باکتری های مختلفی از خانواده enterobacteriacea قادرند موجب پوسیدگی نرم سیب زمینی شوند. این تحقیق جهت ارائه روشی مناسب جهت ردیابی و شناسایی سریع این باکتری ها در برخی مناطق غربی کشور شامل استان های زنجان، کردستان وآذربایجان شرقی انجام شد. بدین منظور22 جدایه شامل 14 جدایه pectobactrium carorovorum subsp carotovorum، سه جدایه dickeya chrysanthemi و پنج جدایه pectobactrium atrosepticumشناخته شده در تحقیقات قبلی و معرفی شده بعنوان نمایندگان باکتری های عامل بیماری در این استان ها برای بررسی انتخاب شد. ابتدا کارایی جفت پرایمر های y1/y2 ,expccf/r ,ade1/2 ,eca1r/f که بعنوان پرایمرهای اختصاصی این باکتری ها منتشر شده بودند جهت شناسایی جدایه ها مورد بررسی قرار گرفت. باند اختصاصی مورد نظر در بسیاری از جدایه ها تکثیر نگردید یا تکثیر باندهای غیر اختصاصی شناسایی آنها را با مشکل روبه رو ساخت. لذا جهت طراحی روشی جدید ابتدا ناحیه igsدر جدایه با جفت پرایمر l1r1491f تکثیر وتوالی یابی شدو سپس جفت پرایمر s1f/s1r طراحی گردید. پرایمر های طراحی شده قادر بودندباند اختصاصیbp 300 را در کلیه جدایه ها ، غیر ازجدایه استاندارد وخارجی تکثیر نمایند. این واکنش در هیچ یک از جدایه های باکتریایی سایر جنس ها باندی را تکثیر ننمود. کلمات کلیدی:پوسیدگی نرم سیب زمینی، p atrosepticum ,p. carotovorum subsp carotovorum وdickeya chrysantemi ، pcr