گوسفند به عنوان حیوانی اهلی برای قرن ها نقش مهمی در تامین منابع غذایی مردمان سرزمین فلات ایران بر عهده داشته است و این ناحیه به عنوان منشا این گونه به شمار می رود. در بین نشانگر های ژنتیکی، توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روشها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه hvr1 از ژنوم میتوکندری یکی از نژاد های گوسفند بومی ایران (گوسفند مغانی) می باشد. برای انجام این تحقیق تعداد 10 عدد نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوندجمع آوری شد. پس از استخراج dna از آنها، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک pcr تکثیر شده و بعد از بدست آمدن بهترین جواب در pcr، تعیین توالی شد. پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی hvr1 از ژنوم گوسفند مغانی با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژاد ها از مناطق مختلف جهان، مشخص شد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی a می باشد، از مقایسه توالی ناحیهhvr1 گوسفند مغانی با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی a از ژنوم گوسفندان سایر نژاد، نزدیکی آن با نژاد بلوچی ایران و یک نژاد از ترکیه تعیین شد که به دلیل مکان زیستی این نژاد از نظر جغرافیایی دور از انتطار نبود همچنین تجزیه و تحلیل نمودار فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی a نشان داد حتمالاً قوچ و میش اوریال به عنوان منشا نژاد بلوچی و نزادهای آسیایی مورد مطالعه مطرح است و این نژادها از آن مشتق شده اند. در نهایت توالی به دست آمده از این منطقه برای اولین بار در بانک ژن با کد دسترسی fj531545 ثبت و نام گوسفند مغانی برای اولین بار در بانک جهانی ژن آورده شد و این نژاد به انجمن های بین المللی معرفی شد.