آنتولوژی به عنوان یک روش برای از بین بردن ناهمگنی اطلاعات ارائه شده است. در یک حوزه ممکن است چندین آنتولوژی که از دیدگاههای متفاوت ایجاد شده اند، وجود داشته باشد که سبب ناهمگنی در یک حوزه خاص می شوند. جهت از بین بردن نا‏همگنی‏ها از فرآیند هم تراز سازییا تطابق آنتولوژی ها استفاده می شود. از آنجا که هنگام هم ترازسازی آنتولوژی ها سعی بر رفع همه انواع ناهمگنی های موجود بین دو آنتولوژی ورودی است پس باید روشی اتخاذ گردد تا به کمک آن بتوان نتایج هم ترازسازی انواع روشهای رفع ناهمگنی بین دو آنتولوژی ورودی را کنار هم گردآوری نمود. به مرحله گردآوری نتایج انواع روشهای ناهمگنی، مرحله جمع آوری شباهت ها گویند. در این تحقیق در ابتدا یک سیستم هم ترازسازی آنتولوژی ها با استفاده از سه روش رفع ناهمگنی بین آنتولوژی ها پیاده سازی شده است. این سیستم برای انواع زبان های بیان آنتولوژی ها یعنیowlو rdf قابل استفاده است. در سیستم ارائه شده از سه تطابق یاب استفاده شده است. دو تطابق یاب از ویژگیهای رشته ای اجزای آنتولوژی ها استفاده می نمایند. یکی از این تطابق یاب ها isub است که از فرم رشته ای موجودیت های دو آنتولوژی استفاده می کند و دیگریvdoc است که قبل از آغاز فرآیند محاسبه شباهت بین رشته ها، ابتدا یکسری عملیات پیش پردازش از قبیل حذف حروف اضافه و ربط را انجام می دهد و سپس براساس روش های بازیابی اطلاعات، میزان شباهت دو رشته را محاسبه می نماید. سومین تطابق یاب پیاده سازی شده، gmo است که از ساختار سلسله مراتبی دو آنتولوژی ورودی جهت محاسبه میزان شباهت موجودیت های دو آنتولوژی بهره می گیرد. پس از محاسبه شباهت توسط انواع تطابق یاب های مختلف، در مرحله جمع آوری شباهت های انواع تطابق یاب ها، روشی ارائه شده است که برخلاف سایر روش های موجود، فرآیند جمع آوری شباهت ها را براساس هر دو آنتولوژی و برای هر جفت موجودیت دو آنتولوژی بطور جداگانه انجام می دهد که یک روش تطبیقی و مطلع از ساختار است. ارزیابی کار انجام شده برای بررسی روش جمع آوری شباهت های ارائه شده بوسیله ی آنتولوژی های مسابقه جهانیتطابق آنتولوژی ها یعنیoaei 2009 صورت گرفته است که حاوییک سری آنتولوژی های استاندارد جهت مقایسه انواع سیستم های هم ترازسازی آنتولوژی ها می باشد. مقایسه نتایج سیستم ارائه شده با سیستم های جِرُمی سوئیت و نگاشت توسط جمع مورچه ها، بهبود دقت تشخیص هم ترازی های بین دو آنتولوژی توسط سیستم را نشان می دهد.