بکارگیری روش های آنالیز تصویر چند متغیره و رگرسیون اسپلاین وفقی چند متغیره در مطالعات qsar بازدارنده های گلوتاتیون s-ترنسفرازp1-1 و پلاسمودیوم فالسیپاروم دی هیدروروتیت دهیدروژناز

پایان نامه
چکیده

مقاومت در برابر داروهای شیمی درمانی به مدت طولانی به یک مانع قابل توجهی برای درمان موفقیت آمیز بسیاری از سرطان ها تبدیل شده است. gstp1-1 ها خاصیت سم زدایی داشته و این خاصیت خود را می-توانند بر روی داروهای شیمی درمانی انجام داده و میزان فعالیت دارو را کم کنند. در روش mia-qsar پیکسل هایی از عکس دو بعدی ساختار مولکول که دوتایی است گرفته می شود و با این اعداد مدل سازی صورت می گیرد. با استفاده از برنامهacd/chemsketch (2008) ساختار مشتقات 35 مولکول داروی بازدارنده gstp1-1 کشیده شده، بعد اندازه این عکس را تغییر داده به طوری که تمام مولکول ها از لحاظ مکان روی هم افتاده و ساختارهای مشترک آن ها روی هم قرار می گیرند. هر تصویر مولکول را وارد برنامه matlab کرده و ساختار های مشترک که برای همه مولکول ها یکسان است حذف می گردد. سپس هر مولکول در برنامه matlab به یک سطر تبدیل شده و همه مولکول ها پشت هم ردیف می شوند طوری که تعداد سطرها با تعداد مولکول ها برابر شود. بعد به وسیله الگوریتم مولفه های اصلی، بهترین pc ها را انتخاب کرده و با استفاده از رگرسیون mlr آنها را مدل می کنند. مقدار r2 برابر 9973/0 و rmse برابر 16/1 می-باشد. آنزیم dhodh یک آنزیم مهم برای توسعه بیماری مالاریا است. زمانی که انگل پلاسمودیوم فالسیپاروم به dhodh وارد می شود یک آنزیم مناسب برای رشد انگل های پلاسمودیوم فالسیپاروم فراهم می شود و در واقع سرعت تکثیر این انگل زیاد می شود. در روش مدل سازی mars این امکان وجود دارد تا بتوان الگوی غیر خطی پنهان در مجموعه داده های با تعداد متغیر زیاد را آشکار کرد و بدین ترتیب ضمن بکارگیری یک روش، امکان تعریف تابع تخمین ممکن می شود و ضرورتی به تلفیق چندین روش آماری وجود نخواهد داشت. tmars در واقع ترکیبی از دو روش mlr (رگرسیون خطی چندگانه) وmars (رگرسیون اسپلاین وفقی چند متغیره) است. در این مطالعه مشتقات داروی بازدارنده pfdhodh مورد بررسی قرار گرفت. پس از بهینه سازی ساختار، توصیف کننده های مختلف (1497توصیف کننده) با استفاده از نرم افزار dragon بدست می آید. بهترین توصیف کننده ها (6 توصیف کننده) با استفاده از روش گام به گام انتخاب شده و سپس mars برای مدل سازی استفاده می گردد. مقدار r2 در این روش 9552/0 و مقدار rmse برابر 2401/0 به دست آمده است.

منابع مشابه

پهنه بندی درجه حرارت های حداقل و حداکثر در ایران به روش رگرسیون چند متغیره

دما اثرات انکارناپذیری بر فعالیت های انسانی و فرآیندهای طبیعی می گذارد. با توجه به گستردگی و تنوع آب و هوایی ایران و پراکندگی مکانی و نوسانات دمایی در گستره ایران، شناخت پهنه های دمایی مختلف در ایران در سیاست گذاری بخش های مختلف صنعت، عمران و کشاورزی یک ضرورت می باشد. به دلیل تنوع اقلیمی کشور و به تبع آن احتمال وقوع گرادیان های دمایی مختلف، در این مطالعه بررسی روابط دمای کمینه و بیشینه به تفکیک...

متن کامل

آنالیز داده های ژل های الکتروفورز دو بعدی با استفاده از روش های آماری چند متغیره

سابقه و هدف : در سـال های اخیـر تکنولـوژی مـربوط به تـوصــیف لکه های پروتئینی نمایان شده بر ژل های الکتروفورز دو بعدی، توسعه ی قابل ملاحظه ای یافته و نرم افزارهای متعدد آماری آنالیز ژل نیز ایجاد و گسترش یافته است که تأثیر این ابتکارات بر ارتقاء پروتئومیک بسیار چشمگیر است.آنالیز داده های عظیم پروتئومیکی با دارا بودن متغیر های زیاد نیاز به روش های چند متغیره است که امکان آنالیز آماری همزمان چندین...

متن کامل

مدلسازی تغییرات کاربری اراضی چندگانه با استفاده از رگرسیون انطباقی چند متغیره اسپلاین و سیستم اطلاعات مکانی

لزوم بررسی تغییرات کاربری اراضی، با توجه به تاثیرات قابل ملاحظه‌ای که این پدیده بر روی زندگی انسان و همچنین محیط زیست می‌گذارد، امری لازم و ضروری به نظر می‌رسد. مدلسازان تغییرات کاربری اراضی عمدتا به مدلسازی تغییرات کلاسهای کاربری اراضی یگانه (مانند شهری) پرداخته اند و کمتر مدلسازی تغییرات کلاسهای کاربری اراضی چندگانه (مانند کشاورزی و شهری ) مورد توجه قرار گرفته است. در این تحقیق، به شبیه سازی ...

متن کامل

برآورد تبخیر پتانسیل از طریق رگرسیون چند متغیره

فرآیند تبدیل آب مایع به بخار را تبخیر گویند. در سیکل هیدرولوژی، تبخیر پدیده پیچیده ­ای است که محاسبات گسترده ­ای را طلب می­ کند. در این تحقیق سعی شده تا روش ساده ­ای جهت محاسبه تبخیر پتانسیل ارایه گردد و با کمک گرفتن از روش ­های آماری و عناصر اقلیمی مؤثر در تبخیر، میزان تبخیر انجام شده از سطوح آبی محاسبه شود. در این روش از رگرسیون چند متغیره و معادله خط استفاده گردید و از آمار تشت تبخیر به عنوا...

متن کامل

مطالعات آماری چند متغیره بر روی داده‏های ژئوشیمیایی منطقه کرویان

در این مطالعه داده‏های ژئوشیمیایی رسوبات آبراهه‏ای برگه 1:50000 میرده به روش حوضه آبریز نمونه بررسی شده است. 299 نمونه از رسوبات آبراهه‏ای در مساحتی حدود 617 کیلومترمربع از منطقه مورد مطالعه برداشت شده و تحت آنالیز شیمیایی قرار گرفته است. به دلیل وجود پتانسیل کانی‏سازی طلا در منطقه روش حوضه آبریز نمونه، بر روی غلظت‏های تک عنصری طلا اعمال شده است. پس از انجام محاسبات مربوط به روش حوضه آبریز نمون...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده شیمی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023