الف) بررسی برهمکنش مولکولی والاسیکلوویر هیدروکلرید با آلبومین سرم انسانی؛ ب) مطالعه شبیه سازی دینامیک مولکولی اثر جهش بر ساختار برخی پروتئین ها

این پایان¬نامه شامل دو قسمت است. درقسمت اول برهمکنش بین والاسیکلوویرهیدروکلرید با آلبومین سرم انسانی بررسی می¬گردد. به کمک طیف سنجی های جذبی در ناحیه مرئی-فرابنفش و فلوئورسانس مرسوم و به همراه شبیه سازی¬های دینامیک مولکولی و اتصال و همچنین معادلات وانت هوف و استرن-ولمر طبیعت برهمکنش بین والاسیکلوویرهیدروکلرید و آلبومین را آشکار می سازند. عامل ترمودینامیکی پیش برنده این برهمکنش از نوع آنتروپی بوده و خاموشی فلوئورسانس مشاهده شده از سازوکار خاموشی پویا می¬باشد. درقسمت دوم پروتئین p53 و دو جهش r273h و r249s مربوط به این پروتئین و پروتئین آلبومین سرم انسانی و دو جهش r218h و r218p مربوط به این پروتئین بررسی می¬شود. پروتیئن p53، یک مهارکننده تومور کلیدی در سلول است که به¬هنگام آسیب به dna فعال می¬شود و مهمترین عملکرد خود که توقف چرخه سلولی و اپاپتوز است، را انجام می¬دهد. پروتئین p53 در بیش از %50 سرطان¬ها جهش می¬یابد و %99 این جهش¬ها در دامنه اتصالی به dna رخ می¬دهد. در این قسمت خواصی از جمله: شعاع گردش، سطوح در معرض حلال و ریشه میانگین مربع انحرافات بررسی خواهد شد.