شناسایی و بررسی میکرو rnaهای پاسخ دهنده به سرما در گیاه گوجه فرنگی

پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی
نویسنده احسان ولی الهی
استاد راهنما محمد فارسی امین میرشمسی کاخکی
سال انتشار 1393

چکیده

میکرو rnaها (micrornas) مولکول های rna تک رشته ای بطول تقریبی 23-21 نوکلئوتید هستند که از برش ساختمان های سنجاق سری ایجاد شده توسط rna های غیر کد شونده بوجود می آیند. این مولکول ها در فرایندهای مختلف سلولی نظیر نمو، انتقال سیگنال، تخریب پروتئین، پاسخ به تهاجم بیمارگرها و تنش های محیطی نقش دارند. ازجمله تنش های محیطی که نقش موثری در توزیع و پراکنش گیاهان در مناطق مختلف دارد، تنش دمایی است. مطالعه الگوی بیان میکرو rnaها و بررسی ژن های هدف آنها، درک جامع تری را از شبکه های کنترل کننده پاسخ به تنش فراهم می کند. در این پژوهش برای اولین بار مطالعه الگوی بیان میکرو rna ها در شرایط تنش سرمایی در گیاه گوجه فرنگی انجام شد. برای شناسایی و تعیین ترادف smallrnaهای موجود در بافت برگ، از تکنیک illumina (solexa) sequencing استفاده شد. با آنالیز کتابخانه های تهیه شده از small rnaهای بافت برگ 28 خانواده حفاظت شده mirna و حدود 50 میکرو rna که تا کنون گزارشی از آنها در پایگاه mirbase برای گیاه گوجه فرنگی ارائه نشده است، شناسایی شد. براساس آنالیز کتابخانه degradom مشخص شد که بیشتر میکرو rnaهای بافت برگ، در کنترل فاکتور های رونویسی محافظت شده مانند spl، arf وmyb نقش دارند. در نهایت به منظور بررسی اثر تنش سرما بر بیان میکروrna ها، تغییرات بیان 14 میکروrna در شرایط تنش سرما با استفاده از تکنیسک stem-loop qpcr مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که میکرو rnaهای پاسخ دهنده به سرما از طریق کنترل ژن های مرتبط با رشد و نمو، پاسخ به تنش، القاء زمان گلدهی و فتوسنتز در فرآیند پاسخ به تنش در گیاه گوجه فرنگی نقش ایفاء می کنند.

منابع مشابه

شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای مرتبط با تنش خشکی در گیاه جو

مطالعه سازوکار‏های تحمل تنش در گیاه جو، به درک بهتر اساس ژنتیکی تحمل تنش خشکی و در نهایت بهبود خصوصیات ژنتیکی مرتبط با تحمل تنش به کمک روش‏های نوین ژنتیک مولکولی می‌انجامد. در این پژوهش، به‌منظور شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای درگیر در تحمل تنش خشکی گیاه جو، واکاوی EST های برگ و ریشه در گیاه جو صورت گرفت. اطلاعات اولیه کتابخانه‌ها از پایگاه‌ NCBI دریافت گردید، سپس با کمک نرم افزارهای بی...

متن کامل

شناسایی و بررسی بیان برخی میکرو RNAهای مرتبط با تنش خشکی در گیاه جو

متن کامل

بررسی بیان ژن‌های فعال شده توسط بتا آمینوبوتیریک اسید( BABA )در گیاه گوجه فرنگی در پاسخ به تنش‌های زیستی

متن کامل

پیش‌بینی محاسباتی ژن های پاسخ دهنده به سرما در کلزا از طریق مقایسه ژنومی با گیاه مدل Arabidopsis thaliana

سرما تنش مهمی است که تولید و پراکندگی جغرافیایی بسیاری از گیاهان زراعی از جمله کلزا به عنوان یک گیاه روغنی مهم را محدود می‌کند. در این مقاله عناصر سیس شناخته شده که تنظیم‌کننده پاسخ مولکولی گیاه به تنش سرما هستند، برای شناسایی ژن‌های دخیل در تحمل سرما استفاده شدند. از تعداد 62384 یونیژن از پایگاه داده Brassica Genome Gateway، تعداد 56 عدد ژن مسئول سرما شناسایی شدند. برای اعتبارسنجی ژن‌های شناس...

متن کامل

پیش‌بینی محاسباتی ژن های پاسخ دهنده به سرما در کلزا از طریق مقایسه ژنومی با گیاه مدل Arabidopsis thaliana

متن کامل

تاثیرسلنیم فلزی و نانو بر خصوصیات فیزیولوژیک گیاه گوجه فرنگی

Selenium (Se) is an important microelement for plants and has been shown to improve growth under normal and stressed conditions. In this study, effect of Se and nano-selenium (N-Se) on hydroponically-grown tomato (Lycopersicum esculentum Mill. cv. ‘Halil’) on photosynthesis, antioxidant activity and total polyphenolic content was assessed. A factorial experiment with three temperatu...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}

نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی

کلمات کلیدی

گوجه فرنگی ها ریز آر ان آ پراکسیداز تنش سرمایی ژن های غالب

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com