نام پژوهشگر: نیره سادات غفاریان نیا

جداسازی و همسانه سازی ژن tlp از منابع گیاهی و بیان پروکاریوتی آن
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک وزیست فناوری 1389
  نیره سادات غفاریان نیا   محمد رضا زمانی

pathogenesis (pr-pr) یکی از مکانیسم های دفاعی گیاهان در برابر پاتوژنها، تولید پروتئین های دفاعی می باشد. در بین thaumatin like protein (tlp) ، می باشد. یکی از انواع این پروتئینها related proteins دارای ( secale cereal ) و چاودار ( oryza sativa ) نظیر برنج poaceae گیاهان بعضی از اعضای خانواده می باشند. در این تحقیق جهت شناسایی، جداسازی، کلون کردن و بررسی ساختمان ژنی و پروتئینی tlp ژنهای چاودار به منظور بررسی فعالیت ضد قارچی آن tlp گیاه چاودار و برنج و همچنین بیان پروکاریوتی tlp انجام پذیرفت. ctab ژنومی از گیاه چاودار و برنج به روش dna علیه قارچهای پاتوژن گیاهی، استخراج و pucng کلونینگ این قطعات در وکتورهای کلونینگ انجام شد و پس از تایید به ترتیب تحت عنوان 1 نامگذاری گردید. مقایسه نتایج توالی های کلون شده با توالی های موجود در بانک ژنی نشان داد که pjng1 توالی ژنی گیاه چاودار و برنج به ترتیب به طول 522 و 720 جفت باز کلون شده و فاقد اینترون می باشند. گیاه چاودار مورد مطالعه در tlp نشان داد که ncbi مقایسه توالی آمینو اسیدی این ژنها با توالی موجود در های tlp 61 و 77 با توالی های مربوط به ،55 ، 43 ، این تحقیق حداقل در 5 اسید آمینه در موقعیت های 12 این گیاه موجود در بانک ژنی متفاوت می باشد. این مساله منجر به تغییر در تعداد صفحات بتا در این پپتید شده از گیاه چاودار) در این تحقیق دارای دوازده صفحه بتا می باشد در حالیکه توالی ) tlp است. بطوری که پپتید گیاه برنج در این تحقیق در مقایسه با tlp دارای یازده صفحه بتا می باشند. همچنین ncbi های موجود در های این گیاه، موجود در بانک ژنی دارای یک اسید آمینه اضافه می باشد و از لحاظ tlp توالی های مربوط به 80 و 93 با توالی های موجود در بانک ژنی متفاوت می باشد. ، سه اسید آمینه دیگر در موقعیت های 79 کلون گردید و بیان pet-24d(+) گیاه چاودار در وکتور tlp در سیستم پروکاریوتی، ژن tlp جهت بیان پروتئین مورد بررسی قرار گرفت. حضور باند پروتئینی در محدوده مورد انتظار e. coli bl21 (de آن در سلول میزبان ( 3 بیان پروتئین را در سیستم پروکاریوتی تایید کرد. همچنین sds-page 18 کیلو دالتون در تصاویر حاصل از نشان داده شد. gel diffusion assay توسط آزمون rhizoctonia solani فعالیت ضدقارچی این پپتید علیه قارچ