نام پژوهشگر: شاداب فهام

مطالعه روابط بین ساختار شیمیایی - خواص فیزیکی و فعالیت های بیولوژیکی به کمک کمومتریکس
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کردستان - دانشکده علوم پایه 1389
  شاداب فهام   ریوف قوامی

بخش اول- رویکردهای ارتباط کمی ساختار- بازداری (qsrr) مبتنی بر اندیس های اتصال مولکولی برای پیش بینی اندیس های بازداری نسبی کواتس کروماتوگرافی گازی (gc-rri) 132 ترکیب آلی فرار بر روی 12 (4 تا غیرقطبی و 8 تا قطبی) فاز ساکن مختلف، (c67، c78، c103، c?، poh، tif، mtf، pcl، pbr، tmo، psh، pcn) در دمای ?130 مفید هستند. بهینه سازی هندسی کامل براساس روش نیمه تجربی اوربیتال مولکولی am1 انجام شد. مجموعه ای از 30 توصیف گر مولکولی مستقیماً از ساختارهای توپولوژیکی ترکیبات از برنامه dragon به دست آمدند. به وسیله روش انتخاب متغیر نهایی الگوریتم های رگرسیون مرحله به مرحله حذف گزینشی، سه توصیف گر بهینه برای توسعه مدل qsrr برای پیش بینی rriهای ترکیبات آلی بر روی هر فاز ساکن با ضریب همبستگی بین 9378/0 و 9673/0 و ضریب همبستگی ارزیابی تقاطعی یکی در بیرون بین 9325/0 و 9653/0 انتخاب شدند. خطاهای ریشه میانگین مربعات بر روی 12 فاز ساکن مختلف در گستره 0333/0 تا 0458/0 قرار دارند. به علاوه، صحت تمام مدل های توسعه یافته با استفاده از روش های تصادفی کردن-y ، ارزیابی خارجی از طریق زوج و فرد کردن و تقسیم سری داده های ورودی به سری های آموزشی و آزمایشی تأیید شد. تفسیر موفقی از روابط پیچیده بین gc-rri های ترکیبات آلی فرار و ساختارهای شیمیایی استفاده شده در روش های qsrr حاصل شده است. سه شاخص اتصالی در مدل ها به طور منطقی قابل تفسیرند، که نشان می-دهند rri های تمام ترکیبات آلی به طور دقیق با استفاده از شاخص های اتصال مولکولی ارائه می شود. کلمات کلیدی: رابطه کمی ساختار- بازداری، اندیس های بازداری کواتس، اندیس های اتصالی، الگوریتم های رگرسیون مرحله به مرحله حذف گزینشی. بخش دوم- مطابق رده های فرعی مشتقات فلاون، فلاونوئیدهای شناسایی شده در میوه های خانواده مرکبات بیش از 60 نوع از فلاونوئیدها را پوشش می دهند. از میان رده های فرعی فلاون ها، یک سری آنالوگ های پدید آمده به طور طبیعی یا سنتزی از فلاون های پلی متوکسیله در مطالعات زیادی نشان داده اند که عملکرد های ضدتکثیری قوی در مقابل تعدادی از سلول های سرطانی انسان از خود نشان می دهند. تجزیه و تحلیل روابط کمی ساختار- فعالیت (qsar) برای یک مجموعه هفده تایی از فلاونوئیدهای پلی متوکسیله در مقابل 6 نوع سلول های سرطانی انسان شامل ریه، پروستات، روده، پوست و سرطان سینه با گیرنده استروژن مثبت (er+) و گیرنده استروژن منفی (er-) جهت ایجاد روابط همبستگی و پیش بینی کردن فعالیت های ضدتکثیری (غلظت مهارکنندگی 50% یا 90% از واکنش آنزیم یا رشد سلول ic50 و ic90) انجام شده است. مدل سازی فعالیت های ضدتکثیری این ترکیبات به عنوان تابعی از توصیف-گرهای محاسبه شده تئوری با استفاده از آنالیز رگرسیون خطی چندگانه (mlra) ساخته شد. از الگوریتم ژنتیک (ga) برای انتخاب متغیرهای مورد استفاده در بهترین مدل های برازش شده استفاده شد. معادلات به دست آمده شامل توصیف گرهای مولکولی محاسبه شده بر مبنای ویژگی های ساختار مولکولی با استفاده از نرم افزار دراگون و روش های شیمی- کوانتومی می باشند. به وسیله روش انتخاب متغیر الگوریتم ژنتیک، تعدادی از توصیف گرهای مولکولی براساس روش انتخاب مرحله به مرحله برای هر کدام از انواع سلول های سرطانی انسانی به دست آمدند. کارآیی مدل qsar برای هر نوع سلول سرطان انسان به وسیله مقادیر r2 به دست آمده برای مدل اصلی بررسی شدند. هم چنین رفتار مدل ها در هر دو ic50 و ic90، با محاسبه پارامترهای آماری خطای اریب میانگین (mbe)، خطای مطلق میانگین (mae)، خطای ریشه میانگین مربعات (rmse) و شاخص توافق (d2 یا ia) ارزیابی شدند. کلمات کلیدی: فعالیت های ضدتکثیری؛ فلاونوئید؛ فلاون های پلی متوکسیله؛ qsar؛ مرکبات؛ سرطان؛ ریه؛ پروستات؛ سینه؛ روده؛ پوست.