نام پژوهشگر: محمدرضا چگینی

شبیه سازی و مدل سازی تکثیر و متمایز شدن سلول های بنیادی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی 1389
  محمدرضا چگینی   حسین بهاروند

تکثیر و خودنوزائی دو ویژگی مهم سلول های بنیادی است. عوامل بسیار زیادی بر تکثیر و خودنوزائی سلول-های بنیادی تأثیر می گذارند. برخی از مهم ترین این عوامل، فاکتورهای خارج سلولی هستند. این فاکتورها، مسیرهای پیام رسانی را در داخل سلول فعال می کنندکه منجر به رخدادهای مهمی در داخل سلول می شود. یکی از این رخدادها، بیان ژن است. سلول های بنیادی پیش ساز عصب به دلیل اهمیت، در این پایان نامه برای مدل سازی در نظر گرفته شده اند. از جمله مهم ترین فاکتورهای خارج سلولی موثر بر تکثیر و خودنوزائی سلول های بنیادی پیش ساز عصب، فاکتورهای رشد egf و bfgf می-باشد. این فاکتورهای با فعال کردن برخی مسیرهای پیام رسانی از جمله erkو akt و بیان برخی ژن ها، از جمله c-fos، سرنوشت سلول را تحت تأثیر قرار می دهند. در این پایان نامه ما به مدل سازی مسیرهای پیام رسانی egf و bfgf، از سطح سلول تا بیان ژن c-fos پرداخته ایم. این مدل بر اساس معادلات دیفرانسیل مرتبه اول غیرخطی است. معادلات دیفرانسیل مدل، بر اساس قوانین شیمیائی حاکم بر مسیرهای پیام رسانی استخراج شده اند. پارامترهای موجود در مدل، که شامل شرایط اولیه و ضرایب قدرت واکنش هاست، بر اساس اطلاعات کیفی و کمی موجود و همچنین آزمایشات انجام گرفته برای بیان ژن c-fos، بدست آمده است. مدل ارائه شده دراین پایان نامه شامل 164 واکنش و 351 پارامتر است. نتایج حاصل از مدل به خوبی توصیف کننده نحوه فعال شدن فاکتورهای موجود در مسیرهای پیام رسانی و بیان ژن c-fos تحت تأثیر فاکتورهای egf و bfgf می باشد.