در این تحقیق سعی بر این بوده که با مد نظر قراردادن اهمیت عوامل نسبت به یکدیگر، از یک شاخص بهره وری چند عاملی موزون جهت اندازه گیری بهره وری راه آهن ج.ا.ا استفاده شود. در این راستا پس از شناسائی نهاده های کلیدی این سازمان، اهمیت نهاده ها با استفاده از فرآیند تحلیل سلسله مراتبی و با توجه به معیارهای یک نهاده مناسب، وزن داده شده اند. سپس یک شاخص چند عاملی موزون جهت اندازه گیری بهره وری سازمان تعریف شده است. از آنجا که واحد سنجش نهاده ها متفاوت می باشد، در اندازه گیری بهره وری از روش نورم جهت بی مقیاس سازی نهاده ها استفاده شده است. از شاخص تعریف شده جهت اندازه گیری بهره وری سازمان در دوره پنج ساله 86-82 استفاده شده است. نهاده های این شاخص عبارتند از: طول خطوط، واگن باری، سالن مسافری، لکوموتیو، پرسنل و سوخت. ستانده های شاخص نیز عبارتند از: تن – کیلومتر و مسافر – کیلومتر. با توجه به تقسیم راه آهن کشور به 14 ناحیه عملیاتی، شاخص دیگری جهت اندازه گیری و مقایسه بهره وری نواحی تعریف شد. در این شاخص تناژ بار بارگیری شده، بعنوان یک ستانده دیگر نواحی، مطرح می باشد.