تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ لاری با استفاده از توالی ناحیه hvr-i ژنوم میتوکندری

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی
  • نویسنده
  • استاد راهنما نصراله پیرانی زهرا کرمی
  • سال انتشار 1393
چکیده

مرغ های بومی ایرانی مواد ژنتیکی پایه برای برنامه های اصلاح نژاد محسوب می شوند و شناخت بهتر این ذخایر می تواند مبنای صحیح تری جهت برنامه های اصلاح نژادی و استفاده بهینه از منابع موجود در جهت افزایش تولید باشد. انجام برنامه های اصلاح نژادی در گام نخست نیازمند شناسایی و حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت هاست. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها میتواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد بررسی را ارائه دهد. در مطالعه حاضر، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان لاری ایران، تعداد 21 قطعه مرغ از منطقه لارستان فارس به عنوان نمونه آزمایشی انتخاب و پس از عمل خون گیری، استخراج dna انجام شد. ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی توالی یابی شدند. در کل تعداد 21 توالی با کیفیت بدست آمد که از این میان تعداد 5 عدد snp شناسایی شد. از تجزیه و تحلیل توالی های بدست آمده تعداد 3 هاپلوتیپ بدست آمد که با کد دسترسی 957610kf، 957611kf و 957612kf در بانک جهانی ژن ثبت گردید. پس از اخذ توالی های مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای موجود در بانک ژن و مرغ مرندی و مازندرانی ایران درخت فیلوژنی مربوطه رسم گردید. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغان بومی لاری ایران با مرغ مرندی، مازندرانی، مرغ بومی کشور آذربایجان، پلیموت راک پرخط دار، مرغ ابریشمی و مرغ جنگلی خاکستری نزدیکی بیشتری دارد که میتوان اینگونه نتیجه گیری کرد که مرغ بومی لاری ایران احتمالاً واجد برخی شباهت های ژنتیکی با این نژادها می باشد.

منابع مشابه

تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ لاری با استفاده از توالی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری

مرغ‌های بومی ایرانی مواد ژنتیکی پایه برای برنامه های اصلاح نژاد محسوب میشوند. انجام برنامه‌های اصلاح نژادی در گام نخست نیازمند شناسایی و حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت هاست. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها میتواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد بررسی را ارائه دهد. در مطالعه حاضر، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان لاری ایران، تعداد 23 قطعه مرغ از منطقه لارست...

متن کامل

تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ بومی گردن لخت توالی ناحیه hvr-i ژنوم میتوکندری

ارزیابی و حفاظت از مرغان بومی به عنوان منابع ژنتیکی، برای بهبود آنها در آینده ضروری است. یکی از راههای شناسایی این نژادها استفاده از تکنیکهای مولکولی بخصوص استفاده از ژنوم میتوکندری است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی مرغان بومی گردن لخت با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ژنوم میتوکندری بررسی شد. برای انجام این تحقیق یک قطعه 455 ژنوم میتوکندری در 20 مرغ گردن لخت پس از تکثیر توسط پرایمرهای d-loop ناحیه...

متن کامل

تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ بومی گردن لخت با استفاده از توالی ناحیه hvr-i ژنوم میتوکندری

در این پژوهش تنوع ژنتیکی مرغان بومی گردن لخت با استفاده از تجزیه و تحلیل ژنوم میتوکندری مورد بررسی قرار گرفت. یک قطعه 455 جفت بازی از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری 10 مرغ گردن لخت توالی‏یابی شد. در کل دو هاپلوتیپ شناسایی شد. تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی در مرغان بومی گردن لخت به ترتیب 01591/0 ± 3556/0 و 002356/0 ± 003133/0 بود. پس از اخذ توالی‏های مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای موجود در با...

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری در گوسفند نژاد افشاری

خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند به علت تلاقی های کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالی­یابی ژنوم میتوکندری، یکی از راه های بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع  ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری می­باشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمع آوری و پس از استخراج dna از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرها...

متن کامل

تعیین توالی ناحیه بسیار متغیر 1 (hvr-i) از dna میتوکندری مرغ مازندرانی

گونه های مرغ به طور گسترده در سراسر جهان پخش شده و نقش آنها در جامعه عموماً به عنوان منبع مواد غذایی و یا برای سرگرمی است. مرغ بومی در کشورهای در حال توسعه یک منبع مفید برای شناسایی، ژن جدید در میتوکندری و ژنوم هسته ای فراهم می کند. توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روش ها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، م...

15 صفحه اول

تجزیه فیلوژنتیک و هاپلوگروهی بزهای بومی ایران بر اساس توالی نوکلئوتیدی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری

بزهای بومی ایران به­عنوان یکی از ذخایر ژنتیکی ارزشمند محسوب می­شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آنها حائز اهمیت است. ژنوم میتوکندری در یک اکوتیپ و مقایسه آن با سایر اکوتیپ­ها می­تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در آن جمعیت را ارائه دهد. هدف از پژوهش اخیر بررسی ساختار ژنتیکی و ترسیم روابط فیلوژنتیکی ناحیه HVR1 میتوکندری چهار توده جمعیتی بز­های بومی ایران شامل سیستانی، پاکستانی، عدنی و سیاه لری (هر کد...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023