پیوند هیدروژنی به عنوان عامل کنترل کننده بسیاری از فرایند های شیمیایی و بیو شیمیایی پدیده شناخته شده ای محسوب می شود. با این حال، به علت گسترده بودن برهمکنش هایی که جزو پیوند های هیدروژنی طبقه بندی می شوند، تعیین خواص دقیق آنها بسیار مشکل است. ویژگی های مختلف بر هم کنش های n-h•••o=cnh ، n-h•••o=co و c-h•••o=cnh با به کار بردن روش های از اساس (ab initio) ، dft و هم چنین تئوری aim مورد بررسی قرار گرفته اند. در این تحقیق ، پارامتر های ساختاری، انرژی های پیوندی ، تانسور های پوشیدگی شیمیایی و شیب میدان الکتریکی هسته های اکسیژن ، نیتروژن و هیدروژن ، اربیتالهای اتمی طبیعی و پارمتر های به دست آمده از تئوری aim در مولکول های دی پپتید(α-glygly) α-glycylglycine تری پپتید alanine-glycine-alanine (aga) با استفاده از روش های mp2 ، b3lyp و pw91xc مطالعه شده است. انرژی های پایداری دایمر و ساختار تعادلی آن در سطوح مختلف تئوری مورد بررسی قرار گرفته است. محاسبات dft و mp2 نشان می دهد که برای دو سیستم اشاره شده پایداری پیوند های هیدروژنی n-h…o و c-h…o به وضوح تحت تاثیر افزایش اثرات هم افزایی در سیستم است. از این گذشته طبیعت کووالانسی برای برخی پیوند های هیدروژنی مشاهده می شود. تانسور های پوشیدگی شیمیایی و شیب میدان الکتریکی هسته های اکسیژن ، نیتروژن و هیدروژن ، نیز در ارتباط منطقی با اثرات هم افزایی در پیوند های هیدروژنی است. برای هر سه نوع پیوند هیدروژنی اشاره شده توانایی خوشه های α-glygly برای استقرار الکترون در نقاط بحرانی پیوندهای n-h…o و c-h…o با افزایش اندازه سیستم مورد بررسی قرار گرفته است.این عامل موجب تغییر اثرات هم افزایی و در نتیجه تغییر طول و قدرت پیوند های هیدروژنی ، تانسور های پوشیدگی شیمیایی و شیب میدان الکتریکی هسته های اکسیژن ، نیتروژن و هیدروژن می شود.