در زیست شناسی به گروهی از ارگان ها که برای انجام وظیفه خاصی با هم کار می کنند یک سیستم زیستی گفته می شود. به عنوام مثال سیستم گردش خون و سیستم عصبی از جمله سیستم های موجود در بدن موجودات زنده می باشند. هنگامی که یک سیستم زیستی از لحاظ ژنتیکی، بیولوژیکی یا شیمیایی دچار آشفتگی می شود،ژنها و پروتئین ها در پاسخ به این آشفتگی دچار تغییراتی می شوند. فرموله کردن تغییرات و قرار دادن آنها در یک مدل ریاضی و تجزیه و تحلیل مدل توسط شاخه ای از ریاضیات به نام نظریه معادلات و سیستم های دینامیکی انجام می شود. بنابراین درک سیسستم های پیچیده زیستی نیاز به ادغام پژوهش های تجربی و محاسباتی دارد. هدف ما بررسی دو مدل ریاضی نوسان های پروتئینی به نام p53 است که در اثر صدمه dna به وجود می آیند. این بررسی شامل تجزیه و تحلیل دو مدل ریاضی معرفی شده براساس داده های تجربی و نمودارهاست. همچنین انشعابهای موجود در این مدل ها را بررسی کرده، به ویژه نشان می دهیم انشعاب در پروتئینی به نام atm یا شکل فسفردار آن atm-p موجب می شود که دینامیک های شبکه توسط atm یا atm-p خاموش و روشن شوند.