در تحقیق حاضر به بررسی دو دسته از متغیرهای آب رودخانه اعم از متغیرهای فیزیکو شیمیایی و هیدرولیکی، مدلسازی ، بررسی تلفیقی آنها و همچنین ارزیابی کیفیت آب رودخانه ی کرج پرداخته شده است. نتایج حاصل از پژوهش حاضر می تواند در مدیریت بهینه و هر چه بهتر کیفیت آب به منظور پیش بینی وضعیت کیفی آب رودخانه راه گشا باشد. در این پایان نامه از مدل qual2kw به منظور مدلسازی کیفیت آب روخانه استفاده شد. متغیرهای کیفی انتخاب شده برای شبیه سازی کیفی، بر اساس آمار در دسترس عبارتند از : conductivity, do, bod, no3, alk, ph, tds . شبیه سازی برای مرداد 1386در کل رودخانه و برای اردیبهشت ماه 1386در پایین دست رودخانه انجام گرفت.از طرفی ارزیابی کیفی آب رودخانه در هردو بازه توسط شاخص wqi انجام شد. برای محاسبه ی اطلاعات هیدرولیکی مورد نیاز از مدل hec-ras استفاده شد و عدد فرود به عنوان پارامتر هیدرولیکی، در مقاطع مورد نظر به کار گرفته شد. زمان شبیه سازی نیز در ماه ها و سال مشابه در مدل کیفی انتخاب شد. صحت سنجی و واسنجی دو مدل در زمان های ذکر شده با مقادیر مشاهده ای مد نظر قرار گرفت . در آخر در مقاطع موجود، پارامترهای کیفی و هیدرولیکی از مدل ها استخراج گردید و همبستگی آن ها بررسی شد. مطالعه ی موردی در این تحقیق رودخانه کرج است که تامین کننده ی آب سد کرج می باشد. سد کرج نیز به نوبه-ی خود بخش اعظمی از آب شرب استان تهران را تامین می کند. در تحقیق حاضر، بازه بالادست سد کرج از ایستگاه ولایترود- گچسر تا نزدیکی دریاچه سد یعنی ایستگاه پل خواب- نشترود مطالعه شده که طول این بازه حدود 35 کیلومتر و شیب متوسط آن 1.62% است . همچنین بازه ی پایین دست سد کرج از خروجی سد تا ورودی آبگیر بیلقان مورد مطالعه قرار گرفت. طول بازه ی پایین دست حدود 20 کیلومتر و شیب متوسط آن 1% است. بر اساس نتایج به دست آمده از بررسی تلفیقی می توان فهمید که پارامتر do بیشترین وابستگی را با پارامتر هیدرولیکی عدد فرود دارد. وجود وابستگی پارامترهای دیگر کیفی نیز مشاهده شد. لازم به ذکر است که پارامترهای رودخانه در شرایط پرآب تر وابستگی بیشتری با یکدیگر دارند و نتایج بهتری را حاصل می شوند. در بررسی کیفیت آب رودخانه کرج در دو فصل پاییز و تابستان می توان فهمید که در فصل پاییز عمدتاَ رودخانه دارای کیفیت بهتر است و همچنین در بالادست به طور کلی کیفیت آب رودخانه بهتر از پایین دست است.