روش اتوماتیک تشخیص تالاسمی مینور از روی تصاویر میکروسکوپی اسلایدهای خون و استخراج ویژگی سلول های قرمز خون
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر
- نویسنده نازیلا کریمیان سیچانی
- استاد راهنما بهزاد نظری سعید صدری
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1393
چکیده
تالاسمی یکی از شایعترین بیماری های ژنتیکی است. این بیماری به دو دسته ی تالاسمی مینور و ماژور طبقهبندی می شود. تالاسمی مینور بیماری تلقی نمی شود و بسیاری از افراد از مبتلا بودن به آن آگاه نیستند ولی در صورت ازدواج دو فرد مبتلا به تالاسمی مینور، به احتمال 25 درصد فرزند آن ها به تالاسمی ماژور مبتلا خواهد شد. علایم بیماری تالاسمی ماژور به تدریج در 6 ماه اول زندگی نوزاد آشکار می شود. طول عمر بیماران تالاسمی ماژور معمولا کوتاه است و هزینه ی نگهداری از این بیماران نیز بسیار بالا است. آزمایش های قبل از ازدواج مطمئن ترین راه برای جلوگیری از بیماری تالاسمی ماژور است. از سال 1376 برنامه ی ملی پیشگیری تالاسمی به طور رسمی در رأس برنامه های مراکز بهداشت سراسر کشور قرار گرفته است. با توجه به حجم زیاد آزمایشهایی که روزانه در مراکز مختلف انجام می شود، نیاز به بررسی روش های شناسایی و تشخیص این بیماری به صورت خودکار ضروری به نظر می رسد. روش های پردازش تصویر یکی از روش های بررسی خودکارگلبول های خونی است. برای این کار می توان با اتصال یک دوربین دیجیتال به میکروسکوپ از لام های تهیه شده از نمونه های خون عکسبرداری نمود و با استفاده از الگوریتم های پردازش تصویر بیماری های مختلفی را بررسی و شناسایی کرد. داده های مورد نیاز (که تصاویر تهیه شده از اسلایدهای خونی است) از بخش پاتولوژی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان و همچنین بیمارستان هایی از قبیل بیمارستان سیدالشهداء تهیه شده است. این تصاویر شامل 100 نمونه خون محیطی سالم و 100 نمونه خون محیطی تالاسمی مینور می باشد. هدف این تحقیق طراحی و پیاده سازی یک سیستم عملی برای آنالیز خودکار گلبول های خون بر اساس مورفولوژی آن ها و تشخیص بیماری تالاسمی مینور بر اساس جدا کردن گلبول های طبیعی از موارد غیر طبیعی می باشد. در اکثر بیماری های خونی گلبول های قرمز خون از حالت طبیعی یا دیسک مانند تغییر شکل داده و به شکل های مختلف یا به اصطلاح پویکیلوسیت تبدیل می شوند.گلبول های هدف (تارگت)، گلبول های بیضوی (الیپتوسیت) وگلبول های اشکی شکل (داکروسیت) از انواع گلبول هایی هستند که در نمونه ی خون محیطی بیماران تالاسمی مینور مشاهده می شوند. هدف این تحقیق جداسازی و آشکارسازی این گلبول ها در نمونه های خون تالاسمی مینور و تشخیص این بیماری بر اساس درصد این گلبول ها می باشد. بعد از جمع آوری پایگاه داده در مرحله ی اول گلبول های قرمز با استفاده از روش آستانه گذاری اوتسو جدا می شوند. سپس ویژگی های هندسی مناسب برای هر گلبول استخراج می شود. انواع گلبول های قرمز در سه مرحله طبقه بندی می شوند. در مرحله ی اول گلبول های تارگت با استفاده از روش آستانه گذاری با صحت 84% شناسایی شده اند. در مرحله ی دوم برای طبقه بندی گلبول های نرمال، الیپتوسیت و داکروسیت، شبکه ی عصبی با الگوریتم پس انتشار خطا، ماشین بردار پشتیبانی و k نزدیک ترین همسایه مورد بررسی قرار گرفته اند. از بین آن ها، طبقه بندی کننده ی k نزدیک ترین همسایه با درصدهای صحت 99% برای گلبول های نرمال، 99% برای گلبول های الیپتوسیت و 94% برای داکروسیت ها در طبقه بندی این دسته گلبول ها عملکرد بهتری داشته است. لازم به ذکر است که یک سطح آستانه نیز برای این طبقه بندی کننده ها در نظر گرفته شده است و چنانچه خروجی طبقه بندی کننده از این سطح آستانه کمتر باشد، این گلبول در هیچ یک از سه دسته ی بالا قرار نمی گیرد. در مرحله ی سوم گلبول های حذف شده به عنوان گلبول های متفرقه در نظر گرفته می شود. درصد صحت به دست آمده برای این گلبول ها 95% می باشد. پس از طبقه بندی گلبول های قرمز با استفاده از درصد گلبول های به دست آمده (که به عنوان بردار ویژگی ورودی به یک شبکه ی عصبی داده شده اند) تشخیص تالاسمی مینور صورت گرفته است. الگوریتم ارائه شده در نهایت با 98% صحت و حساسیت 100% موفق به تشخیص تالاسمی مینور شده است.
منابع مشابه
استخراج اتوماتیک هسته و سیتوپلاسم سلول های سفید خون در تصاویر لام محیطی
مقدمه: یکی از پارامترهای اساسی در تشخیص سلول های بلاست، افزایش نسبت مساحت هسته به سیتوپلاسم آن ها است. علاوه بر این پارامتر، پارامترهایی از قبیل اندازه ی هسته، میزان گرد بودن هسته و نیز اندازه ی کل سلول در تعیین بلاست یا عدم بلاست بودن سلول ها مؤثر می باشند. روش ها: در این مقاله با استفاده از خصوصیت متمایز هسته از سایر اجزاء یک لام خونی، آن ها را ابتدا با استفاده از الگوریتمی مبتنی بر روش خوشه ...
متن کاملبررسی و مقایسه روشهای استخراج DNA از نمونه خون و اسلایدهای مغز استخوان و خون محیطی
Introduction: DNA extraction methods are very important for genetics research and diagnostic tests. In These methods are also important for detecting genetic diseases or in cancers for investigating genetic changes during cancer progression or treatment. Therefore, selection of the best method for DNA extraction from different samples such as bone marrow (BM) or peripheral blood (PB) and their ...
متن کاملالگوریتم بهینه تقسیمبندی تصاویر میکروسکوپی خون برای تشخیص سلولهای لوسمی حاد لنفوبلاست با استفاده از الگوریتم FCM و بهینهسازی ژنتیک
Cancer is type of disease caused by irregular, uncontrollable growth of blood cells in bone marrow. The process of generating three main blood cells including pallets, red and white blood cells, is started from a progenitor cell called as blast. Blast generates a considerable number of immature cells which are developed affected by differentiation factors. If any interruption occurs during this...
متن کاملطبقهبندی سلول های مؤثر در تشخیص سرطان میلوئیدی مزمن به روش نیمه خودکار پردازش تصاویر میکروسکوپی
مقدمه: لوسمی میلوئیدی مزمن (cml یا chronic myeloid leukemia)، نوعی بیماری سرطان خون است که اغلب، بزرگ سالان را درگیر می کند. آزمایش خون، شمارش و بررسی سلول های شناور خون، اولین گام جهت تشخیص لوسمی است. تشخیص و شمارش سلول ها از روی لام خون محیطی، توسط پاتولوژیست با استفاده از میکروسکوپ نوری صورت می گیرد. این امر، فرایندی زمان بر و پرهزینه است و نیاز به تجربه و فرد خبره در این زمینه دارد. همچنین،...
متن کاملتشخیص اتوماتیک بیماری مالاریا با استفاده از الگوریتم برازش بیضی- دایره از روی تصاویر گسترش نازک خون
بیماری مالاریا با تهدید تقریبا نیمی از جمعیت کره ی زمین، از مهم ترین مشکلات بهداشتی جهان محسوب می شود. روش قطعی در تشخیص مالاریا، مشاهدات میکروسکوپی گسترش های خونی بیماران است. گسترش های خونی، روش هایی برای تثبیت موقعیت انگل بر روی لام خون می باشند. تشخیص مالاریا با استفاده از مشاهدات میکروسکوپی، وظیفه ی زمان بر و خسته کننده ای برای تکنسین محسوب می شود. علاوه بر این ، به دلیل واگذاری تصمیم نهای...
15 صفحه اولاستخراج اتوماتیک ردّ ماهواره در تصاویر رقومی نجومی
از جمله مهمترین ارکان استقلال در برنامههای فضایی هر کشور، داشتن توانایی ردیابی و تعیین مدار ماهوارهها است. یکی از روشهای آگاهی از موقعیت دقیق ماهوارهها در یک چارچوب مرجع مشخص در ژئودزی ماهوارهای روش کینماتیک است. در این روش، مدار ماهواره بهطور مستقیم از روی مشاهدات ایستگاههای ردیابی تعیین میشود. در این راستا روش ردیابی ماهواره با استفاده از سیستمهای اپتیکی در صورت برقراری شرایط ایدهآ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023