بررسی وجود mirna در اینترون های ژن trkc انسانی و تأثیر بیش بیان آن بر ژن های هدف احتمالی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم زیستی
- نویسنده سادات دوکانه ای فرد
- استاد راهنما بهرام محمدسلطانی سید جواد مولی
- سال انتشار 1393
چکیده
با توجه اهمیت و عملکردهای مهم mirnaها، شناسایی mirnaهای جدید و نقش آن ها ما را در درک بهتر فرایندهای داخل سلولی یاری می کند. بنابراین استفاده از روش هایی که قادر باشد ما را سریعتر به این مهم برساند ضروری است. رویکردهای کامپیوتری بر اساس ویژگی های ساختاری، حفظ شدگی در طول تکامل و همچنین میزان انرژی آزاد ساختارهای پیش بینی شده طراحی شده اند. در این رویکردها از چندین نرم افزار و سایت به موازات هم استفاده می شود تا در نهایت به ساختاری دست یابیم که بیشترین امتیاز را برای واقعی بودن پیش ساز mirna داشته باشد. همچنین با توجه به نقش های مهم ژن trkc و ویژگی های مهمی که این ژن دارد، از جمله وجود اینترون های بسیار طویل که دربردارنده توالی های حفاظت شده ای است که دارای ویژگی های شبه ساختارهای mirna هستند، احتمال اینکه این ژن میزبان برخی از mirnaهای مهم در سلول باشد دور از انتظار نیست و بررسی و تأئید این ساختارها ضروری است. پس از کشف این mirnaها، بررسی عملکرد آنها در بافت هایی که trkc در آن بیان می شود ضروری است. همچنین از آنجائیکه ژن trkc دارای عملکردهای متناقضی است که هنوز دید مشخصی برای مکانیسم آن وجود ندارد این احتمال وجود دارد که rnaهای غیرکدکننده ای در این امر دخیل باشند. لذا بررسی رابطه فعالیت این mirnaها با فعالیت های متناقض trkc ضروری است.
منابع مشابه
شناسایی miRNA ها و ژن های هدف مرتبط با آنها در گیاه خشخاش ( Papaver somniferum)
miRNA ها یک رده از RNA های تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 17-22 نوکلئوتید می باشند. miRNA ها بیان ژن را پس از رونویسی از طریق تجزیه mRNA یا مهار ترجمه انها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرایند های بیولوژیکی و متابولیکی در گیاهان و جانوران بازی می کنند. روش های متعددی برای شناسایی miRNA ها موجود می باشد که یکی از ساده ترین و کم هزینه ترین انها ، روش شناس...
متن کاملبررسی تأثیر بیش بیان mir-302f بر ژن هدف احتمالی trka و تأثیر آن بر چرخه سلولی در رده های سلولی huh-7 و hek293t
ژن های mirna ، بیان ژن های دیگر را با ممانعت از ترجمه و یا تجزیه رونوشت های هدف تنظیم می کنند و بیان غیرعادی آن ها در بدخیمی های مختلف گزارش شده است. ازطرفی، نقش اعضای خانواده گیرنده تیروزین کینازی نوروتروفینی همانند trka در سرطان های مختلف ازجمله در نوروبلاستوما شناخته شده است. در این تحقیق، به منظور شناسایی mirnaهای جدید که ممکن است رونوشت ژن trka را هدف قرار دهند و در پیش آگهی مبتلایان به سر...
15 صفحه اولتاثیر اینترون 1 ژن بتاگلوبین انسانی بر روی بیان موقت فاکتور 9 انعقادی فعال انسانی در ردهای از سلولهای پستانداران
چکید ه سابقه و هدف تاثیر حضور اینترونها در افزایش بیان ژنها در سلولهای پستانداران نشان داده شده است. در این مطالعه کارایی اینترون 1 ژن بتاگلوبین انسانی بر بیان موقت cDNA فاکتور 9 انسانی در رده سلولی تخمدان هامستر چینی( CHO ) تحت کنترل پروموتر سیتومگالوویروس نشان داده شد. مواد وروشها مطالعه انجام شده از نوع تجربی بود. در این پژوهش اینترون 1 ژن بتاگلوبین انسانی بین اگزونهای 1 و 2 ...
متن کاملبررسی پلی مورفیسم اینترون 3 ژن P53 در نمونه های سرطانی پستان در اصفهان
Introduction & Objective: Genetic agents play important roles in developing of cancers. Mutations and polymorphism affects on p53 protein function in suppressing tumor. We aimed to investigate the intron 3 polymorphism of p53 in Isfahanian breast invasive ductal carcinoma. Materials & Methods: We undertook a case–control study on 192 controls and 192 patients with breast invasive ductal carc...
متن کاملبررسی بیان ژن های Snail در سرطان پروستات
سابقه و هدف : سرطان پروستات ( PCa ) دومین بدخیمی مرسوم در مردان در سراسر جهان است. Snail و Slug ، تنظیمکنندگان اصلی فرآیند تغییر اپیتلیال ـ مزانشیمال ( EMT )، ژنهایی هستند که عملکرد آنها به طور اساسی تنظیم حرکت سلولی و فراهم نمودن ویژگیهای بقا برای سلولها است. مواد و روشها : در مطالعهی مورد ـ شاهد حاضر، محتوای RNA ی کل از بافتهای طبیعی و سرطانی پروستات استخراج گردید و جهت تولید cDNA مورد...
متن کاملبررسی بیوانفورماتیکی و تجربی امکان وجود mirna اینترونی در ژن p75ntr انسانی
نروتروفین ها دامنه وسیعی از فعالیت ها را در سلول نشان میدهند.p75ntr ، یکی از گیرنده های مهم نوروتروفین هاست که مسیر سیگنالینگ آن بدرستی مشخص نیست. این ژن هم به عنوان تومورساپرسور و هم افزایش دهنده متاستاز در بدخیمی ها معرفی شده است. گر چه دخالت برخی mirna ها در سرطانها معلوم شده است ولی دخالت mirnaها در این مسیر بخصوص که از p75ntr میگذرد مشخص نیست. در این تحقیق با استفاده از روش های بیوانفورمات...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم زیستی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023