به منظور شناسایی و جداسازی قارچ های بی هوازی اختیاری شکمبه در اطراف رگ های خونی گوسفند از شش راس گوسفند نر نژاد نائینی استفاده شد.گوسفندان به دو گروه سه تایی تقسیم شدند. به یک گروه جیره کنسانتره ای و به گروه دیگر جیره علوفه ای غنی از سلولز خورانده شد. دو هفته پس از تغذیه گوسفندان با جیره های تعیین شده، گوسفندان ذبح شدند و شکمبه به طور کامل از بدن آن-ها جدا گشت. از چندین ناحیه از دیواره شکمبه که حاوی رگ ها یا مویرگ های خونی بود، تکه های شکمبه ای جدا گردید. به همین روش از چندین منطقه بدون مویرگ یا رگ خونی به عنوان شاهد تکه برداری شد. نمونه ها درون تشتک پتری های استریل قرار داده و به هود استریل منتقل گشتند. قطعات ابتدا با سرم فیزیولوژی شستشو و بر روی کاغذ صافی استریل قرار داده شدند. پرزها به همراه سطح کراتینی داخلی جدا شده و تحت شرایط استریل بر روی محیط کشت اختصاصی، تا زمان پدیدار شدن کلونی های قارچ در انکوباتور قرار گرفتند. پنج جدایه قارچ از نمونه های تهیه شده از گوسفندان مورد آزمایش به دست آمد. برای اولین بار، قارچ های aspergillus terreus، a. flavus a. penicilloides، trichoderma longibrachiatum از شکمبه گوسفندان تغذیه شده با جیره های غنی از سلولز و برای اولین بار در ایران، قارچabsidia corymbifera، از شکمبه گوسفندان تغذیه شده با جیره های کنسانتره ای به-دست آمد. جدایه های به دست آمده در این تحقیق فعالیت سلولازی، آمیلازی و ژلاتینازی داشتند و به استثناء گونه a. corymbifera بقیه گونه های جدا شده دارای فعالیت کازئینازی نیز بودند. تمامی جدایه قارچ های بدست آمده بیشترین رشد را در محیط های کشت حاوی عصاره شکمبه نشان دادند. نتایج این تحقیق نشان داد که همانند باکتری ها، قارچ ها نیز قادر به زیست در اطراف رگ های خونی شکمبه ای می باشند و با تشکیل بیوفیلم قارچی و استفاده از اکسیژن منتشر شده از جدار رگ های خونی به تبدیل بیوزیستی مواد می پردازند. نظر به این که این قارچ ها دارای فعالیت های آنزیمی ارزشمندی هستند، می توانند به عنوان پروبیوتیک در صنعت دام و طیور مورد استفاده قرار گیرند.