انتقال رسوب و رسوبگذاری از جمله موارد مهم در مطالعه مصب دریاها می باشد. به علت هزینه های بالای لایروبی، مطالعات عددی دو بعدی و سه بعدی فراوانی به منظور مدلسازی انتقال رسوبات در مصب دریاها در حال انجام است. خور موسی یکی از خورهای اصلی در جنوب ایران است که با مشکلات فراوان رسوبگذاری در کانال آن روبرو بوده و از آنجا که آبراهه اصلی به بندر امام خمینی می باشد، مصائبی را در حمل و نقل از طریق این بندر ایجاد نموده است. در نتیجه، این رساله به منظور شبیه سازی عددی سه بعدی رسوبگذاری این محدوده، از نرم افزار flow model flexible mesh mike 3 که برای مدلسازی ترکیب موج، جریان و انتقال رسوب در گستره مهندسی سواحل و مورفولوژی به صورت سه بعدی به کار می رود، استفاده کرده و مدول های هیدرودینامیک و انتقال رسوبات چسبنده آن را به کار برده است. در تمامی مراحل محاسبه پارامترهای مدل سعی گردیده از نتایج نمونه برداری های صورت گرفته استفاده شود. پس از حساسیت سنجی و کالیبراسیون هیدرودینامیک جریان و رسوب، مکانیزم دراز مدت انتقال رسوبات در خور موسی مورد توجه قرار گرفته و عوامل موثر بر پدیده رسوبگذاری از قبیل تاثیرات غلظت رسوب و آشفتگی، بررسی شده است. نتایج حاصله بیانگر قابلیت خوب نرم افزار در شبیه سازی های عددی هیدرودینامیک و رسوب منطقه می باشد. ورتکس ایجاد شده در محدوده و تاثیر آن در رسوبگذاری، جریانات چرخشی خلیج فارس و تاثیر آن در مکانیسم انتقال رسوبات، پدیده اختلاط شدید ناشی از جریانات جزرومدی از جمله نتایج قابل توجه تحقیق حاضر است. ارزیابی محدودیت های مدول mt نرم افزار mike 3 flow model fm از دیگر موارد مطرح گردیده است. کلمه های کلیدی: مصب، شبیه سازی عددی،3 mike، مدول hd، مدول mt، رسوب