نام پژوهشگر: احسان ولی الهی

شناسایی و بررسی میکرو rnaهای پاسخ دهنده به سرما در گیاه گوجه فرنگی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی 1393
  احسان ولی الهی   محمد فارسی

میکرو rnaها (micrornas) مولکول های rna تک رشته ای بطول تقریبی 23-21 نوکلئوتید هستند که از برش ساختمان های سنجاق سری ایجاد شده توسط rna های غیر کد شونده بوجود می آیند. این مولکول ها در فرایندهای مختلف سلولی نظیر نمو، انتقال سیگنال، تخریب پروتئین، پاسخ به تهاجم بیمارگرها و تنش های محیطی نقش دارند. ازجمله تنش های محیطی که نقش موثری در توزیع و پراکنش گیاهان در مناطق مختلف دارد، تنش دمایی است. مطالعه الگوی بیان میکرو rnaها و بررسی ژن های هدف آنها، درک جامع تری را از شبکه های کنترل کننده پاسخ به تنش فراهم می کند. در این پژوهش برای اولین بار مطالعه الگوی بیان میکرو rna ها در شرایط تنش سرمایی در گیاه گوجه فرنگی انجام شد. برای شناسایی و تعیین ترادف smallrnaهای موجود در بافت برگ، از تکنیک illumina (solexa) sequencing استفاده شد. با آنالیز کتابخانه های تهیه شده از small rnaهای بافت برگ 28 خانواده حفاظت شده mirna و حدود 50 میکرو rna که تا کنون گزارشی از آنها در پایگاه mirbase برای گیاه گوجه فرنگی ارائه نشده است، شناسایی شد. براساس آنالیز کتابخانه degradom مشخص شد که بیشتر میکرو rnaهای بافت برگ، در کنترل فاکتور های رونویسی محافظت شده مانند spl، arf وmyb نقش دارند. در نهایت به منظور بررسی اثر تنش سرما بر بیان میکروrna ها، تغییرات بیان 14 میکروrna در شرایط تنش سرما با استفاده از تکنیسک stem-loop qpcr مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که میکرو rnaهای پاسخ دهنده به سرما از طریق کنترل ژن های مرتبط با رشد و نمو، پاسخ به تنش، القاء زمان گلدهی و فتوسنتز در فرآیند پاسخ به تنش در گیاه گوجه فرنگی نقش ایفاء می کنند.