باکتری¬ها و قارچ¬هایی که به صورت همزیست درون بافت¬های گیاهی زندگی می¬کنند، به عنوان اندوفیت شناخته می¬شوند. این میکروارگانیسم ها متابولیت¬های ثانویه تولید می¬نمایند که بالقوه می¬توانند در صنایع داروسازی و مواد غذایی کاربردهایی داشته باشند. در این مطالعه بررسی حضور اندوفیت ها در 3 گونه گیاه دارویی بررسی و خواص ضد باکتریایی این اندوفیت ها علیه برخی جدایه های باکتریایی پاتوژن در حیوانات مطالعه شده است. گیاهان مورد بررسی شامل خرفه (portulaca olevacea)، کاسنی ((pelargonium hortorum و شمعدانی (cichorium intybus l) بود. نمونه ها از برگ و ساقه سه گیاه دارویی فوق انتخاب شدند. برای جدا سازی باکتری های اندوفیت، قطعات مربوط به ساقه و برگ ضد عفونی شده ی هر گیاه روی محیط های pepton agar وyeast extract agart کشت داده شد. بعد از رشد، جهت بررسی ترکیبات ساختاری باکتری، کلنی باکتری اندوفیت با کلروفرم غیر فعال گردید. در روش بررسی متابولیت ها، مایع رویی محیط کشت مایع باکتری بعد از سانتریفیوژ، درون سیلندر ها ریخته شد. از سه گیاه دارویی 24 اندوفیت جدا شد. در بررسی ترکیبات ساختاری از 24 اندوفیت جدا شده، اندوفیت های باکتریایی برگ گیاه کاسنی و ساقه خرفه بیشترین تأثیر را علیه باکتری-های نشانگر داشتند در حالیکه در روش متابولیتی اندوفیت های باکتریایی برگ کاسنی و ساقه شمعدانی بیشترین تأثیر را علیه باکتری¬های نشانگر داشتند. در نتیجه گیری نهایی، باکتری های اندوفیتی که در شمعدانی، خرفه و کاسنی حضور داشتند، به نظر می¬رسد منبع امیدوار کننده برای تولید مواد فعال زیستی حداقل در برابر برخی از سویه های جدا شده از باکتری های بیماری¬زای دامی ¬باشند.