر تنظیم شده است . رووس مطالبی را که در پایان نامه ملاحظه خواهید نمود عبارتند از: -1 دیدگاه اسلام نسبت به جامعه جهانی، عقد ذمه و مسائل مربوط به آن، که در فصل اول گنجانیده شده است . ضرورت آوردن این مسائل در ابتدای پایان نامه بدلیل جایگاه والای حقوق اقلیتها در قوانین اسلامی می باشد. و علت دیگر آن است که اهل کتاب دیگر آن است که اهل کتاب تنها با انعقاد قرار داد ذمه به تابعیت جامعه اسلامی در آمده و از حقوق و آزادیهای هم سطح با حقوق و آزادیهای دیگر اعضای جامعه اسلامی (مسلمانان) برخوردار خواهند شد. -2 حقوق و آزادیهای اساسی و فردی اقلیتهای دینی (که بر دیگر حقوق و آزادیها مقدم می باشد) در فصل دوم مورد بحث قرار گرفته است . -3 حقوق و آزادیهای سیاسی اقلیتهای مذهبی ساکن دارالاسلام، که در فصل سوم گنجانیده شده است . -4 حقوق و آزادیهای قضایی اقلیتهای دینی مقیم درالاسلام و برخی از احکام قضایی مربوط به آنها، که در فصل چهارم قرار داده شده است . -5 حقوق اقتصادی و تجاری اقلیتهای دینی و آزادی آنها در انعقاد عقدها و بستن قراردادها، موضوعاتی هستند که در فصل پنجم مورد بحث قرار گرفته است . البته در قبال حقوق و آزادیهایی که اسلام به اقلیتهای دینی داده، یک سلسله حقوق و تکالیفی را نیز بر عهده آنان گذارده است که جزیه و خراج از اهم آنها می باشد. جون راجع به این حقوق، کتابها و پایان نامه هایی تحت عنوان "جزیه و خراج" تهیه و تالیف شده است ضرورتی در بحث پیرامون آن ندیدم.