جهت تعیین تنوع ژنتیکی تعدادی از لاین ها و ارقام گندم نان از نظر ژن های کنترل کننده زیرواحدهای گلوتنین با وزن مولکولی بالا (hmw-gs)، 37 رقم گندم هگزاپلوئید، از نظر شش جفت آغازگر اختصاصی برای مکان های ژنی glu-a1 ، glu-b1، glu-d1استفاده شد. برای تفکیک محصولات واکنش pcr از ژل آگارز دو درصد استفاده شد. ارقام گندم با استفاده از روش تجزیه خوشه ای همبستگی متوسط و بر مبنای ضریب تطابق ساده، در 10 گروه قرار گرفتند. روش همبستگی متوسط به خوبی توانست ارقام دارای آلل های مشترک را در یک گروه قرار دهد. ارقام نیک نژاد، شیرودی، تجن، اترک، نوید، 11199 دارای ترکیب آللی مناسب (ax1+ax2* ،bx7 ،dx5+dy10) از نظر ژن های کنترل کننده کیفیت نانوایی بودند. بالاترین محتوای اطلاعات چندشکلی در ارقام مورد مطالعه مربوط به آغازگر ax1+ax2* (برابر با 491/0) و کمترین آنها مربوط به آغازگر dy12 (برابر با 368/0) بود.