نام پژوهشگر: علی دلجو

بررسی تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی باکتری های گرمادوست جدا شده از چشمه های آب گرم بر اساس توالی ژنی 16srrnaو امکان سنجی تولید آنزیم سلولاز در آنها
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  زهرا رحم جو   علی دلجو

تنش های شیمیایی و فیزیکی موجود در چشمه های آب گرم موجب جداسازی جامعه باکتری های وابسته به آن شده است. هدف از انجام این تحقیق جداسازی، شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی جدایه های باکتری های گرمادوست از یکی از چشمه های آب گرم ایران و همچنین بررسی بعضی از خصوصیات فنوتیپی و توانایی تولید آنزیم های آمیلاز و سلولاز در آن ها بود.بدین منظور 3 جدایه باکتری از چشمه آب گرم قینرجه واقع در استان آذربایجان شرقی بدست آمده و dna آن ها جداسازی شد و برای تکثیر ژن 16srrna از آغازگرهای جهانی (r149 و f27) استفاده شد. محصولات تکثیر شده توالی یابی شدند و در پایگاه های اطلاعاتی ncbi با استفاده از نرم افزار blast مورد جستجو قرار گرفتند و نزدیکترین توالی هایی که بیشترین شباهت را داشتند نمایش داده شدند. درخت فیلوژنی به روش نیبرجوینینگ و با استفاده از نرم افزار وگاوسایت bibi ترسیم شد. جدایه های باکتری از نظر تولید آنزیم های آمیلاز و سلولاز بررسی شدند وph و دمای مناسب برای فعالیت آنزیم های تولید شده تعیین شد. نتایج حاصل شباهت 99% دو سویه گونه bacillus licheniformis و با جنس anoxybacillus را نشان داد. هر دو آنزیم تولیدی برون سلولی بودند. دو جدایه az2 و q تولید آلفا آمیلاز زیادی داشتند. بهینه فعالیت دمایی آن ها در دما و phبه ترتیب در محدوده 70-60 درجه سانتی گراد و بهینه برابر7 مشخص گردید. جدایه az1 نیز تولید سلولاز خوبی داشت و بهینه فعالیت دمایی آن 65 درجه سانتی گراد و ph برای آن معادل 5/7 بود

اثر نیتروژن و جاسمونیک اسید بر تولید ریزغد? گیاهچه های سیب زمینی ‏حاصل ازکشت بافت
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  بهمن تقدیری   علی دلجو

به منظور ارزیابی اثر مقادیر مختلف نیتروژن به صورت اضافه نمودن به محیط کشت و اسید ‏جاسمونیک به صورت محلول پاشی روی برگ بر تولید ریزغده در شرایط هیدروپونیک با استفاده ‏از گیاهچه های سیب زمینی(رقم مارفونا) حاصل از کشت بافت، آزمایشی بصورت فاکتوریل در ‏قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در گلخانه گروه زراعت دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی ‏سینا در سال1388 اجرا گردید. تیمار های آزمایش شامل نیتروژن در سه سطح صفر(شاهد)، 50 و ‏‏100 میلی گرم در لیتر حجم بستر از منبع نیترات آمونیم و اسید جاسمونیک در چهار سطح ‏صفر(اسپری آب مقطر به عنوان شاهد)، 1، 5 و 10 میکرومولار بودند. تعداد و وزن کل ریزغده ها؛ ‏متوسط وزن ریز غده؛ اندازه ریزغده؛ ارتفاع بوته وتعداد برگ؛ وزن ماده خشک ساقه، برگ، غده، ‏ریشه، اندام هوایی وکل؛ نسبت وزن ریشه به اندام هوایی و سطح برگ در بوته و شاخص برداشت ‏مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج نشان داد که بیشترین تعداد کل ریزغده، وزن کل ریزغده، وزن ماده ‏خشک غده، متوسط وزن ریزغده، ، نسبت وزن ریشه به اندام هوایی و شاخص برداشت از مصرف ‏‏50 میلی گرم نیتروژن به علاو? 5 میکرومولار اسید جاسمونیک بدست آمد. هم چنین بیشینه وزن ‏ماده خشک برگ، اندام هوایی، کل، و سطح برگ در بوته در تیمار 100 میلی گرم در لیتر نیتروژن و ‏‏1 میکرومولار اسید جاسمونیک حاصل گردید. بالاترین ارتفاع ساقه و تعداد برگ به ترتیب متعلق ‏یه تیمارهای 50 میلی گرم در لیتر حجم بستر نیتروژن بدون جاسمونیک اسید و 100 میلی گرم ‏نیتروژن به علاو? 1 میکرومولار اسید جاسمونیک بودند. کمترین تعداد و وزن کل ریزغده، تعداد ‏برگ، وزن ماده خشک ریشه و کل بوته از محلول پاشی 1 میکرومولار اسید جاسمونیک بدون ‏مصرف نیتروژن بدست آمد. ‏

تنوع ژنتیکی باکتریهای گره زای ریشه یونجه در استان خراسان بر اساس توالی ژن .16s rrna
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  حمید رفیع پور   علی دلجو

چکیده: یونجه یکی از گیاهان لگوم است که میزان زیادی علوفه تولید می کند. اغلب گونه های یونجه توانایی قابل توجهی در تثبیت نیتروژن دارند و کیفیت مراتع را در علفزارهای طبیعی و کشت شده بهبود می بخشد. باکتریهای خوانواده ریزوبیاسه قادر به تثبیت اتمسفر در ریشه گیاهان لگومینوزی همچون یونجه هستند. اهداف این تحقیق تعیین تنوع ژنتیکی میان استرین های باکتری گره زای یونجه در نمونه های جدا شده از خاک استان خراسان، شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی و همچنین شناسایی فنوتیپی این باکتری ها بودند. شانزده استرین باکتری از گره ریشه یونجه ایزوله شدند. dnaی آنها استخراج شد و با پرایمرهای یونیورسال برای تکثیر ژن s rrna16 بکار رفتند. مقداری از محصول pcr برای هضم بوسیله چهار آنزیم cfo، haeiii،mspi و hinfi محدود کننده بکار رفت. از قطعه هات بدست آمده از پرایمرهای rd1 و fd1 متعلق به چهار استرین برای توالی یابی ژن srrna16 و بررسی های بیشتر انتخاب گردیدند. برای رسم دندوگرام، قطعات حاصل از pcr-rflp امتیازبندی شده و برای محاسبه تنوع با نرم افزار ntsys-pc بکار رفتند. محصولات pcr با نرم افزار بلاست از پایگاه ncbi و bibi مقایسه شدند. درخت فیلوژنی با روش نیبرجوینینگ با نرم افزار مگا ترسیم شد. نتایج حاصل تنوع بالای ژنتیکی و فنوتیپی در میان باکتریها را آشکار کرد. دندوگرام حاصل pcr-rflp وجود چهار گروه متفاوت را میان باکتریهای بومی نشان داد. بر اساس آنالیز توالی یابی، استرین ها همولوژی بالایی با بعضی از استرین های گونهsinorhizobium meliloti داشتند. این تحقیق اطلاعات شناسایی باکتری های گره زای یونجه را در استان خراسان فراهم می کند. نتایج حاضر تنوع ژنتیکی غنی ریزوبیوم ها را پیشنهاد می کند که می تواند در سطوح اقتصادی و اکوسیستمی با ارزش باشد کلمات کلیدی: ریزوبیوم، یونجه، تنوع ژنتیکی، ژن s rrna16

بررسی بیان ژن در شرایط تنش سرما در گیاه بنفشه
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  سمیه فلاحتیان   علی دلجو

گیاه بنفشه گیاهی زینتی و متعلق به خانواده ویولاسه (violacea) است که دارای گونه های متعددی می باشد. یکی از مهمترین گونه های بنفشه، یک گونه دورگ با نام v.wittrockiana بوده که به دلیل تحمل بالا به سرما، در سراسر جهان از محبوبیت زیادی برخودار است. به منظور مطالعه الگوی بیان ژن در شرایط دماهای پایین از برگ های این گیاه در دمای 25 درجه سانتیگراد به عنوان نمونه شاهد و دماهای 5 ، صفر، 5- و 10- درجه سانتیگراد نمونه برداری شد. با کمک روش نماش افتراقی (differential display or rap- pcr) به بررسی تفاوت بیان ژن ها پرداخته شد. روش نمایش افتراقی روشی قدرتمند در جهت بررسی بیان ژن است که در سال 1992 ابداع شد. استخراج rna از برگ های بنفشه برای هر پنج تیمار دمایی انجام شد. با کمک آنزیم رونویسی معکوس و با استفاده از سه آغازگر اولیگو (اولیگوdta، اولیگو dtc و اولیگو dtg)، ساخت رشته اول cdna انجام شد. در مرحله بعد از هشت آغازگر انتخابی با طول 13 نوکلئوتید استفاده گردید. آغازگرهای مورد استفاده شامل، hap25 ، hap26 ، hap27 ، hap28 ، hap29 ، hap30 ، hap31 و hap32 بودند که به همراه آغازگرهای اولیگوی مورد استفاده در مرحله ساخت رشته اول cdna ، در واکنش pcr با استفاده از دستگاه ترموسایکلر اپندرف در ساخت رشته دوم cdna به کار رفتند. جداسازی باندها روی ژل پلی اکریل آمید غیر واسرشت ساز 19 درصد در دستگاه الکتروفورز عمودی انجام شد. رنگ آمیزی ژل پلی اکریل آمید با استفاده از محلول نیترات نقره انجام گرفت و با کمک اسکنر از روی ژل تصویر برداری شد. نتایج نشان داد که از میان سه آغازگر اولیگو، آغازگر اولیگو dtc بیشترین تعداد باند را تولید کرد. از میان آغازگرهای انتخابی نیز آغازگر انتخابی hap30 برای مجموع سه آغازگر اولیگو، بیشترین تعداد باند را ایجاد کرد. روندی که برای تعداد باند ایجاد شده روی ژل پلی اکریل آمید مشاهده شد بدین صورت بود که تعداد باندهای تیمار دمایی 5 درجه سانتیگراد نسبت به دمای شاهد(25 درجه) بیشتر بود اما تعداد باندها در دمای صفر درجه کاهش یافته و در دمای 5- درجه به حداکثر تعداد خود رسید. در دمای 10- درجه مجدداً تعداد باند نسبت به دمای 5- درجه کاهش یافت. به نظر می رسد بهترین دما از میان دماهای به کار رفته در این تحقیق به عنوان تیمار دمای پایین، از نظر تعداد باند ایجاد شده و برای بررسی تفاوت بیان ژن، دمای 5- درجه سانتیگراد باشد. در کل برای تیمارهای دمایی اختلاف باندها کاملا مشهود بود.

"تنوع ژنتیکی باکتری های گره زای ریشه شبدر در استان کردستان "
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  آزاده صلواتی   علی دلجو

چکیده: از بین انواع باکتری هائی که در خاک یافت می شو ند باکتریهای همزیست با ریشه دولپه ای ها بیشتر مورد توجه قراردارند. مطالعه تنوع ژنتیکی باکتری های ریزوبیومی و ارزیابی کارایی همزیستی آن ها در جمعیت های بومی خاک و همچنین نقش مدیریت های متفاوت بر تنوع این باکتری ها از اهمیت زیادی برخوردار است. تعیین تنوع ژنتیکی میان جدایه های باکتری های گره زای ریشه شبدر قرمز در مناطقی از خاک استان کردستان، شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی و همچنین شناسایی فنوتیپی این باکتری هااز اهداف این تحقیق است. برای انجام این تحقیق 21 نمونه باکتری از گره شبدر قرمز جدا شدند.dna آن ها استخراج شد و تنوع آن ها با استفاده از روش های ملکولی rflp ژن srdna16 ، توالی یابی ژن srdna16 ، rflp نواحی جدا کننده بین ژنی igs و rapd غنی از c-g مطالعه شد.جهت rflp مقداری از محصول pcr برای هضم بوسیله سه آنزیم haeiii،hpaii و hinfi بکار رفت. برای رسم دندروگرام، قطعات حاصل از pcr/rflp امتیاز بندی شده و برای محاسبه تنوع آن از نرم افزار ntysis استفاده شد.محصولات pcr با نرم افزارblast از پایگاه ncbi مقایسه شدند.درخت فیلوژنی با روش نیبرجوینینگ با نرم افزار مگا4 ترسیم شد. بر اساس آنالیز توالی یابی، استرین ها همولوژی بالایی با بعضی از استرین های گونه sinorhizobium meliloti و rhizobium leguminosarum داشتند. جدایه ها بر اساس الگوی rflp ژن rdna16 در چهار گروه توزیع شدند. آنالیز- rflp igs باعث تقسیم جدایه ها به پنج گروه وrapd ایزوله ها را به شش گروه متفاوت تقسیم کرد. این تحقیق اطلاعات شناسایی باکتری های گره زای شبدر را در استان کردستان فراهم می کند. نتایج حاضر تنوع ژنتیکی غنی ریزوبیوم ها را پیشنهاد می کند می تواند در سطوح اقتصادی و اکوسیستمی با ارزش باشد.

شناسایی نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژنهای مقاومت به فوزرایوم سنبله در گندم
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  کورش حاتم سروری   محسن مردی

بلایت فوزاریومی سنبله (fhb, fusarium head blight) درگندم که عموماً تحت عنوان اسکب نامیده می شود، یکی از بیماری های قارچی گندم و دیگر غلات دانه ریز در مناطق گرم و مرطوب است. fhb باعث کاهش شدید عملکرد و کیفیت دانه می شود. مقاومت به fhb یک صفت کمّی است که به وسیله ژن های زیادی کنترل می شود. به منظور شناسایی نشانگر های مولکولی پیوسته با ژن های کنترل کننده مقاومت به بلایت فوزاریومی سنبله در گندم، جمعیت هایf3 و f5 حاصل از تلاقی دو والد فلات (حساس) و sumai#3 (مقاوم) طی دو سال مورد ارزیابی فنوتیپی قرار گرفتند. تجزیه مولکولی به-وسیله 170 نشانگر ریزماهواره(ssr)، نشان داد والدین و جمعیت های در حال تفکیک دارای اختلاف های معنی دار در مقاومت به fhb بودند و بهترین تفکیک برای مقاومت در 22 تا 26 روز پس از آلودگی اولیه مشاهده شد. نتایج تجزیه مولکولی نشان دادند که یک فاصله ژنومی بر روی بازوی کوتاه کروموزوم 3b بیشترین سهم را در توجیه تنوع audpc دارد که حدود 6/8 درصد از تغییرات audpc را با اثر منفی توجیه نمود و یک فاصله ژنومی دیگر بر روی بازوی کوتاه کروموزوم 5b با حدود 4/7 درصد از تغییرات audpc را با اثر منفی توجیه نمود.

خالص سازی آنزیم آلفا- آمیلاز از bacillus sp. جداشده از چشمه آبگرم استان اردیبل
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1390
  صمد گودرزی   علی دلجو

آلفا-آمیلاز آنزیمی است که پیوند های آلفا تشکیل دهنده پلی ساکارید هایی همچون نشاسته و گلیکوژن را شکسته و به گلوکز و مالتوز تبدیل می کند. آلفا-آمیلاز های ترموفیل برای استفاده در صنعت بسیار مهم می باشد. آمیلازهای تجاری بیشتر از باسیلوس یا آسپرژیلوس بدست می آید. علی رغم مشابهت توالی پروتئینی آلفا - آمیلاز در باکتری مزوفیلbacillus lichenifromis باb.stearothermophilus و bacillus amyliquuefaciens آنزیم آمیلازی این سویه مقاومت دمایی بیشتری را نشان می دهد به همین دلیل از آلفا-آمیلاز b.licheniformis به طور گسترده ای در فرایند مایع سازی نشاسته استفاده می شود. در این مطالعه آنزیم آلفا-آمیلاز مقاوم به حرارت از باکتری bacillus sp. جدا شده از آبگرم استان اردبیل خالص سازی و خصوصیات آن شرح داده شد. در نخستین گام مشخص شد که شرایط رشد و تولید آنزیم این باکتری دمای 40 درجه سانتی گراد و ph 9 به صورت بهینه است. سپس آنزیم سویه مورد نظر به وسیله کروماتوگرافی تعویض یونی و فیلتراسیون ژلی جدا و خالص سازی شد. مطالعه sds-page وجود تک باند 56 کیلو دالتونی را نشان داد. مطالعات آنزیم شناسی نشان داد که بهینه دمای فعالیت آنزیم 80 درجه سانتی گراد و ph بهینه آن 7 بود. همچنین حضور عناصر mg2+، ca2+ و+ k باعث تحریک فعالیت آنزیم وmn2+ ، zn2+ ، cu2+ ،3+ al ، fe 2+ ،+ li ، ni + ، co+، sds، edtaباعث کاهش فعالیت آنزیم شد، در حالی که بتا- مرکاپتواتانول و pmfs تاثیری بر روی فعالیت آنزیم نداشتند. مقدار vmax و kmبرای نشاسته به ترتیب 35/7 و 48/3 محاسبه گردید. با توجه به خصوصیات به دست آمده این آنزیم می تواند در صنایع غذایی کاربرد داشته باشد.

بررسی اثرات آنتی اکسیدانی، آنتی باکتریایی و سمیت عصاره پوست درخت بید(salix alba .l) همدان در دو مدل سلول گیاهی ، جانوری
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  جعفر منتشلو   علی دلجو

ابزارهای بیوتکنولوژی و تکنیک های آن راهگشای تحقیقات جدید برای درک چگونگی عملکرد بدن های سالم می باشد. شناخت پایه ملکولی سلامت و بیماری منجربه کشف روش های جدید برای درمان و جلوگیری از بیماری می شود. استفاده از گیاهان دارویی از زمان های قدیم تا به امروز توسط عموم مردم بطور گسترده رایج بوده است؛ بنابراین مطالعه اثرات سیتوتوکسیک، ژنوتوکسیک(ناهنجاری های کروموزومی) و ضد میکروبی آنها امری ضروری می باشد. درخت بید یکی از درختانی است که بطور معمول بعنوان گیاه دارویی مصرف می-شود. پوست درخت بید در تمام قرون در چین، اروپا استفاده می شده است و امروزه برای برای درمان درد(بخصوص پشت درد خفیف و ورم زانو)، سردرد، آماس کیسه های مفصلی و غیره استفاده می شود. پوست درخت بید شامل سالیسین می باشد که ماده شیمیایی مشابه آسپرین است. در این تحقیق جهت ارزیابی میزان سمیت غلظت های مختلف عصاره دم کرده پوست تنه و شاخه بید همدان از مدل گیاهی پیاز استفاده گردید. نتایج تست سمیت نشان داد، عصاره دم کرده این دو اندام در غلظت های بیشتر مورد استفاده در طب سنتی، بر روی سلول های ریشه پیاز اثرات سمی داشته و باعث بروز برخی ناهنجاری های کروموزومی می-شود. در بررسی سمیت حاد، یکبار عصاره بید به موش ها در دُزهای از 2 تا 20 گرم در کیلوگرم داده شد. رفتار عمومی، اثرات مضر و مرگ و میر برای 14 روز بعد از تیمار تعیین شد و هیچکدام از دُزها مرگ و میر یا تغییرات رفتاری معنی داری را باعث نشدند. در بررسی سمیت تحت مزمن عصاره پوست بید بطور دهانی بصورت تک تجویز به رت های ویستار در دُزهای 200، 400، 800 و 1600 میلی گرم در کیلوگرم روزانه برای 28 روز داده شدند و تجویز روزانه عصاره در دُزهای 800 و mg/kg 1600 کاهش معنی داری در تعداد گلبول های قرمز، هموگلوبین، هماتوکریت موجب شد. ast، alp، alt و tb سرم افزایش پیدا کردند در حالیکه پروتئین کل و تری گلیسرید کاهش معنی داری داشتند. همچنین تغیرات معنی داری در وزن حیوانات مشاهده نشد. در ارزیابی خواص ضد-میکروبی، اثرات ضد باکتریایی غلظت های مختلف از سه نوع عصاره متانولی، هیدروالکلی و آبی دو اندام پوست تنه وشاخه بر روی 8 نوع باکتری بیماری زا بررسی گردید. بررسی ها نشان داد که غلظت های بالا( 200 و400 میلی گرم در میلی-لیتر)از عصاره های هیدروالکلی و متانولی این دو اندام دارای اثرات ضد باکتریایی بر روی باکتری های اشرشیا کولی، استافیلوکوکوس اورئوس، باسیلیوس سوبتلیس، باسیلیوس سرئوس، میکروکوکوس لوتوس و استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس می باشند اما بر روی باکتری های کلبسیا پنومونیه و سالمونلا تیفی اثر ضد باکتریایی خاصی در مورد هیچ کدام از انواع عصاره ها در اندام-ها مشاهده نشد. در ارزیابی خواص آنتی اکسیدانی از چهار نوع عصاره اتانولی، اتیل استاتی، متانولی و کلروفرمی پوست تنه و شاخه بید استفاده شد که بین عصاره ها و اندام ها تفاوت معنی داری وجود داشت. در تست dpph نیز ic50 ارزیابی شده برای چهار عصاره اتانولی، اتیل استاتی، متانولی و کلروفرمی پوست تنه و شاخه به ترتیب 130/0، 138/0، 139/0،147/0 و 129/.، 134/0، 137/0، 141/0 میلی گرم در میلی لیتر بود.

تولید سوخت زیستی بیواتانول از ضایعات نشاسته ای سیب زمینی با استفاده از آنزیم آلفاآمیلاز حاصل از سویه بومی bacillus licheniformis جداسازی شده از چشمه آبگرم قینرجه (استان اردبیل)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  ایمان آرضی   علی دلجو

چکیده: اتانول یک ماده شیمیایی بسیار مهم است که کاربرد های وسیعی در زمینه تولید مواد شیمیایی، سوخت (بیواتانول)، نوشیدنی های الکلی، پزشکی، داروئی، آرایشی و بهداشتی دارد و امروزه در مقیاس انبوه طی فرآیند تخمیر از مواد خام اولیه مانند ضایعات قندی، ترکیبات نشاسته دار و ترکیبات لیگنوسلولزی در صنعت تولید می شود. معروفترین میکروارگانیسمی که تاکنون برای تولید اتانول به کار رفته مخمر saccharomyces cerevisiae می باشد. این مخمر می تواند از سوبسترا های متنوعی استفاده کند. در ایران سیب زمینی یکی از محصولات مهم کشاورزی است که تولید سالانه آن بیش از 5 میلیون تن تولید می باشد. میزان ضایعات آن در کشور حدود 30 درصد برآورد گردیده که حدود 3/1 از این ضایعات حاوی نشاسته است. آمیلاز ها (?- آمیلاز، ?- آمیلاز و گلوکوآمیلاز) از مهمترین نوع آنزیم ها در زمینه بیوتکنولوژی محسوب می شوند که کاربرد گسترده و متنوعی در صنایع نساجی، کاغذ سازی، نانوایی، تولید اتانول و صنایع غذایی دارند. در این مطالعه سویه bacillus licheniformis-az2 جدا شده از چشمه آبگرم قینرجه (دامنه شمالی کوه سبلان، استان اردبیل با مختصات طول جغرافیایی ?46, ?39 شرقی و عرض جغرافیایی ?36, ?53 شمالی) به منظور تولید آلفا آمیلاز مورد استفاده قرار گرفت. پس از اثبات تولید این آنزیم توسط باکتری یاد شده تأثیر عواملی چون دما و ph، منابع مختلف کربنی، نیتروژنی آلی و معدنی، اسید های آمینه، ویتامین ها، سورفکتانت ها، غلظت های مختلف مواد معدنی و حجم مایه تلقیح بر رشد و قابلیت تولید آنزیم توسط این باکتری مورد بررسی قرار گرفت. اثر میزان هوادهی و سرعت همزدن در شرایط فرمانتور نیز بر رشد باکتری و میزان تولید آلفا آمیلاز آن مورد آزمون قرار گرفت. هم چنین تأثیر شرایط مختلف واکنش سنجش آنزیمی از جمله دما، ph، یون های فلزی مختلف و بازدارنده ها، نسبت آنزیم به سوبسترا و غلظت سوبسترا بر فعالیت آنزیم و راندمان هیدرولیز نشاسته مورد ارزیابی قرار گرفت. با تولید آنزیم گلوکوآمیلاز توسط سویه aspergillus niger var. tubingensis (ptcc 5162)، فرآیند مایع سازی و شیرین سازی نشاسته با استفاده از آلفا آمیلاز و گلوکوآمیلاز بر روی نشاسته بدست آمده از ضایعات سیب زمینی انجام گردید. در نهایت محلول قندی بدست آمده با استفاده از مخمر saccharomyces cerevisiae (y3-4) تخمیر و میزان تولید اتانول در آن با استفاده از روش تغییر یافته تقطیر رنگ سنجی با استفاده از مخلوط اسید سولفوکرومیک تعیین شد. نتایج بررسی ها نشان داد این سویه قادر به تولید آنزیم آلفا آمیلاز در شرایط بهینه (دمای 40 درجه سانتی گراد و ph برابر 9) می باشد. در میان منابع مورد بررسی غلظت 1 درصد (وزنی/حجمی) سبوس برنج به عنوان منبع کربنی و 5/0 درصد (وزنی/حجمی) تریپتون و 1/0 درصد (وزنی/حجمی) تریپتوفان به عنوان منابع نیتروژنی انتخاب شدند. مقایسات بین محیط تولید پایه و بهینه شده تحت شرایط فلاسک لرزشی نشان داد که میزان رشد باکتری و تولید آنزیم تحت شرایط بهینه در مقایسه با محیط تولید پایه افزایش معنی داری داشته، هم چنین تولید آنزیم تحت شرایط فرمانتور در مقایسه با شرایط فلاسک لرزشی علاوه بر افزایش محصول آنزیم، مدت زمان انکوباسیون برای تولید حداکثر آن را از 120 ساعت به 60 ساعت کاهش داد. میزان بهینه شدت هوادهی و سرعت همزدن به ترتیب vvm 1 وrpm 100 تعیین گردید. نتایج حاصل از بهینه سازی فعالیت آلفا آمیلاز در واکنش سنجش آنزیمی نشان می دهد بیشترین فعالیت آنزیم در دمای 80 درجه سانتی گراد وph برابر با 7 می باشد. در میان یون های فلزی مورد استفاده یون کلسیم باعث افزایش فعالیت نسبی شد. بیشترین راندمان هیدرولیز نشاسته نیز در نسبت (1:4) آنزیم به سوبسترا و غلظت 3 درصد (وزنی/حجمی) نشاسته بدست آمد. به منظور تهیه آنزیم گلوکوآمیلاز مورد نیاز برای فرآیند شیرین سازی، از قارچ aspergillus niger ptcc 5162استفاده شد. این قارچ طی 90 ساعت انکوباسیون در حدودu/ml 9/6 آنزیم گلوکوآمیلاز تولید کرد. تخمیر محلول قندی حاصل از هیدرولیز نشاسته که با استفاده از مخمر sacchromyces cerevisiae y3-4 انجام شد، ظرف مدت حدود 72 ساعت مقدار 6 گرم بر لیتر اتانول تولید نمود.

بررسی ژن های مرتبط با تنش سرما در گیاه بنفشه از طریق نمایش افتراقی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  مرتضی حسینی واسوکلایی   علی دلجو

گیاه بنفشه گیاهی زینتی و متعلق به خانواده ویولاسه (violacea) است که دارای گونه های متعددی می باشد. یکی از مهمترین گونه های بنفشه، گونه ای با نامviola tricolor بوده که به دلیل تحمل بالا به سرما، در سراسر جهان از محبوبیت زیادی برخودار است. به منظور مطالعه الگوی بیان ژن در شرایط دما های پایین از برگ های این گیاه در دمای 25 درجه سانتیگراد به عنوان نمونه شاهد و دما های 5 ، صفر، 5- و 10- درجه سانتیگراد نمونه-برداری شد. با کمک روش نمایش افتراقی (differential display) به بررسی تفاوت بیان ژن ها پرداخته شد. استخراج rna از برگ های بنفشه برای هر پنج تیمار دمایی انجام شد. با کمک آنزیم رونویسی معکوس و با استفاده از سه آغازگر اولیگو (اولیگوdta، اولیگوdtc و اولیگو dtg)، ساخت رشته اول cdna انجام شد. در مرحله بعد از هشت آغازگر انتخابی با طول 13 نوکلئوتید استفاده گردید. آغازگر های مورد استفاده شامل hap25، hap26، hap27، hap28، hap29، hap30، hap31 و hap32 بودند که به همراه آغازگر های اولیگوی مورد استفاده در مرحله ساخت رشته اول cdna، در واکنش pcr جهت ساخت رشته دوم cdna به کار رفتند. جداسازی باندها روی ژل آگارز 3% انجام شد نتایج نشان داد که از میان سه آغازگر اولیگو، آغازگر اولیگو dtc بیشترین تعداد باند را تولید کرد. از میان آغازگر های انتخابی نیز آغازگر انتخابی hap30 برای مجموع سه آغازگر اولیگو، بیشترین تعداد باند را ایجاد کرد. چندین نمونه توالی یابی شدند که بعد از انجام کارهای بیوانفورماتیکی مشاهده شد که اکثر توالی ها شباهت معنی داری در پایگاه اطلاعاتی داده نشان نمی دهند که می توان آن ها را به عنوان توالی های جدید ثبت نمود و یکسری دیگر شباهت بالایی در پایگاه داده داشتند که یکی از آن ها توالی بوده است که بیشترین شباهت را با توالی های est گیاه سپیدار که در تنش خشکی دخیل هستند از خود نشان داده است. در پایان 6 توالی به نام های mhv6, mhv5, mhv4, mhv3, mhv2, mhv1 شناسایی ودر پایگاه اطلاعاتی داده est در قسمت ncbi گزارش وثبت شدند.

بهینه سازی انتقال ژن بتا گلوکورونیداز (gusa) به گیاه مفراح(nepeta crispa)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  محمد آویزه گوش   علی دلجو

مفراح گیاه دارویی چند ساله متعلق به خانواده لابیاته است . گسترش این گیاه بیشتر در نواحی معتدل و نیمه معتدل دنیا است. این گیاه به دلیل استفاده در زمینه های مختلف دارویی ، بهداشتی و غذایی حائز اهمیت است . تراریختی به واسطه آگروباکتریوم باعث گیاهان تراریخت بی شمار با ویژگی های برجسته شده است. گیاه تراریخت حاوی ژن گزارشگر فقط در نعناع و پونه آبی به دست آمده است، بنابراین شایان توجه است که این تراریختی در مورد گونه های دیگر این جنس مثل مفراح هم انجام شود. برقراری یک سیستم باززایی قابل اعتماد در برنامه های انتقال ژن گیاهی ضروری است. در این تحقیق، باززای مستقیم گیاه مفراح از دیسک های برگی در شرایط آزمایشگاهی صورت گرفته است. بهترین نتایج زمانی به دست آمد که از محیط ms همراه با چهار میلی گرم در لیتر هورمون bap استفاده شد. گیاهان تراریخت در اثر هم کشتی دیسک های برگی با آگروباکتریوم تو مفسینس سویه gv3850 حامل وکتور pbi121 که در برگیرنده ژن بتا گلوکورونیداز باکتری ای. کولی به عنوان ژن گزارشگر و ژن مقاومت به کانامایسین به عنوان نشانگر انتخابی بود، به دست آمد. شواهد حضور و بیان ژن های انتقال یافته در گیاهان تراریخت توسط سنجش هیستوشیمیایی gus و واکنش pcr بررسی شد. بازدهی نهایی ترانسفورماسیون 0 بود.

شناسایی نشانگرهای ssr و est-ssr در چغندر (beta vulgaris l.)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  محمدحسین صفری   اصغر میرزایی اصل

چغندر قند با نام علمی بتا ولگاریس گیاهی دوساله از خانواده آمارانتاسه می باشد. تاکنون شناسایی نشانگرهای ssr به روش های هیبریداسیون و est-ssr در چغندر صورت گرفته است اما شناسایی نشانگرهای جدید به ویژه نشانگرهای مرتبط با صفات مهم حائظ اهمیت می باشد. از توالی های est موجود در پایگاه های اطلاعاتی و همچنین توالی ژنومی ژن flc-like ، یکی از ژن های کلیدی کنترل کننده گلدهی، جهت شناسایی نشانگرهای چندشکل est-ssr و ssr در چغندر استفاده شد. برای این کار توالی های est چغندر قند مربوط به سال های 2011-2008 از پایگاه ncbi دریافت و سرهمبندی شدند که در مجموع 2147 کانتیگ حاصل شد. از نرم افزارهای phobosv.3.3.12 و ssrlocator v.1 برای شناسایی ssrهای 2 تا 6 نوکلئوتیدی استفاده شد. طراحی آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی های حفاظت شده مجاور ناحیه تکراری صورت گرفت. واکنش زنجیره ای پلیمراز برای این آغازگرها به همراه dna ژنومی 10 لاین و رقم چغندر قند و دو نمونه چغندر ماریتیما انجام شده و پس از جداسازی با ژل 8 درصد پلی اکریل آمید به روش افقی، رنگ آمیزی آن با استفاده از اتیدیوم بروماید انجام گردید. از مجموع 10 جفت 9 جفت تولید باند کرده و 5 آغازگر c981، c1653، c1، c30 و c52 چندشکلی نشان دادند. این نشانگرها مجموعا با 14 الل در هر مکان 2 تا 4 الل تولید کردند. شاخص pic برای این آغازگرها بین 4/0 تا 66/0 بود. همچنین از مجموع 5 جفت آغازگر طراحی شده بر اساس ssrهای موجود در ناحیه پروموتر و اینترون اول ژن flc-like همه آغازگرها قادر به تولید محصول pcr در اندازه مورد انتظار بودند که در این بین آغازگر c744 با 2 الل و شاخص pic برابر با 37/0 چند شکل بود. در مجموع تعداد 4 نشانگر ssr از ژن های کنترل کننده گلدهی و دو نشانگر از توالی های est ناشناخته به دست آمد که چندشکلی مشاهده شده در آن ها ممکن است بر عملکرد این ژن ها اثر گذار باشد و در نتیجه نشانگرهای مناسبی برای عملکرد این ژن ها در ژنوتیپ های مختلف باشند.

ارزیابی فعالیت آنتی اکسیدانی، ضد باکتریایی و ضد قارچی عصاره های مختلف چهار گیاه بومی استان همدان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  سمیه مرادی   خسرو پیری

استان همدان از گذشته های خیلی دور یکی از قطب های گیاهان دارویی در ایران بوده است. در این تحقیق قسمت های مختلف چهار گیاه بومی استان همدان به نام های شکرتیغال شرقی، وسمه، سلمک کوهی و ورگ برای تعیین محتوای فنل و فلاونوئید کل، فعالیت مهار رادیکال آزاد dpph، فعالیت ضد باکتریایی و ضد قارچی، با استفاده از عصاره های متانولی و هیدروالکلی مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که عصاره متانولی گیاهان محتوای فنل و فلانوئید بالایی دارند. بالاترین فعالیت مهار رادیکال آزاد dpph، در عصاره متانولی برگ و گل شکرتیغال شرقی مشاهده شد. بیشترین میزان فنل تام را عصاره متانولی برگ و ریشه وسمه نشان داد، در حالی که عصاره متانولی اندام هوایی ورگ بیشترین میزان فلاونوئید تام را داشت. فعالیت ضد باکتریایی در شرایط آزمایشگاهی علیه 14 سویه باکتری بیماری زای انسانی به روش انتشار در آگار و رقت لوله ای مورد ارزیابی قرار گرفت. در بین گیاهان مورد ارزیابی، عصاره هیدروالکلی برگ وسمه و عصاره متانولی اندام هوایی گیاه ورگ بهترین فعالیت ضد باکتریایی را از خود نشان دادند. کمترین مقدار mic و mbc مربوط به عصاره هیدروالکلی شکرتیغال شرقی، وسمه و سلمک کوهی و همچنین عصاره متانولی گیاه ورگ بود. فعالیت ضد قارچی در شرایط آزمایشگاهی علیه 4 قارچ بیماری زای گیاهی و 4 قارچ بیماری زای انسانی مورد ارزیابی قرار گرفت. در بین گیاهان مورد ارزیابی عصاره متانولی برگ و گل شکرتیغال شرقی بهترین فعالیت ضد قارچ های گیاهی را از خود نشان داد و عصاره متانولی اندام هوایی ورگ بهترین فعالیت ضد قارچ های بیماری زای انسانی را داشت. بررسی خاصیت ضد میکروبی این گیاهان نشان داد که عصاره متانولی بهتر از هیدروالکلی عمل نمود. با افزایش غلظت هر عصاره میزان بازدارندگی رشد باکتریایی افزایش یافت.

بررسی اثر سمیت پداژه گیاه شیپوری وحشی (arum maculatum linn.) روی سلول های مدل انسانی و اثر بازدارندگی آن روی سلول های قارچی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  سمانه توکلی   علی دلجو

هزاران سال است که گیاهان، از مهم ترین منابع درمانی محسوب می شوند. گیاهان هم چنین منبع بسیاری از درمان های جدید می باشند. تقریبا یک چهارم دارو های تولید شده حاوی عصاره های گیاهی یا ترکیباتی هستند که از مواد گیاهی بدست آمده اند یا براساس ترکیبات گیاهی مدل سازی شده اند. شیپوری وحشی یکی از گیاهان دارویی است که در استان همدان یافت می شود. این گیاه دارای ترکیبات ثانویه با ارزشی است. در این تحقیق برای بررسی اثر اسپرم کشی گیاه شیپوری وحشی بر اسپرماتوزوای انسان پرداختیم و هم چنین اثر ضد-قارچی گیاه شیپوری وحشی عوامل پاتوژن انسانی با توجه به روش انتشار دیسک صورت گرفت. تاثیر بی حرکت سازی اسپرم در اثر عصاره هیدرواتانولی این گیاه بلافاصله به صورت وابسته به دوز ظاهر شد و 100? از اسپرم ها در غلظت 180 میلی گرم / میلی لیتر و بالاتر بی حرکت شدند. پس از شستن اسپرم، بازگشت پذیری حرکت مشاهده نشد. اختلال و صدمه به کروماتین ومرفولوژی و غشای سلول-ها در گروه تیمار شده با عصاره مشاهده شد. عصاره غده و برگ گیاه شیپوری وحشی هیچ گونه فعالیت ضد قارچی قابل توجهی در برابر میکروسپوروم کنیس نشان نداد و فعالیت ضد قارچی بر سایر قارچ ها مشاهده شد.

ارزیابی خاصیت ضداکسیدانی، ضد باکتریایی و سمیت عصاره گیاه شیپوری وحشی (arum maculatum) بر سلول های مدل انسانی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  نسیم یاری   علی دلجو

بسیاری از گیاهان دارای خواص دارویی هستند و تاثیر سودمندی بر سلامت بدن دارند.به عنوان مثال می توان فعالیت آنتی اکسیدانی، ضد التهابی، ضد میکروبی و پتانسیل ضد سرطانی آن ها را می توان ذکر کرد. بنابراین شناسایی ترکیبات شیمیایی متنوع ، و بررسی اثرات گوناگون بیولوژیکی گیاهان امری ضروری می باشد. گیاه شیپوری وحشی با نام علمی arum maculatum گیاهی علفی ، دارای ریزوم متورم است و متعلق به خانواده araceae می باشد. بر اساس دانش محلی، انتظار می رود این گیاه دارای برخی از اثرات مهاری بر روی استحاله مواد غذایی و خواص حفاظت می باشد. اثرات قابل توجهی در ارزیابی خواص ضد سرطان و ضد سرطانی این گیاه گزارش شده است. . در این تحقیق جهت ارزیابی خواص ضدتوموری و ضدسرطانی این گیاه بر روی بقاء لاین سلول های سرطانی کولون (cal-co2) از آزمون ldh استفاده گردید. نتایج حاکی از این بود که بیشترین اثر ضدسرطانی بر روی سلول ها به میزان 100 درصد مربوط به غلظت 320 میکروگرم بر میلی لیتر عصاره هیدروالکلی می باشد. در ارزیابی خواص ضد میکروبی، اثرات ضدباکتربایی غلظت های مختلف از سه عصاره آبی، اتانولی و متانولی برگ و ریشه گیاه بر روی 10 نوع باکتری بیماری زا بررسی گردید. همچنین مقادیر mic و mbc این عصاره ها بر روی این باکتری ها ارزیابی شد که همه سویه ها دارای اثر ضدباکتریایی بودند. در ارزیابی خواص آنتی اکسیدانی میزان فنول کل برای ریشه و برگ به ترتیب 25/60 و 74/24 میلی گرم اسید گالیک در گرم ماده خشک اندازه گیری شد و میزان فلاونوئید کل نیز به ترتیب 28/40 و 85/27 میلی گرم کوئرستین در گرم ماده خشک تعیین گردید. در تست dpph نیز ic50 ارزیابی شده برای ریشه و برگ گیاه مذکور به ترتیب 1114/0 و 1015/0 میلی گرم بر میلی لیتر بود.

تولید آنزیم آلفاآمیلاز با استفاده از سویه بومی az2،bacillus licheniformis جداسازی شده از چشمه آبگرم قینرجه (استان اردبیل) تحت شرایط تخمیر در بستر جامد
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1392
  سمیه عظیمی   علی دلجو

آلفاآمیلازها از مهمترین آنزیم های مورد استفاده در بیوتکنولوژی محسوب می شوند و اهمیت آنها به دلیل کاربرد گسترده شان در صنایع مختلفی نظیر نساجی، کاغذسازی، نانوایی و غذایی می باشد. همچنین به عنوان ترکیبات ضدلک در شوینده ها به کار می روند. کاربرد این آنزیم ها امروزه در زمینه دارویی و شیمی تجزیه نیز گسترده شده است. روش تخمیر در بستر جامد نوعی فرآیند تخمیری است که در آن از سوبسترای جامد استفاده می شود. به عبارتی این فرآیند، رشد میکروارگانیسم ها روی ذرات جامد و مرطوب سوبسترا است، با این حال میزان رطوبت در این فرایند بر حسب نوع بستر متغیر می باشد. هدف از این تحقیق بررسی امکان تولید آلفاآمیلاز از سویه بومی گرمادوست باسیلوس لیچنی فورمیس جداسازی شده از چشمه آبگرم قینرجه (استان اردبیل) تحت شرایط تخمیر در بستر جامد می باشد. تاثیر عوامل مختلف بر تولید آنزیم آلفا آمیلاز از جمله جنس بستر تخمیر (مانند سبوس گندم، آرد ذرت، کلش چاودار، کاه گندم و سبوس برنج)،میزان محتوای رطوبت بستر(50و10،20،30،40 درصد)،اندازه ذرات جامد بستر(250،500،1000 میکرومتر، الک نشده)،طول دوره انکوباسیون (24، 48، 72، 96، 120 ساعت)، مقدار مایه تلقیح اولیه (5، 10، 15، 20، 25 درصد)، تاثیر غلظت های مختلف کلسیم(20، 15، 10، 5 و 1 میلی مولار)، منبع کربن مکمل (نشاسته،گلوکز،فروکتوز،ساکاروز،مالتوز)ومنبع نیتروژن مکمل(عصاره مخمر، تریپتون، کازئین، کلریدآمونیوم، نیترات سدیم و آرد سویا)بررسی شده است. دمای مطلوب تولید آنزیم برای همه نمونه ها در انکوباتور 40 درجه سانتیگراد در نظر گرفته شد. نتایج نشان داد که سبوس گندم با اندازه ذرات 500 میکرومتر بهترین بستر جامد برای تولید آنزیم آلفاآمیلاز می باشد. تولید آنزیم با بکارگیری 15 درصد مایه تلقیح اولیه،30 درصد میزان رطوبت بستر، غلظت 5 میلی مولار کلسیم و اعمال 72 ساعت برای طول دوره انکوباسیون افزایش یافت. در ادامه نشاسته و آرد سویا حداکثر تاثیر را در تولید آنزیم داشتند. نتایج این تحقیق پیشنهاد می دهد که باسیلوس لیچنی فورمیس را می توان برای تولید آلفا آمیلاز در بستر جامد استفاده کرد.

اثرات ضد میکروبی و آنتی اکسیدانی عصاره گیاه تاتوره (datura innoxia)
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  عاطفه رضایی ستار   سنبل ناظری

گیاهان دارویی از هزاران سال پیش منابع مهمی برای تولید دارو بوده اند. تنوع فوق العاده گیاهان و امکان وجود ترکیبات شیمیایی متنوع در آن ها، شناسایی و بررسی اثرات گوناگون بیولوژیکی در این گیاهان را ضروری می سازد. تاتوره (datura sp.) از خانواده سولاناسه از حدود نیم قرن پیش به عنوان گیاهی با اثرات مفید دارویی کشت می شود. این گیاه حاوی چندین متابولیت ثانویه مهم است. اسکوپولامین و هیوسیامین، متابولیت های اصلی این گیاه، آثار پاراسمپاتیک دارند. هدف پژوهش حاضر بررسی فعالیت ضد میکروبی عصاره های اتانولی، متانولی و هیدروالکلی برگ های تاتوره به روش انتشار دیسک علیه هشت سویه باکتری و چهار جدایه قارچ بیماری زا و همچنین تعیین مقادیر mic وmbc این عصاره ها به روش رقت لوله ای بود. بر اساس نتایج حاصل، عصاره اتانولی بر طیف گسترده تری از باکتری ها تأثیر داشت و بزرگ ترین قطر هاله ممانعت از رشد تحت تأثیر عصاره هیدروالکلی به دست آمد. همچنین مشخص شد که عصاره هیدروالکلی در غلظت های کمتری در مقایسه با دو عصاره اتانولی و متانولی، باعث مهار رشد باکتری های مورد سنجش شد. نتایج ارزیابی خواص ضد قارچی عصاره گیاه تاتوره نشان داد که این گیاه اثر بازدارنده ای بر رشد قارچ های مورد بررسی نداشته است. ارزیابی خواص آنتی اکسیدانی عصاره متانولی به روش dpph انجام و مشخص شد که ic50 آن با ic50 اسید آسکوربیک قابل مقایسه است.

تنوع ژنتکی ژرم پلاسم های خاکشیر شیرین جمع آوری شده از استان های یزد و همدان با استفاده از نشانگرهای issr
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1392
  سحر ساکی   علی دلجو

گیاه خاکشیر شیرین با نام علمی descurainia sophia یکی از گیاهان دارویی با ارزش است. متاسفانه در کشور ایران هنوز اکثر گیاهان دارویی از جمله خاکشیر شیرین از مراتع طبیعی برداشت می¬شوند. این فرآیند منجر به حذف تدریجی ژرم¬پلاسم¬های وحشی می¬گردد. به منظور نگه¬داری این گیاهان ابتدا باید بتوان آن¬ها را شناسایی کرد. برای شناسایی و دسته¬بندی دقیق¬تر ژنوتیپ¬های موجود یک گیاه، استفاده از تنوع ژنتیکی می¬تواند مورد توجه قرار گیرد. به کارگیری نشانگرهای مولکولی از جمله issr روشی است که در سال¬های اخیر توسط محققیق برای این منظور مورد استفاده قرار گرفته است. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 15 اکوتیپ از دو استان یزد و همدان با نشانگر issr بررسی شد. با بررسی 181 مکان ژنی مجموعا 1141 باند امتیازدهی شد که 165 مورد از آن¬ها نشان¬دهنده چند¬شکلی بودند. به منظور ارزیابی شباهت ژنتیکی بین نمونه¬ها از تجزیه خوشه¬ای با استفاده از ماتریس تشابه جاکارد با روش upgma استفاده گردید. در نقطه برش دندروگرام حاصل از نمونه¬ها، اکوتیپ¬های یزد و همدان از هم تفکیک نشدند. نتایج amova نیز موید این مطلب است. به طوری که واریانس داخل گروه¬ها 90 درصد بود. البته در قبل از نقطه برش دو خوشه اصلی بدست آمده است که اکوتیپ¬های یزد همراه با h40، h41، h6، h24، h5 و h2 از همدان در یک خوشه و بقیه اکوتیپ¬های همدان در خوشه دیگر قرار گرفتند. نمودار دو بعدی بر اساس روش تجزیه به مختصات اصلی تهیه شد و با دندروگرام تنوع ژنتیکی تطابق مناسبی داشت. در این نمودار نیز نمونه¬ها در دو ناحیه (مطابق دو خوشه در دندروگرام) واقع شدند. علت این عدم تفکیک و شباهت ژنتیکی بالای این دو اکوتیپ می¬تواند به خاستگاه مشترک نمونه¬ها اشاره داشته باشد. محل اصلی رشد خاکشیر در کشور ایران در استان¬های مناطق شمالی، رشته جبال البرز و زاگرس است. به همین جهت احتمالا منشا اکوتیپ¬های یزد به منطقه همدان نزدیک بوده و گیاهان یزد در طول زمان به واسطه جریان ژنی و مهاجرت به این منطقه وارد شده¬اند. میانگین درصد چندشکلی میان نمونه¬ها 16/81 درصد و میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (pic) 77 درصد بود. آغازگر (ag)8t با 91% بالاترین مقدار pic را داشت. شباهت ژنتیکی بین اکوتیپ-های h5 و h2 حدود 68 درصد برآورد شد. میانگین شاخص نشانگر (mi) معادل 06/10 بود. از بین 12 آغازگر، (tg)8g با 48/14 شاخص نشانگری به عنوان آغازگر برتر برای مطالعات بعدی بر روی انواع خاکشیر در نظر گرفته شد.

بررسی ویژگیهای ضد باکتریایی وآنتی اکسیدانی عصارههای مختلف اندامهای دو گیاه گاوزبان ایتالیایی و قیچ لوبیایی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1393
  محمودرضا رنجبری   علی دلجو

علم شناسایی و استفاده از گیاهان دارویی به قدمت عمر انسان است. بشر هنگامی که از گیاهان به عنوان غذا استفاده میکرد، متوجه برخی از اثرات ویژه از جمله اثر درمانی یا اثر سمی آنها شد. سپس این اطلاعات از نسلی به نسل دیگر انتقال یافتند. یکی از مشکلات مهم که همواره انسان با آن دست به گریبان بوده بیماری های میکروبی است و مقاومت میکروبی در برابر آنتی بیوتیک ها از موضوعات مهمی است که در درمان بیماری های عفونی رو به افزایش است. عوارض آنتی بیوتیک ها را نیز می توان به این مشکلات اضافه کرد. وجود این مشکلات باعث تداوم تحقیقات در جهت یافتن ترکیبات ضد میکروبی جدید و موثر بالاخص بامنشاء گیاهی گردیده است. گاوزبان ایتالیایی (italicum echium) که از خانواده boraginaceae است، گیاهی علفی، معطر و دو ساله با ساقه قائم با ارتفاع 40-100 سانتیمتر و پوشیده از کرک های خاردار مشخص میباشد. این خانواده شامل حدود 100 جنس و بیش از 2000 گونه میباشد. قیچ لوبیایی (zygophyllum fabago)گیاهی علفی، چند ساله و بدون کرک است که متعلق به خانواده zygophyllaceae میباشد. این تیره گیاهی شامل 25 جنس و 240 گونه است. گیاهان این خانواده بهصورت علفی چند ساله، درختچهای و بوتهای هستند. در این تحقیق پس از جمعآوری گیاهان از مناطق شناسایی شده، اندامهای مختلف بوته جداسازی، شسته و زیر سایه خشک شد. سپس عصارههای آبی، هیدروالکلی و اتانولی اندامهای هردوگیاه به روش خیساندن تهیه شد و با کاغذ واتمن صاف شد. سپس با سانتریفیوژ نمودن عصاره و تبخیر حلال با دستگاه روتاری، عصارهای شفاف بدست آمد. اثر ضد باکتریایی عصارههای مختلف هر اندام به روش انتشار دیسک در آگار بر روی 10 باکتری بیماریزای انسانی بررسی شد. آنتیبیوتیکهای استرپتومایسین و کانامایسین به طور جداگانه به عنوان گروههای کنترل مثبت در این آزمایش منظور گردیدند. نتایج تست ضدباکتریایی نشان داد که هر دو گونه دارای اثرات ضدباکتریایی قابل توجهی علیه بیشتر باکتری های بیماریزای انسانی به خصوص باکتری باسیلوس سرئوس بودند. در این تحقیق حساسیت باکتریهای گرم مثبت در تمامی اندامهای گیاهان، بیشتراز باکتریهای گرم منفی بود. در تمامی موارد و در تمام اندامها، با افزایش غلظت عصارههای گیاهی اثر ضد باکتریایی نیز افزایش یافته است. همچنین نتایج نشان داد که برگ گیاه قیچ لوبیایی و ریشه گاوزبان ایتالیایی بیشترین اثر ضد باکتریایی را داشته اند. برای بررسی خاصیت آنتی اکسیدانی، پس از تهیه عصاره اتانولی، میزان فنول کل و فلاونوئید کل سنجیده شدند. اندازه گیری فعالیت آنتی اکسیدانی عصاره اتانولی با روش dpph انجام شد. میزان ic50 عصاره در محدوده 1/0-2/0 میلیگرم بر میلی لیتر بود. با مقایسه میانگین درصد مهار dpph بافتهای گیاهی در غلظت یک میلی گرم بر میلی لیتر، مشخص شد که عصاره ریشه گاوزبان ایتالیایی و اسید آسکوربیک از نظر درصد مهار dpph، در بالاترین سطح قرار گرفتند. کمترین میزان مهار رادیکال آزاد درعصاره غلاف بذر قیچ لوبیایی مشاهده شد. محتوای فنل کل نمونه ها( بر اساس روش فولین سیو کالتو) در محدوه 94/97- 94/249 میلیگرم اسید گالیک بر گرم وزن خشک و محتوای فلاونوئید کل برای بافتها(بر اساس روش نور سنجی کلرید آمونیوم )در محدوده بین13/3- 8/7 میلیگرم کوئرسیتین بر گرم وزن خشک قرار داشت. بر این اساس میتوان به این نتیجه رسید که عصاره این گیاهان نیز میتوانند بهعنوان جایگزین مناسبی برای سایر آنتی اکسیدانهای تجاری باشند.

فعالیت ضدباکتریایی عصاره گیاهان آفتاب پرست اروپایی heliotropium europaeum و اکلیل الملک melilotus officinalis l.
پایان نامه دانشگاه بوعلی سینا - همدان - دانشکده علوم کشاورزی 1393
  سهیلا نقی لو   علی دلجو

چکیده: تاریخ اجداد ما بیانگر این است که گیاهان اغلب بعنوان منبع اصلی غذا و دارو تلقی می شده اند.در طول سال های متمادی، درمانهای طبیعی بخصوص گیاهان داروئی منبع اصلی وبعضا تنها راه درمان بیماری ها بوده اند. اما به تدریج با پیشرفت های حاصله در علوم شیمی داروهای طبیعی بوسیله دارو های مصنوعی جایگزین شد. اخیرا، عوارض جانبی و حساسیت ها و بروز نژاد های مقاوم میکروبها به آنتی بیوتیک های مصنوعی باعث رویکرد مجدد به دارو های گیاهی شده است. از طرف دیگر پیشرفت تکنیک های جدید باعث بهبود روش های مورد استفاده برای تعیین فعالیت متابولیت های فعال در گیاهان شده است. برآورد شده است که حدود یک سوم محصولات داروئی شامل موادی هستند که از گیاهان بدست آمده اند. در دو دهه اخیر مقاله های متعددی در مورد عصاره گیاهان و ترکیبات آنها منتشر شده است. در این تحقیق اثر ضد باکتریائی گیاه های آفتاب پرست اروپائی heliotropium europaeum و اکلیل الملک melilotus officinalis l.مورد بررسی قرار گرفته است. آفتاب پرست اروپائی گیاهی است از تیره گاوزبان و جنس آفتاب پرست است. این جنس در ایران شامل چهل و هفت گونه است. گیاه اکلیل الملک که دارای نام های دیگری مثل شبدر شیرین یا یونجه زرد است که با نام ملیلوت نیز شناخته می شود گیاهی از تیره پروانه اسا است. نمونه های گیاهی مورد نیاز این تحقیق از رویشگاه های طبیعی تهیه شده و توسط گیاه شناس دانشگاه بوعلی سینا شناسائی شدند. از نمونه های جمع آوری شده اندام های برگ، ساقه و گل آذین از گیاه آفتاب پرست اروپایی و اندام هوایی و ریشه از گیاه اکلیل الملک جدا شده و پس از شستشو خشک و آسیاب شدند. عصاره های هر نمونه بوسیله حلال های آب، الکل و مخلوط آب و الکل استخراج شده و پس از عبور از کاغذ واتمن صاف شدند. پس از سانتریفیوژ شدن و حذف حلال ها، عصاره ها خشک شده و جهت استفاده های بعدی در فریزر نگهداری شدند. با استفاده از روش انتشار دیسک در آگار فعالیت آنتی باکتریائی همه عصاره ها بر ده نمونه باکتری بیماریزای انسانی مورد بررسی قرار گرفت. آنتی بیوتیک های استرپتومایسین وانکومایسین بطور جداگانه بعنوان کنترل مثبت مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج آزمایش نشان داد که عصاره های هر دوگونه گیاهی بر علیه اکثر باکتری های بیماریزای انسانی مورد بررسی مخصوصا باسیلوس سرئوس دارای خواص آنتی باکتریائی قوی هستند. باکتری های گرم مثبت بیش تر از باکتری های گرم منفی تحت تاثیر عصاره های این گیاهان بودند. مقایسه میانگین داده ها نشان داد که در تمامی موارد عصاره برگ گیاه آفتاب پرست اروپائی و عصاره قسمت های هوائی اکلیل الملک بیشتر از سایر اندامها اثر داشتند. تقریبا در اکثر موارد افزایش غلظت عصاره ها باعث افزایش خواص ضد باکتریائی شده است. واژه های کلیدی: آفتاب پرست اروپایی، اکلیل الملک، عصاره گیاهی، ضدباکتریایی.

بررسی اثردما,نوع مواد قندی,مواد نیتروژنی ,میزان اسیدیته بر شرایط رشد باکتری bacillus licheniformis جدا شده از چشمه های آبگرم قینرجه (استان اردبیل) برای افزایش آنزیم پروتئازخارج سلولی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1394
  علیرضا موسی نژاد   علی دلجو

میکرو ارگانیسم ها مهم ترین وعمده ترین منبع تولید آنزیم ها محسوب می شوند. بیشتر آنزیم های میکروبی قابل تجاری شدن در تعداد معدودی از جنس های باکتریایی یافت می شوند که در اکثر موارد شناخته شده ترین آنها به گونه باکتریایی باسیلوس تعلق دارند. پروتئاز جزء مهم ترین آنزیم های صنعتی می باشد. پروتئازها در صنایع متعددی از جمله سنتز پپتید و فرآوری پروتئین و صنایع غذایی، دارویی وشوینده، کاربرد فراوان دارند. . در این میان پروتئاز قلیایی در صنعت مواد شوینده اهمیت بیشتری دارد. جهت تولید گسترده و ارزان قیمت این آنزیم ها محیط های کشت مختلف طراحی شده است.در این تحقیق باکتری bacillus licheniformis از چشمه آبگرم قینرجه استان اردبیل جدا سازی شده و روی محیط کشت نوترین آگار ودر مای 40 درجه سانتی گراد نگه داری گردید. برای بهینه سازی فاکتورهای دما، نوع مواد قندی نیتروژنی، درجه ph در فواصل زمانی 1 تا 6 ساعت بررسی گردید. تولید هاله شفاف دراطراف کلنی ها دال بر تولید آنزیم پروتئاز قلیایی می باشد. از بین منابع کربن مختلف، گلوکز ولاکتوز و از بین منابع ازت، سدیم نیترات تأثیر گذارترین منابع کربن و ازت در تولید آنزیم در 6=ph و دمای 40 درجه سانتی گراد توسط bacillus licheniformis مورد آزمایش بود. حداکثر تولید آنزیم 48 ساعت پس از گرم خانه گذاری مشاهده شد و پس از آن تولید کاهش یافت.

انتقال ژن بتا 1 و 3 اندو گلوکاناز (bgn 3.1)به کلزا (brassica napus l) و تأیید گیاه تراریخت به وسیله تکنیک های ملکولی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1386
  حمیدرضا خیری   علی دلجو

چکیده ندارد.

انتقال ژن بتا 1و3 اندوگلوکاناز (bgn 3.1) به کلزا (brassica napus l) و تایید گیاه تراریخت به وسیله تکنیکهای ملکولی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1386
  حمید رضا خیری   علی دلجو

چکیده ندارد.

بررسی تنوع ژنتیکی توده های گردوی ایرانی (juglans regia l.) در غرب کشور با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1386
  روح الله کریمی   علی دلجو

چکیده ندارد.

شناسایی آلل های خودناسازگاری در ارقام بادام ایرانی با استفاده از تکثیر اختصاصی آلل ها به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1386
  بابک ولیزاده کاجی   علی دلجو

چکیده ندارد.